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2008 Fiscal Year Annual Research Report

イネ生殖過程におけるゲノム障壁遺伝子の単離と機能解析

Planned Research

Project AreaGenome Barriers in Plant Reproduction
Project/Area Number 18075009
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

倉田 のり  National Institute of Genetics, 系統生物研究センター, 教授 (90178088)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 久保 貴彦  国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 助教 (00370148)
Keywordsゲノム障壁 / イネ / 生殖的隔離
Research Abstract

本研究課題では、イネ亜種間(ジャポニカ, インディカ間)交雑後代に見られる生殖的隔離障壁の単離と機能解析を行う。生殖的隔離は遺伝子間の相互作用によって引き起こされるため、相互作用遺伝子を一対として単離し、どのステージで「ゲノム障壁」として働くのか、通常の生殖過程ではどのような機能を持つのかなどの解明を行う。これらの研究を通じて、生殖過程の中でゲノム間の遺伝子変異により生じる障壁の構造、機能、進化の実態を明らかにし、植物進化や多様性との関連について解析することを目指す。今年度の成果は、
1. POC遺伝子の候補としてRNAサイレンシングに関わるPAZ-domainタンパクをコードする遺伝子を見出し、相補性検定によりこのことを実証した。相互作用因子であるPOIについても、ファインマッピングによりHis-kinaseタンパクをコードする遺伝子を候補遺伝子として特定した。
2. 2組目の第1染色体と第6染色体に座乗する生殖隔離遺伝子対は、雄性配偶子側で働く生殖隔離遺伝子であることがわかっている。それらの遺伝子単離を進め、両遺伝子が機能未知の重複遺伝子であることがわかった。この相同遺伝子はイネを含む単子葉・双子葉植物において広く保存されており、イネ以外ではシングルコピーであることがわかった。よって、本遺伝子の進化解析における重要性が示唆された。
3. 亜種間交雑にみられる雌性配偶子致死は染色体8、9と12に座乗する遺伝子座によるが原因遺伝子は未特定である。このうち、染色体12については候補遺伝子を一つに特定した。また、雌性致死が減数分裂後の発生異常によることを明らかにした。
4. 日本晴とKinandang puti間で見出された第1染色体末端で大きな分離歪みを引き起す生殖隔離遺伝子について、関与領域を116kbに特定した。

  • Research Products

    (20 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (15 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] A novel epistatic interaction at two loci causing hybrid male sterility in an inter-subspecific cross of rice (Oryza sativa L.)2009

    • Author(s)
      Kubo T
    • Journal Title

      Genes Genet. Syst. 83

      Pages: 443-453

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification, characterization and interaction of HAP family genes in rice2008

    • Author(s)
      Thirumurugan T.
    • Journal Title

      Mol Gen Genomics 279

      Pages: 279-289

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Separated transcriptomes of male gametophyte and tapetum in rice : validity of a laser microdissection (LM) microarray2008

    • Author(s)
      Suwabe K
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol. 49

      Pages: 1407-1416

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Various spatiotemporal expression profiles of anther-expressed genes in rice2008

    • Author(s)
      Hobo T
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol. 49

      Pages: 1417-1428

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] イネ亜種間交雑で分離の歪みを示すゲノム領域の検出2009

    • Author(s)
      久保貴彦
    • Organizer
      日本育種学会第115回講演会
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      20090327-28
  • [Presentation] イネのF1花粉不稔遺伝子S24に相互作用する遺伝子座S352009

    • Author(s)
      久保貴彦
    • Organizer
      日本育種学会第115回講演会
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      20090327-28
  • [Presentation] 日本晴とKinandang putiとの交雑で見られる生殖隔離遺伝子座のマッピング2009

    • Author(s)
      新濱充
    • Organizer
      日本育種学会第115回講演会
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      20090327-28
  • [Presentation] イネ全生殖過程における遺伝子発現解析を用いた多様な因子の捕捉2009

    • Author(s)
      藤田雅丈
    • Organizer
      日本育種学会第115回講演会
    • Place of Presentation
      つくば
    • Year and Date
      20090327-28
  • [Presentation] イネの雄性配偶子とタペータム細胞でのトランスクリプトーム解析2009

    • Author(s)
      保浦徳昇
    • Organizer
      第50回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20090321-24
  • [Presentation] 栽培イネと野生イネの種間交雑にみられる胚乳発生異常の原因2009

    • Author(s)
      石川亮
    • Organizer
      第50回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      20090321-24
  • [Presentation] イネ亜種間交雑で生殖的隔離障壁となる重複遺伝子の解析2008

    • Author(s)
      水多陽子
    • Organizer
      日本育種学会第114回講演会
    • Place of Presentation
      彦根
    • Year and Date
      20081011-12
  • [Presentation] イネのシュート形成における極長鎖脂肪酸(VLCFA)の機能解析2008

    • Author(s)
      津田勝利
    • Organizer
      日本育種学会第114回講演会
    • Place of Presentation
      彦根
    • Year and Date
      20081011-12
  • [Presentation] Genomic Imprinting and reproductive barrier observed in the hybrid endosperm of rice2008

    • Author(s)
      Ishikawa R
    • Organizer
      EMBO Workshop
    • Place of Presentation
      Singapope
    • Year and Date
      20080921-24
  • [Presentation] Identification of a Reproductive Barrier Working in the Process of Pollen Competition in Rice2008

    • Author(s)
      倉田のり
    • Organizer
      XX International Congress of Genetics
    • Place of Presentation
      Berlin
    • Year and Date
      20080712-17
  • [Presentation] Positional Cloning of a Pair of Interactive Genes Causing Reproductive Barrier in the Hybrid Pollen of Rice2008

    • Author(s)
      水多陽子
    • Organizer
      XX International Congress of Genetics
    • Place of Presentation
      Berlin
    • Year and Date
      20080712-17
  • [Presentation] Detection of Pairs of Interactive Reproductive Barriers in Rice Genome2008

    • Author(s)
      春島嘉章
    • Organizer
      XX International Congress of Genetics
    • Place of Presentation
      Berlin
    • Year and Date
      20080712-17
  • [Presentation] Identification and Analysis of Rice Mutants Misexpressing KNOX Genes in Leaves2008

    • Author(s)
      Tsuda K
    • Organizer
      XX International Congress of Genetics
    • Place of Presentation
      Berlin
    • Year and Date
      20080712-17
  • [Presentation] Detection of Nucleotide and Expression Polymorphisms between Rice Strains Using Affymetrix Rice Genome Array2008

    • Author(s)
      Horiuchi Y
    • Organizer
      XX International Congress of Genetics
    • Place of Presentation
      Berlin
    • Year and Date
      20080712-17
  • [Presentation] 減数第一分裂前期に特異的な染色体挙動の観察2008

    • Author(s)
      米田典央
    • Organizer
      イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ2008
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20080704-05
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.nig.ac.jp/labs/NigPrjct/PlantGenBarr/index.html

URL: 

Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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