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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Structural and chemical properties of non-cellulosic cell wall polymers contributing to mechanical strength of plants

Planned Research

Project AreaElucidation of the strategies of mechanical optimization in plants toward the establishment of the bases for sustainable structure system
Project/Area Number 18H05495
Research InstitutionSaitama University

Principal Investigator

小竹 敬久  埼玉大学, 理工学研究科, 教授 (20334146)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 石水 毅  立命館大学, 生命科学部, 教授 (30314355)
Project Period (FY) 2018-06-29 – 2023-03-31
Keywordsアラビノガラクタン-タンパク質 / 細胞壁 / ガラクタナーゼ / セルロース / ラムノガラクツロナン-I / ペクチン / 細胞壁物性
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、植物体の優れた物理的性質に寄与する細胞壁成分のはたらきを調べた。アラビノガラクタン-プロテイン(AGP)は植物の細胞外プロテオグリカンであるが、糖鎖の働きがよくわかっていない。またペクチンは細胞接着を介した組織形態の制御への関与が指摘されてきた。本研究ではAGPの糖鎖とペクチンのラムノガラクツロナン(RG)-Iの植物体物性への寄与を明らかにすることを目指した。
AGPの糖鎖であるAGは構造が多様であるが、(i) 糖鎖主鎖がβ-1,3-ガラクタンであること、(ii) 糖鎖側鎖にβ-1,6-ガラクタンをもつこと、は共通している。本研究ではまず、真菌由来の特異的な酵素分解を利用し、側鎖の頻度や側鎖長の分布が植物種を超えて保存されていることを明らかにした。またAGの特定糖鎖がin vivoで破壊されるシロイヌナズナを作出したところ、主鎖β-1,3-ガラクタンの破壊で著しい成長阻害と組織形態が観察された。また主鎖β-1,3-ガラクタンを破壊せずに長いβ-1,6-ガラクタン側鎖を特異的に分解しても顕著な成長阻害が起こった。これらの植物ではセルロース量が減少し、胚軸の細胞壁物性が顕著に変化していた。以上から、AGPの糖鎖はセルロース合成を介して細胞壁物性に寄与することが示唆された。
急速な細胞成長が起こる暗所胚軸で、RG-Iのアラビナン側鎖が異常なarad2変異体とRG-IIが異常なmur1変異体の胚軸の細胞壁物性を引張試験により調べたところ、どちらも野生型植物と比べてゆっくり破断されることがわかった。mur1変異体で表皮細胞の剥離や細胞列の乱れなどの異常がみられ、arad2変異体でも程度は弱いものの同様の異常がみられた。RG-IとRG-IIには少なくとも部分的な機能重複があり、細胞接着や細胞形態制御により、胚軸の細胞壁物性に影響していることがわかった。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (30 results)

All 2023 2022

All Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 5 results) Presentation (20 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results)

  • [Journal Article] Rhamnogalacturonan-I as a nematode chemoattractant from Lotus corniculatus L. super-growing root culture2023

    • Author(s)
      Oota Morihiro、Toyoda Syuuto、Kotake Toshihisa、Wada Naoki、Hashiguchi Masatsugu、Akashi Ryo、Ishikawa Hayato、Favery Bruno、Tsai Allen Yi-Lun、Sawa Shinichiro
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 13 Pages: 1008725

    • DOI

      10.3389/fpls.2022.1008725

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] FLOURY ENDOSPERM 6 mutations enhance the sugary phenotype caused by the loss of ISOAMYLASE1 in barley2023

    • Author(s)
      Matsushima, R., Hisano, H., Galis, I., Miura, S., Crofts, N., Takenaka, Y., Oitome, N.F., Ishimizu, T., Fujita, N., Sato, K.
    • Journal Title

      Theor. Appl. Genet.

      Volume: - Pages: -

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Plant type II arabinogalactan: Structural features and modification to increase functionality2023

    • Author(s)
      Ghosh, K., Takahashi D., Kotake T.
    • Journal Title

      Carbohydr. Res.

      Volume: - Pages: -

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Surface-localized glycoproteins act through class C ARFs to fine-tune gametophore initiation in Physcomitrium patens2022

    • Author(s)
      Teh Ooi Kock、Singh Prerna、Ren Junling、Huang Lin Tzu、Ariyarathne Menaka、Salamon Benjamin Prethiviraj、Wang Yu、Kotake Toshihisa、Fujita Tomomichi
    • Journal Title

      Development

      Volume: 149 Pages: dev200370

    • DOI

      10.1242/dev.200370

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] In vivo structural modification of type II arabinogalactans with fungal endo-β-1, 6-galactanase in Arabidopsis2022

    • Author(s)
      Kikuchi Aina、Hara Katsuya、Yoshimi Yoshihisa、Soga Kouichi、Takahashi Daisuke、Kotake Toshihisa
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 13 Pages: 1010492

    • DOI

      10.3389/fpls.2022.1010492

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Temporal cell wall changes during cold acclimation and deacclimation and their potential involvement in freezing tolerance and growth2022

    • Author(s)
      Kutsuno Tatsuya、Chowhan Sushan、Kotake Toshihisa、Takahashi Daisuke
    • Journal Title

      Physiologia Plantarum

      Volume: 175 Pages: e13837

    • DOI

      10.1111/ppl.13837

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Hydroxycinnamic acid‐modified xylan side chains and their cross‐linking products in rice cell walls are reduced in the Xylosyl arabinosyl substitution of xylan 1 mutant2022

    • Author(s)
      Feijao Carolina、Morreel Kris、Anders Nadine、Tryfona Theodora、Busse‐Wicher Marta、Kotake Toshihisa、Boerjan Wout、Dupree Paul
    • Journal Title

      The Plant Journal

      Volume: 109 Pages: 1152~1167

    • DOI

      10.1111/tpj.15620

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Metabolomic analysis of rice brittle culm mutants reveals each mutant- specific metabolic pattern in each organ2022

    • Author(s)
      Miyagi Atsuko、Mori Kazuhisa、Ishikawa Toshiki、Ohkubo Satoshi、Adachi Shunsuke、Yamaguchi Masatoshi、Ookawa Taiichiro、Kotake Toshihisa、Kawai-Yamada Maki
    • Journal Title

      Metabolomics

      Volume: 18 Pages: 95

    • DOI

      10.1007/s11306-022-01958-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Alkaline hydrolysis of coconut pith: process optimization, enzymatic saccharification, and nitrobenzene oxidation of Kraft lignin2022

    • Author(s)
      Gundupalli, M.P., Kajiura, H., Ishimizu, T., Bhattacharyya, D.
    • Journal Title

      Biomass Conv. Bioref.

      Volume: 12 Pages: 2349-2367

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural features of free N-glycans in α1,3/4-fucosidase-deficient Arabidopsis thaliana: deletion of α1,3/4-fucosidase activity induced accumulation of plant complex type GN1 free N-glycans2022

    • Author(s)
      Takata Shun、Hayashi Megumi、Maeda Megumi、Ishimizu Takeshi、Kimura Yoshinobu
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 86 Pages: 1413~1416

    • DOI

      10.1093/bbb/zbac120

  • [Presentation] Changes in soluble sugars and cell wall in wheat cultivars during cold acclimation2023

    • Author(s)
      Sushan Chowhan, Tatsuya Kutsuno, Hiroto Handa, Toshihisa Kotake, Daisuke Takahashi
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] L-アスコルビン酸合成におけるKONJAC1タンパク質の役割2023

    • Author(s)
      宮川萌、高橋大輔、小竹敬久
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会・仙台
  • [Presentation] シロイヌナズナ子葉敷石細胞の多方向への平面成長は団扇型の子葉形態形成に寄与する2023

    • Author(s)
      菊川琴美,今村寿子,曽我康一,小竹敬久,檜垣匠
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] メタボローム解析から探るイネのカマイラズ変異体の代謝変動2023

    • Author(s)
      宮城敦子,森和久,石川寿樹,大久保智司,安達俊輔,大川泰一郎,山口雅利,小竹敬久,川合真紀
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会・仙台
  • [Presentation] An epigenetic regulator affects awn formation in barley2023

    • Author(s)
      中村 光希,菊池 優一,白神 美瑞穂,小竹 敬久,武田 真,池田 陽子
    • Organizer
      第64回日本植物生理学会年会
  • [Presentation] エノコログサ(Setaria viridis)のアラビノキシラン生合成に関わるアラビノフラノース転移酵素の組換えタンパク質発現2023

    • Author(s)
      鈴木聖治,木塚康彦,石水毅,鈴木史朗
    • Organizer
      第73回日本木材学会大会
  • [Presentation] パセリ由来時空間特異的に発現するタンパク質複合体の同定2023

    • Author(s)
      金井梨夏,濱出拓人,石水毅
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会
  • [Presentation] 植物細胞壁ペクチンRG-II: Kdo転移酵素のドナー基質CMP-Kdoの調製2023

    • Author(s)
      瀧井治貴,高原遥,青田夏美,石水毅
    • Organizer
      日本農芸化学会2023年度大会
  • [Presentation] Acetylated glucomannan in Dendrobium catenatum2022

    • Author(s)
      Kotake, Toshihisa, Nishigaki, Naho, Kikuchi, Aina, Ono, Mao, Takahashi, Daisuke, Yeh, Chuan-Ming, Tsai, Wen-Chieh, Ishimizu, Takeshi
    • Organizer
      Cell wall research conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Engineered galactoglucomannan changes glucomannan-cellulose interaction in Arabidopsis secondary cell walls2022

    • Author(s)
      Yoshimi, Yoshihisa, Yu, Li, Cresswell, Rosalie, Guo, Lucie, Lyczakowski, J. Jan, Kotake, Toshihisa, Dupree, Paul
    • Organizer
      Cell wall research conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] デンドロビウムのグルコマンナンのアセチル化に関する TBL ファミリータンパク質2022

    • Author(s)
      菊地 愛菜, 西垣 南歩, 小野 真央, 石水 毅, Yeh-Chuan-Ming, Twai Wen-Chieh, 高橋 大輔, 小竹 敬久
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
  • [Presentation] オオムギの芒形成に関わるエピゲノム制御因子の解析2022

    • Author(s)
      中村 光希,菊池 優一,白神 美瑞穂,小竹 敬久,武田 真,池田 陽子
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
  • [Presentation] ペクチンのアラビナン側鎖の細胞接着における役割2022

    • Author(s)
      樋口 慶太, 曽我 康一, 金子 康子, 九鬼 寛明, 高橋 大輔, 小竹 敬久
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
  • [Presentation] Haruka Sunazaki, Yohei Uehara, Yuto Takenaka, Takeshi Ishimizu2022

    • Author(s)
      Haruka Sunazaki, Yohei Uehara, Yuto Takenaka, Takeshi Ishimizu
    • Organizer
      Cell wall research conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Identification and biochemical characterization of parsley apiosyltransferase involved in apiin biosynthesis2022

    • Author(s)
      Song An, Maho Yamashiata, Masaru Kobayashi, Takeshi Ishimizu
    • Organizer
      第71回日本応用糖質科学会大会
  • [Presentation] セロリ由来アピイン生合成グルコース転移酵素遺伝子の同定2022

    • Author(s)
      橋本斗汰,森岡佑香,石水毅
    • Organizer
      第71回日本応用糖質科学会大会
  • [Presentation] ペクチンRG-I:ガラクツロン酸転移酵素遺伝子の同定2022

    • Author(s)
      砂﨑遥香,竹中悠人,石水毅
    • Organizer
      第71回日本応用糖質科学会大会
  • [Presentation] エノコログサ(Setaria viridis)のアラビノキシラン生合成に関わるアラビノフラノース転移酵素の機能解析2022

    • Author(s)
      鈴木聖治,木塚康彦,石水毅,石井忠,鈴木史朗
    • Organizer
      第39回日本植物バイオテクノロジー学会大会
  • [Presentation] 大腸菌におけるアピゲニン-7-O-グルコシド生産向上を目指したグルコース転移酵素発現条件の検討2022

    • Author(s)
      小林美稀,石水毅,大橋貴生
    • Organizer
      第74回日本生物工学会大会
  • [Presentation] ペクチナーゼのマセレーション活性を促進するAspergillus japonicus由来の未知因子の解析2022

    • Author(s)
      寺本智世、上條岳己、上田晴子、石水毅、長田敏行、森田理日斗、南善子
    • Organizer
      第74回日本生物工学会大会

URL: 

Published: 2023-12-25  

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