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2018 Fiscal Year Annual Research Report

C4光合成を可能にしたプロトン駆動力制御の進化

Planned Research

Project AreaNew Photosynthesis : Reoptimization of the solar energy conversion system
Project/Area Number 16H06557
Research InstitutionKwansei Gakuin University

Principal Investigator

宗景 ゆり  関西学院大学, 理工学部, 准教授 (30423247)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 松田 祐介  関西学院大学, 理工学部, 教授 (30291975)
古本 強  龍谷大学, 農学部, 教授 (30313208)
Project Period (FY) 2016-06-30 – 2021-03-31
Keywords光合成制御
Outline of Annual Research Achievements

1.C4光合成におけるサイクリック電子伝達の機能の解明: CRISPER/Cas9によるゲノム編集技術を用いて、PGRL1またはNdhOのノックアウト株の作成を行い、gRNAのターゲット配列であるPGRL1に14bpのdeletionを、NdhOについては15bpのinsertionを確認した。また、C4種Flaveria NPQ7-RNAiノックダウン株の解析結果から、NPQ7は光化学系IIの非化学的消光(NPQ)だけでなく光化学系II複合体形成に関わる可能性が示唆された。
2.CP12-3によるC4代謝制御システムの解明: CP12-3機能抑制株と野生株それぞれからの抽出タンパク質において、PRK、MDHおよびGAPDHの複合体構成を2次元展開によって検討した。その結果、GAPDHの複合体構成に異常を見いだした。これはGAPDHがCP12-3と単独で結合しうることを示している。
Bass4機能抑制株の光合成を測定し、光合成がとても低くなることに加え、とくにこの傾向が弱光条件下で顕著なことがわかった。
3.無機炭素濃縮機構と連動したプロトン駆動力制御機能の解明: 海洋性珪藻2種、P. tricornutumおよびT. pseudonanaからBestrophin様膜タンパク質遺伝子を2つずつ単離し、GFP標識および免疫TEMによる局在決定を行った結果、これらがチラコイド膜因子であることが分かった。また、両珪藻からPyshell遺伝子をやはり2つずつ単離したが、それぞれ同一配列だった。この2種のPyshellの局在はピレノイドであり、またこの過剰発現とノックダウンは光合成の無機炭素親和性に大きな影響を与えることが分かった。一方、珪藻が有する葉緑体、細胞膜共局在型アクアポーリンが、CO2/NH3チャンネルとして働き、強光耐性をもたらすことが分かった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

1.CRISPER/Cas9によるゲノム編集技術を用いたノックアウト株の作成は順調に進展している。確認されたdeletionにより、PGRL1遺伝子にストップコドンが入ることが予測され、現在のヘテロ系統から、次世代においてホモ系統のノックアウト株を取得することが期待できる。NPQ7ノックダウン株の解析を進めることで光化学系II複合体形成に関わるシステムを解明することが期待できる。
2.BN-PAGE/SDS-PAGEの2次元電気泳動法によるタンパク質複合体構成の調査手法を確立し、CP12-3機能抑制株と野生株それぞれから抽出したタンパク質に適用することで、PRK、MDHおよびGAPDHの挙動の変化を調査した。その結果、GAPDHの複合体構成に異常を見いだした。これはGAPDHがCP12-3と単独で結合しうることを示している。
Bass4機能抑制株の光合成を測定し、光合成が20%程度まで低くなることに加え、とくにこの傾向が弱光条件下で顕著なことがわかった。高光量においてわずかに光合成活性が見いだされた。Bass4を介さない物質輸送とBass4を解する物質輸送の二つが存在し、Bass4依存的な回路が主として働くことと介さない回路が高光量領域で機能する可能性を示唆する。
3.これまで見つかっている重要因子の単離と局在解析は順調に進んでいる。また、RNA干渉による特異的発現抑制も結果が出始めている。CRISPR/Cas9およびTALEN法によるゲノム編集株が得られ始めているほか、CRSPR/Cas9nickaseを使ったより特異性の高いDNAダブルカットによるゲノム編集に使用の目途が立った。

Strategy for Future Research Activity

1.C4光合成におけるサイクリック電子伝達の機能の解明: CRISPER/Cas9ゲノム編集技術を用いて作成した株は、ヘテロでの遺伝子deletionまたはinsertionが確認されているため、次世代でホモ系統を選抜する。さらにこれらを用いて、細胞特異的プロモーターにより細胞特異的に遺伝子発現を相補した系統を作成し、葉肉細胞または維管束鞘細胞それぞれにおけるサイクリック電子伝達の重要性を明らかにする。
また、引き続きC4種Flaveria NPQ7-RNAiノックダウン株の解析を進める。
2.CP12-3によるC4代謝制御システムの解明: GAPDHとCP12-3がin vitroで結合することを示す再構成実験を行う。GAPDHはA2B2複合体を構成するうえに、葉肉細胞と維管束鞘細胞のそれぞれの細胞に発現する。CP12-3との結合は、CP12-3が局在する維管束鞘細胞葉緑体で起こっていると推定されるので、(1)維管束鞘細胞葉緑体で機能するGAPDH分子種をまず特定し、ついで(2)in vitroでの複合体再構成実験を行う。Bass2が60kDaの2量体のサイズを示した一方で、Bass4が240kDaの大きな複合体を構成すると推定された。この複合体組成を確認する。
3.無機炭素濃縮機構と連動したプロトン駆動力制御機能の解明: BestおよびPyshell等の重要因子の機能決定を行うとともに、これらに相互作用する因子、および新奇ピレノイド因子の探索と単離、機能決定を行い、無機炭素濃縮とプロトン駆動力制御の関りを解明する。

  • Research Products

    (27 results)

All 2019 2018

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (23 results) (of which Int'l Joint Research: 15 results,  Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Cross‐compartment metabolic coupling enables flexible photoprotective mechanisms in the diatom Phaeodactylum tricornutum2019

    • Author(s)
      Broddrick Jared T.、Du Niu、Smith Sarah R.、Tsuji Yoshinori、Jallet Denis、Ware Maxwell A.、Peers Graham、Matsuda Yusuke、Dupont Chris L.、Mitchell B. Greg、Palsson Bernhard O.、Allen Andrew E.
    • Journal Title

      New Phytologist

      Volume: 222 Pages: 1364~1379

    • DOI

      10.1111/nph.15685

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Uncovering the hidden world of the Molecular Life of Diatoms2019

    • Author(s)
      Tsuji Yoshinori、Matsuda Yusuke
    • Journal Title

      Perspectives in Phycology

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1127/pip/2019/0087

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Comparative analysis of strategies to prepare electron sinks in aquatic photoautotrophs2018

    • Author(s)
      Shimakawa Ginga、Murakami Akio、Niwa Kyosuke、Matsuda Yusuke、Wada Ayumi、Miyake Chikahiro
    • Journal Title

      Photosynthesis Research

      Volume: 139 Pages: 401~411

    • DOI

      10.1007/s11120-018-0522-z

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Plasma-membrane-type aquaporins from marine diatoms function as CO2/NH3 channels and provide photoprotection2018

    • Author(s)
      Matsui Hiroaki、Hopkinson Brian、Nakajima Kensuke、Matsuda Yusuke
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 178 Pages: 345~357

    • DOI

      10.1104/pp.18.00453

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Contribution of cyclic electron flow around photosystem I to C4 photosynthesis in Flaveria bidentis2018

    • Author(s)
      Takako Ogawa, Kana Kobayashi, Yukimi Taniguchi and Yuri Munekage
    • Organizer
      Japan-Finland Seminar 2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Role of cyclic electron transport around photosystem I in C4 Flaveria bidentis2018

    • Author(s)
      Yuri N. Munekage
    • Organizer
      Japan-Finland Seminar 2018
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] C4-photosynthetic caracters in F2 hybrids between Flaveria floridana (C3-C4) and Flaveria brownii (C4-like)2018

    • Author(s)
      Yukimi Y. Taniguchi, Yuri N. Munekage
    • Organizer
      Japan-Finland Seminar 2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] NDH-dependent cyclic electron flow around photosystem I has a greater role in C4 photosynthesis than PGR5/PGRL1-dependent one in Flaveria bidentis.2018

    • Author(s)
      Takako Ogawa, Kana Kobayashi, Yukimi Taniguchi and Yuri Munekage
    • Organizer
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] C4光合成における循環的電子伝達の役割2018

    • Author(s)
      小川敬子、小林加奈、谷口幸美、宗景ゆり
    • Organizer
      第60回日本植物生理学会年会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Electron transport and energy production in chloroplasts of NADP-ME type C4 plants2018

    • Author(s)
      Yuri N. Munekage, Takako Ogawa, Yukimi Y. Taniguchi
    • Organizer
      第60回日本植物生理学会年会国際シンポジウム
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 海洋性珪藻ピレノイドにおけるCCMと光化学系機能連携の解明2018

    • Author(s)
      天野凌輔、山岸寛征、菊谷早絵、辻敬典、松田祐介
    • Organizer
      第9回光合成学会年会
  • [Presentation] Structure and function of new pyrenoidal components in marine diatoms2018

    • Author(s)
      Yusuke Matsuda
    • Organizer
      SEB Florence
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 海洋性珪藻ピレノイドにおけるCCMと光化学系機能連携解明2018

    • Author(s)
      天野凌輔、山岸寛征、菊谷早絵、辻敬典、松田祐介
    • Organizer
      日本植物学会第82回大会
  • [Presentation] 海洋性珪藻における葉緑体四重包膜のイオン濃度勾配解析技術の開発2018

    • Author(s)
      屋代愛美、辻敬典、松田祐介
    • Organizer
      日本植物学会第82回大会
  • [Presentation] 海洋性珪藻Thalassiosira pseudonanaにおけるcAMP依存的なCO2センシング機構の解明2018

    • Author(s)
      清水由紀、中川真佑、斎藤健人、中島健介、辻敬典、松田祐介
    • Organizer
      日本植物学会第82回大会
  • [Presentation] Molecular aspects of CO2 concentrating mechanism in marine diatoms.2018

    • Author(s)
      Yusuke Matsuda
    • Organizer
      Japan-Finland Seminar 2018
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Function of Tylakoidal anion transporters in the marine diatom Thlassiosira pseudonana2018

    • Author(s)
      Ryousuke Amano, Yusuke Matsuda
    • Organizer
      Japan-Finland Seminar 2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Function of Tylakoidal anion transporters in the marine diatom Phaeodactylum tricornutum.2018

    • Author(s)
      Kansei Yamagishi, Yusuke Matsuda
    • Organizer
      Japan-Finland Seminar 2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Revealing new structures and functions of the aquatic chloroplast bundling the photosystem and the CO2-concentrating mechanism.2018

    • Author(s)
      Yusuke Matsuda, Yoshinori Tsuji, Sae Kikutani, Ryosuke Ohkubo, Natsumi Morishima
    • Organizer
      International Symposium on Photosynthesis and chloroplast biogenesis.
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Plasma membrane type aquaporins function as CO2 or NH3 channels for photoprotection in marine diatom2018

    • Author(s)
      Hiroaki Matsui, Brian M Hopkinson, Kensuke Nakajima, Yusuke Matsuda
    • Organizer
      International Symposium on Photosynthesis and chloroplast biogenesis.
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification of new molecular components suppoting active carbon fixation by marine diatoms2018

    • Author(s)
      Yoshinori Tsuji, Natsumi Morishima, Ryosuke Okubo, Sae Kikutani, Yusuke Matsuda
    • Organizer
      International Symposium on Photosynthesis and chloroplast biogenesis.
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The role of stromal localized θ-carbonic anhydrase on photosynthesis in marine diatom2018

    • Author(s)
      Hermanus Nawaly, Yoshinori Tsuji, Atsuko Tanaka, Yusuke Matsuda
    • Organizer
      International Symposium on Photosynthesis and chloroplast biogenesis.
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Study on cAMP-dependent CO2 response mechanism in the marine diatom Phaeodactylum tricornutum2018

    • Author(s)
      Mayu Nakagawa, Kento Saito, Kensuke Nakajima, Yusuke Matsuda
    • Organizer
      International Symposium on Photosynthesis and chloroplast biogenesis
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 珪藻殻への有用タンパク質提示発現による機能性材料開発2018

    • Author(s)
      大西菜月、中島健介、辻敬典、松田祐介
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] 海洋性珪藻ピレノイドにおけるCCMと光化学系機能連携の解明2018

    • Author(s)
      天野凌輔,辻敬典,松田祐介
    • Organizer
      第60回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] Characterization of phosphate uptake mechanism in marine diatoms2018

    • Author(s)
      Kanako Maeda, Nanae Kimura, Yohei Fukuchi, Toshiki Sugiyama, Kensuke Nakajima, Yoshinori Tsuji, Yusuke Matsuda
    • Organizer
      第60回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] Optimum integration of C4 cycle into Calvin-Benson cycle2018

    • Author(s)
      Tsuyoshi Furumoto
    • Organizer
      第60回日本植物生理学会年会シンポジウム
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2019-12-27  

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