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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Dynamic optimization strategy of plant structural unit learning from synthesis and degradation process of woody biomass

Planned Research

Project AreaElucidation of the strategies of mechanical optimization in plants toward the establishment of the bases for sustainable structure system
Project/Area Number 18H05494
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

五十嵐 圭日子  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (80345181)

Project Period (FY) 2018-06-29 – 2023-03-31
Keywordsセルロース / セルラーゼ
Outline of Annual Research Achievements

2019年度は、生合成(biosynthesis)レベルの実験としては、2018年度から引き続き、植物細胞壁の主成分であるセルロースがどのように結晶(セルロースナノクリスタル;CNC)化し、それがセルロースナノファイバー(CNF)化するのかを明らかにするとともに、植物細胞壁の生合成および生分解に関わる酵素の生産に力点を置いた。一方で、昨年度安定したセルロース合成実験に成功したセロデキストリン加リン酸分解酵素の逆反応を用いたCNCの生産系は、重力による影響を調べるために引き続き宇宙実験を試みる。昨年度はロシアでのロケット打ち上げ失敗とともにJAXAFS実験の不採択を受けて、本年度は有人宇宙システム株式会社(JAMSS)との共同研究によって宇宙におけるセルロース合成に取り組み成功させた。
生分解(biodegradation)に関する実験としては、昨年度成果報告にたどり着いたセルラーゼによるCNCの分解挙動の完全シミュレーションを用いて、結晶型の影響やセルロース分子鎖の長さ依存性などを明らかにした。また、細菌由来のセルラーゼによるセルロース分解メカニズムを明らかにする実験にも取り組み、それらに関してin vitroとin silicoの実験を並行して進めた。さらに生改変(biomodification)実験としては、植物細胞壁のリモデリングに関与する酵素群によるCNCやCNFの変化観察に取り組み始めており、特にセルロース繊維の膨潤に関与する酵素としてエクスパンシンの特徴付けなどにも取り組む。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

昨年度計画していた宇宙ステーションでの微小重力実験の失敗を、JAMSSとの共同研究によって成功させた。

Strategy for Future Research Activity

生合成(biosynthesis)レベルの実験としては、主に一昨年度、昨年度に引き続き、植物細胞壁の主成分であるセルロースがどのように結晶(セルロースナノクリスタル;CNC)化し、それがセルロースナノファイバー(CNF)化するのかを明らかにするとともに、植物細胞壁の生合成および生分解に関わる酵素の生産に力点を置く。本年度は動物の中で唯一セルロースを合成することが知られているホヤのセルロース合成酵素に関しても、研究を行う予定である。一方で昨年度安定したセルロース合成実験に成功しているセロデキストリン加リン酸分解酵素の逆反応を用いたCNCの生産系は、重力による影響を調べるために再度宇宙実験を試みる。昨年度のSpaceXによる成功を受けて、本年度は実験手法をさらに最適化して望む。生分解(biodegradation)に関する実験としては、昨年度成果報告にたどり着いたセルラーゼによるCNCの分解挙動の完全シミュレーションを用いて、結晶型の影響やセルロース分子鎖の長さ依存性などを明らかにする。また、細菌由来のセルラーゼによるセルロース分解メカニズムを明らかにする実験にも取り組み始めたことから、それらに関してin vitroとin silicoの実験を並行して進める予定である。さらに生改変(biomodification)実験としては、セルロース繊維の膨潤に関与する酵素としてエクスパンシンの反応性をさらに深く調べる。

  • Research Products

    (13 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 4 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] VTTフィンランド技術研究センター(フィンランド)

    • Country Name
      FINLAND
    • Counterpart Institution
      VTTフィンランド技術研究センター
  • [Journal Article] The Lipomyces starkeyi gene Ls120451 encodes a cellobiose transporter that enables cellobiose fermentation in Saccharomyces cerevisiae2020

    • Author(s)
      de Ruijter, J. C., Igarashi, K., and Penttila, M.
    • Journal Title

      FEMS Yeast Res.

      Volume: 20 Pages: foaa019

    • DOI

      10.1093/femsyr/foaa019

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Evaluation of ammonia pretreatment for enzymatic hydrolysis of sugarcane bagasse to recover xylooligosaccharides2020

    • Author(s)
      Tsutsui, S., Sakuragi, K., Igarashi, K., Samejima, M., and Kaneko, S.
    • Journal Title

      J. Appl. Glycosci.

      Volume: 67 Pages: 17-22

    • DOI

      10.1103/PhysRevLett.122.098102

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The crystal structure of the catalytic domain and the cytochrome b domain in a eukaryotic PQQ-dependent dehydrogenase2019

    • Author(s)
      Takeda, K., Ishida, T., Yoshida, M., Samejima, M., Hiroyuki Ohno, Igarashi, K., and Nakamura, N.
    • Journal Title

      Appl. Environ. Microbiol.

      Volume: 85 Pages: e01692

    • DOI

      10.1128/AEM.01692-19

  • [Presentation] 酵母による組換え酵素生産性向上に向けた自動化培養システムの構築2020

    • Author(s)
      砂川直輝、古久保美樹、五十嵐圭日子、 望月誠、大野ふみ、松尾英典、伊賀光博
    • Organizer
      第70回日本木材学会鳥取大会
  • [Presentation] 白色腐朽菌Phanerochete chrysosporium由来β-1,3-ガラクタナーゼの結晶構造解析2020

    • Author(s)
      松山佳織、五十嵐圭日子、金子哲、石田卓也、藤本瑞
    • Organizer
      第70回日本木材学会鳥取大会
  • [Presentation] セロデキストリンホスホリラーゼにより合成されたセルロース微結晶の解析2019

    • Author(s)
      久我友大、砂川直輝、鮫島正浩、五十嵐圭日子
    • Organizer
      第26回セルロース学会
  • [Presentation] New Cellulosic Materials via Cellulose Endo-Transglycosylases and Cellodextrin Phosphorylases2019

    • Author(s)
      Naoki Sunagawa
    • Organizer
      The 2019 Gordon Research Conference on Carbohydrate-Active Enzymes for Glycan Conversions
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] バイオエコノミーの実現に向けたセルラーゼの基礎研究:10^15の壁を越えて2019

    • Author(s)
      五十嵐 圭日子
    • Organizer
      バイオ・高分子研究会/バイオミメティクス研究会合同研究会
    • Invited
  • [Presentation] Neutron and high-resolution X-ray structural studies of cellulases2019

    • Author(s)
      Kiyohiko Igarashi
    • Organizer
      J-PARC Symposium 2019
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Molecular mechanisms of cellulases2019

    • Author(s)
      Kiyohiko Igarashi
    • Organizer
      7th International Conference on Bio-based Polymers (ICBP2019)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 世界初、宇宙でのセルロース酵素合成に成功

    • URL

      https://www.a.u-tokyo.ac.jp/news/news_20200316-1.html

  • [Remarks] 真核生物初のピロロキノリンキノン依存性脱水素酵素の立体構造を決定

    • URL

      https://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/topics_20191216-1.html

URL: 

Published: 2021-12-27  

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