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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Metabolic adaptation of type 2 diabetes

Planned Research

Project AreaTransomic Analysis of Metabolic Adaptation
Project/Area Number 17H06300
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

黒田 真也  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (50273850)

Project Period (FY) 2017-06-30 – 2022-03-31
Keywordsトランスオミクス / 2型糖尿病
Outline of Annual Research Achievements

申請者らは、2型糖尿病の代謝アダプテーションの解析における基盤技術として、トランスオミクスを測る、繋ぐ、読み解く解析手法の確立を行った(川田ら、Genes Cells, 2018)。ラット肝がん由来のFAO細胞にインスリン刺激を施し、細胞から抽出したリン酸化タンパク質についてリン酸化プロテオームにより網羅的に取得した(トランスオミクスを測る)。またこれらの網羅的データからインスリン刺激に対して変動するリン酸化たんぱく質のネットワークを明らかにした。
また、これに先行してヒトの血中ホルモンやメタボロームデータの時系列データの解析も行った(藤井ら、NPJ Syst. Biol. Appl. 2019)。これにより生体はグルコースに対して感受性や時定数などを用いてフレキシブルに全身の糖代謝を制御することが明らかとなった
さらに、野生型(WT)マウスと肥満マウスであるレプチン欠損マウスob/obマウスに経口グルコース負荷を行い、肝臓でのメタボローム解析・トランスクリプトーム解析・シグナル分子の大規模時系列データを測定した。糖に対して増加あるいは減少する糖応用分子を定義して、それぞれの階層で糖応答分子を大規模に同定した。さらに経路データベースと組合せることにより、野生型マウス及び肥満マウスob/obマウスの肝臓の糖応答代謝反応の制御トランスオミクスネットワークの構築を開始した。これにより個体レベルで初めてトランスオミクスを測る、繋ぐが可能となった。なお、今回の予備的な解析によりトランスオミクス解析により、WTマウスとob/obマウスの肝臓では代謝制御の方法が大きく異なることが明らかとなった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の計画は順調に進んでおり、期待通りの成果が得られている。

Strategy for Future Research Activity

正常と肥満モデルマウスを用いて個体レベルでの2型糖尿病の代謝アダプテーションの解析を行いつつある。通常のグルコースに加えて、13Cで標識したグルコースによる経口糖負荷を行い、肝臓、筋肉、脂肪組織などでのフラックス解析も行う。糖負荷後の肝臓・筋肉・脂肪組織・血液などの代謝物の同位体計測を行い、数理モデルを用いて臓器内・臓器間の代謝フラックスの時間変化を推定する。このフラックスデータを、他の階層と統合するネットワークインテグレーション技術も開発する。これにより、各代謝フラックスの制御メカニズムを明らかにするとともに、血中代謝物濃度を制御している反応を同定する。さらに、野生型および肥満モデルマウスの解析結果を比較し、肥満に伴う代謝異常をフラックスとその制御の観点から解明する。

  • Research Products

    (3 results)

All 2019 2018

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Funded Workshop (1 results)

  • [Journal Article] Logical design of oral glucose ingestion pattern minimizing blood glucose in humans2019

    • Author(s)
      Fujii Masashi、Murakami Yohei、Karasawa Yasuaki、Sumitomo Yohei、Fujita Suguru、Koyama Masanori、Uda Shinsuke、Kubota Hiroyuki、Inoue Hiroshi、Konishi Katsumi、Oba Shigeyuki、Ishii Shin、Kuroda Shinya
    • Journal Title

      npj Systems Biology and Applications

      Volume: 5 Pages: 31

    • DOI

      doi:10.1038/s41540-019-0108-1

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reconstruction of global regulatory network from signaling to cellular functions using phosphoproteomic data2018

    • Author(s)
      Kawata Kentaro、Yugi Katsuyuki、Hatano Atsushi、Kokaji Toshiya、Tomizawa Yoko、Fujii Masashi、Uda Shinsuke、Kubota Hiroyuki、Matsumoto Masaki、Nakayama Keiichi I.、Kuroda Shinya
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 24 Pages: 82-93

    • DOI

      doi:10.1111/gtc.12655

    • Peer Reviewed
  • [Funded Workshop] 2nd international symposium for trans-omics2018

URL: 

Published: 2021-01-27  

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