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2011 Fiscal Year Annual Research Report

プリオンなどの構造多形と機能発現システムの再構築

Planned Research

Project AreaProtein community: organization and maintenance of protein functions
Project/Area Number 19058002
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

田口 英樹  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (40272710)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 小池 あゆみ  神奈川工科大学, 応用バイオ科学部, 教授 (20454176)
Keywordsタンパク質 / フォールディング / シャペロン / アミロイド / プリオン
Research Abstract

(1)プリオンなどの構造多形:
アミノ酸配列がタンパク質の天然構造を一義に決定するというアンフィンゼンのドグマによるタンパク質観は、アミロイドやプリオンといった秩序ある凝集状態や、単独では天然構造を取り得ない天然変性タンパク質の概念の登場により再検討を余儀なくされている。本研究課題において我々は、酵母プリオンやポリグルタミンをモデルとしてアミロイド構造の細胞内での構造や伝播機構について研究を進めた。研究期間内に、酵母プリオン伝播に必須の役割を果たしているHsp104の役割の解明、細胞内でのアミロイドの構造、細胞内でのプリオンタンパク質の1分子追跡法の開発などを行った。さらに、出芽酵母の200種類にもおよぶタンパク質の細胞内動態を調べるに至った。
(2)タンパク質機能発現システムの再構築:
タンパク質のフォールディングは常に凝集体形成の危機にさらされている。生体高分子でひしめいている細胞内で凝集形成がいかに抑制されているかを解明することが「タンパク質の社会」の理解には必須である。本研究課題では、再構築型の無細胞翻訳系を用いた凝集形成アッセイ、凝集を抑えてフォールディングを助けるシャペロンの役割、について研究を進めた。
無細胞翻訳系による研究では、大腸菌の全タンパク質の凝集形成のしやすさ、さらにGroELやDnaKなどのシャペロンを加えたときにどのタンパク質の凝集が抑制されるかについて大規模な解析を行った。これらの結果により、タンパク質の一次配列や立体構造と凝集しやすさの相関やシャペロン間の役割分担について新たな知見を得た。
細胞の生育に必須のシャペロンであるシャペロニンGroELの細胞内における基質タンパク質を同定し、その性質を明らかにした。

  • Research Products

    (17 results)

All 2013 2012 2011

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (4 results) Book (4 results)

  • [Journal Article] Mechanism of methionine synthase overexpression in chaperonin-depleted Escherichia coli2012

    • Author(s)
      Fujiwara K, Taguchi, H
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 158 Pages: 917-924

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nano-scale alignment of proteins on a nexible DNA back-bone2012

    • Author(s)
      Nojima, T.*, Konno, H., Kodera, N., Seio, K, Taguchi, H., Yoshida, M.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 7 Pages: e52534

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0052534

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Flexibility of GroES mobile loop is required for efficient chaperonin function2012

    • Author(s)
      Nojima, T., Ikegami, T., Taguchi, H., Yoshida, M.*
    • Journal Title

      J. Mol. Biol.

      Volume: 422 Pages: 291-299

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2012.05.026

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Global Analysis of Chaperone Effects Using a Reconstituted Cell-Free Translation System2012

    • Author(s)
      Niwa, T., Kanamori T, Ueda, T.*, Taguchi, H.*
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.

      Volume: 109 Pages: 8937-8942

    • DOI

      10.1073/pnas.1201380109.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Difference in the distribution pattern of substrate enzymes in the metabolic network of Escherichia coli, according to chaperonin requirement.2011

    • Author(s)
      Takemoto K*, Niwa T, Taguchi H.
    • Journal Title

      BMC Syst Biol.

      Volume: 5 Pages: 98

    • DOI

      10.1186/1752-0509-5-98.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Amphiphilic Polysaccharide Nanogels as Artificial Chaperones in Cell-Free Protein Synthesis2011

    • Author(s)
      Sasaki, Y, Asayama, W., Niwa, T., Sawada, S., Ueda, T., Taguchi, H., Akiyoshi, K.*
    • Journal Title

      Macromol. Biosci.

      Volume: 11 Pages: 814-820

    • DOI

      10.1002/mabi.201000457.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Yeast prion protein Newl can break Sup35 amyloid fibrils into fragments in an ATP-dependent manner.2011

    • Author(s)
      Inoue, Y., Kawai-Noma, S., Koike-Takeshita, A., Taguchi, H., Yoshida, M.*
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 16 Pages: 545-556

    • DOI

      10.1111/j.1365-2443.2011.01510.x.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-particle tracking of quantum dot-conjugated prion proteins inside yeast cells.2011

    • Author(s)
      Tsuji, T., Kawai-Noma, S., Pack, C-G., Terajima, H., Yajima, J., Nishizaka, T., Kinjo, M., Taguchi, H.*
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      Volume: 405 Pages: 638-643

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2011.01.083.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single molecule imaging of the trans-translation entry process via anch oring of the tagged ribosome.2011

    • Author(s)
      Zhou, Z-P., Shimizu, Y., Tadakuma, H.*, Taguchi, H., Ito, K., Ueda, T.
    • Journal Title

      J. Biochem.

      Volume: 149 Pages: 609-618

    • DOI

      10.1093/jb/mvr010.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] In vivo structure and dynamics of yeast prion protein2013

    • Author(s)
      Hideki Taguchi
    • Organizer
      SPIE 2013 : Nano-Bio Sensing, Imaging & Spectros copy.
    • Place of Presentation
      Jeju-do, (Korea)(招待講演)
    • Year and Date
      20130220-20130222
  • [Presentation] Global analyses of protein aggregation and chaperone effects2012

    • Author(s)
      Hideki Taguchi,
    • Organizer
      SFB 3rd International symposium "Molecular Machines in Protein Folding and Protein Transport"
    • Place of Presentation
      Munich, (Germany)(招待講演)
    • Year and Date
      20120723-20120725
  • [Presentation] 大腸菌のシャペロニンGroELの細胞内での役割2012

    • Author(s)
      田口英樹
    • Organizer
      日本蛋白質科学会年会ワークショップ「ここまでわかったシャペロニン:作動機構と細胞内での役割」
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知県)(招待講演)
    • Year and Date
      20120620-20120622
  • [Presentation] Global analysis of chaperone action using a reconstituted cell-free translation system2011

    • Author(s)
      田口英樹
    • Organizer
      EMBO Conference "The Biology of Molecular Chaperones"
    • Place of Presentation
      Grundlsee, (Austria)(招待講演)
    • Year and Date
      20110519-20110524
  • [Book] 実験医学30(「史上最長の実験は続くよ」)2012

    • Author(s)
      田口英樹
    • Total Pages
      2(3078-3079)
    • Publisher
      羊土社
  • [Book] バイオサイエンスとインダストリー70(「綱羅約な解析から見えてきたタンバク質凝集特性とシャペロンの役割」)2012

    • Author(s)
      丹羽達也、田口英樹
    • Total Pages
      6(448-452)
    • Publisher
      JBA
  • [Book] 実験医学29,(「自然免疫誘導にプソオン的な自己増殖が関与」)2011

    • Author(s)
      田口英樹
    • Total Pages
      2(2654-2665)
    • Publisher
      羊土社
  • [Book] 実験医学29(「βシートからなるアミロイド形成の発端はコイルドコイル構造?」)2011

    • Author(s)
      田口英樹30, 田口英樹
    • Total Pages
      2(563-564)
    • Publisher
      羊土社

URL: 

Published: 2014-07-16  

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