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2008 Fiscal Year Annual Research Report

回転モータトルク発生ユニットの構造基盤

Planned Research

Project AreaInnovative nanoscience of supermolecular motor proteins working in biomembranes
Project/Area Number 18074006
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

今田 勝巳  Osaka University, 大学院・生命機能研究科, 准教授 (40346143)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 南野 徹  大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 助教 (20402993)
Keywords分子モーター / ナノマシン / ナノバイオ / 生物物理 / 分子機械
Research Abstract

本研究では、固定子蛋白質(PomA、PomB、MotX, MotY、MotA、MotB)と、固定子と直接相互作用する回転子蛋白質FliGの原子レベルの構造決定を行い、細菌べん毛のトルク発生ユニットの構造基盤を明らかにすることにより、分子モーターの構築・回転機構の解明を目指している。また、F_0F_1システムとの類似が明らかになったべん毛輸送装置構成蛋白質の構造と作動機構の解明にも取り組んでいる。本年度の主な成果は、以下に記す。
好熱細菌由来の回転子蛋白質FliGは、MCドメイン間の3残基が欠失すると右方向にしか回転できなくなる(CWミュータント)。このミュータントのMCドメインの2.5A分解能の構造解析に成功した。正常なFliGとドメインコンフォメーションが著しく変化していた。
サルモネラ菌由来MotBペリプラズムフラグメントの1.7A分解能での構造解析に成功した。この構造モデルは、MotBがモーター機能を発揮するために必要なペリプラズム領域を全て含んでいる。この構造と構造に基づく変異体解析から、ペリプラズム領域での2量体形成が、膜内の水素イオン透過に関わるヘリックスの配置に決定的な役割を果たすことが明らかになった。また、MotBがモーターに組み込まれる際に大きな構造変化を起こすこと、水素イオン透過性がこの変化と連動することが示唆された。
MotAのFliGに対する相互作用領域の発現に成功した。
べん毛輸送装置構成蛋白質FliJの1.9A分解能での構造解析に成功した。FliJはF_1ATPaseのγサブユニットの構造に酷似しており、これまでのFliIの構造解析結果と併せて、輸送装置の細胞質領域はF_1ATPaseと同様の構造と作用機構を持つ可能性が示唆された。

  • Research Products

    (36 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (28 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray analysis of FliJ, a cytoplasmic component of the flagellar type III protein export apparatus from Salmonella2009

    • Author(s)
      Ibuki, T.
    • Journal Title

      Acta Crystallogr F65

      Pages: 47-50

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effect of Intracellular pH on the Torque-Speed Relationship of Bacterial Proton-Driven Flagellar Motor2009

    • Author(s)
      Nakamura, S.
    • Journal Title

      J. Mol. Biol 386

      Pages: 332-338

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Insights into the stator assembly of the Vibrio flagellar motor from the crystal structure of MotY2008

    • Author(s)
      Kojima, S.
    • Journal Title

      PNAS 105

      Pages: 7696-7701

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Suppressor analysis of the MotB(D33E)mutation to probe the bacterial flagellar motor dynamics coupled with proton translocation2008

    • Author(s)
      Che, Y-S.
    • Journal Title

      J. Bacteriol 190

      Pages: 6660-6667

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mechanisms of type III protein export for bacterial flagellar assembly2008

    • Author(s)
      Minamino, T.
    • Journal Title

      Mol. BioSyst 4

      Pages: 1105-1115

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular motors of the bacterial flagella2008

    • Author(s)
      Minamino, T.
    • Journal Title

      Current Opinion in Structural Biology 18

      Pages: 6660-6667

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Molecular Mechanism of Bacterial Flagellar Protein Export2009

    • Author(s)
      Minamino, T.
    • Organizer
      Mexico-Japan Workshop"Bacterial Physiology and Biop hvsics"
    • Place of Presentation
      UNAM, Mexico City, Mexico
    • Year and Date
      2009-02-26
  • [Presentation] Characterization of suppressors of the MotB(D33E)mutation, a putative proton-binding residue of the bacterial flagellar motor2009

    • Author(s)
      Che, Y.
    • Organizer
      BLAST X Meeting
    • Place of Presentation
      Camino Real Sumiya, Cuema vaca, Mexico
    • Year and Date
      2009-01-20
  • [Presentation] Fluorescence imaging of assembly and disassembly of the bacterial flagellar prote in export ATPase FliL to the flagellar basal body2009

    • Author(s)
      Yoshimura, S.
    • Organizer
      BLAST X Meeting
    • Place of Presentation
      Camino Real Sumiya, Cuemavaca, Mexico
    • Year and Date
      2009-01-20
  • [Presentation] Structure of FIiJ, a cytoplasmic component of the flagellar type III ; protein export apparatus of Salmonella2009

    • Author(s)
      Ibuki, T.
    • Organizer
      BLAST X Meeting
    • Place of Presentation
      Camino Real Sumiya, Cuemavaca, Mexico
    • Year and Date
      2009-01-19
  • [Presentation] Effect of intracellular pH on the torque-speed relationship of bacterial proton-driven flagellar motor2009

    • Author(s)
      Nakamura, S.
    • Organizer
      BLAST X Meeting
    • Place of Presentation
      Camino Real Sumiya, Cuema vaca, Mexico
    • Year and Date
      2009-01-19
  • [Presentation] X-ray analysis of FliJ, a cytoplasmic component of the flagellar type III proteinexport apparatus2008

    • Author(s)
      Ibuki, T.
    • Organizer
      XXI Congress of the International Union of Crystallography
    • Place of Presentation
      Grand Cube Osaka, Japan
    • Year and Date
      20080828-29
  • [Presentation] べん毛特異的Flil ATPaseの離合集散2008

    • Author(s)
      南野徹
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回ワークショップ
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場
    • Year and Date
      20080616-17
  • [Presentation] Characterization and X-ray analysis of FliJ, a cytoplasmic component of the flagellar type III protein export apparatus of Salmonella2008

    • Author(s)
      伊吹達也
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第4回ワークショップ
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場
    • Year and Date
      20080616-17
  • [Presentation] Structure of FliJ, a cytoplasmic component of the flagellar type III protein export apparatus of Salmonella2008

    • Author(s)
      伊吹達也
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第5回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-18
  • [Presentation] 結晶構造から見えてきた細菌べん毛モーター固定子の活性化機構2008

    • Author(s)
      小嶋誠司
    • Organizer
      特定領域研究「生体超分子の構造形成と機能制御の原子機構」第5回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-18
  • [Presentation] べん毛モーター固定子蛋白質MotBのペリプラズムドメインの構造解析2008

    • Author(s)
      小嶋誠司
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場他
    • Year and Date
      2008-12-10
  • [Presentation] 結晶構造が明らかにするべん毛モーターの機能2008

    • Author(s)
      Imada, K.
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-04
  • [Presentation] サルモネラ菌べん毛タイプIII輸送装置構成蛋白質FliJの構造2008

    • Author(s)
      Ibuki, T.
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-04
  • [Presentation] べん毛モーター固定子タンパク質MotB(D33E)変異体とそのサプレッサー変異体モーターのトルク発生機構の解析2008

    • Author(s)
      Che, Y.
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-03
  • [Presentation] 高感度pHイメージングシステムを用いた細菌の細胞内局所pHの測定2008

    • Author(s)
      Morimoto, Y.
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-03
  • [Presentation] 高速高感度で単一菌体内pH分布を計測する顕微システムの開発2008

    • Author(s)
      Morimoto, Y.
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-03
  • [Presentation] 細菌べん毛蛋白質輸送におけるプロトン駆動力の2成分の異なる使われ方2008

    • Author(s)
      Minamino, T.
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-03
  • [Presentation] サルモネラ菌のプロトン駆動型べん毛モーター回転における細胞内pHの影響2008

    • Author(s)
      Nakamura, S.
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-03
  • [Presentation] 細菌べん毛モーター固定子蛋白質MotBのプリプラズムドメインの結晶構造2008

    • Author(s)
      Kojima, S.
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-03
  • [Presentation] 蛍光イメージング法を用いたサルモネラ菌べん毛特異的ATPaseの基部体への離合集散機構の解析2008

    • Author(s)
      Yoshimura, S.
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-03
  • [Presentation] Structure of a biological macromolecular nanomachine, the bacterial flagellum2008

    • Author(s)
      Imada, K.
    • Organizer
      Spring-8 Academic Review Committee(SPARC)
    • Place of Presentation
      SPring-8, Rarima, Japan
    • Year and Date
      2008-11-17
  • [Presentation] 細菌べん毛タンパク質輸送におけるATPaseとプロトン駆動力の役割分担2008

    • Author(s)
      南野徹
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会第34回討論会
    • Place of Presentation
      東京医科歯科大学
    • Year and Date
      2008-11-06
  • [Presentation] Intracellular pH measurement of Salmonella with a pH-sensitive GFP, pHluorin, and a newly developed pH imaging system2008

    • Author(s)
      Morimoto, Y.
    • Organizer
      T3SS-UK meeting
    • Place of Presentation
      Badock Hall, University of Bristol, U.K.
    • Year and Date
      2008-09-11
  • [Presentation] Dynamics of the proton-driven bacterial flagellar motor2008

    • Author(s)
      Minamino, T.
    • Organizer
      T3SS-UK meeting
    • Place of Presentation
      Badock Hall, University of Bristol, U.K.
    • Year and Date
      2008-09-10
  • [Presentation] べん毛蛋白質輸送におけるプロトン駆動力の役割2008

    • Author(s)
      南野徹
    • Organizer
      特定領域研究「膜超分子モーターの革新的ナノサイエンス」第3回班会議
    • Place of Presentation
      名古屋大学野依記念学術交流館
    • Year and Date
      2008-06-27
  • [Presentation] べん毛モーター構成タンパク質の構造2008

    • Author(s)
      今田勝巳
    • Organizer
      特定領域研究「膜超分子モーターの革新的ナノサイエンス」第3回班会議
    • Place of Presentation
      名古屋大学野依記念学術交流館
    • Year and Date
      2008-06-27
  • [Presentation] Characterization and X-ray analysis of FliJ, a cytoplasmic component of the flagellar type III protein export apparatus of Salmonella2008

    • Author(s)
      伊吹達也
    • Organizer
      特定領域研究「膜超分子モーターの革新的ナノサイエンス」第3回班会議
    • Place of Presentation
      名古屋大学野依記念学術交流館
    • Year and Date
      2008-06-27
  • [Presentation] サルモネラ菌べん毛タイプIII輸送装置校正蛋白質FliJの結晶化とX線結晶構造解析2008

    • Author(s)
      伊吹達也
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀
    • Year and Date
      2008-06-11
  • [Book] 細菌べん毛の分子機構,最新分子マシンナノで働く高度な機械を目指して4-22008

    • Author(s)
      今田勝巳
    • Total Pages
      104-112
    • Publisher
      化学同人編集部(編)
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labo/09a.html

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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