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2010 Fiscal Year Annual Research Report

相関分光法を用いた凝集体タンパク質の品質評価の確立

Planned Research

Project AreaProtein community: organization and maintenance of protein functions
Project/Area Number 19058001
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

金城 政孝  北海道大学, 大学院・先端生命科学研究院, 教授 (70177971)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 三國 新太郎  北海道大学, 大学院・医学研究科, 特任助教 (40435954)
Keywords生物物理 / 生体分子 / 蛍光測定 / 分子集合体 / 1分子検出 / 凝集タンパク質 / 蛍光相互相関分析 / 酵母プリオン
Research Abstract

生きた細胞内ではタンパク質は動的に相互作用を繰り返し機能している。このようなタンパク質の機能を明らかにするためには生細胞内での複合体や凝集体の相互作用の定量的な把握が重要であること必要である。本研究はこのような凝集体や複合体の形成をいち早く検出し分子の挙動を細胞内で高感度に検出するシステムの構築を行うことを目的としている。これまで全反射型蛍光相関装置の高感度化と生細胞内におけるタンパク質凝集検出システムの構築を行い,生細胞内における新たな定量的解析法を確立しタンパク質社会研究に貢献する。
そのため本年は,酵母プリオンを凝集体タンパク質との相互作用の研究対象とした。特に,シャペロン系タンパク質の相互作用解析として出芽酵母のHsp104を対象とした。Hsp104はSup35タンパク質の凝集・脱凝集を司る因子として知られているが,実際の酵母細胞内での挙動は明らかではない。そこで,まず蛍光相互相関法を用いてSup35・Hsp104タンパク質の相互作用測定条件を明らかにした。次にHsp104のATPase活性を阻害するグアニジン塩酸塩(GdnHCl)を細胞抽出液に添加してFCCS測定を行った。その結果、濃度依存的に相互相関関数が消失することが分かった。100%相互作用していると考えられるモデルタンパク質の値で規格化すると、Sup35が凝集する[PSI+]では約半数のSup35可溶性オリゴマーがHsp104と相互作用しているということが分かった。このことは、Hsp104は脱凝集機構に必要なATPase活性を用いて可溶性Sup35オリゴマーと結合していることが考えられる。次に,溶液の中のATP濃度を変化させたところ,10mMATPでは相互作用が消失し,1mMATPでは相互作用が検出された。一見矛盾する結果のようであるが,ATP分解活性が結合ではなく,解離に関係することを示唆している結果と考えている。

  • Research Products

    (21 results)

All 2011 2010

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (12 results)

  • [Journal Article] Two distinct amyloid {beta}-protein (A{beta}) assembly pathways leading to oligomers and fibrils identified by combined fluorescence correlation spectroscopy, morphology and toxicity analyses.2011

    • Author(s)
      Matsumura S
    • Journal Title

      J Biol Chem

      Volume: 286(13) Pages: 11555-11562

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-particle tracking of quantum dot-conjugated prion proteins inside yeast cells.2011

    • Author(s)
      Tsuji T
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun

      Volume: 405(4) Pages: 638-643

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Monitoring the caspase cascade in single apoptotic cells using a three-color fluorescent protein substrate.2011

    • Author(s)
      Sun F
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun

      Volume: 404(2) Pages: 706-710

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamic Assembly Properties of Nonmuscle Myosin II Isoforms Revealed by Combination of Fluorescence Correlation Spectroscopy and Fluorescence Cross-Correlation Spectroscopy.2010

    • Author(s)
      Mitsuhashi M
    • Journal Title

      J Biochem

      Volume: 149(3) Pages: 253-263

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] STPR, a 23-amino acid tandem repeat domain, found in the human function-unknown protein ZNF821.2010

    • Author(s)
      Nonaka Y
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 49(38) Pages: 8367-8375

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In vivo evidence for the fibrillar structures of Sup35 prions in yeast cells.2010

    • Author(s)
      Kawai-Noma S
    • Journal Title

      J Cell Biol

      Volume: 190(2) Pages: 223-231

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A quantum dot-based ratiometric pH sensor.2010

    • Author(s)
      Jin T
    • Journal Title

      Chem Commun (Camb)

      Volume: 46(14) Pages: 2408-2410

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Kinesin-1/Hsc70-dependent mechanism of slow axonal transport and its relation to fast axonal transport.2010

    • Author(s)
      Terada S
    • Journal Title

      EMBO J

      Volume: 29(4) Pages: 843-854

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 蛍光相関法によるタンパク質の機能解析2010

    • Author(s)
      金城政孝
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 82(12) Pages: 1103-1116

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Fluorescence correlation analysis of intranuclear transcriptional activity of glucocorticoid receptor.2011

    • Author(s)
      Shintaro Mikuni
    • Organizer
      2^<nd> International Symposium on Photonic Bioimaging
    • Place of Presentation
      Hilton Niseko Village (Niseko, Japan)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-02-10
  • [Presentation] Study of protein dynamics in live cell using multipoint temporal and spatial correlation spectroscopy analysis.2011

    • Author(s)
      Masataka Kinjo
    • Organizer
      2^<nd> International Symposium on Photonic Bioimaging
    • Place of Presentation
      Hilton Niseko Village (Niseko, Japan)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-02-08
  • [Presentation] The relationship between the landscape of the diffusion property and transcriptional activity of glucocorticoid recetor.2011

    • Author(s)
      Shintaro Mikuni
    • Organizer
      International Symposium Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      Awaji Yumebutai International Conference Center (Awaji, Japan)
    • Year and Date
      2011-01-24
  • [Presentation] Dynamic properties of cell structure analyzed by fluorescence correlation spectroscopy.2010

    • Author(s)
      Masataka Kinjo
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Hilton Hawaiian Village (Honolulu, Hawaii, U.S.A)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-12-19
  • [Presentation] 多焦点蛍光相関分光法:蛍光相関イメージングへ向けて2010

    • Author(s)
      金城政孝
    • Organizer
      平成22年度 日本分光学会 ナノ分光部会・生細胞分光部会 合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学小柴ホール(東京都)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-12-10
  • [Presentation] 多点蛍光相関分光装置の構築と細胞内測定2010

    • Author(s)
      金城政孝
    • Organizer
      第3回 タンパク質の異常凝集とその防御・修復機能に関する研究会
    • Place of Presentation
      京都大学原子炉実験所(大阪府泉南郡)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-11-12
  • [Presentation] Study of molecular complexes in live cell using multipoint temporal and spatial correlation spectroscopy analysis.2010

    • Author(s)
      Masataka Kinjo
    • Organizer
      13^<th> Carl Zeiss Sponsored International Workshop on FCS and Related Methods
    • Place of Presentation
      The National University of Singapore (Singapore)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-10-26
  • [Presentation] Imaging correlation analysis of intranuclear transcriptional activity of glucocorticoid receptor2010

    • Author(s)
      Shintaro Mikuni
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(仙台市)
    • Year and Date
      2010-09-22
  • [Presentation] Study of molecular interaction in live cell using multipoint temporal and spatial correlation spectroscopy analysis.2010

    • Author(s)
      Masataka Kinjo
    • Organizer
      The 3^<rd> International Symposium on Protein Community
    • Place of Presentation
      Hotel Nikko Nara (Nara, Japan)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-09-16
  • [Presentation] Cell membrane-binding proteins analyzed by multi-point total internal reflection fluorescence correlation spectroscopy.2010

    • Author(s)
      Masataka Kinjo
    • Organizer
      Japan-Korea Workshop of FCS and FCCS
    • Place of Presentation
      Korea Advanced Institute of Science and Technology (Daejon, Korea)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-08-27
  • [Presentation] 生細胞におけるタンパク質社会のイメージングに向けて2010

    • Author(s)
      金城政孝
    • Organizer
      第10回日本蛋白質学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(札幌市)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-06-16
  • [Presentation] 蛍光相関分光法を用いた細胞内導入DNAの解析2010

    • Author(s)
      金城政孝
    • Organizer
      遺伝子・デリバリー研究会 第10回シンポジウム
    • Place of Presentation
      北海道大学学術交流会館(札幌市)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-06-03

URL: 

Published: 2012-07-19  

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