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2020 Fiscal Year Annual Research Report

難培養微生物を起源とする希少医薬品資源の量産

Planned Research

Project AreaCreation of Complex Functional Molecules by Rational Redesign of Biosynthetic Machineries
Project/Area Number 16H06448
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

脇本 敏幸  北海道大学, 薬学研究院, 教授 (70363900)

Project Period (FY) 2016-06-30 – 2021-03-31
Keywords海綿 / Calyculin A / 環状ペプチド
Outline of Annual Research Achievements

本研究では多様な天然物の生産能を有する海綿共生微生物に着目し、その二次代謝産物の生合成経路の解析を進めた。伊豆半島産のチョコガタイシカイメンは強力な細胞毒性活性を示すcalyculin Aを高濃度で含んでいる。その生産菌は難培養性の海綿共生細菌Entotheonellaである。Entotheonellaはcalyculin Aをより低毒性なリン酸化体phosphocalyculin Aとして生産して蓄積している。ひとたび海綿組織に傷害が生じると、脱リン酸化酵素が作動して強毒性なcalyculin Aが生じる。これまでの研究によって、活性化を担う脱リン酸化酵素はEntotheonellaがcalyculin生合成遺伝子クラスター内にコードするCalLであることを明らかにした。本年度はさらに詳細な解析を進め、CalLの酵素活性に必須な金属種の同定を進めた。ICP-MSや比色定量法を用いて解析を進めた結果、銅と亜鉛を含むことが分かり、purple acid phosphatase familyとして初めて見出された中心金属であった。さらにN末端側の配列を詳細に解析したところ、nativeおよびリコンビナント酵素の両方において同じ箇所で切断されていることが分かった。該当領域はペリプラズムへの輸送に関わるシグナルペプチド配列と良い一致を示した。実際にリコンビナント酵素を調製した大腸菌のペリプラズム画分から高純度のCalLを精製した。以上の結果から、難培養性の海綿共生細菌Entotheonellaはphosphocalyculin Aをprotoxinとして生産するとともに、活性化酵素としてCalLをペリプラズムに発現し、両者を区画化するとともに、膜傷害に応じてcalyculin Aへ変換することが明らかになった。これらの成果は異種生産系の確立において重要な知見となる。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (12 results)

All 2021 2020 Other

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Book (2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] PenA, a penicillin-binding protein-type thioesterase specialized for small peptide cyclization2021

    • Author(s)
      Matsuda Kenichi、Fujita Kei、Wakimoto Toshiyuki
    • Journal Title

      Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology

      Volume: - Pages: in press

    • DOI

      10.1093/jimb/kuab023

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Ascidian-associated photosymbionts originated from Manado, Indonesia: Secondary metabolite identification, bioactivity simulation, and biosynthetic insight2021

    • Author(s)
      Rumengan Inneke F.M.、 Roring Vera I.Y.、Haedar Jabal R.、 Siby Mayse S.、Luntungan Aldian H.、Kolondam Beivy J.、Uria Agustinus R.、Wakimoto Toshiyuki
    • Journal Title

      Symbiosis

      Volume: - Pages: in press

    • DOI

      10.1007/s13199-021-00766-4

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 新規ペプチド環化酵素PBP-type TEの発見と機能解析2021

    • Author(s)
      松田研一、脇本敏幸
    • Journal Title

      ファインケミカル

      Volume: - Pages: in press

  • [Journal Article] Total Synthesis and Structural Revision of Kasumigamide, and Identification of a New Analogue2020

    • Author(s)
      Kuranaga Takefumi、Matsuda Kenichi、Takaoka Masachika、Tachikawa Chisato、Sano Ayae、Itoh Kosei、Enomoto Ayumu、Fujita Kei、Abe Ikuro、Wakimoto Toshiyuki
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 21 Pages: 3329~3332

    • DOI

      10.1002/cbic.202000409

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Polyketides Biosynthesis in Marine Sponges of the Family Theonellidae2020

    • Author(s)
      Uria Agustinus R.、Wakimoto Toshiyuki
    • Journal Title

      Topics in Heterocyclic Chemistry

      Volume: - Pages: 1~25

    • DOI

      10.1007/7081_2020_48

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Heterochiral coupling in non-ribosomal peptide macrolactamization2020

    • Author(s)
      Matsuda Kenichi、Zhai Rui、Mori Takahiro、Kobayashi Masakazu、Sano Ayae、Abe Ikuro、Wakimoto Toshiyuki
    • Journal Title

      Nature Catalysis

      Volume: 3 Pages: 507~515

    • DOI

      10.1038/s41929-020-0456-7

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Discovery and functional analysis of a new peptide cyclase, PBP-type TE2021

    • Author(s)
      Wakimoto Toshiyuki
    • Organizer
      1st GSD/GI-CoRE国際シンポジウム
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 新規ペプチド環化酵素PBP-type TEの機能解析2021

    • Author(s)
      脇本敏幸
    • Organizer
      日本農芸化学会2021大会
    • Invited
  • [Presentation] 海洋生物活性天然物の生合成に関する研究2021

    • Author(s)
      脇本敏幸
    • Organizer
      日本薬学会第141年会
    • Invited
  • [Book] パートナー天然物化学(改訂第4版)2021

    • Author(s)
      海老塚 豊、森田 博史、阿部 郁朗、脇本 敏幸、他
    • Total Pages
      306
    • Publisher
      南江堂
    • ISBN
      978-4-524-40332-5
  • [Book] パートナー生薬学(改訂第4版)2021

    • Author(s)
      竹谷 孝一、木内 文之、小松 かつ子、脇本 敏幸、他
    • Total Pages
      458
    • Publisher
      南江堂
    • ISBN
      978-4-524-40342-4
  • [Remarks] 北海道大学大学院薬学研究院天然物化学研究室

    • URL

      https://www.pharm.hokudai.ac.jp/tennen/index.html

URL: 

Published: 2021-12-27  

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