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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of mechanism and etraction of key for hybrid catalytic systems based on the automated reaction path search method

Planned Research

Project AreaHybrid Catalysis for Enabling Molecular Synthesis on Demand
Project/Area Number 17H06445
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

畑中 美穂  奈良先端科学技術大学院大学, 研究推進機構, 特任准教授 (80616011)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) Sameera W.M.C.  北海道大学, 低温科学研究所, 特任助教 (90791278)
Project Period (FY) 2017-06-30 – 2022-03-31
Keywords反応経路自動探索 / 密度汎関数法
Outline of Annual Research Achievements

複数の触媒が協働的に作用するハイブリッド触媒系のメカニズム解明には、反応経路の網羅的探索が不可欠である。本研究では、反応経路を自動的に探索する方法論の一つである「人工力誘起反応法(Artificial Force Induced Reaction:AFIR法)を駆使し、領域内で研究が進められる様々なハイブリッド触媒系の機構解明に取り組んだ。
今年度は、前年度に引き続き、不斉トリアゾリウム塩を用いる開環付加反応の機構解明に取り組んだ。本反応は、律速段階において触媒2分子が関与することが実験的に明らかにされている。そこで、律速段階の遷移状態に着目し、AFIR法を用いることで、コンフォメーションの異なる60個の構造を求めた。得られた構造を効率よく解析すべく、新しい解析法を提案した。まず、遷移状態間のエネルギー差を目的変数に、各原子上の部分電荷から求まる静電相互作用エネルギー項、および、ファンデルワールスエネルギー項を説明変数とした上で、PLS回帰モデルを構築し、エネルギー差に大きく寄与する原子間ペアのランキングを作った。その結果、複雑な構造の中から、遷移状態の安定性に大きく寄与する原子間ペアを効率よく抽出することが可能となった。この手法は、PLS回帰モデル作成に利用するデータの範囲を変えることで、比較的安定な遷移状態のエネルギーに寄与する原子ペア、大きく不安定化した遷移状態のエネルギーに寄与するペアを分けて抽出できることが大きな利点の一つであると言える。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

複数の触媒系の反応機構の研究を進めている。非常に複雑な系の解析には時間がかかっているものの、反応機構の調べを進める上で、新たな解析手法の提案に結び付いたものもあるため、全体としてはおおむね順調に進展していると言える。

Strategy for Future Research Activity

ハイブリッド触媒系は、複数の触媒が関与するため、計算コストが高くなってしまう。そのため、反応経路を(数か月単位のスケースで)計算するためには、電子状態の計算を大胆に近似せざるを得ない。しかし、ハイブリッド触媒系の中には、反応中心が未知であったり、反応中心が反応の進行に伴い変化するなど、従来の手法(ONIOM法など)の適用にも困難が伴っていた。そこで、今後は反応中心が未知の場合であっても、適切に反応中心を選びながら、反応経路の探索が行えるよう、検討していく予定である。

  • Research Products

    (29 results)

All 2020 2019

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 1 results) Presentation (19 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 11 results)

  • [Journal Article] Catalytic Chemoselective O-Phosphorylation of Alcohols2020

    • Author(s)
      Domon K.、Puripat M.、Fujiyoshi K.、Hatanaka M.、Kawashima S. A.、Yamatsugu K.、Kanai M.
    • Journal Title

      ACS Central Science

      Volume: 6 Pages: 283~292

    • DOI

      https://doi.org/10.1021/acscentsci.9b01272

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Synthesis of Dinuclear Mo‐Fe Hydride Complexes and Catalytic-Silylation of N22020

    • Author(s)
      Ishihara Kodai、Araki Yuna、Tada Mizuki、Takayama Tsutomu、Sakai Yoichi、Sameera W. M. C.、Ohki Yasuhiro
    • Journal Title

      Chemistry: A European Journal

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      https://doi.org/10.1002/chem.202000104

  • [Journal Article] Evaluation of Zn2+ Coordination Structures in Chiral Zn2+ Complexes Based on Shape Measurement Factors: Relationships between Activity and the Coordination Structure2019

    • Author(s)
      Aoki Shin、Kikuchi Chiharu、Kitagawa Yuichi、Hasegawa Yasuchika、Sonoike Shotaro、Saga Yutaka、Hatanaka Miho
    • Journal Title

      European Journal of Inorganic Chemistry

      Volume: 2019 Pages: 4740~4751

    • DOI

      https://doi.org/10.1002/ejic.201900934

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The Origins of the Stereoselectivity and Enantioswitch in the Rare‐Earth‐Catalyzed Michael Addition: A Computational Study2019

    • Author(s)
      Miyazaki Aya、Hatanaka Miho
    • Journal Title

      ChemCatChem

      Volume: 11 Pages: 4036~4042

    • DOI

      https://doi.org/10.1002/cctc.201900555

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A remarkably strained cyclopyrenylene trimer that undergoes metal-free direct oxygen insertion into the biaryl C-C σ-bond2019

    • Author(s)
      Kurosaki Ryo、Hayashi Hironobu、Suzuki Mitsuharu、Jiang Julong、Hatanaka Miho、Aratani Naoki、Yamada Hiroko
    • Journal Title

      Chemical Science

      Volume: 10 Pages: 6785~6790

    • DOI

      DOI: 10.1039/c9sc01777a

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Strong Luminescent Europium Complexes Induced by the Unprecedented Anti-chelate Effect of Acyl Groups on a N6-Hexadentate Ligand2019

    • Author(s)
      Ogata Shuhei、Komiya Hiroaki、Goto Naoto、Tanabe Ryota、Sugimoto Kunihisa、Kawaguchi Shogo、Goto Kenta、Hatanaka Miho、Ishii Ayumi、Hasegawa Miki
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: 48 Pages: 593~596

    • DOI

      https://doi.org/10.1246/cl.190140

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] UV-polarizing linear polyyne molecules aligned in PVA2019

    • Author(s)
      Sata R.、Suzuki H.、Ueno N.、Morisawa Y.、Hatanaka M.、Wakabayashia T.
    • Journal Title

      Chinese Journal of Chemical Physics

      Volume: 32 Pages: 175~181

    • DOI

      https://doi.org/10.1063/1674-0068/cjcp1812273

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bi2Ne: Weakly bound cluster of diatomic bismuth with neon2019

    • Author(s)
      Endo Asuka、Hatanaka Miho、Ueno Nami、Morisawa Yusuke、Wakabayashi Tomonari
    • Journal Title

      Low Temperature Physics

      Volume: 45 Pages: 689~696

    • DOI

      DOI: 10.1063/1.5111288

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Exploring approximate geometries of minimum energy conical intersections by TDDFT calculations2019

    • Author(s)
      Harabuchi Yu、Hatanaka Miho、Maeda Satoshi
    • Journal Title

      Chemical Physics Letters: X

      Volume: 2 Pages: 100007~100007

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.cpletx.2019.100007

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Asymmetric Synthesis of β 2‐Aryl Amino Acids through Pd‐Catalyzed Enantiospecific and Regioselective Ring‐Opening Suzuki-Miyaura Arylation of Aziridine‐2‐carboxylates2019

    • Author(s)
      Takeda Youhei、Matsuno Tetsuya、Sharma Akhilesh K.、Sameera W. M. C.、Minakata Satoshi
    • Journal Title

      Chemistry: A European Journal

      Volume: 25 Pages: 10226~10231

    • DOI

      https://doi.org/10.1002/chem.201902009

  • [Presentation] Database and Machine-Learning Enabled New Insights into the Lanthanide Luminescence Materials2019

    • Author(s)
      M. Hatanaka
    • Organizer
      The 9th Asia-Pacific Association of Theoretical and Computational Chemists
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Application of automated reaction path search method to a systematic search of transition states2019

    • Author(s)
      M. Hatanaka
    • Organizer
      The 1st International Symposium on Hybrid Catalysis for Enabling Molecular Synthesis on Demand
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Theoretical prediction of luminescent intensities lanthanide complexes2019

    • Author(s)
      M. Hatanaka
    • Organizer
      International Symposium on Circularly polarized luminescence and Related Phenomena
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Computational Chemistry Meets Machine Learning: A Case Study of Lanthanide Luminescence Material2019

    • Author(s)
      M. Hatanaka
    • Organizer
      The 19th Tateshina Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 量子化学計算と機械学習の融合による化学現象の理解の深化と新規材料の設計2019

    • Author(s)
      畑中美穂
    • Organizer
      大阪府立大RIMED第21回研究会
    • Invited
  • [Presentation] 量子化学と機械学習の効率的活用2019

    • Author(s)
      畑中美穂
    • Organizer
      新化学技術推進協会 先端化学・材料技術部会 コンピュータケミストリ分科会講演会
    • Invited
  • [Presentation] Database and Machine-Learning Enabled New Insights into the Lanthanide Luminescence Materials2019

    • Author(s)
      畑中美穂
    • Organizer
      大阪府立大学マテリアル工学コロキウム
    • Invited
  • [Presentation] マテリアルズ・インフォマティクスの概念と要素技術~今日から始める機械学習・化学屋編~2019

    • Author(s)
      畑中美穂
    • Organizer
      分析化学近畿支部若手の会
    • Invited
  • [Presentation] 反応経路自動探索を用いる機構解析と機械学習による効率的材料探索2019

    • Author(s)
      畑中美穂
    • Organizer
      有機合成化学協会「AIと有機合成化学」第3回勉強会
    • Invited
  • [Presentation] 量子化学計算によるマイクロ波効果の解明22019

    • Author(s)
      畑中美穂
    • Organizer
      電磁波励起反応場第188委員会 2019年度第2回ワークショップ
    • Invited
  • [Presentation] 消光経路のデータベースと機械学習を用いるランタノイド発光材料の理解・分子設計2019

    • Author(s)
      畑中美穂
    • Organizer
      光機能材料研究会第73回講演会
    • Invited
  • [Presentation] ハーフペアレント型ジアゾメタンの光反応に関する理論的研究2019

    • Author(s)
      吉村誠慶, 松尾司, 畑中美穂
    • Organizer
      第42回ケモインフォマティクス討論会
  • [Presentation] 14族元素化合物の安定性と結合性に関する理論的研究2019

    • Author(s)
      奥野博貴, 畑中美穂
    • Organizer
      第42回ケモインフォマティクス討論会
  • [Presentation] 金属錯体を触媒とするアルキド樹脂重合機構の理論的解明2019

    • Author(s)
      永野駿介, 中野宏明, 高橋亮則, 畑中美穂
    • Organizer
      第42回ケモインフォマティクス討論会
  • [Presentation] 人工力誘起反応法を用いたパラジウム触媒による分子内環化反応経路の探索2019

    • Author(s)
      吉村誠慶, 荻原陽平, 坂井教郎, 畑中美穂
    • Organizer
      第13回分子科学討論会
  • [Presentation] 金属錯体を触媒とするアルキド樹脂重合機構の理論的解明2019

    • Author(s)
      永野駿介, 中野宏明, 高橋亮則, 畑中美穂
    • Organizer
      第13回分子科学討論会
  • [Presentation] xploring mechanistic puzzles in Pd-catalyzed aziridine ring-opening reactions2019

    • Author(s)
      W. M. C. Sameera
    • Organizer
      The Asia-Pacific Association of Theoretical and Computational Chemists
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Combining modern force fields with ONIOM(QM:MM): the SICTWO interface.2019

    • Author(s)
      W. M. C. Sameera, F. Maseras
    • Organizer
      The Asia-Pacific Association of Theoretical and Computational Chemists
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] n the reaction mechanisms: quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM) studies.2019

    • Author(s)
      W. M. C. Sameera
    • Organizer
      The 1st Symposium International on Hybrid Catalysis for Enabling Molecular Synthesis on Demand
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2021-01-27  

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