• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2022 Fiscal Year Annual Research Report

核内RNAボディによるクロマチン制御機構の解明

Planned Research

Project AreaChromatin potential for gene regulation
Project/Area Number 18H05531
Research InstitutionJapanese Foundation for Cancer Research

Principal Investigator

斉藤 典子  公益財団法人がん研究会, がん研究所 がん生物部, 部長 (40398235)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 落合 博  広島大学, 統合生命科学研究科(理), 准教授 (60640753)
Project Period (FY) 2018-06-29 – 2023-03-31
KeywordsRNAボディ / 遺伝子発現制御 / クロマチン / 核内構造体
Outline of Annual Research Achievements

真核生物の細胞核内には、生体膜に囲まれない構造体であるRNAボディが多数存在する。これらは、ノンコーディングRNAとタンパク質複合体が凝集して形成されたもので、核内の局所に転写に関連する因子を濃集させる。RNAボディは、近隣クロマチンの転写の起こりやすさに対するクロマチンポテンシャルを理解する鍵と考えられる。本研究では、真核生物に普遍的に存在し、かつ核内最大のRNAボディである核小体と、ER陽性乳がんに特異的なエレノアクラウドに着目している。これらの形成機序、転写制御機能、物性、細胞分化や疾患における役割の解析を行い、核内RNAボディによるクロマチン制御機構を解明することを目的としている。本年度は主に、エレノアRNAから構成されるエレノアクラウドの生体内の意義の解明に努めた。臨床検体を用いた解析により、エレノアの発現はERを発現するER陽性乳がん症例に限定され、かつERの発現度合いに相関をみとめた。これは、今細胞株を用いた研究から得られた、「エレノアはERをコードするESR1遺伝子の転写を活性化する」という結果とよく一致するものであった。興味深いことに、原発巣でエレノアを発現するケースは、晩期再発(術後5年以上経って再発)の頻度が高いことがわかった。さらにERの発現と乳がん幹細胞マーカーであるCD44の発現に相関がみとめられ、細胞核内でCD44とエレノアが頻繁に共局在することを見出し、CD44の転写活性にエレノアが必要であることを明らかにした。エレノアは乳がん幹細胞維持を介して、がんの長期休眠に貢献し、それが晩期再発につながることを見出した。基礎研究と臨床をつなぐ新たな知見が得られた。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (40 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 5 results) Presentation (28 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 25 results) Book (2 results) Remarks (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Kansas(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of Kansas
  • [Journal Article] POLR1A variants underlie phenotypic heterogeneity in neural, craniofacial, and cardiac anomalies2023

    • Author(s)
      Smallwood, K., Saitoh, N., Weaver, K. N. , et al.
    • Journal Title

      The American Journal of Human Genetics

      Volume: 110(5) Pages: 1_17

    • DOI

      10.1016/j.ajhg.2023.03.014

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Methylated histones on mitotic chromosomes promote Topoisomerase IIα function for high-fidelity chromosome segregation2023

    • Author(s)
      Sundararajan, S., Park, H., Kawano, S., Johansson, M., Lama, B., Saito-Fujita, T., Saitoh, N., Arnaoutov, A., Dasso, M., Wang, Z., Keifenheim, D., Clarke D.J., Azuma, Y.
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 26(5) Pages: 106743

    • DOI

      10.1016/j.isci.2023.106743

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Mathematical model of structural changes in nuclear speckle.2023

    • Author(s)
      Wakao, S., Saitoh, N., Awazu, A.
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v20.0020

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The ELEANOR non-coding RNA expression contributes to cancer dormancy and predicts late recurrence of ER-positive breast cancer2022

    • Author(s)
      Fukuoka, M., Ichikawa, Y., Osako, T., Fujita, T., Baba, S., Takeuchi, K., Tsunoda, N., Ebata, T., Ueno, T., Ohno, S., *Saitoh, N.
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 113 Pages: 2336-235

    • DOI

      10.1111/cas.15373

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The 3′ Pol II pausing at replication-dependent histone genes is regulated by Mediator through Cajal bodies’ association with histone locus bodies.2022

    • Author(s)
      Suzuki, H., Abe, R., Shimada, M., Hirose, T., Hirose, H., Noguchi, K., Ike, Y., Yasui, N., Furugori, K., Yamaguchi, Y., Toyoda, A., Suzuki, Y., Yamamoto, T., Saitoh, N., Sato, S., Tomomori-Sato, C., Conaway, R., Conaway, J., Takahashi, H.
    • Journal Title

      Nature Commun

      Volume: 3(1) Pages: 2905

    • DOI

      10.1038/s41467-022-30632-w.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] STREAMING-tag system reveals spatiotemporal relationships between transcriptional regulatory factors and transcriptional activity2022

    • Author(s)
      Ohishi, H., Shimada, S., Uchino, S., Li, J., Sato, Y., Shintani, M., Owada, H., Ohkawa, Y., Pertsinidis, A., Yamamoto, T., *Kimura, H., *Ochiai, H
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Pages: 7672

    • DOI

      10.1038/s41467-022-35286-2

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Chromatin Associating Long Non-coding RNAs in Late Recurrence of Breast Cancer.2023

    • Author(s)
      Saitoh, N., Tachiwana, H.
    • Organizer
      International Symposium On Chromatin Architecture: Structure And Function (ERATO)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Localization of transcriptional regulator condensates in transcriptional bursting revealed by STREAMING-tag system2023

    • Author(s)
      Hiroshi Ochiai
    • Organizer
      Cretan RNA Salon Seminar Series
    • Invited
  • [Presentation] マウス多能性幹細胞における転写動態制御機構の解明2023

    • Author(s)
      落合 博
    • Organizer
      第4回ゲノム生物物理学セミナー
    • Invited
  • [Presentation] Chromatin associating long non-coding RNAs involved in dormancy for late recurrence of breast cancer.2022

    • Author(s)
      Saitoh, N., Yamamoto, T., Ichikawa, Y., Fukuoka, M., Tachiwana, H.
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting, Epigenetics & Chromatin
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Non-coding RNAs in the molecular condensate contribute to chromatin regulation and tumor dormancy in late recurrence of breast cancer.2022

    • Author(s)
      Saitoh, N., Ichikawa, Y., Fukuoka, M.
    • Organizer
      The FASEB Meeting, The Nuclear Bodies Conference: Hubs of Genomic Activity
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ELEANOR non-coding RNAs activate the chromatin domain, balancing cell death and proliferation in the breast cancer dormancy.2022

    • Author(s)
      Saitoh, N.
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会3AW-08
    • Invited
  • [Presentation] 乳がんの休眠に寄与するクロマチン制御ノンコーディングRNA.2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会 2AW-16
    • Invited
  • [Presentation] 乳がんの晩期再発におけるノンコーディングRNAのゲノム調節.2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 機能性RNAが制御するゲノムDNAとがん2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      第467回つくば分子生命科学セミナー.
    • Invited
  • [Presentation] クロマチン構造 エピジェネティクスとノンコーディングRNA 再発乳がんの診断と治療応用の可能性2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      福島県立医科大学医学部2年 基礎特別講義
    • Invited
  • [Presentation] 乳がんにおけるノンコーディングRNAによる染色体の構造と機能の制御.2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      染色体学会第73回年会
    • Invited
  • [Presentation] ELEANOR non-coding RNAs associate with chromatin, and contribute to the 3D genome structure in breast cancer.2022

    • Author(s)
      Yamamoto, T., Ichikawa, Y., Palihati, M., Saitoh, N.
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 非コードRNAが駆動するがんの悪性化とその分子基盤.2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      第81回日本癌学会学術総会モーニングレクチャー
    • Invited
  • [Presentation] 乳がんにおけるエピジェネティクス-再発乳がんに関わるノンコーディングRNAエレノアの解析2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      Breast Cancer Symposium 2022特別講演II
    • Invited
  • [Presentation] ノンコーディングRNA が制御する高次生命現象とがん進展.2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      第30回日本乳癌学会学術総会.
    • Invited
  • [Presentation] 再発乳がんにおけるゲノム3次元構造と核内ノンコーディング RNA.2022

    • Author(s)
      斉藤 典子、 市川 雄一、福岡恵.
    • Organizer
      第74回日本細胞生物学会大会. シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] 長鎖ノンコーディングRNAによる再発乳がんのエピジェネティクス制御.2022

    • Author(s)
      斉藤典子
    • Organizer
      第23回ホルモンと癌研究会 教育講演
    • Invited
  • [Presentation] Approaches to identify and characterize the roles of the ELEANOR non-coding RNA in breast cancer.2022

    • Author(s)
      マルダン・パルハット
    • Organizer
      2022年度新学術領域学術研究支援基盤先端モデル動物支援プラットフォーム
  • [Presentation] Approaches to characterize the roles of the ELEANOR non-coding RNA in breast cancer.2022

    • Author(s)
      Maierdan, P.
    • Organizer
      新学術領域・学術変革領域A合同「若手の会2022」
  • [Presentation] 組織切片からエピゲノム情報を取得する手法の開発.2022

    • Author(s)
      松戸亮太
    • Organizer
      新学術領域・学術変革領域A合同「若手の会2022」
  • [Presentation] 超解像イメージングから解き明かす転写動態と転写制御因子クラスターの関係性2022

    • Author(s)
      落合 博
    • Organizer
      日本顕微鏡学会 第78回学術講演会
    • Invited
  • [Presentation] イメージングによる転写動態制御機構の解明2022

    • Author(s)
      落合 博
    • Organizer
      遺伝学研究所研究会「染体安定維持研究会」
    • Invited
  • [Presentation] 高次ゲノム構造と転写ダイナミクス2022

    • Author(s)
      落合 博
    • Organizer
      一般財団法人 染色体学会 第73 回(2022 年度)年会
    • Invited
  • [Presentation] 高次ゲノム構造と転写の動態2022

    • Author(s)
      落合 博
    • Organizer
      令和4年遺伝研究会 クロマチン・細胞核構造の動的変換とゲノム機能制御
    • Invited
  • [Presentation] Revealing regulatory mechanisms of transcriptional dynamics by single-gene imaging system2022

    • Author(s)
      Hiroshi Ochiai
    • Organizer
      Single Molecule & Chromatin meeting 2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 単一遺伝子イメージングから解き明かす転写活性依存的な転写制御因子凝集体の形成2022

    • Author(s)
      Hiroshi Ochiai
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Transcriptional dynamics regulated by non-genomic codes2022

    • Author(s)
      Hiroshi Ochiai
    • Organizer
      The 1st International Symposium on REPLICATION of NON GENOME
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 遺伝子発現動態の定量的理解2022

    • Author(s)
      落合 博
    • Organizer
      定量生物学の会 第十回年会
    • Invited
  • [Book] 「実験医学」増刊 第40巻2022

    • Author(s)
      斉藤典子、立和名博昭、松戸亮太
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      978-4-7581-0404-3
  • [Book] 「病理と臨床」2022年臨時増刊号40巻2022

    • Author(s)
      立和名博昭、斉藤典子
    • Total Pages
      -
    • Publisher
      文光堂
    • ISBN
      978-4-7581-0404-3
  • [Remarks] がん研究所がん生物部

    • URL

      http://202.242.5.28/laboratory/department/cancer_biology/www/index.html

  • [Remarks] がん研究所

    • URL

      https://www.jfcr.or.jp/laboratory/department/cancer_biology/index.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] ER陽性乳がんの晩期再発を検査する方法、及び治療薬のスクリーニング方法2022

    • Inventor(s)
      福岡 恵、斉藤 典子、他
    • Industrial Property Rights Holder
      福岡 恵、斉藤 典子、他
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2022-65345

URL: 

Published: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi