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2011 Fiscal Year Annual Research Report

茎頂及び根端メリステム新生の共通基盤となる細胞増殖統御系

Planned Research

Project AreaPlant regulatory systems that control developmental interactions between meristems and lateral organs
Project/Area Number 19060001
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

杉山 宗隆  東京大学, 大学院・理学系研究科, 准教授 (50202130)

Keywords温度感受性突然変異体 / 細胞増殖 / シロイヌナズナ / 数理モデル / 先端成長 / 側根 / メリステム / RNA代謝
Research Abstract

本研究では、シロイヌナズナの各種温度感受性突然変異体を用いて、メリステム新生の共通基盤となる細胞増殖統御系を追究している。また、細胞増殖統御がもたらすメリステムの先端成長パターンについて、数理モデルを用いた解析も行っている。本年度は、制限温度下で帯化側根を形成するrrd1、rrd2、rid4(temperature-dependent fasciationにちなみTDF変異体と総称)、メリステムの新構築が強い温度感受性を示すrid3の解析、先端成長の数理モデル解析で以下の進展があった。
TDF変異体の責任遺伝子は、RRD1がポリA特異的リボヌクレアーゼ様タンパク質、RRD2とRID4がペンタトリコペプチドリピートタンパク質をコードしており、何らかのRNA代謝への関与が推定されていた。マイクロアレイなどにより解析した結果、どのTDF変異体でも、ミトコンドリアの呼吸鎖構成因子のmRNAがアデニル化された異常な状態で蓄積していることがわかった。また、呼吸阻害剤処理が側根の帯化を誘導することを発見した。これらの結果から、ミトコンドリアのmRNA代謝が呼吸活性を通して細胞増殖域の限定化に作用することが示された。
CUC・STM経路の遺伝子発現を抑制することなどが判明していたものの、直接的な分子機能が不明であったRID3について、改めてin silico解析を行い、rRNA生合成への関与が報告されている出芽酵母のIPI3との類縁関係を見出した。そこで、rid3変異体におけるrRNA前駆体の蓄積を調べて、RID3がプレrRNAプロセッシングにはたらくことを確認した。
体積成長と細胞増殖を関連づける数理モデルを、核内倍加の影響を考慮して、細胞数を基礎とするモデルからゲノムDNA:量を基礎とするモデルに改変した。これにより、根端成長の実測値とモデルとが、よりよく合致するようになった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

プレmRNAスプライシング関連の変異体の解析など、必ずしも予定通りのペースで進んでいない部分もあるが、ミトコンドリアのmRNA代謝と側根原基形成時の細胞増殖制御との関連が示されたこと、RID3の分子機能がrRNA生合成と結びついたことなど、大きく進展した部分もあり、全体としては概ね順調と判断している。

Strategy for Future Research Activity

TDF変異体の解析から得られた知見を総合すると、RRD1がRRD2、RID4とともに、ミトコンドリアmRNAのポリ A依存的な代謝を担っており、側根原基形成に際しては、内鞘細胞の非対称分裂を終了させるのに、このmRNA代謝の上昇に支えられた呼吸鎖タンパク質の発現と高い呼吸活性が必要である、と推測できる。この仮説の分子レベルでの検証が、残された重要課題である。CUC・STM経路を負に制御するRID3が、rRNA生合成に関与することが新たに判明したが、一方でやはりrRNA生合成にはたらくRID2は、抑圧変異sriw1の効果から、プレmRNAスプライシングとも接点をもつことがわかっている。今後はこれらの関係を再整理して、全体像を掴み直す。先端成長の数理的解析では、メリステムの細胞増殖と成長のパターンとの関連性、それらの調節の基本特性などを抽出していく。

  • Research Products

    (15 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (13 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Genetic identification of Arabidopsis RID2 as an essential factor involved in pre-rRNA processing2011

    • Author(s)
      Iwai Ohbayashi, Mineko Konishi, Kazuo Ebine, Munetaka Sugiyama
    • Journal Title

      The Plant Journal

      Volume: 67 Pages: 49-60

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1365-313X.2011.04574.x

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Critical roles of Arabidopsis RID1, a DEAH-box RNA helicase, in organogenesis in vitro and in planta2012

    • Author(s)
      Misato Ohtani
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都)
    • Year and Date
      2012-03-18
  • [Presentation] シロイヌナズナにおける扁平で左右相称な葉の形成の仕組み:ASYMMETRIC LEAVES2 (AS2)/AS1タンパク質による制御2012

    • Author(s)
      町田泰則
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都)
    • Year and Date
      2012-03-17
  • [Presentation] シロイヌナズナASYMMETRIC LEAVES2遺伝子とリボソームRNA前駆体のプロセシングに関わる因子は葉の軸性の確立に必要である2012

    • Author(s)
      松村葉子
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都)
    • Year and Date
      2012-03-17
  • [Presentation] シロイヌナズナの根端成長に関する数理モデルを用いた定量解析2012

    • Author(s)
      岩元明敏
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都)
    • Year and Date
      2012-03-16
  • [Presentation] Cell proliferation control depending on the capacity of essential RNA processing is mediated by a NAC transcription factor in Arabidopsis2011

    • Author(s)
      Iwai Ohbayashi
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜)
    • Year and Date
      2011-12-16
  • [Presentation] シロイヌナズナ葉ディスクを用いた木部・師部分化系の確立2011

    • Author(s)
      近藤侑貴
    • Organizer
      第75回日本植物学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京)
    • Year and Date
      2011-09-19
  • [Presentation] 細胞分裂再開過程におけるpre-mRNAスプライシング活性制御2011

    • Author(s)
      大谷美沙都
    • Organizer
      第75回日本植物学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京)
    • Year and Date
      2011-09-18
  • [Presentation] 側根形成初期における細胞分裂域の制御機構:RNA代謝系の関与の可能性2011

    • Author(s)
      大塚蔵嵩
    • Organizer
      第75回日本植物学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京)
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] ゲノム倍数化がシロイヌナズナの根端成長に及ぼす影響の解析2011

    • Author(s)
      近藤衣里
    • Organizer
      第75回日本植物学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京)
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] NAC型転写因子ANAC082を介した細胞増殖の負の制御2011

    • Author(s)
      大林祝
    • Organizer
      第75回日本植物学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京)
    • Year and Date
      2011-09-17
  • [Presentation] Differential requirement for the supply of essential RNAs, such as snRNAs and rRNAs, in various aspects of plant development2011

    • Author(s)
      Munetaka Sugiyama
    • Organizer
      XVIII International Botanical Congress
    • Place of Presentation
      MCEC (Melbourne, Australia)
    • Year and Date
      2011-07-28
  • [Presentation] Phenotypic and molecular characterization of temperature-sensitive mutants of Arabidopsis that form fasciated roots under the restrictive temperature2011

    • Author(s)
      Kurataka Otsuka
    • Organizer
      XVIII International Botanical Congress
    • Place of Presentation
      MCEC (Melbourne, Australia)
    • Year and Date
      2011-07-28
  • [Presentation] Analysis of lignescens, a novel temperature-sensitive mutant of Arabidopsis exhibiting ectopic lignin deposition2011

    • Author(s)
      Mamoru Nozaki
    • Organizer
      XVIII International Botanical Congress
    • Place of Presentation
      MCEC (Melbourne, Australia)
    • Year and Date
      2011-07-28
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.bg.s.u-tokyo.ac.jp/koi/shikawa/research/sugi-lab/sugi-1.html

URL: 

Published: 2013-06-26  

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