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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of "Response zone" and " Communication zone" in mitochondria and Golgi apparatus

Planned Research

Project AreaToward an integrative understanding of functional zones in organelles
Project/Area Number 17H06414
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

清水 重臣  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授 (70271020)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 田村 康  山形大学, 理学部, 准教授 (50631876)
細谷 孝充  東京医科歯科大学, 生体材料工学研究所, 教授 (60273124)
吉田 秀郎  兵庫県立大学, 生命理学研究科, 教授 (60378528)
矢木 宏和  名古屋市立大学, 大学院薬学研究科, 講師 (70565423)
Project Period (FY) 2017-06-30 – 2022-03-31
Keywordsゴルジ体 / ミトコンドリア / 小胞体 / ストレス
Outline of Annual Research Achievements

1つのオルガネラの中には、異なる役割を担う場が存在し、本領域ではこれをオルガネラ・ゾーンと命名して解析している。本研究では、「ミトコンドリアとゴルジ体の応答ゾーン」、「ミトコンドリアと小胞体、ゴルジ体の連携ゾーン」を中心に解析を行ない、以下の知見を明らかにした。
1、ゴルジ体ストレス応答ゾーン:このゾーンには、ゴルジ体ストレス時に、過剰な分泌たんぱく質の蓄積を抑制するためのGOMEDゾーン、プロテオグリカン型糖鎖修飾を行うプロテオグリカン・ゾーン、小胞体からゴルジ体へのコレステロール輸送を担うコレステロール・ゾーンなどが存在する。(1)GOMEDに関しては、この機構がトランスゴルジ膜の変形によってもたらされること、即ち、トランスゴルジ膜の形状が変化し、これが分泌タンパク質をラッピングし、分解に寄与することを明らかにした。また、一連のゴルジ体動態の観察、関連分子の同定、欠損マウスの作成を行った。(2)プロテオグリカン・ゾーンに関しては、これを制御するエンハンサー配列の同定に成功した。(3)コレステロール・ゾーンに関しては、コレステロールの輸送タンパク質であるOSBPの阻害剤やノックダウンによって、ゴルジ体の断片化やTFE3経路の活性化が生じることを見いだした。
2、ミトコンドリア・小胞体(Mt-ER)連携ゾーン:出芽酵母におけるMt-ER連携ゾーン形成因子ERMES複合体の機能,構造解析を行った。また,ERMES構成因子をGFPとの融合タンパク質として発現させることで,出芽酵母におけるMt-ER連携ゾーンを可視化し,その動態を解析した。さらに、Split-GFP分子を様々なオルガネラ膜上に局在化させることで,オルガネラ間連携ゾーンを可視化する実験系を構築した。この実験系により,オルガネラ間の新たな連携ゾーンの存在が明らかとなった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ゴルジ体のストレス応答ゾーン解析においては、イメージング(膜の形態変化の捕捉)、分子生物学的解析(ゾーン形成に関わる分子の同定とシグナル伝達機構の解明)、遺伝学的解析(ゾーン形成ができないマウスの作成)、転写レベルでの解析、などが順調に進行し、多方面からの解析による相乗的効果が現れ、実態解明が急速に進行した。Mt-ER連携ゾーン解析に関しても、split GFPを用いた可視化ツールの開発に成功した他、ゾーン構成因子の構造解析(ERMES複合体の構造)、遺伝学的解析(酵母の遺伝学)、細胞生物学的解析が進み、実態解明が急速に進行した。
これらの成果は、原著論文9編、英文総説2編として発表に至っている他、次年度以降に向けて論文投稿も多く行われており、研究は順調に推移している。

Strategy for Future Research Activity

ゴルジストレス応答ゾーンやMt-ER連携ゾーンの解析に関しては、様々な手法を駆使して研究が進んでいる。これら多方面からの解析結果が有機的に連携していることから、現在の研究を引き続き進めることにより、応答ゾーン、連携ゾーンの実態解明に迫れるものと考えている。また、split GFPを用いた方法によって、新たなオルガネラ間の連携が見出されており、これらの実態解明にも行っていく予定である。

  • Research Products

    (26 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 2 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results) Remarks (5 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Int'l Joint Research] Kings coledge of London(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      Kings coledge of London
  • [Int'l Joint Research] Monash University(Australia)

    • Country Name
      Australia
    • Counterpart Institution
      Monash University
  • [Int'l Joint Research] National University of Singapore(Singapore)

    • Country Name
      Singapore
    • Counterpart Institution
      National University of Singapore
  • [Journal Article] Convergent synthesis of trifunctional molecules by three sequential azido-type-selective cycloadditions2018

    • Author(s)
      Yoshida Suguru、Kanno Kimiyuki、Kii Isao、Misawa Yoshihiro、Hagiwara Masatoshi、Hosoya Takamitsu
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 54 Pages: 3705~3708

    • DOI

      10.1039/c8cc01195h

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Visualizing multiple inter-organelle contact sites using the organelle-targeted split-GFP system2018

    • Author(s)
      Kakimoto Yuriko、Tashiro Shinya、Kojima Rieko、Morozumi Yuki、Endo Toshiya、Tamura Yasushi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Pages: 6175

    • DOI

      10.1038/s41598-018-24466-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dram1 regulates DNA damage-induced alternative autophagy2018

    • Author(s)
      Nagata Meruna、Arakawa Satoko、Yamaguchi Hirofumi、Torii Satoru、Endo Hazuki、Tsujioka Masatsune、Honda Shinya、Nishida Yuya、Konishi Akimitsu、Shimizu Shigeomi
    • Journal Title

      Cell Stress

      Volume: 2 Pages: 55~65

    • DOI

      10.15698/cst2018.03.127

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Small fluorescent molecules for monitoring autophagic flux2018

    • Author(s)
      Iwashita Hidefumi、Sakurai Hajime Tajima、Nagahora Noriyoshi、Ishiyama Munetaka、Shioji Kosei、Sasamoto Kazumi、Okuma Kentaro、Shimizu Shigeomi、Ueno Yuichiro
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 592 Pages: 559~567

    • DOI

      10.1002/1873-3468.12979

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biological Roles of Alternative Autophagy2018

    • Author(s)
      Shigeomi Shimizu
    • Journal Title

      Mol. Cells

      Volume: 41 Pages: 50-54

    • DOI

      10.14348/molcells.2018.2215

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Site-specific N-glycosylation analysis of soluble Fcγ receptor IIIb in human serum2018

    • Author(s)
      Yagi Hirokazu、Takakura Daisuke、Roumenina Lubka T.、Fridman Wolf Herman、Saut?s-Fridman Catherine、Kawasaki Nana、Kato Koichi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 8 Pages: 2719

    • DOI

      10.1038/s41598-018-21145-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Role of Atg5-dependent cell death in the embryonic development of Bax/Bak double-knockout mice2017

    • Author(s)
      Arakawa Satoko、Tsujioka Masatsune、Yoshida Tatsushi、Tajima-Sakurai Hajime、Nishida Yuya、Matsuoka Yosuke、Yoshino Ikuyo、Tsujimoto Yoshihide、Shimizu Shigeomi
    • Journal Title

      Cell Death and Differentiation

      Volume: 24 Pages: 1598~1608

    • DOI

      10.1038/cdd.2017.84

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure-function insights into direct lipid transfer between membranes by Mmm1-Mdm12 of ERMES2017

    • Author(s)
      Kawano Shin、Tamura Yasushi、Kojima Rieko、Bala Siqin、Asai Eri、Michel Agnes H.、Kornmann Benoit、Riezman Isabelle、Riezman Howard、Sakae Yoshitake、Okamoto Yuko、Endo Toshiya
    • Journal Title

      The Journal of Cell Biology

      Volume: 217 Pages: 959~974

    • DOI

      10.1083/jcb.201704119

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of Intra- and Inter-mitochondrial Membrane Contact Sites in Yeast Phospholipid Biogenesis2017

    • Author(s)
      Tamura Yasushi、Endo Toshiya
    • Journal Title

      Adv Exp Med Biol.

      Volume: 997 Pages: 121~133

    • DOI

      10.1007/978-981-10-4567-7_9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Lewis X-Carrying Neoglycolipids Evoke Selective Apoptosis in Neural Stem Cells2017

    • Author(s)
      Yagi Hirokazu、Yan Gengwei、Suzuki Tatsuya、Tsuge Shingo、Yamaguchi Takumi、Kato Koichi
    • Journal Title

      Neurochemical Research

      Volume: 43 Pages: 212~218

    • DOI

      10.1007/s11064-017-2415-5

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] オートファジーと疾患2018

    • Author(s)
      清水重臣
    • Organizer
      第6回AAA会
    • Invited
  • [Presentation] オートファジーが関わる細胞死2017

    • Author(s)
      清水重臣
    • Organizer
      日本Cell Death学会
    • Invited
  • [Presentation] 新規オートファジーの分子機構とその破綻による疾患2017

    • Author(s)
      清水重臣
    • Organizer
      第22回 日本病態プロテアーゼ学会
    • Invited
  • [Presentation] Development of molecularly targeted anticancer agents based on the regulation of autophagic cell death2017

    • Author(s)
      清水重臣
    • Organizer
      第76回日本癌学会
    • Invited
  • [Presentation] Structural and Mechanistic Insights into Phospholipid Transfer via Mitochondria2017

    • Author(s)
      Yasushi Tamura
    • Organizer
      5th International Conference on Smart Systems Engineering
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The characterization of the laminin-binding glycans on α-dystroglycan catalyzed by several causative gene products of dystroglycanopathy2017

    • Author(s)
      Hirokazy Yagi
    • Organizer
      1st International Conference on the Glycobiology of Nervous System
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 東京医科歯科大学病態細胞生物ホームページ

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/mri/pcb/index.html

  • [Remarks] 東京医科歯科大学生命有機化学ホームページ

    • URL

      http://chembiolab.sakura.ne.jp/Home.html

  • [Remarks] 山形大学理学部・田村研究室ホームページ

    • URL

      https://www.tamuralab.com/

  • [Remarks] 兵庫県立大学大学院生命理学研究科ホームページ

    • URL

      http://www.eonet.ne.jp/~biophysics-kyoto/

  • [Remarks] 名古屋市立大学 大学院薬学研究科 生命構造学分野ホームページ

    • URL

      http://www.phar.nagoya-cu.ac.jp/hp/sbk/

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 糖タンパク質の糖修飾2018

    • Inventor(s)
      矢木宏和、齋藤泰輝、加藤晃一
    • Industrial Property Rights Holder
      矢木宏和、齋藤泰輝、加藤晃一
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2018-047235
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 糖タンパク質の生産方法2017

    • Inventor(s)
      矢木宏和、本田怜奈、加藤晃一
    • Industrial Property Rights Holder
      矢木宏和、本田怜奈、加藤晃一
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2017-132312

URL: 

Published: 2018-12-17   Modified: 2022-03-29  

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