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2018 Fiscal Year Annual Research Report

3次元トポロジーに基づく静的・動的ネットワークの提案

Planned Research

Project AreaDiscrete Geometric Analysis for Materials Design
Project/Area Number 17H06463
Research InstitutionSaitama University

Principal Investigator

下川 航也  埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (60312633)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 石原 海  山口大学, 教育学部, 准教授 (40634762)
出口 哲生  お茶の水女子大学, 基幹研究院, 教授 (70227544)
手塚 育志  東京工業大学, 物質理工学院, 教授 (80155457)
Project Period (FY) 2017-06-30 – 2022-03-31
Keywordsトポロジー / ネットワーク / 共連続構造 / トポロジー高分子 / 結び目
Outline of Annual Research Achievements

本年度は、研究計画に挙げていた、3つの絡み合うネットワークと共連続構造の分岐曲面の関連についての基礎的研究を完成し、研究分担者の石原氏、研究協力者の小沢氏、古宇田氏とともに論文として発表した。また、多面体絡み目の形状をもつ化合物の特徴付けを行い、雑誌Nature Communicationsに発表した。
出口氏の研究では、複雑な構造をもつ高分子に対して、慣性半径や拡散係数などを具体的に数値的に計算した。東工大のつばめ計算機を用いて分子動力学シミュレーションを実行し、排除体積効果が存在する場合におけるトポロジー高分子の慣性半径や拡散係数を求めている。手塚氏は、これまで推進してきた独自の高分子合成手法(ESA-CF法)に基づく、様々な新奇多環状トポロジー高分子の設計法を発展させ、トポロジー幾何学の視点から特に重要な「かたち」に焦点を絞り合成を行うとともに、高分子のトポロジー効果によるブレークスルー機能の創出を図っている。
国際会議を2件行った。
○ “The Topology of Nucleic Acids: Research at the Interface of Low-Dimensional Topology, Polymer Physics and Molecular Biology” (19w5226), Banff International Research Station for Mathematical Innovation and Discovery, Banff, Alberta, Canada, 2019年3月24日~29日
○ “Polymers meet Topology” 2019年1月30日~2月1日、東京工業大学, 世話人 : 出口哲生(お茶の水女子大学)、手塚育志(東京工業大学)、下川航也(埼玉大学)(アブストラクト集を発行)

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究目的に挙げた課題のうち、3相共連続構造と3つの絡み合うネットワークとの関係について、成果をあげることが出来、論文として発表した。これは、当初の目的としてまず考えたものであり、トポロジー的側面の研究については目標通りの達成度であるといえる。統計物理学的観点、高分子化学的観点でも、現段階までに予定した研究を行っており、論文も、下記にあげる通り、数多く出版している。これも目標通りと言える。
また、国際会議を2つ行うことが出来た。これは、当初の予定より活発に活動出来ていると言える。また、2017年度に行った国際会議のプロシーディングも、雑誌Reactive and Functional PolymersのSpecial Issueとして発行できたことは、このコミュニティへのアピールとなっており、大きな成果と言える。
さらに、新たに発生した研究課題の論文がNature Communicationに出版されたことは、当初の予定にはない成果である。
また、ポスドクであった久野氏の昇進と新たなポスドクの阪田氏の着任があった。阪田氏の加入により、双曲的幾何学を用いた議論を行えるようになり、A03-1班との共同研究が新たに開始された。これは当初の予定をより強力にするものとなった。

Strategy for Future Research Activity

引き続き、3次元トポロジーの議論を応用し、3相共連続構造と3次元ネットワークの研究を、3次元トーラスのハンドル体分割の分類の研究を用いて行う。そのデータを、A02班に提供し、シミュレーションを用いて、物性を予測する。そのなかでも良いものを、高分子化学者に提供し、新奇材料の開発を目指す。
現在、絡み合う3つのネットワークから、分岐曲面を作り出す研究を進めている。例えば、srsというネットワークを3つ用いた絡み合うネットワークの例は、3次元トーラスの種数5のハンドル体3つによる分解の例となっている。この分解は対称的に配置さている観点では良い例となっているが、stabilizedな分解の例となっている。このような例からより本質的な種数の小さい例の構成とトポロジーの観点からの分類を行う。この部分を、研究代表者の下川、研究分担者の石原氏、研究協力者の小沢氏、古宇田氏、および、ポスドクの阪田氏とともに行う。さらに、その安定性などの統計物理学的評価を、研究分担者の出口氏、伊藤氏が担当する。そのモデルを、A02-2の青柳氏のグループに提供する。さらに、公募班の山本氏らの高分子化学者と、材料の設計に関して議論を行っていく。

  • Research Products

    (32 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 5 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 12 results,  Invited: 13 results) Remarks (1 results) Funded Workshop (2 results)

  • [Int'l Joint Research] University of California, Davis/University of Georgia(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of California, Davis/University of Georgia
  • [Int'l Joint Research] University of Saskatchewan/University of British Colombia(カナダ)

    • Country Name
      CANADA
    • Counterpart Institution
      University of Saskatchewan/University of British Colombia
  • [Int'l Joint Research] UNAM(メキシコ)

    • Country Name
      MEXICO
    • Counterpart Institution
      UNAM
  • [Int'l Joint Research] University of Melbourne(オーストリア)

    • Country Name
      AUSTRIA
    • Counterpart Institution
      University of Melbourne
  • [Journal Article] Metal-peptide rings form highly entangled topologically inequivalent frameworks with the same ring- and crossing-numbers2019

    • Author(s)
      Sawada Tomohisa、Saito Ami、Tamiya Kenki、Shimokawa Koya、Hisada Yutaro、Fujita Makoto
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: 921

    • DOI

      https://doi.org/10.1038/s41467-019-08879-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Neighborhood equivalence for multibranched surfaces in 3-manifolds2019

    • Author(s)
      Ishihara Kai、Koda Yuya、Ozawa Makoto、Shimokawa Koya
    • Journal Title

      Topology and its Applications

      Volume: 257 Pages: 11~21

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.topol.2019.02.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bimodality in the knotting probability of semiflexible rings suggested by mapping with self-avoiding polygons2019

    • Author(s)
      Uehara Erica、Coronel Lucia、Micheletti Cristian、Deguchi Tetsuo
    • Journal Title

      Reactive and Functional Polymers

      Volume: 134 Pages: 141~149

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.reactfunctpolym.2018.11.008

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Programmed Polymer Folding with Periodically Positioned Tetrafunctional Telechelic Precursors by Cyclic Ammonium Salt Units as Nodal Points2019

    • Author(s)
      Kyoda Kohei、Yamamoto Takuya、Tezuka Yasuyuki
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 141 Pages: 7526~7536

    • DOI

      10.1021/jacs.9b02459

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterising knotting properties of polymers in nanochannels2018

    • Author(s)
      Beaton N. R.、Eng J. W.、Ishihara K.、Shimokawa K.、Soteros C. E.
    • Journal Title

      Soft Matter

      Volume: 14 Pages: 5775~5785

    • DOI

      10.1039/c8sm00734a

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Two-point correlation function of ring polymers: Experiments and numerical simulations for the case of circular DNA in 2 dimensions2018

    • Author(s)
      Ropelewski Sophia、Uehara Erica、Lehmann Caroline、Deguchi Tetsuo、Dietler Giovanni
    • Journal Title

      Reactive and Functional Polymers

      Volume: 133 Pages: 66~70

    • DOI

      10.1016/j.reactfunctpolym.2018.10.001

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Mean-square radius of gyration and the hydrodynamic radius for topological polymers expressed with graphs evaluated by the method of quaternions revisited2018

    • Author(s)
      Uehara Erica、Deguchi Tetsuo
    • Journal Title

      Reactive and Functional Polymers

      Volume: 133 Pages: 93~102

    • DOI

      https://doi.org/10.1016/j.reactfunctpolym.2018.09.007

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Statistical properties of multi-theta polymer chains2018

    • Author(s)
      Uehara Erica、Deguchi Tetsuo
    • Journal Title

      Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical

      Volume: 51 Pages: 134001~134001

    • DOI

      https://doi.org/10.1088/1751-8121/aaae2d

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Macrocyclic poly(p-phenylenevinylene)s by ring expansion metathesis polymerisation and their characterisation by single-molecule spectroscopy2018

    • Author(s)
      Lidster Benjamin John、Hirata Shuzo、Matsuda Shoki、Yamamoto Takuya、Komanduri Venukrishnan、Kumar Dharam Raj、Tezuka Yasuyuki、Vacha Martin、Turner Michael L.
    • Journal Title

      Chemical Science

      Volume: 9 Pages: 2934~2941

    • DOI

      10.1039/C7SC03945J

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Recent advances in the construction of cyclic grafted polymers and their potential applications2018

    • Author(s)
      Zhang Shuangshuang、Tezuka Yasuyuki、Zhang Zhengbiao、Li Na、Zhang Wei、Zhu Xiulin
    • Journal Title

      Polymer Chemistry

      Volume: 9 Pages: 677~686

    • DOI

      10.1039/C7PY01544E

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Synthesis, Isolation, and Properties of All Head-to-Tail Cyclic Poly(3-hexylthiophene): Fully Delocalized Exciton over the Defect-Free Ring Polymer2018

    • Author(s)
      Yamamoto Takuya、Hosokawa Masaaki、Nakamura Minato、Sato Shin-ichiro、Isono Takuya、Tajima Kenji、Satoh Toshifumi、Sato Masamichi、Tezuka Yasuyuki、Saeki Akinori、Kikkawa Yoshihiro
    • Journal Title

      Macromolecules

      Volume: 51 Pages: 9284~9293

    • DOI

      10.1021/acs.macromol.8b01681

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Enzyme action for topological entanglement in DNA and knot theory2018

    • Author(s)
      Ishihara K.
    • Journal Title

      Reactive and Functional Polymers

      Volume: 132 Pages: 74~80

    • DOI

      10.1016/j.reactfunctpolym.2018.09.006

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 3-dimensional topology and polycontinuous pattern2019

    • Author(s)
      Koya Shimokawa
    • Organizer
      The Topology of Nucleic Acids: Research at the Interface of Low-Dimensional Topology, Polymer Physics and Molecular Biology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] トポロジーと高分子科学2019

    • Author(s)
      下川航也
    • Organizer
      日本数学会 2019年度年会企画特別講演
    • Invited
  • [Presentation] Poly-continuous pattern, networks and 3-dimensional topology2019

    • Author(s)
      Koya Shimokawa
    • Organizer
      International Symposium "Polymers meet Topology"
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Rouse Dynamics of Topological Polymers through Gaussian Random Embeddings and Comparison with Experiments2019

    • Author(s)
      Tetsuo Deguchi
    • Organizer
      The Topology of Nucleic Acids: Research at the Interface of Low-Dimensional Topology, Polymer Physics and Molecular Biology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Rouse Dynamics of Topological Polymers through Gaussian Random Graph Embeddings2019

    • Author(s)
      Tetsuo Deguchi
    • Organizer
      International Symposium "Polymers meet Topology"
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Knotting probability of self-avoiding polygons under a topological constraint: A sum rule derived from the factorization property2019

    • Author(s)
      T. Deguchi and E. Uehara
    • Organizer
      ``Topology of Biopolymers’’, Special Session at the Spring Eastern Sectional Meeting of AMS
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Topological Polymer Chemistry Designing Macromolecular Graph Constructions, International2019

    • Author(s)
      Y. Tezuka
    • Organizer
      International Symposium "Polymers meet Topology"
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Types of Multicyclic Graphs2019

    • Author(s)
      K. Ishihara
    • Organizer
      International Symposium "Polymers meet Topology"
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] First steps of unlinking pathways2019

    • Author(s)
      K. Ishihara
    • Organizer
      The Topology of Nucleic Acids: Research at the Interface of Low-Dimensional Topology, Polymer Physics and Molecular Biology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Knots, links and spatial graphs in the simple cubic lattice2018

    • Author(s)
      Koya Shimokawa
    • Organizer
      2018 Fall AMS Sectional Meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Lattice knots and links in tube regions2018

    • Author(s)
      Koya Shimokawa
    • Organizer
      33rd Summer Conference on Topology and its Applications
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Topological Polymer Chemistry with Programmed ESA-CF Polymer Folding Constructions2018

    • Author(s)
      Y. Tezuka
    • Organizer
      14th Japan-Belgium Symposium on Polymer Science
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Topological Chemistry Designing Novel Macromolecular Constructions2018

    • Author(s)
      Y. Tezuka
    • Organizer
      2018 Taiwan-Japan Bilateral Polymer Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 下川航也ホームページ

    • URL

      http://www.rimath.saitama-u.ac.jp/lab.jp/KoyaShimokawa.html

  • [Funded Workshop] 国際シンポジウム「Polymers meet Topology」2019

  • [Funded Workshop] The Topology of Nucleic Acids: Research at the Interface of Low-Dimensional Topology, Polymer Physics and Molecular Biology2019

URL: 

Published: 2019-12-27  

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