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2018 Fiscal Year Annual Research Report

Inflammation cellular society in pulmonary fibrosis

Planned Research

Project AreaPreventive medicine through inflammation cellular sociology
Project/Area Number 17H06392
Research InstitutionTokyo University of Science

Principal Investigator

松島 綱治  東京理科大学, 研究推進機構生命医科学研究所, 教授 (50222427)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 橋本 真一  金沢大学, 医薬保健学総合研究科, 特任教授 (00313099)
上羽 悟史  東京理科大学, 研究推進機構生命医科学研究所, 准教授 (00447385)
七野 成之  東京理科大学, 研究推進機構生命医科学研究所, 助教 (70822435)
Project Period (FY) 2017-06-30 – 2022-03-31
Keywords免疫学 / 遺伝子 / 病理学 / モデル化 / 情報工学
Outline of Annual Research Achievements

肺線維症における肺の構造破壊は、線維芽細胞、上皮細胞、内皮細胞、マクロファージなど様々な細胞種の相互作用によって調節されていると考えられているが、その実態は不明なままである。我々は、組織中の数千~数万の各1細胞のトランスクリプトームを、高感度、高効率に解析可能な、新規シングルセルトランスクリプトーム法の開発に成功した(特許申請中)。本法を用い、ブレオマイシン誘導肺線維化モデルの経時的解析(day0,3,7,10)を実施し、合計20802個の細胞を解析した。その結果、ILC2や中皮細胞、plasmacytoid DCといったマイナーな細胞集団を含む、様々な細胞集団が同定された。存在頻度の多い細胞集団中におけるpseudotime analysisを用いた細胞活性化系譜の再構成により、リンパ球よりも、線維芽細胞・マクロファージ・上皮細胞・内皮細胞のほうが、ブレオマイシン傷害にともないより顕著に性質変動していることが見出された。細胞外分子―膜表面レセプター関係に基づく、線維芽細胞・マクロファージ・上皮細胞・内皮細胞間の相互作用を、シングルセルトランスクリプトームデータより再構成したところ、day7-day10にかけて結びつきの強い相互作用ネットワークの種類が増加し、TGF-betaを中心とするネットワークはday 7より現れること、そのネットワークにはVEGFもまた所属していることが明らかとなった。また、ブレオマイシン傷害の早期からそのサイズを減少させる相互作用ネットワークとしてDcnを中心とした線維芽細胞ネットワークがあることを見出し、実際にDcnを過剰発現させた線維芽細胞の予防的投与により、ブレオマイシン誘導肺線維症が抑制されることが見出された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

平成30年度は、新規技術開発に伴う、本計画研究のシングルセルトランスクリプトーム技術の大幅な進歩があり、ブレオマイシン誘導肺線維症における極めてマイナーな細胞集団の同定に成功し、また時系列解析によりそれら細胞も含めた形での細胞間相互作用ネットワークのin silico再構性に成功した。そのなかで、既存の肺線維症治療薬ニンテダニブの標的分子と同一のネットワーク内に、線維化進展で重要な位置を占めるTGF-betaがあることがわかり、今までにない側面から治療効果のメカニズムを示唆するものであると考えている。さらに、経時的にそのサイズを小さくする細胞ネットワークの中心分子の一つとしてDcnを同定した。実際に、Dcnは一部の肺線維芽細胞で特異的に発現しており、Dcnノックインマウスにより、その空間的分布は気道および気管支周辺に限局していることが見出された。Dcnのブレオマイシン誘導肺線維症における生理的意義・および予防標的となりうる可能性を検証するため、Dcnを過剰発現させた線維芽細胞を経気道的に養子移入すると、肺線維症の進展が抑制された。このことより、Dcnを増加させることは、新たな線維化進展の予防標的たりうる可能性が示唆された。
細胞間相互作用ネットワークの検証をすすめるため、H30年度は肺細胞を用いた3次元オルガノイド系の確立を実施した。既存の線維芽細胞-上皮細胞の共培養系だけでなく、経時的な細胞間相互作用解析により、肺上皮細胞でのみスフィロイドを形成させ、継代も可能な新規培養系の確立に成功した。本培養系は、マウス細胞だけでなく、ヒトの初代培養肺上皮細胞でも可能であることも見出した。
H30年度はさらに、奈良県立医科大学との共同研究により、ヒトの線維化肺の手術検体におけるシングルセルトランスクリプトーム解析も実施し、線維化の強弱に伴う炎症細胞社会の相違の解析にも成功した。

Strategy for Future Research Activity

H31年度は、新たに見出したDcnという肺線維症予防標的につき、それがブレオマイシン誘導肺線維症における炎症細胞社会に対する影響を、Dcn-GFP/Cre x STOP-DTRマウスを用いたりすることで、標的細胞、および個々の細胞におけるシグナルの変化の観点から細胞・分子レベルで解明する。また、マクロファージやT/B細胞欠損マウスに関してもシングルセルトランスクリプトーム解析を行い、in silicoでの細胞depletionと比較することで、炎症細胞社会変化の予測モデルを作出する。上記モデルにより予測された、鍵となる細胞間相互作用をつかさどる分子につき、その上皮細胞・線維芽細胞への影響を、H30に作出した新規3D organoid系を用いて検証する。複数の肺線維症臨床検体の、線維化の強弱や疾患背景の相違に基づく炎症細胞社会の変化を解析し、上記モデルとの共通点・差異から、低分子などで介入可能な複合的新規予防標的をさらに探索し、マウスモデルで検証する。加えて、新規肺線維症自然発症モデルとして、ヒトの家族性間質性肺炎で頻繁に認められるSFTPC点変異マウスを作出し、炎症や線維化が顕著でない、「未病」状態の細胞社会の変化を解析する。
また、同定された炎症細胞社会クラスターにつき、その病変部位における空間的配置を、蛍光in situ hybridizationやマスサイトメトリーなどにより検証し、病態進行の前線なのか否かを明らかとする。

  • Research Products

    (15 results)

All 2019 2018 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (4 results)

  • [Journal Article] Engraftment and proliferation potential of embryonic lung tissue cells in irradiated mice with emphysema2019

    • Author(s)
      Shiraishi Kazushige、Shichino Shigeyuki、Tsukui Tatsuya、Hashimoto Shinichi、Ueha Satoshi、Matsushima Kouji
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Pages: 1-12

    • DOI

      https://doi.org/10.1038/s41598-019-40237-x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mesenchymal-Epithelial Interactome Analysis Reveals Essential Factors Required for Fibroblast-Free Alveolosphere Formation2019

    • Author(s)
      Shiraishi Kazushige、Shichino Shigeyuki、Ueha Satoshi、Nakajima Takuya、Hashimoto Shinichi、Yamazaki Satoshi、Matsushima Kouji
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 11 Pages: 318~333

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.isci.2018.12.022

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Transcriptome network analysis identifies protective role of the LXR/SREBP-1c axis in murine pulmonary fibrosis2019

    • Author(s)
      Shichino Shigeyuki、Ueha Satoshi、Hashimoto Shinichi、Otsuji Mikiya、Abe Jun、Tsukui Tatsuya、Deshimaru Shungo、Nakajima Takuya、Kosugi-Kanaya Mizuha、Shand Francis H.W.、Inagaki Yutaka、Shimano Hitoshi、Matsushima Kouji
    • Journal Title

      JCI Insight

      Volume: 4 Pages: 1-19

    • DOI

      https://doi.org/10.1172/jci.insight.122163

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Lung fibroblasts express a miR-19a-19b-20a sub-cluster to suppress TGF-β-associated fibroblast activation in murine pulmonary fibrosis2018

    • Author(s)
      Souma Kunihiko、Shichino Shigeyuki、Hashimoto Shinichi、Ueha Satoshi、Tsukui Tatsuya、Nakajima Takuya、Suzuki Hiroshi I.、Shand Francis H. W.、Inagaki Yutaka、Nagase Takahide、Matsushima Kouji
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Pages: 1-14

    • DOI

      https://doi.org/10.1038/s41598-018-34839-0

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 20.ブレオマイシン誘導マウス肺線維症モデルにおける経時的1細胞トランスクリプトーム解析2019

    • Author(s)
      七野成之, 橋本真一, 上羽悟史, 松島綱治
    • Organizer
      第18回分子予防環境医学研究会大会
  • [Presentation] 21.マウス肺線維症モデルへの移入ルートおよびドナーによる移入効率と治療効果の解析2019

    • Author(s)
      中島拓弥, 七野成之, 上羽悟史, 松島綱治
    • Organizer
      第18回分子予防環境医学研究会大会
  • [Presentation] 7.マウス肺線維症モデルへの間葉系幹細胞の移入ルートおよびドナーによる移入効率と治療効果の解析2018

    • Author(s)
      中島拓弥, 七野成之, 上羽悟史, 松島綱治
    • Organizer
      第39回日本炎症・再生医学会
  • [Presentation] 10.Single-cell transcriptomeによるマウス線維化肺のサイト カイン・ケモカイン発現プロファイルの解明2018

    • Author(s)
      七野成之, 橋本真一, 上羽悟史, 松島綱治
    • Organizer
      第83回日本インターフェロン・サイトカイン学会学術集会
  • [Presentation] 16.Single-cell transcriptome identifies cytokine/chemokine expression signatures of lung cell subsets in murine pulmonary fibrosis2018

    • Author(s)
      Shigeyuki Shichino, Shin-ichi Hashimoto, Satoshi Ueha, Kouji Matsushima
    • Organizer
      第47回日本免疫学会学術集会
  • [Presentation] Engraftment and proliferation potential of embryonic lung tissue cells in irradiated mice with emphysema.2018

    • Author(s)
      Kazushige Shiraishi, Shigeyuki Shichino, Satoshi Ueha, Kouji Matsushima
    • Organizer
      International Society for Stem Cell Research (ISSCR) 2018 Annual Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Transcriptome analysis of lung epithelial cells and fibroblasts during alveologenesis revealed fibroblast-epithelial interactions and key regulators of alveolar epithelial cells type 2.2018

    • Author(s)
      Kazushige Shiraishi, Shigeyuki Shichino, Satoshi Ueha, Kouji Matsushima.
    • Organizer
      Joint Annual Meeting of Japanese Society of Developmental Biologists (JSDB) 51st and Japan Society for Cell Biology (JSCB) 70th
  • [Remarks] 当研究室 白石 一茂さんの論文がScientific Reports誌に掲載されました。

    • URL

      https://k-matsushimalab.org/2019/03/07/

  • [Remarks] 当研究室 七野助教の論文がJCI Insight誌に掲載されました。

    • URL

      https://k-matsushimalab.org/2019/01/10/

  • [Remarks] 当研究室 白石 一茂さんの論文がiScience誌に掲載されました。

    • URL

      https://k-matsushimalab.org/2018/12/26/

  • [Remarks] 当研究室の外研生 相馬さんの論文がScientific Reports誌に掲載されました。

    • URL

      https://k-matsushimalab.org/2018/11/09/

URL: 

Published: 2022-12-28  

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