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2009 Fiscal Year Annual Research Report

イネ生殖過程におけるゲノム障壁遺伝子の単離と機能解析

Planned Research

Project AreaGenome Barriers in Plant Reproduction
Project/Area Number 18075009
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

倉田 のり  National Institute of Genetics, 系統生物研究センター, 教授 (90178088)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 久保 貴彦  国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 助教 (00370148)
寺田 理枝  国立遺伝学研究所, 基礎生物学研究所・分子遺伝学研究部門, 助教 (30137799)
Keywordsゲノム障壁 / イネ / 生殖的隔離
Research Abstract

本研究課題では、イネ亜種間(ジャポニカ,インディカ間)交雑後代に見られる生殖的隔離障壁の単離と機能解析を行う。生殖的隔離は遺伝子間の相互作用によって引き起こされるため、相互作用遺伝子を一対として単離し、どのステージで「ゲノム障壁」として働くのか、通常の生殖過程ではどのような機能を持つのかなどの解明を行う。これらの研究を通じて、生殖過程の中でゲノム間の遺伝子変異により生じる障壁の構造、機能、進化の実態を明らかにし、植物進化や多様性との関連について解析することを目指す。今年度の成果は、
1. RNAサイレンシングに関わるPAZ-domainタンパクPOC遺伝子の相互作用因子であるPOIについて、His-kinaseタンパクをコードする遺伝子を候補遺伝子として特定し、相補性検定を進めた。
2. 2組目の生殖隔離遺伝子対DPL1(染色体1)とDPL2(染色体6)が機能未知の重複遺伝子であり、花粉の機能に必須であることを明らかにした。またイネにおけるそれらの重複時期と機能欠損の発生時期などの進化の道筋を特定した。DPL1/DPL2は単子葉・双子葉植物で高度に保存されており、他の代表的なモデル植物種においても重複して存在することを見出し、進化解析における本遺伝子の重要性を示唆する結果を得た。
3. 亜種間交雑にみられる雌性配偶子致死は染色体8、9と12に座乗する遺伝子座間相互作用によることがわかっている。その分子機構の解明を目的として、染色体12について候補遺伝子を特定し相補性検定を進めた。また、相互作用因子である染色体8については、160kbの領域に絞り込んだ。
4. 日本晴とKinandang puti間で見出された第1染色体末端で大きな分離歪みを引き起す生殖隔離遺伝子について、関与領域を83kbに特定し、この領域内に大きなゲノム変異があることを明らかにした。

  • Research Products

    (31 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (25 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] SNEP : Simultaneous detection of nucleotide and expression polymorphisms using Affymetrix GeneChip2009

    • Author(s)
      Fujisawa H
    • Journal Title

      BMC Bioinformatics VOL.10

      Pages: 131

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation and mapping of three rice mutants that showed ectopic expression of KNOX genes in leaves2009

    • Author(s)
      Tsuda K
    • Journal Title

      Plant Sci. 177

      Pages: 131-135

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evolutionary History of GS3, a Gene Conferring Grain Length in Rice2009

    • Author(s)
      Takano-Kai N
    • Journal Title

      Genetics 182

      Pages: 1323-1334

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of two loci causing F_1 pollen sterility in inter^- and intras pecific crosses of rice2009

    • Author(s)
      Win KT
    • Journal Title

      Breeding Sci. 59

      Pages: 411-418

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] アブラナ科植物の雌ずい乳頭細胞で特異的に発現する遺伝子群の解析2010

    • Author(s)
      大原圭子
    • Organizer
      第51回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本大学(熊本県)
    • Year and Date
      20100318-20100319
  • [Presentation] シロイヌナズナゲノムタイリングアレイを用いたメチローム・トランスクリプトーム統合解析2010

    • Author(s)
      柴博史
    • Organizer
      第51回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本大学(熊本県)
    • Year and Date
      20100318-20100319
  • [Presentation] 次世代高速シークエンサー自動解析パイプラインによるイネ近縁種ゲノム解析2010

    • Author(s)
      永田俊文
    • Organizer
      第51回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本大学(熊本県)
    • Year and Date
      20100318-20100319
  • [Presentation] イネの遺伝子発現ネットワーク構築2010

    • Author(s)
      濱田和輝
    • Organizer
      第51回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本大学(熊本県)
    • Year and Date
      20100318-20100319
  • [Presentation] イネ亜種間交雑で生殖的隔離を引き起こすDOPPELGANGER(DPL)1とDPL2の解析2010

    • Author(s)
      水多陽子
    • Organizer
      日本育種学会第117回講演会
    • Place of Presentation
      京都大学(京都府)
    • Year and Date
      2010-03-27
  • [Presentation] 次世代高速シークエンサー自動解析パイプラインによるイネ近縁種ゲノム解析2010

    • Author(s)
      永田俊文
    • Organizer
      日本育種学会第117回講演会
    • Place of Presentation
      京都大学(京都府)
    • Year and Date
      2010-03-26
  • [Presentation] イネの遺伝子発現ネットワーク構築2010

    • Author(s)
      濱田和輝
    • Organizer
      日本育種学会第117回講演会
    • Place of Presentation
      京都大学(京都府)
    • Year and Date
      2010-03-26
  • [Presentation] Quantification of barriers to pollen tube elongation in interspecific crosses of Oryza2010

    • Author(s)
      Shenton M
    • Organizer
      日本育種学会第117回講演会
    • Place of Presentation
      京都大学(京都府)
    • Year and Date
      2010-03-26
  • [Presentation] イネ亜種間交雑で生殖的隔離を引き起こすDOPPELGANGER(DPL1)およびDPL2遺伝子の解析2010

    • Author(s)
      水多陽子
    • Organizer
      第51回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本大学(熊本県)
    • Year and Date
      2010-03-20
  • [Presentation] イネ雌性配偶体構成細胞における遺伝子発現プロファイリング2010

    • Author(s)
      高梨秀樹
    • Organizer
      第51回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本大学(熊本県)
    • Year and Date
      2010-03-20
  • [Presentation] Genome barriers in the reproductive process of rice2010

    • Author(s)
      倉田のり
    • Organizer
      International Symposium of Cell-Cell Communication in Plant Reproduction : from pollination to fertilization
    • Place of Presentation
      奈良県新公会堂(奈良県)
    • Year and Date
      2010-03-12
  • [Presentation] Analysis of a pair of genes, DOPPELGANGER(DPL)1 and DPL2 responsible for reproductive isolation between two rice subspecies2010

    • Author(s)
      水多陽子
    • Organizer
      International Symposium of Cell-Cell Communication in Plant Reproduction : from pollination to fertilization
    • Place of Presentation
      奈良県新公会堂(奈良県)
    • Year and Date
      2010-03-11
  • [Presentation] イネ亜種間交雑で生殖的隔離を引き起こすDOPPELGANGER1(DPL1)とDPL2の単離・解析2009

    • Author(s)
      水多陽子
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • Year and Date
      2009-12-12
  • [Presentation] Genetic and genomic analysis of factors consisting of reproductive barriers in rice2009

    • Author(s)
      倉田のり
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • Year and Date
      2009-12-11
  • [Presentation] イネの大規模な遺伝子発現データに基づく発現制御ネットワーク構築2009

    • Author(s)
      濱田和輝
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] 次世代高速シークセンサーを用いた近縁イネゲノム配列データの評価2009

    • Author(s)
      永田俊文
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] イネ全生殖過程における遺伝子発現解析を用いた多様な因子の捕捉2009

    • Author(s)
      藤田雅丈
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] Genome evolution and reproductive barriers in rice2009

    • Author(s)
      倉田のり
    • Organizer
      6th International Rice Genetics symposium
    • Place of Presentation
      Manila Hotel(Philippines)
    • Year and Date
      2009-11-17
  • [Presentation] Wild Rice Resource Project in Japan Its Perspectives2009

    • Author(s)
      倉田のり
    • Organizer
      6th International Rice Genetics symposium
    • Place of Presentation
      Manila Hotel(Philippines)
    • Year and Date
      2009-11-17
  • [Presentation] Affimetrix Rice Genome Array を用いたSFP検出とゲノム多様性解析への利用2009

    • Author(s)
      堀内陽子
    • Organizer
      日本育種学会第116回講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道)
    • Year and Date
      2009-09-26
  • [Presentation] F2集団を使った配偶体または接合体内の2遺伝子座間の相互作用による生殖的隔離の検出2009

    • Author(s)
      春島嘉章
    • Organizer
      日本育種学会第116回講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道)
    • Year and Date
      2009-09-26
  • [Presentation] イネの種子長に関する遺伝子座GS3の多様性2009

    • Author(s)
      鷹野典子
    • Organizer
      日本育種学会第116回講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道)
    • Year and Date
      2009-09-25
  • [Presentation] イネの胚珠分化に異常を示す osmads13変異体の解析2009

    • Author(s)
      山木辰一郎
    • Organizer
      日本育種学会第116回講演会
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道)
    • Year and Date
      2009-09-25
  • [Presentation] イネ亜種間交雑において生殖的隔離を引き起こす相互作用遺伝子座DOPPELGANGER1と2の単離・解析2009

    • Author(s)
      水多陽子
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会
    • Place of Presentation
      信州大学理学部(長野県)
    • Year and Date
      2009-09-17
  • [Presentation] 野生イネ種間、種内変異とゲノム機能分化2009

    • Author(s)
      倉田のり
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会
    • Place of Presentation
      信州大学理学部(長野県)
    • Year and Date
      2009-09-16
  • [Book] バィオリソース&データベース活用術(細胞工学別冊)2009

    • Author(s)
      倉田のり
    • Total Pages
      190-192
    • Publisher
      秀潤社
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.nig.ac.jp/labs/NigPrjct/PlantGenBarr/index.html

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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