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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Chemical communications in microbial interactions and development of useful bioactive ligands

Planned Research

Project AreaFrontier research of chemical communications
Project/Area Number 17H06401
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

掛谷 秀昭  京都大学, 薬学研究科, 教授 (00270596)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 井本 正哉  慶應義塾大学, 理工学部(矢上), 教授 (60213253)
西村 慎一  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 講師 (30415260)
Project Period (FY) 2017-06-30 – 2022-03-31
Keywords化学コミュニケーション / 天然物化学 / 複合培養 / 生物活性リガンド / 生合成
Outline of Annual Research Achievements

微生物が産生する二次代謝産物は、歴史上、有用なケミカルツール分子や創薬シーズになっている。しかし、これら二次代謝産物の本来の化学コミュニケーションに基づいた生物学的意義はほとんど解明されていない。そこで、本研究代表者らが見出した新規抗生物質5aTHQs及びSTAMsを生産可能な放線菌Streptomyces sp. HEK616とTsukamurella pulmonis TP-0596の複合培養系に加えて、複数の有用な複合培養系を確立した。また、5aTHQ類の活性体・不活性体の混合物の生物活性発現機構を明らかにすることができ、これら5aTHQ類は新しいタイプの細胞膜シグナル制御物質であることが示唆された。一方、熱ショック代謝産物(HSMs)として、angucyclin-type化合物や新規化合物murecholamideなどを含む14種類の同定に成功した。
さらに、従来のMarfey法と比較して、より温和な加水分解条件下で生成する極微量のアミノ酸や化学コミュニケーション分子でも検出可能な新規ラベル化剤の開発に成功した。一方、領域内連携を活用して、引き続き、ベルコペプチンの細胞内化学シグナルの解析のためのプローブ合成およびケミカルプロテオミクス解析を行うとともに、β-カテニン遺伝子活性型変異がん細胞選択的アポトーシスを誘導するリガンドとしてのmiclxinを見出し、詳細な作用機序を明らかにした。さらに、ショウガ科ウコン由来のポリフェノール化合物であるクルクミンのプロドラッグ型水溶性化合物CMGの治療抵抗性大腸がん細胞株における抗がん作用のメカニズムを明らかにした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

微生物間化学コミュニケーションの理解に有用な微生物の複合培養系のモデル系として、Streptomyces sp. HEK616とTsukamurella pulmonis TP-0596の系に加えて、新たに複数の有用な複合培養系を確立できたとともに、14種類のHSMsの同定に成功した。さらに、5aTHQ類の活性体・不活性体の混合物の生物活性発現機構を明らかにできた。また、極微量の化学コミュニケーション分子を探索・同定するための高感度ラベル化剤の開発に成功した。一方、有用生物活性リガンドの開拓研究においても、β-カテニン遺伝子活性型変異がん細胞選択的アポトーシス誘導剤miclxinや革新的プロドラッグ型抗がん剤CMGの開発や作用機序解明に成功した。

Strategy for Future Research Activity

引き続き、下記の研究項目を設定し本研究課題を遂行する。
項目1:微生物間化学コミュニケーションの解析研究
引き続き、Tsukamurella pulmonis TP-0596と当研究室保有の放線菌ライブラリーの複合培養系を試み、新規化合物生産系を確立し、生産メカニズムや生物活性発現機構の解析を行う。また、耐熱性放線菌が生産する熱ショック代謝産物(HSM)の生産メカニズムや生物活性発現機構解析を行うとともに、ベルコペプチン等の生合成経路の解析などを行う。
項目2:有用生物活性リガンドの開拓研究
ベルコペプチンなどの生合成解析研究および全合成研究などにより、分子プローブ創製研究を行うとともに、細胞内化学シグナルの解析を行う。また、β-カテニン活性変異がんやがん幹細胞を標的として、領域内リソースなどを活用して、有用生物活性リガンドの探索研究を行う。さらに、プロドラッグ型水溶性化合物CMGの希少疾患における薬効解析などを行う。

Remarks

(1)は、本研究代表者の主宰研究室ホームページ

  • Research Products

    (35 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (13 results) (of which Peer Reviewed: 13 results,  Open Access: 1 results) Presentation (15 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 11 results) Book (1 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Int'l Joint Research] トロント大学(カナダ)

    • Country Name
      CANADA
    • Counterpart Institution
      トロント大学
  • [Int'l Joint Research] スイス連邦工科大学(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      スイス連邦工科大学
  • [Int'l Joint Research] プリンストン大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      プリンストン大学
  • [Int'l Joint Research] ライプニッツ天然有機化合物研究所(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      ライプニッツ天然有機化合物研究所
  • [Journal Article] Thioamycolamides A-E, Sulfur-Containing Cycliclipopeptides Produced by the Rare Actinomycete Amycolatopsis sp.2020

    • Author(s)
      Pan, C., Kuranaga, T., Liu, C., Lu, S., Shinzato, N., Kakeya, H.
    • Journal Title

      Org. Lett.

      Volume: 22 Pages: 3014-3017

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.0c00776

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Serinr catabolism produce ROS, sensitizes cells to actin dysfunction, and suppresses cell growth in fission yeast.2020

    • Author(s)
      Kanou, A., Nishimura, S., Tabuchi, T., Matsuyama, A., Yoshida, M., Kato, T., Kakeya, H.
    • Journal Title

      J. Antibiot.

      Volume: 73 Pages: 574-580

    • DOI

      10.1038/s41429-020-0305-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Different localization of lysosomal-associated membrane protein 1(LAMP1) in mammalian cultured cell lines.2020

    • Author(s)
      Baba, K., Kuwada, S., Nakao, A., Li, X., Okuda, A., Nishida, A., Matsuda, S., Fukuoka, N., Kakeya, H., Kataoka, T.
    • Journal Title

      Histochem. Cell. Biol.

      Volume: 153 Pages: 199-213

    • DOI

      10.1007/s00418-019-01842-z

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Curcumin beta-D-glucuronide (CMG) exhibits anti-tumor effects on oxaliplatin-resistant colon cancer with less toxicity.2020

    • Author(s)
      Ozawa-Umeta, H., Kishimoto, A., Imaizumi, A., Hashimoto, T., Kakeya, H., Kanai, M.
    • Journal Title

      Cancer Sci.

      Volume: 111 Pages: in press

    • DOI

      10.1111/cas.14383

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Total synthesis and antimicrobial activity of tumescenamide C and its derivatives.2020

    • Author(s)
      Takahashi, N., Kaneko, K., Kakeya, H.
    • Journal Title

      J. Org. Chem.

      Volume: 85 Pages: 4530-4535

    • DOI

      10.1021/acs.joc.9b03516

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L1 promotes hypoxia-inducible factor 1-dependent tumor cell malignancy in spheroid models.2020

    • Author(s)
      Li, X., Hattori, A., Takahashi, S., Goto, Y., Harada, H., Kakeya, H.
    • Journal Title

      Camcer Sci.

      Volume: 111 Pages: 239-252

    • DOI

      10.1111/cas.14236

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cryptic chemical communication: Secondary metabolic responses revealed by microbial co-culture.2020

    • Author(s)
      Liu, C., Kakeya, H.
    • Journal Title

      Chem. Asian. J.

      Volume: 15 Pages: 327-337

    • DOI

      10.1002/asia.201901505

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Discovery of “heat shock metabolites” produced by thermotolerant actinomycetes in high-temperature culture.2020

    • Author(s)
      Saito, S., Kato, W., Ikeda, H., Katsuyama, Y., Ohnishi, Y., Imoto, M.
    • Journal Title

      J. Antibiot.

      Volume: 73 Pages: in press

    • DOI

      10.1038/s41429-020-0279-4

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] BRUP-1, an intracellular bilirubin modulator, exerts neuroprotective activity in a cellular Parkinson’s disease model.2020

    • Author(s)
      Kataura, T., Saiki, S., Ishikawa, K., Akamatsu, W., Sasazawa, Y., Hattori, N., Imoto, M.
    • Journal Title

      J. Neurochemstry

      Volume: - Pages: in press

    • DOI

      10.1111/jnc.14997

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Total synthesis of verucopeptin, an inhibitor of hypoxia-inducible factor 1 (HIF-1).2019

    • Author(s)
      Takahashi, N., Hayashi, H., Poznaks, V., Kakeya, H.
    • Journal Title

      Chem. Commun.

      Volume: 55 Pages: 11956-11959

    • DOI

      10.1039/c9cc06169j

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation, structure elucidation and conformational regulation of myropeptins, lipopeptides from a fungus Myrothecium rodium.2019

    • Author(s)
      Yoshimura, A., Nishimura, S., Suzuki, T., Hattori, A., Dohmae, N. Kato, T., Kakeya, H.
    • Journal Title

      Org. Lett.

      Volume: 21 Pages: 7524-7528

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.9b02801

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chemical interaction of cryptic actinomycete metabolite 5-alkyl-1,2,3,4-tetrahydroquinolines through aggregate formation.2019

    • Author(s)
      Sugiyama, R., Nakatani, T., Nishimura, S., Takenaka, K., Ozaki, T., Asamizu, S., Onaka, Y., Kakeya, H.
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 58 Pages: 13486-13491

    • DOI

      10.1002/anie.201905970

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of highly absorbable curcumin in patients with impaired glucose tolerance and non-insulin dependent diabetes mellitus.2019

    • Author(s)
      Funamoto, M., Shimizu, K., Sunagawa, Y., Katanasaka, Y., Miyazaki, Y., Kakeya, H., Yamakage, H., Satoh-Asahara, N., Wada, H., Hasegawa, K., Morimoto, T.
    • Journal Title

      J. Diabetes Res.

      Volume: - Pages: in press

    • DOI

      10.1155/2019/8208237

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 希少天然物の構造をモチーフとした高感度ラベル化剤の開発2020

    • Author(s)
      箕手万由里, 小川はるか, 森本涼太, 潘 承謙, 倉永健史, 掛谷秀昭
    • Organizer
      日本薬学会第140年会
  • [Presentation] アカデミア発創薬を目指した創薬ケミカルバイオロジー研究2020

    • Author(s)
      掛谷秀昭
    • Organizer
      TSMTP (Translational Science and MedicineTraining Program) Symposium in Sapporo
    • Invited
  • [Presentation] 有用生物活性リガンドの開発を志向した化学コミュニケーション研究2020

    • Author(s)
      掛谷秀昭
    • Organizer
      有機合成のニュートレンド2020(有機合成化学協会関西支部主催)
    • Invited
  • [Presentation] Continuing Fascination with Discovery Science: Phenotypic Screening to Chemical Biology2020

    • Author(s)
      Kakeya, H.
    • Organizer
      Mona Symposium 2020: Natural Product Chemistry and Medicinal Chemistry
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 微生物間化学コミュニケーションの理解と有用生物活性リガンドの開発2019

    • Author(s)
      掛谷秀昭
    • Organizer
      新学術領域研究「化学コミュニケーションのフロンティア」・第6回公開シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Chemical comunication research toward the development of usefulchemical probes2019

    • Author(s)
      Kakeya, H.
    • Organizer
      The 4th A3 Roundtable Meeting on Asia Chemical Probe Research
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Natural products-prompted chemical biology: Phenotypic screeningand a new platform for target identification2019

    • Author(s)
      Kakeya, H.
    • Organizer
      The 6th Tishler-Omura Sympoium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Developmentof an injectable water-soluble anticancer drug CMG for oxaliplatin-resistantcolorectal cancer with KRAS mutation2019

    • Author(s)
      Kakeya, H, Kishimoto, A., Umeta, H., Imaizumi, A., Kanai, M.
    • Organizer
      31th EORTC-NCI-AACR Symposium: InternationalConference on Molecular Targets and Cancer Therapeutics
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Highly sensitive labeling reagents inspired bya scarce marine natural product2019

    • Author(s)
      Kuranaga, T., Kakeya, H.
    • Organizer
      10th Korea-Japan Chemical Biology Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Symposia20 "Frontier in Molecular Target Therapy of Cancer": Developmentof a water-soluble prodrug CMG which inhibits proteasome activity throughDYRK2 dependent manner.2019

    • Author(s)
      Kanai, M., Kishimoto, A., Umeta, H., Imaizumi, A., Kakeya, H.
    • Organizer
      The 78th Annual Meeting of the Japanese CancerAssociation
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 低酸素誘導因子HIF-1阻害活性を有する環状デプシペプチドverucopeptinの全合成2019

    • Author(s)
      高橋伸明, 林 秀明, Poznaks, V. 掛谷秀昭
    • Organizer
      第61回天然有機化合物討論会
  • [Presentation] Frontier research on chemical communications unveils the mysteryof life science2019

    • Author(s)
      Kakeya, H.
    • Organizer
      The 27th International Society of Heterocyclic ChemistryCongress
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 自然に学ぶ薬づくり2019

    • Author(s)
      掛谷秀昭, 倉永健史
    • Organizer
      京都大学アカデミックデイ2019
  • [Presentation] 微生物間化学コミュニケーションの利活用による新規生物活性リガンドの開発研究2019

    • Author(s)
      掛谷秀昭
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会・第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会
    • Invited
  • [Presentation] 「シンポジウム・がんと宿主の化学コミュニケーションの理解と制御」. 水溶性プロドラッグ型分子標的抗がん剤CMGの開発研究2019

    • Author(s)
      掛谷秀昭
    • Organizer
      第23回日本がん分子標的治療学会学術集会
    • Invited
  • [Book] くすりの科学知識(増補第2版)2019

    • Author(s)
      掛谷秀昭
    • Total Pages
      175
    • Publisher
      ニュートンプレス
    • ISBN
      978-4-315-52189-4
  • [Remarks] 京都大学大学院薬学研究科 医薬創成情報科学専攻 システムケモセラピー(制御分子学)分野

    • URL

      http://www.pharm.kyoto-u.ac.jp/sc-molsci/

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 新規フルオロジニトロフェニル化合物及びその用途2019

    • Inventor(s)
      掛谷秀昭、倉永健史、小川はるか
    • Industrial Property Rights Holder
      掛谷秀昭、倉永健史、小川はるか
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      JP2019-081766

URL: 

Published: 2021-01-27  

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