Genomic barriers during endosperm development

2008 Fiscal Year Self-evaluation Report

• Project Area: Genome Barriers in Plant Reproduction
• Project/Area Number: 18075010
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: Nara Institute of Science and Technology (2007-2010); National Institute of Genetics (2006)
• Principal Investigator: KINOSHITA Tetsu Nara Institute of Science and Technology, バイオサイエンス研究科, 特任准教授 (60342630)
• Project Period (FY): 2006 – 2010
• Keywords: ゲノムインプリンティング / DAN脱メチル化 / エピジェネティクス / シロイヌナズナ / 胚乳DNAメチル化

Research Abstract

植物の胚乳では、父親と母親の由来に従って、遺伝子発現が決定されるゲノムインプリンティングという機構が知られている。これは、遺伝子発現のオン・オフがDNAのメチル化や、ヒストン修飾などのエピジェネティックな情報により決定される機構である。植物のゲノムインプリンティングはエピジェネティック制御のモデル系であるとともに、胚乳でおこる生殖隔離機構の鍵を握っていることが示唆されている。ゲノムインプリンティングの制御機構の解明は、DNAの塩基配列情報以外のエピジェネティックな情報が、種間の生殖隔離機構を担っていることを示すための必要不可欠なステップと位置づけ、この解明を目指す。

Research Products

• [Journal Article] MATERNALLY EXPRESSED PAB C-TERMINAL, a Novel Imprinted Gene in Arabidopsis (2009)
  • Author(s): Tiwari S., Schulz R., Ikeda Y., Dytham L., Bravo J., Mathers L., Spielman M., Guzman P., Oakey RJ., Kinoshita T., and Scott RJ.
  • Journal Title: Encodes the Conserved C-Terminal Domain of Polyadenylate Binding Proteins Plant Cell 20 Pages: 2387-2398
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Evolution and control of imprinted FWA genes in the genus Arabidopsis. (2008)
  • Author(s): Fujimoto R, Kinoshita Y, Kawabe A, Kinoshita T, Takashima K, Nordborg M, Nasrallah ME, Shimizu KK, Kudoh H, Kakutani T
  • Journal Title: Plos Genetics 4,(4) Pages: e1000048
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Genomic imprinting: A balance between antagonistic roles of parental chromosomes. (2008)
  • Author(s): Kinoshita T, Ikeda Y, Ishikawa R.
  • Journal Title: Seminars in Cell and Dev Biol 19 Pages: 574-579
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Control of FWA gene silencing in Arabidopsis thaliana by SINE-related direct repeats. (2007)
  • Author(s): Kinoshita Y, Saze H, Kinoshita T, Miura A, Soppe WJ, Koorneef M, Kakutani T
  • Journal Title: Plant J 49 Pages: 38-45
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Maintenance of DNA methylation during the Arabidopsis life cycle is essential for parental imprinting (2006)
  • Author(s): Jullien PE, Kinoshita T, Ohad N, Berger F
  • Journal Title: Plant Cell 18 Pages: 1360-72
• [Presentation] Control of Genomic Imprinting by ALAR M CLOCK1 gene in Arabidopsis (2008)
  • Author(s): 木下哲
  • Organizer: Frontiers of Sexual Plant Reproduction III
  • Place of Presentation: U.S.A. Tucson
  • Year and Date: 20081000
• [Presentation] Establishment of genomic imprinting by ALARM CLOCK genes in Arabidopsis (2008)
  • Author(s): 木下哲
  • Organizer: EMBO Workshop on Genomic Imprinting
  • Place of Presentation: Singapore
  • Year and Date: 20080900
• [Book] ゲノムインプリンティング、細胞工学別冊植物細胞工学シリーズ24、植物のエピジェネティクス (2008)
  • Author(s): 池田陽子、木下哲
  • Total Pages: 129-135
  • Publisher: 秀順社
• [Book] ポリコーム複合体による植物の発生制御、植物の生長調節43(1) (2008)
  • Author(s): 木下哲、池田陽子、石川亮
  • Total Pages: 29-34
• [Remarks] 植物におけるゲノムインプリンティングの同定とその制御機構に関する研究 第48回日本植物生理学会(2007)日本植物学会奨励賞受賞講演
• [Remarks]
  • URL: http://bsgcoe.naist.jp/special-grp02.html