Repertoire analysis of neo-self-recognizing receptors

2020 Fiscal Year Annual Research Report

• Project Area: Creation, function and structure of neo-self
• Project/Area Number: 16H06499
• Research Institution: University of Toyama
• Principal Investigator: 岸 裕幸 富山大学, 学術研究部医学系, 教授 (60186210)
• Project Period (FY): 2016-06-30 – 2021-03-31
• Keywords: ネオ・セルフ / レパートリー解析 / 単一細胞解析 / TCR / 抗体

Outline of Annual Research Achievements

2020年度，活性化された大腸癌浸潤リンパ球（TIL）より，標的抗原が未知の場合でも腫瘍特異的TCRを取得できることを示した。また、妊娠時の脱落膜中のCD8陽性T細胞のTCRレパトアおよびマーカーを解析し、妊娠初期および後期における異常妊娠におけるCD8陽性T細胞の役割について考察した。さらに，多くのTCRの腫瘍反応性を網羅的に解析する方法（cFIT法，TCR-TAP-Jurkat法）を開発した。cFIT法を応用し、妊娠時の脱落膜中の胎児抗原反応性TCRをCD8+ effector T細胞より取得し、現在抗原の解析を行っている。また、TCR-TAP-Jurkat法を用い、腫瘍浸潤CD8+ T細胞よりネオ抗原反応性TCRを同定できることを示した。さらに、以前に作製法を樹立したペプチド/HLA/β2ミクログロブリンの3分子をリンカーでつないだ単鎖三量体を抗原として，単一B細胞解析法（ISAAC法）を応用し、TCRと同じ様式でペプチド/HLA複合体を認識するTCR様抗体を取得できることを示した。また，単一細胞レベルでのTCRレパトア解析を用いて、CD8+ effector memory T細胞のクローナルな増殖やPD-1の発現低下が妊娠初期および後期の異常妊娠に関連することを示した。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Rapid and efficient generation of T-cell receptor-like antibodies using chip-based single-cell analysis. (2021)
  • Author(s): Ozawa T, Kobayashi E, Hamana H, Nakamura T, Lyu F, Hayashi A, Muraguchi A, Kishi H
  • Journal Title: Eur. J. Immunol. Volume: in press Pages: in press
  • DOI: 10.1002/eji.202049083
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The role of decidual regulatory T cells in the induction and maintenance of fetal antigen-specific tolerance: Imbalance between regulatory and cytotoxic T cells in pregnancy complications. (2021)
  • Author(s): Tsuda S, Nakashima A, Morita K, Shima T, Yoneda S, Kishi H, Saito S.
  • Journal Title: Human Immunology Volume: 82 Pages: 346-352
  • DOI: 10.1016/j.humimm.2021.01.019
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Evaluation of SARS-CoV-2 neutralizing antibodies using a vesicular stomatitis virus possessing SARS-CoV-2 spike protein. (2021)
  • Author(s): Tani H, Kimura M, Tan L, Yoshida Y, Ozawa T, Kishi H, Fukushi S, Saijo M, Sano K, Suzuki T, Kawasuji H, Ueno A, Miyajima Y, Fukui Y, Sakamaki I, Yamamoto Y, Morinaga Y
  • Journal Title: Virology Journal Volume: 18 Pages: 16
  • DOI: 10.1186/s12985-021-01490-7
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Characterization of pseudotyped vesicular stomatitis virus bearing the heartland virus envelope glycoprotein. (2021)
  • Author(s): Kimura M, Egawa K, Ozawa T, Kishi H, Shimojima M, Taniguchi S, Fukushi S, Fujii H, Yamada H, Tan L, Sano K, Katano H, Suzuki T, Morikawa S, Saijo M, Tani H.
  • Journal Title: Virology Volume: 556 Pages: 124-132
  • DOI: 10.1016/j.virol.2020.10.006
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Effect of porphyromonas gingivalis infection on gut dysbiosis and resultant arthritis exacerbation in mouse model. (2020)
  • Author(s): Hamamoto Y, Ouhara K, Munenaga S, Shoji M, Ozawa T, Hisatsune J, Kado I, Kajiya M, Matsuda S, Kawai T, Mizuno N, Fujita T, Hirata S, Tanimoto K, Nakayama K, Kishi H, Sugiyama E, Kurihara H.
  • Journal Title: Arthritis Res. Ther. Volume: 22 Pages: 249
  • DOI: 10.1186/s13075-020-02348-z
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Artificial T cell adaptor molecule-transduced TCR-T cells demonstrated improved proliferation only when transduced in a higher intensity. (2020)
  • Author(s): Sakai T, Terakura S, Miyao K, Okuno S, Adachi Y, Umemura K, Julamanee J, Watanabe K, Hamana H, Kishi H, Leitner J, Steinberger P, Nishida T, Murata M, Kiyoi H.
  • Journal Title: Mol. Ther. Oncolytics Volume: 18 Pages: 613-622
  • DOI: 10.1016/j.omto.2020.08.014.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Identification of a protective Leishmania antigen dihydrolipoyl dehydrogenase and its responding CD4+ T cells at clonal level. (2020)
  • Author(s): Mou Z, Barazandeh A, Hamana H, Kishi H, Zhang X, Jia P, Ikeogu N, Onyilagha C, Gupta G, Uzonna J.
  • Journal Title: J. Immunol Volume: 205 Pages: 1355-1364
  • DOI: 10.4049/jimmunol.2000338.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Physiologic target, molecular evolution, and pathogenic functions of a monoclonal anti-citrullinated protein antibody obtained from a patient with rheumatoid arthritis. (2020)
  • Author(s): Ozawa T, Ouhara K, Tsuda R, Munenaga S, Kurihara H, Kohno H, Hamana H, Kobayashi E, Taki H, Tobe K, Sugiyama E, Muraguchi A, Kishi H.
  • Journal Title: Arthritis & Rheumatology Volume: 72 Pages: 2040-2049
  • DOI: 10.1002/art.41426
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The suppressive effect on CD4 T-cell alloresponse against endothelial HLA-DR via PD-L1 induced by anti-A/B ligation. (2020)
  • Author(s): Iwasaki K, Hamana H, Kishi H, Yamamoto T, Hiramitsu T, Okada M, Tomosugi T, Takeda A, Narumi S, Watarai Y, Miwa Y, Okumura M, Matsuoka Y, Horimi K, Muraguchi A, Kobayashi T.
  • Journal Title: Clin. Exp. Immunol. Volume: 202 Pages: 249-261
  • DOI: 10.1111/cei.13482
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Analysis of TCR repertoire and PD-1 expression in decidual and peripheral CD8+ T cells reveals distinct immune mechanisms in miscarriage and preeclampsia. (2020)
  • Author(s): Morita K, Tsuda S, Kobayashi E, Hamana H, Tsuda K, Shima T, Nakashima A, Ushijima A, Kishi H, Saito S.
  • Journal Title: Front Immunol. Volume: 11 Pages: 1082
  • DOI: 10.3389/fimmu.2020.01082
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Relationship between T cell receptor clonotype and PD-1 expression of tumor-infiltrating lymphocytes in colorectal cancer. (2020)
  • Author(s): Sukegawa K, Shitaoka K, Hamana H, Kobayashi E, Miyahara Y, Fujii K, Tsuda K, Saeki S, Nagata T, Ozawa T, Saito S, Fujii T, Muraguchi A, Shiku H, Kishi H.
  • Journal Title: Eur. J. Immunol. Volume: 50 Pages: 1580-1590
  • DOI: 10.1002/eji.201948399
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Production of a rabbit monoclonal antibody for highly sensitive detection of citrus mosaic virus and related viruses. (2020)
  • Author(s): Miyoshi S, Tokunaga S, Ozawa T, Takeda H, Aono M, Miyoshi T, Kishi H, Muraguchi A, Shimizu S, Nozawa A, Sawasaki T.
  • Journal Title: PloS One Volume: 15 Pages: e0229196
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0229196
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Non-transmissible MV vector with segmented RNA genome establishes different types of iPSCs from hematopoietic cells. (2020)
  • Author(s): Hiramoto T, Tahara M, Liao J, Soda Y, Miura Y, Kurita R, Hamana H, Inoue K, Kohara H, Miyamoto S, Hijikata Y, Okano S, Yamaguchi Y, Oda Y, Ichiyanagi K, Toh H, Sasaki H, Kishi H, Ryo A, Muraguchi A, Takeda M, Tani K.
  • Journal Title: Mol. Ther. Volume: 28 Pages: 129-141
  • DOI: 10.1016/j.ymthe.2019.09.007
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] 大腸がん浸潤リンパ球におけるTCRクロノタイプとPD-1の発現 (2020)
  • Author(s): 岸 裕幸，下岡清美，小林栄治，宮原慶裕，津田 桂，佐伯しおり，長田拓哉，村口 篤，珠玖 洋
  • Organizer: 第79回日本癌学会学術総会
• [Presentation] ヒト大腸がん組織浸潤T細胞の腫瘍反応性とその認識抗原の解析 (2020)
  • Author(s): 宮原慶裕，山根真妃子，平糠和志，藤井啓介，問山裕二，北嶋貴仁，井上靖浩，浜名 洋，中村徳弘，井上正宏，岸 裕幸，珠玖 洋
  • Organizer: 第79回日本癌学会学術総会
• [Presentation] マウス難治性癌モデルにおける腫瘍抗原ペプチドワクチン療法と免疫チェックポイント阻害剤の併用療法の奏功 (2020)
  • Author(s): 上田翔平，入江 厚，千住 覚，伊藤甲雄，浜名 洋，小笠原康悦，岸 裕幸，江藤正俊，西村泰治
  • Organizer: 第79回日本癌学会学術総会
• [Presentation] マウス内在性ウィルスのエンベロープタンパク質由来の新しいエピトープの同定 (2020)
  • Author(s): 下岡清美，浜名 洋，保田朋波流，岸 裕幸
  • Organizer: 第79回日本癌学会学術総会
• [Presentation] Development of a novel tumor antigen-specific TCR cloning system using a microarray chip (2020)
  • Author(s): KOBAYASHI Eiji, OZAWA Tatsuhiko, HAMANA hiroshi, MURAGUCHI Atsushi, KISHI Hiroyuki
  • Organizer: 第24回日本がん免疫学会総会
• [Presentation] ISAAC法を用いたTCR様抗体の迅速作製とその応用 (2020)
  • Author(s): 小澤龍彦，小林栄治，浜名 洋，村口 篤，岸 裕幸
  • Organizer: 第24回日本がん免疫学会総会
• [Presentation] Jurkat細胞を用いたTCRのネオアンチゲン反応性解析 (2020)
  • Author(s): 浜名 洋，宮原慶裕，下岡清美，祐川健太，小林栄治，小澤龍彦，村口 篤，藤井 努，珠玖 洋，岸 裕幸
  • Organizer: 第24回日本がん免疫学会総会
• [Presentation] ヒト大腸がん浸潤T細胞中の腫瘍反応性T細胞とその認識抗原の解析 (2020)
  • Author(s): 宮原慶裕，山根真妃子，藤井啓介，問山裕二，北嶋貴仁，井上靖浩，浜名 洋，井上正宏，岸 裕幸，珠玖 洋
  • Organizer: 第24回日本がん免疫学会総会
• [Presentation] 正常妊娠と異常妊娠における脱落膜CD8+T細胞のTCRレパートリーとPD-1の発現についての検討 (2020)
  • Author(s): 森田恵子，津田さやか，小林栄治，浜名 洋，津田 桂，島 友子，中島彰俊，岸 裕幸，齋藤 滋
  • Organizer: 第28回日本胎盤学会学術集会
• [Presentation] 新規マラリアワクチン候補PfRiprにより誘導されるウサギモノクローナル抗体の評価 (2020)
  • Author(s): 徳永 聡，長岡ひかる，小澤龍彦，岸 裕幸，村口 篤，坪井敬文，高島英造，澤崎達也
  • Organizer: 第43回日本分子生物学会
• [Presentation] TCR-T細胞療法へ向けた単一T細胞解析 (2020)
  • Author(s): 岸 裕幸
  • Organizer: 第50回日本皮膚免疫アレルギー学会総会学術大会
  • Invited