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2009 Fiscal Year Annual Research Report

FoF1-ATP合成酵素の回転動作機構の解明

Planned Research

Project AreaInnovative nanoscience of supermolecular motor proteins working in biomembranes
Project/Area Number 18074005
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

野地 博行  Osaka University, 産業科学研究所, 教授 (00343111)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 田端 和仁  大阪大学, 産業科学研究所, 助教 (50403001)
飯野 亮太  大阪大学, 産業科学研究所, 助教 (70403003)
Keywords1分子計測 / 分子モーター / 生物物理
Research Abstract

本年度も多くの成果があがった。その中でも重要な成果は細胞内ATPレベルの計測を可能とするATPセンサータンパク質(ATeam)の開発である(PNAS 2009)。これによって、ATPレベルの時間変化、各細胞内分布などを詳細に計測できるようになった。この発表に対する反響は非常に大きく、国内外よりAteamの分与の問い合わせが100件以上来ている。また、NHKをはじめとする各種メディアに多数取り上げられた。また、顕微鏡下における平面膜形成技術を用いた輸送小胞(COPII)の形成過程のダイナミクス計測(EMBO 2009)に関しても、EMBO誌におけるダウンロードTop10に入るなど国内外の反響が非常に大きかった。その他の本年度の主たる成果を下記に列挙する。
● F_1-ATPaseの温度感受性反応ステップの解析:昨年度発見した新しい反応ステップである温度感受性反応が、予想と異なりATP結合前後の構造変化であることが解明された。
● F_0F_1ATP合成酵素のATP合成反応における制御サブユニットの役割:制御サブユニットεは、ATP加水分解・合成反応に対して阻害的に働くことが分かった。また、合成反応における膜電位・pH差依存性が詳細に調べられ、合成時回転の1分子計測に必要な条件が明らかとなった。
● ATP結合の角度依存性:マイクロチャンバーを用いた高感度ATP消費計測技術を応用することで、加水分解方向に強制回転した時のATP加水分解効率を計測した。この結果を、様々なモデルで検証した結果、ATP結合速度定数が回転方向に対して指数的に上昇することが明らかとなった。

  • Research Products

    (22 results)

All 2010 2009

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (13 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Biomolecular Nano-Flow-Sensor to Measure Near-Surface Flow2009

    • Author(s)
      Lee S-W, Kinoshita H, Noji H, Fujii T, Yamamoto T.
    • Journal Title

      Nanoscale Res Lett. 5

      Pages: 296-301

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Protein assay using diffusion effect in single molecule micro-TAS2009

    • Author(s)
      Nakayama T, Namura M, Tabata KV, Noji H, Yokokawa R
    • Journal Title

      Lab on a Chip 9

      Pages: 3567-3573

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Acceleration of the ATP-binding rate of F_1-ATPase by forcible forward rotation2009

    • Author(s)
      Iko, Y., Tabata, K.V., Sakakihara, S., Nakashima, T., Noji, H.
    • Journal Title

      FEBS Lett. 583

      Pages: 3187-3191

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Visualization of cargo concentration by COPII minimal machinery in a planar lipid membrane2009

    • Author(s)
      Tabata, K.V., Sato, K., Ide, T., Nishizaka, T., Nakano, A., Noji, H.
    • Journal Title

      EMBO J. 28

      Pages: 3279-3289

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Visualization of ATP levels inside single living cells with fluorescence resonance energy transfer-based genetically encoded indicators2009

    • Author(s)
      Imamura, H., Huynh Nhat, K.P., Togawa, H., Saito, K., Iino, R., Kato-Yamada, Y., Nagai, T., Noji, H.
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci USA. 106

      Pages: 15651-15656

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-molecule study on the temperature-sensitive reaction of F_1-ATPase with a hybrid F_1 carrying a single ss (E190D)2009

    • Author(s)
      Enoki, S., Watanabe, R., Iino, R., Noji, H.
    • Journal Title

      J Biol Chem. 284

      Pages: 23169-23176

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mechanism of inhibition by C-terminal α-helices of the ε subunit of Escherichia coli F_0F_1-ATP synthase2009

    • Author(s)
      Iino, R., Hasegawa, R., Tabata, K.V., Noji, H.
    • Journal Title

      J Biol Chem. 284

      Pages: 17457-17464

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-biomolecule observation with micro one-way valves for rapid buffer exchange2009

    • Author(s)
      Hirono-Hara, Y., Noji, H., Takeuchi, S.
    • Journal Title

      J Appl.Phys. 105

      Pages: 102016

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Imaging of Intracellular ATP Using FRET-Based Indicators2010

    • Author(s)
      Hiroyuki Noji
    • Organizer
      International Symposium of Joint Research Network on Advanced Materials and Devices
    • Place of Presentation
      Sapporo (Japan)
    • Year and Date
      2010-03-26
  • [Presentation] Single-Molecule Imaging of Ion-Transporting Rotary Motor Protein2010

    • Author(s)
      Ryota Iino, Khek-Chian Tham, Kazuhito V.Tabata, Hiroshi Ueno, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      International Symposium of Joint Research Network on Advanced Materials and Devices
    • Place of Presentation
      Sapporo (Japan)
    • Year and Date
      2010-03-25
  • [Presentation] 超微小反応容器を用いた1分子バイオアッセイ2010

    • Author(s)
      飯野亮太, 野地博行
    • Organizer
      超微小反応容器を用いた1分子バイオアッセイ
    • Place of Presentation
      神奈川県平塚市
    • Year and Date
      2010-03-18
  • [Presentation] Fluctuation theorem applied to F_1-ATPase2010

    • Author(s)
      Kumiko Hayashi, Hiroshi Ueno, Ryota Iino, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      Biophysical Society 54^<th> Annual Meeting
    • Place of Presentation
      San Francisco (USA)
    • Year and Date
      2010-02-24
  • [Presentation] The role of P_i-release as the main torque generating step of F_1-ATPase2010

    • Author(s)
      Rikiya Watanabe, Hiroshi Ueno, Ryota Iino, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      Biophysical Society 54^<th> Annual Meeting
    • Place of Presentation
      San Francisco (USA)
    • Year and Date
      2010-02-21
  • [Presentation] Completion of the chemomechanical coupling scheme of F1-ATPase2009

    • Author(s)
      Hiroyuki Noji
    • Organizer
      Single Molecule Biology Symposium (2^<nd> Kanazawa Bio-AFM workshop)
    • Place of Presentation
      Osaka (Japan)
    • Year and Date
      2009-12-15
  • [Presentation] Direct observation of steps in c-ring rotation of Escherichia coil F_0F_1-ATP synthase2009

    • Author(s)
      Ryota Iino
    • Organizer
      Single Molecule Biology Symposium (2^<nd> Kanazawa Bio-AFM workshop)
    • Place of Presentation
      Osaka (Japan)
    • Year and Date
      2009-12-15
  • [Presentation] Angle Dependency of ATP binding event in V_1-ATPase2009

    • Author(s)
      Naciye Esma Uner, Masahiro Nakano, Daichi Okuno, Ken Yokoyama, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      The 47th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Tokushima (Japan)
    • Year and Date
      2009-10-30
  • [Presentation] Visualization of COPII vesicle formation process reconstituted in the artifical lipid bilayer.2009

    • Author(s)
      Kazuhito Tabata, Ken Sato, Toru Ide, Takayuki Nshizaka, Akihiko Nakano, Hiroyuki Noji
    • Organizer
      The 47^<th> Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Tokushima (Japan)
    • Year and Date
      2009-10-30
  • [Presentation] ATP合成酵素のナノサイエンス2009

    • Author(s)
      野地博行
    • Organizer
      第82回日本生化学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2009-10-23
  • [Presentation] 人工脂質二重膜上に再構成したCOPIIタンパクによる輸送基質の濃縮と輸送されないタンパク質の排除2009

    • Author(s)
      田端和仁, 佐藤健, 井出徹, 西坂崇之, 中野明彦, 野地博行
    • Organizer
      第82同日本生化学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2009-10-21
  • [Presentation] 36-degree stepping rotation of F_0F_1-ATP synthase2009

    • Author(s)
      Hiroyuki Noji, Ryota Iino
    • Organizer
      International Symposium "Innovative Nanoscience of Supermolecular Motor Proteins Working in Biomembranes"
    • Place of Presentation
      Kyoto (Japan)
    • Year and Date
      2009-09-09
  • [Presentation] F1-ATPaseにおける構造揺らぎの役割2009

    • Author(s)
      野地博行
    • Organizer
      日本蛋白質学会年会
    • Place of Presentation
      熊本全日空ホテル
    • Year and Date
      2009-05-22
  • [Book] 「第4章 第1節 第1項 生体膜超分子モーター-細胞の回転エネルギー変換装置:ATP合成酵素」超分子サイエンス&テクノロジー2009

    • Author(s)
      飯野亮太、田端和仁、野地博行
    • Total Pages
      (851-859)
    • Publisher
      NTS

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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