2018 Fiscal Year Annual Research Report
網羅的3次元観察技術による細胞のダイバーシティー検証
| Project Area | Integrated analysis and regulation of cellular diversity |
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| Project/Area Number |
17H06328
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
洲崎 悦生 東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 講師 (10444803)
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| Project Period (FY) |
2017-06-30 – 2022-03-31
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| Keywords | 細胞・組織 / イメージング / 組織透明化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
CUBIC技術における種々のラベリング手法およびイメージング法の検証(前年度よりの継続計画)：透明化した組織から生物学的に意味のある情報を抽出するためには、研究目的に応じた細胞ラベリング法とイメージング法の組み合わせが必須となる。この目的のため、これまでに部分的な検証が進んでいる種々の遺伝学的手法、ウイルスベクター、組織化学的染色等の各種ラベリング手法を本領域内で使用する様々な検体に適用し、CUBIC技術とのコンパチビリティや各ラベル法の最適条件の検証を昨年度に引き続き進めた。ウイルスベクターについては実施場所にて組織中にインジェクションするための設備がすでに導入済みであり、要望や目的に応じてラベリングを施行する体制を整えた。組織学的染色については3次元的に染色する方法をすでにテストしていたため(Susaki et al. Cell 2014; Tainaka et al. Cell 2014)、マウス全腎臓に対して適応し、様々な構造の3次元的可視化に成功した（Hasegawa et al. Kidney int. 2019）。さらに、染色剤や抗体の組織内浸透原理の解明を鋭意進め、プロトコルへの落とし込みを完了させた。また、1600化合物のスクリーニング結果から透明化試薬の大幅なアップデートに成功し、骨組織や成体マーモセット脳など、これまで適用が困難だったサンプルへの拡張を進めた。（Tainaka et al. Cell Rep. 2018)。これらの新しい試薬の適用について、領域内でCUBICの利用を促進するための技術講習やコンサルティング等の支援を実施し、一部のアクティビティに関しては領域内の共同研究体制をとった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
大まかに研究計画に沿った形で研究が進行し、共同研究を含めた論文化も進みつつあるため、概ね順調な推移と判断した。
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| Strategy for Future Research Activity |
CUBIC技術における種々のラベリング手法およびイメージング法の検証(前年度よりの継続計画): 透明化した組織から生物学的に意味のある情報を抽出するための、これまで検証が進んでいる種々の遺伝学的手法、ウイルスベクター、組織化学的染色等の各種ラベリング手法を本領域内で使用するオルガノイド、動物発生胚 、昆虫等の様々な検体に適用し、CUBIC技術とのコンパチビリティや各ラベル法の最適条件の検証を昨年度に引き続き進める。これら多種類のラベリング法を導入することで、各ラベリング法の利点・欠点をうまく相補させるとともに、領域内で対象となる多様な検体に対応できる、安定的な技術基盤の確立を目指す。また、取得した3 次元画像から生物学的情報を抽出する目的のため、ラベルされた細胞や解剖学的構造を抽出(セグメンテーション)し定量解析するのに必要な 種々の画像解析法を適応し検討する。
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Research Products
(25 results)
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[Journal Article] Novel 3D analysis using optical tissue clearing documents the evolution of murine rapidly progressive glomerulonephritis2019
Author(s)
Puelles VG, Fleck D, Ortz L, Papadouri S, Thiago T, Boehner A, van der Wolde JW, Vogt M, Saritas T, Kuppe C, Fuss A, Menzel S, Klinkhammer BM, Mller-Newen G, Heymann F, Decker L, Braun F, Kretz O, Huber TB, Susaki EA, Ueda HR, et al.
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Journal Title
Kidney international
Volume: AOP
Pages: AOP
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Chemical Landscape for Tissue Clearing Based on Hydrophilic Reagents.2018
Author(s)
Tainaka K, Murakami TC, Susaki EA, Shimizu C, Saito R, Takahashi K, Hayashi-Takagi A, Sekiya H, Arima Y, Nojima S, Ikemura M, Ushiku T, Shimizu Y, Murakami M, Tanaka KF, Iino M, Kasai H, Sasaoka T, Kobayashi K, Miyazono K, Morii E, Isa T, Fukayama M, Kakita A, Ueda HR
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Journal Title
Cell reports
Volume: 24
Pages: 2196-2210
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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