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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of GPI-anchored protein sorting zone at the ER exit site

Planned Research

Project AreaToward an integrative understanding of functional zones in organelles
Project/Area Number 17H06420
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

中野 明彦  国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究センター, 副センター長 (90142140)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 黒川 量雄  国立研究開発法人理化学研究所, 光量子工学研究センター, 専任研究員 (40333504)
Project Period (FY) 2017-06-30 – 2022-03-31
Keywords超解像ライブイメージング / GPIアンカー選別ゾーン
Outline of Annual Research Achievements

出芽酵母をモデルとしたGPIアンカー型蛋白質の輸送ゾーンの解明を目指した。小胞体からゴルジ体への積荷蛋白質輸送はCOPII小胞が担う。COPII小胞は小胞体上のER exit site (ERES)と呼ばれる領域に集積する。新規合成された積荷蛋白質の動態解析のために、COPII小胞形成に損傷をもつ変異株で積荷蛋白質をGalプロモーター制御下に発現させ、集積した積荷蛋白質のみが小胞体からゴルジ体への輸送されるパルス・チェイス・ライブイメージングを開発した。
GPIアンカー型蛋白質Gas1は、一部のERES近傍に集積し、通常の膜貫通部位をもつ非GPIアンカー蛋白質Mid2は小胞体全域に分布すること、両者の局在は排他的で、異なるERESに選別的に取り込まれることを明らかにし、小胞体における積荷蛋白質の選別輸送ゾーンの存在を明確にした。 出芽酵母では、GPIアンカーのGPIリピッドが極長鎖セラミド(C26)化される。そのセラミド合成酵素を欠損させ、代わりに綿のセラミド合成酵素を発現する出芽酵母株では、脂肪酸鎖長が短いC18/C16セラミドが合成され小胞体の膜に蓄積する。この株では、Gas1はMid2と同様に小胞体全域に広く分布し、Mid2と同じERESに取り込まれたことから、小胞体脂質に含まれるセラミドの脂肪酸長が、GPIアンカー型蛋白質の選別ゾーンへの集積とERESへの選別に決定的な役割を果たすことを明らかにした。さらに、さまざまな変異体の解析から、選別輸送にはGPIアンカーのセラミド部分と、それをモニターする糖鎖リモデリング酵素の両方による品質管理機構が働いていることを明らかにした(Cell Rep誌)。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (25 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 5 results) Presentation (14 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 6 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Seville(スペイン)

    • Country Name
      SPAIN
    • Counterpart Institution
      University of Seville
  • [Int'l Joint Research] Umea Plant Science Centre(スウェーデン)

    • Country Name
      SWEDEN
    • Counterpart Institution
      Umea Plant Science Centre
  • [Journal Article] The TGN/EE SNARE protein SYP61 and the ubiquitin ligase ATL31 cooperatively regulate plant responses to carbon/nitrogen conditions in Arabidopsis2022

    • Author(s)
      Hasegawa Yoko、Huarancca Reyes Thais、Uemura Tomohiro、Baral Anirban、Fujimaki Akari、Luo Yongming、Morita Yoshie、Saeki Yasushi、Maekawa Shugo、Yasuda Shigetaka、Mukuta Koki、Fukao Yoichiro、Tanaka Keiji、Nakano Akihiko、Takagi Junpei、Bhalerao Rishikesh P、Yamaguchi Junji、Sato Takeo
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: 34 Pages: 1354~1374

    • DOI

      10.1093/plcell/koac014

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Quality-controlled ceramide-based GPI-anchored protein sorting into selective ER exit sites2022

    • Author(s)
      Rodriguez-Gallardo Sofia、Sabido-Bozo Susana、Ikeda Atsuko、Araki Misako、Okazaki Kouta、Nakano Miyako、Aguilera-Romero Auxiliadora、Cortes-Gomez Alejandro、Lopez Sergio、Waga Miho、Nakano Akihiko、Kurokawa Kazuo、Muniz Manuel、Funato Kouichi
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 39 Pages: 110768

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.110768

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Super-resolution live imaging of cargo traffic through the Golgi apparatus in mammalian cells2022

    • Author(s)
      Takuro Tojima, Daisuke Miyashiro, Yasuhito Kosugi, and Akihiko Nakano
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The Golgi Apparatus and its Next-Door Neighbors2022

    • Author(s)
      Akihiko Nakano
    • Journal Title

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      Volume: 10 Pages: 884360

    • DOI

      10.3389/fcell.2022.884360

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 分子夾雑の細胞生物学2022

    • Author(s)
      中野明彦
    • Journal Title

      CSJカレントレビュー

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Assay for dual cargo sorting into endoplasmic reticulum exit sites imaged by 3D Super-resolution Confocal Live Imaging Microscopy (SCLIM)2021

    • Author(s)
      Rodriguez-Gallardo Sofia、Kurokawa Kazuo、Sabido-Bozo Susana、Cortes-Gomez Alejandro、Perez-Linero Ana Maria、Aguilera-Romero Auxiliadora、Lopez Sergio、Waga Miho、Nakano Akihiko、Muniz Manuel
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 16 Pages: e0258111

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0258111

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 超解像ライブイメージング顕微鏡SCLIMの開発とSCLIMの多色4Dライブセルイメージングによるゴルジ体タンパク質輸送機構の解明2021

    • Author(s)
      黒川量雄,宮代大輔,中野明彦
    • Journal Title

      レーザー研究

      Volume: 49 Pages: 271-275

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] EVs 細胞外小胞の生物学 -エクソソームをはじめとする多様な小胞の生理・病理の理解と新しい解析法2021

    • Author(s)
      中野明彦,吉森保,華山力成
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 39 Pages: 1-2

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 植物の細胞内膜輸送を制御するRABH1 GTPaseの局在と機能解析2022

    • Author(s)
      大堀智博,伊藤容子,伊藤瑛海,中野明彦,上田貴志,植村知博
    • Organizer
      日本植物生理学会第63回大会
  • [Presentation] SNAREタンパク質SYP61はユビキチンリガーゼATL31と共にシロイヌナズナのC/N栄養応答を制御する2022

    • Author(s)
      長谷川陽子,Thais Huarancca Reyes, 植村知博,Anirban Baral, 羅永茗, 前川修吾, 安田盛貴, 深尾陽一朗, 中野明彦,高木純平,Rishikesh P. Bhalerao, 山口淳二,佐藤長緒
    • Organizer
      日本植物生理学会第63回大会
  • [Presentation] シロイヌナズナ VAMP714 の細胞内局在の解析2022

    • Author(s)
      江口倫子,遠藤彩瑛,伊藤瑛海,中野明彦,植村知博
    • Organizer
      日本植物生理学会第63回大会
  • [Presentation] Golgi apparatus and its next-door neighbors2021

    • Author(s)
      Akihiko Nakano
    • Organizer
      EMBO | Japan Virtual Lectures
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Super-resolution confocal live imaging microscopy (SCLIM) as a powerful tool for exosome research2021

    • Author(s)
      Akihiko Nakano
    • Organizer
      Pacifichem 2021
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 究極の細胞内イメージング2021

    • Author(s)
      中野明彦
    • Organizer
      SXR The 2nd Scienc-ome XR Innovation Hub
    • Invited
  • [Presentation] 膜交通の新パラダイム2021

    • Author(s)
      中野明彦
    • Organizer
      第73回日本細胞生物学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 微粒子ダイナミクスの可視化2021

    • Author(s)
      中野明彦
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 超解像4Dイメージングで迫るゴルジ体形成のダイナミクス2021

    • Author(s)
      伊藤容子,植村知博,中野明彦
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Invited
  • [Presentation] 超解像ライブイメージングによるシロイヌナズナRab6/RABH1 GTPaseの細胞内局在の解析2021

    • Author(s)
      大堀智博,伊藤瑛海,中野明彦,上田貴志,植村知博
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
  • [Presentation] Syntaxin6N末端領域を有する植物固有タンパク質の生理機能に関する研究2021

    • Author(s)
      長尾レイナ,清水優太朗,藤倉崇紘,伊藤瑛海,由良敬, 中野明彦,植村知博
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
  • [Presentation] シロイヌナズナVAMP714の細胞内局在の解析2021

    • Author(s)
      江口倫子,遠藤彩瑛,伊藤瑛海,中野明彦,植村知博
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
  • [Presentation] TGN-液胞間の輸送が制御する塩ストレス応答2021

    • Author(s)
      井上 柚紀, 清水優太朗, 伊藤瑛海, 中野明彦, 植村知博
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
  • [Presentation] 病原菌応答における植物分泌システムの役割2021

    • Author(s)
      遠藤彩瑛,伊藤瑛海,中野明彦,植村知博
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
  • [Remarks] 中野明彦ラボ

    • URL

      http://sclim.riken.jp

URL: 

Published: 2022-12-28  

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