2021 Fiscal Year Annual Research Report
Evolution of Yaponesians based on genome sequence analyses of modern humans
| Project Area | Deciphering Origin and Establishment of Japonesians mainly based on genome sequence data |
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| Project/Area Number |
18H05506
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| Research Institution | National Institute of Genetics |
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Principal Investigator |
斎藤 成也 国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 教授 (30192587)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
井ノ上 逸朗 国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 教授 (00192500)
吉浦 孝一郎 長崎大学, 原爆後障害医療研究所, 教授 (00304931)
Jinam TimothyA 国立遺伝学研究所, ゲノム・進化研究系, 助教 (20648258)
松波 雅俊 琉球大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (60632635)
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| Project Period (FY) |
2018-06-29 – 2023-03-31
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| Keywords | ヤポネシア / 現代人ゲノム / ゲノム進化 / オキナワ人 / ヤマト人 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
以下の地域の住民からDNAサンプル入手を試みた：(1)沖縄、(2)九州(なし)、(3)中国(隠岐諸島、鳥取県)、(4)四国(徳島県)、(5)近畿（なし)、(6)中部(なし)、(7)関東(なし), (8)東北（山形県）。具体的には、4人の祖父母がすべてその地域出身者である提供者50名をえらび、本研究について説明してインフォームドコンセントを取得し、DNAサンプルの供与を受ける。既存の全ゲノムSNP多型データを持つ研究機関などの協力も得る。沖縄地域は松波(琉球大学)が、九州地域は吉浦(長崎大学)・井ノ上(遺伝研)・斎藤(遺伝研)が、中国・四国・近畿・中部・関東・東北地域については、斎藤と井ノ上がサンプリングを担当した。全ゲノムSNP多型データが未決定の人間について、ゲノム規模SNPデータを決定する。一部個体についてはゲノム配列決定をおこなった。現代人のゲノムをすでに決定した日本の研究機関および海外の研究機関やゲノムデータの解析を大規模に進めている海外の研究者と連絡をとり、共同研究を継続した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
研究実績の概要で記したように、すでに多くの地域からDNAサンプルを収集あるいは共同研究によりDNAデータを共有した。また、現代ヤポネシア人の地域的なゲノム多様性を調べるために、いろいろな地域を訪問して唾液サンプルの提供を受ける予定だったが、新型コロナウイルス感染拡大の影響により、大部分の地域への訪問を延期した。
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| Strategy for Future Research Activity |
沖縄県の集団については、今後全ゲノム配列決定とその解析を進める。出雲市出身者と枕崎市在住者については、すでに全ゲノム配列を決定したので、他の集団のデータと比較解析をおこなう。佐渡島在住者のゲノム規模SNPデータを新潟大学の共同研究者と共有し、集団遺伝学的解析をおこなう。新型コロナウイルス感染は2022年度にはすこし落ち着くと期待されるので、奄美大島をはじめとして、隠岐諸島などの地域の人々について、DNAサンプルの収集をおこなう。これらあらたに収集するDNAサンプルは、まずゲノム規模SNPのタイピングをおこない、解析する。また班会議は、一部対面を含めてインターネットを用いたテレビ会議を開催する予定である。
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[Book] ヒトゲノム事典2021
Author(s)
斎藤成也・井ノ上逸朗・松波雅俊ら
Total Pages
431
Publisher
一色出版
ISBN
978-4-910389-12-7
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