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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Molecular mechanisms underlying heterochromatin assembly

Planned Research

Project AreaChromatin potential for gene regulation
Project/Area Number 18H05532
Research InstitutionNational Institute for Basic Biology

Principal Investigator

中山 潤一  基礎生物学研究所, クロマチン制御研究部門, 教授 (60373338)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小布施 力史  大阪大学, 大学院理学研究科, 教授 (00273855)
Project Period (FY) 2018-06-29 – 2023-03-31
Keywordsヘテロクロマチン / HP1 / ヒストン修飾 / 転写制御
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、ヘテロクロマチン構造形成の分子機構の解明を目指して以下の研究を実施した。
【1】HP1によるヘテロクロマチン制御(中山):ヘテロクロマチン形成におけるHP1アイソフォームの機能分担を明らかにするため、分裂酵母のChp2に着目して解析を進めた。これまでにChp2がCSD近傍領域を介してDNAに結合することを明らかにした。本年度は、Chp2のDNA結合能に関与する領域を特定し、その領域に変異を入れた変異Chp2を発現させた分裂酵母株では、ヘテロクロマチンに異常が起きることを明らかにした。
【2】増殖・分化のスイッチング過程におけるクロマチンの構造変換(中山・小布施):分裂酵母の胞子形成について、昨年度までに代表的なヒストン修飾の局在パターンを明らかにした。本年度はさらにゲノムワイドなChIP-seq解析を進め、特徴的なヌクレオソームの局在パターンと、RNAポリメラーゼIIの局在を明らかにした。これらの結果より、胞子特異的なヒストン修飾のパターンは、転写とは別の機構で規定されている可能性が示唆された。ES細胞に関しては、これまでに、不活性X染色体に局在する機能未知のHP1結合因子、HBiX2、HBiX3を同定した。本年度は、HBiX2のC末端側がSMCHD1、HP1への結合と、不活性X染色体の局在に必要なことを見出した。HBiX2はN末端側でHDAC複合体と結合することから、この酵素活性がC末端側の機能により不活性化X染色体に濃縮されることにより、不活性X染色体特異的な抑制型ヒストン修飾の維持や伝搬をしていることが示唆された。また、HP1-betaのde novo突然変異をヘテロでもつ発達障害、自閉症を示す患者を見出した。プロテオミクス解析から、HP1-betaのクロマチン結合が減退していたことから、ドミナントネガティブな機構により障害を引き起こしていることが示唆された。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (22 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 3 results) Presentation (14 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Aberdeen(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      University of Aberdeen
  • [Int'l Joint Research] Childrens Hospital of Philadelphia(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Childrens Hospital of Philadelphia
  • [Int'l Joint Research] Institut Curie(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      Institut Curie
  • [Journal Article] Regulation of the SUV39H Family Methyltransferases: Insights from Fission Yeast2023

    • Author(s)
      Nakamura Rinko、Nakayama Jun-ichi
    • Journal Title

      Biomolecules

      Volume: 13 Pages: 593~593

    • DOI

      10.3390/biom13040593

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Researchers support preprints and open access publishing, but with reservations: A questionnaire survey of MBSJ members2023

    • Author(s)
      Ide Kazuki、Nakayama Jun‐ichi
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1111/gtc.13015

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Inner nuclear membrane proteins Lem2 and Bqt4 interact with different lipid synthesis enzymes in fission yeast2023

    • Author(s)
      Hirano Yasuhiro、Kinugasa Yasuha、Kubota Yoshino、Obuse Chikashi、Haraguchi Tokuko、Hiraoka Yasushi
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1093/jb/mvad017

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Polycomb repressive complexes 1 and 2 are each essential for maintenance of X inactivation in extra-embryonic lineages2023

    • Author(s)
      Masui Osamu、Corbel Catherine、Nagao Koji、Endo Takaho A.、Kezuka Fuyuko、Diabangouaya Patricia、Nakayama Manabu、Kumon Mami、Koseki Yoko、Obuse Chikashi、Koseki Haruhiko、Heard Edith
    • Journal Title

      Nature Cell Biology

      Volume: 25 Pages: 134~144

    • DOI

      10.1038/s41556-022-01047-y

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] RNaseH2A downregulation drives inflammatory gene expression via genomic DNA fragmentation in senescent and cancer cells2022

    • Author(s)
      Sho Sugawara, Ryo Okada, Tze Mun Loo, Hisamichi Tanaka, Kenichi Miyata, Masatomo Chiba, Hiroko Kawasaki, Kaoru Katoh, Shizuo Kaji, Yoshiro Maezawa, Koutaro Yokote, Mizuho Nakayama, Masanobu Oshima, Koji Nagao, Chikashi Obuse, Satoshi Nagayama, Keiyo Takubo, Akira Nakanishi, Masato T Kanemaki, Eiji Hara, Akiko Takahashi
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 5 Pages: 1420~1420

    • DOI

      10.1038/s42003-022-04369-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] テトラヒメナのゲノム削減は複数のHP1様タンパク質の協調的作用により制御される2022

    • Author(s)
      片岡 研介、Olivera Valentirovic 、吉村 ゆり子、Eliot Geraud、西本 裕希、中川 れい子、谷 直紀、望月 一史、中山 潤一
    • Organizer
      第15回日本エピジェネティクス研究会年会
  • [Presentation] 分裂酵母における胞子クロマチン構造の網羅的解析2022

    • Author(s)
      林 亜紀、中川 れい子、大川 恭行、中山 潤一
    • Organizer
      第54回酵母遺伝学フォーラム
  • [Presentation] Distinct biochemical properties of two HP1 proteins in fission yeast2022

    • Author(s)
      Anisa Fitri Rahayu, Yuriko Yoshimura, Reiko Nakagawa, Aki Hayashi, Jun-ichi Nakayama
    • Organizer
      第95回 日本生化学会大会
  • [Presentation] 分裂酵母ヒストンメチル化酵素Clr4の活性制御機構の解析2022

    • Author(s)
      林 亜紀、中川 れい子、大川 恭行、中山 潤一
    • Organizer
      第45回 日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Distinct biochemical properties of two HP1 proteins in fission yeast2022

    • Author(s)
      Anisa Fitri Rahayu, Yuriko Yoshimura, Reiko Nakagawa, Aki Hayashi, Jun-ichi Nakayama
    • Organizer
      24th EMBL PhD Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 分裂酵母の胞子におけるヒストン修飾の網羅的解析2022

    • Author(s)
      林 亜紀、中川 れい子、大川 恭行、中山 潤一
    • Organizer
      第40回 染色体ワークショップ・第21回 核ダイナミクス研究会
  • [Presentation] テトラヒメナのゲノム削減は複数のHP1様タンパク質の協調的作用により制御される2022

    • Author(s)
      片岡 研介、Olivera Valentirovic、吉村 ゆり子、Eliot Geraud、西本 裕希、中川 れい子、谷 直紀、望月 一史、中山 潤一
    • Organizer
      第40回染色体ワークショップ・第21回核ダイナミクス研究会
  • [Presentation] Mechanisms regulationg Clr4/SUV39H histone methyltransferase activity2022

    • Author(s)
      Rinko Nakamura, Yuriko Yoshimura, Reiko Nakagawa, Jun-ichi Nakayama
    • Organizer
      Japan-UK Regulation through Chromatin Conference
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] RNA polymerase II Ser7リン酸化は、転写と共役したヌクレオソーム弛緩・再構築を促進して転写一時停止を安定化する2022

    • Author(s)
      梶谷 卓也、加藤 太陽、沖 昌也、木村 宏、大川 恭行、小布施 力史、Hermand Damien、Lis John、村上 洋太
    • Organizer
      第45回 日本分子生物学会年会
  • [Presentation] ピゲノムとヘテロクロマチン構造構築に働きかけるHP1結合タンパク質2022

    • Author(s)
      小布施 力史、 磯部 真也、佐渡 敬、長尾 恒治
    • Organizer
      第45回 日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Replication dynamics identifies the folding principles of the inactive X chromosome2022

    • Author(s)
      Rawin Poonperm, Saya Ichihara, Hisashi Miura, Akie Tanigawa, Koji Nagao, Chikashi Obuse, Takashi Sado, Ichiro Hiratani
    • Organizer
      第45回 日本分子生物学会年会
  • [Presentation] ポリコーム複合体PRC1とPRC2はマウス胚体外組織におけるX染色体不活性化の維持に必須である2022

    • Author(s)
      増井 修、Corbel Catherine、長尾 恒治、遠藤 高帆、毛塚 芙由子、小布施 力史、Heard Edith、古関 明彦
    • Organizer
      第45回 日本分子生物学会年会
  • [Presentation] PCGF6-PRC1 は着床後胚においてX染色体不活性化を安定に保つ役割を持つ2022

    • Author(s)
      増井 修、長尾 恒治、信賀 順、遠藤 高帆、毛塚 芙由子、小布施 力史、古関 明彦
    • Organizer
      第45回 日本分子生物学会年会
  • [Presentation] PHIP/ICEN4 regulates centromere via CENP-B2022

    • Author(s)
      arinela Perpelescu, Chikashi Obuse, Hiroshi Masumoto, Masato Kanemaki, Hiroshi Kimura
    • Organizer
      第45回 日本分子生物学会年会

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Published: 2023-12-25  

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