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2009 Fiscal Year Annual Research Report

メリステム機能のエピジェネティックな統御系

Planned Research

Project AreaPlant regulatory systems that control developmental interactions between meristems and lateral organs
Project/Area Number 19060014
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

角谷 徹仁  National Institute of Genetics, 総合遺伝研究系, 教授 (20332174)

KeywordsDNAメチル化 / small RNA / ヒストン修飾
Research Abstract

昨年度までに、ddm1突然変異下でのBONSAI遺伝子のメチル化上昇には既知のRNAi因子は不要で、ヒストンH3K9のメチル化因子が必要であることを明らかにしている。このようなBONSAI遺伝子のふるまいがどの程度普遍的かを知るため、自殖したddm1突然変異体におけるDNAメチル化を、高メチル化抗体とゲノムタイリングアレイを用いてゲノムワイドに調べた。その結果、BONSAI以外の複数の遺伝子座でも類似の制御機構が働いていることがわかった(論文準備中)。さらに、遺伝子のDNAメチル化を負に制御するjmjC遺伝子IBM1(increase in BONSAI methylation 1)の突然変異は様々な発生異常を誘発する(Saze et al 2008 Science)。この突然変異に影響される遺伝子を調べた結果、少なくとも数千の遺伝子でDNAメチル化が大きく上昇していた(Miura et al 2009)。さらに、ibm1突然変異のヒストン修飾に対する効果をゲノムワイドに調べた結果、多くの遺伝子でヒストンH3の9番目のリジンのメチル化が上昇していることがわかった(論文投稿中)。ibm1で誘発されるH3K9のメチル化はヒストンH3メチル化酵素であるKYPに依存した。これは、ibm1で誘発される発生異常がKYPに依存するのと一致する。ibm1で誘発される発生異常は、標的遺伝子の発現がKYPによる修飾で変化したせいでおこると推察される。

  • Research Products

    (14 results)

All 2009 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (10 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Bursts of retrotransposition reproduced in Arabidopsis2009

    • Author(s)
      Tukahara, S., et al
    • Journal Title

      Nature 303

      Pages: 423-426

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An Arabidopsis jmjC domain protein protects transcribed genes from DNA methylation at CHG sites2009

    • Author(s)
      Miura, A., et al
    • Journal Title

      EMBO J 28

      Pages: 1078-1086

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Induction of RNA-directed DNA methylation upon decondensation of constitutive heterochromatin2009

    • Author(s)
      Schoft, V., et al
    • Journal Title

      EMBO Rep. 10

      Pages: 1015-1021

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] シロイヌナズナにおいて転移するレトロトランスポゾンの制御機構2009

    • Author(s)
      塚原小百合, 他
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会
    • Place of Presentation
      松本
    • Year and Date
      20090916-20090918
  • [Presentation] アラビドプシス属における爆発的レトロトランスポジションの再現2009

    • Author(s)
      小林啓恵, 他
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会
    • Place of Presentation
      松本
    • Year and Date
      20090916-20090918
  • [Presentation] シロイヌナズナの転移するトランスポゾンVANDAL21のエピジェネティックな制御2009

    • Author(s)
      付〓, 他
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会
    • Place of Presentation
      松本
    • Year and Date
      20090916-20090918
  • [Presentation] シロイヌナズナのddm1変異体自殖系統におけるDNAメチル化制御の解析2009

    • Author(s)
      佐々木卓, 他
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会
    • Place of Presentation
      松本
    • Year and Date
      20090916-20090918
  • [Presentation] シロイヌナズナの jumonji ドメイン蛋白質が転写されている遺伝子のDNAメチル化を防ぐ2009

    • Author(s)
      稲垣宗一, 他
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会
    • Place of Presentation
      松本
    • Year and Date
      20090916-20090918
  • [Presentation] Genetics of DNA Methylation in Genes and Transposons in Arabidopsis2009

    • Author(s)
      Kakutani, T.
    • Organizer
      Gordon Research Conference on Epigenetics
    • Place of Presentation
      Holderness, NH, U.S.A.
    • Year and Date
      20090809-20090814
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in Arabidopsis thaliana2009

    • Author(s)
      Kakutani, T.
    • Organizer
      The 24^<th> Naito Conference on Nuclear Dynamics and RNA
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      20090623-20090626
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in Arabidopsis2009

    • Author(s)
      Kakutani, T.
    • Organizer
      発生生物学会シンポジウム
    • Place of Presentation
      新潟
    • Year and Date
      20090529-20090531
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in genes and transposons in Arabidopsis thaliana2009

    • Author(s)
      Kakutani, T.
    • Organizer
      EMBL conference on Chromatin and Epigenetics
    • Place of Presentation
      Hidelberg, Germany
    • Year and Date
      20090513-20090517
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in genes and transposons in Arabidopsis2009

    • Author(s)
      Kakutani, T., et al
    • Organizer
      第32回分子生物学会年会シンポジウム Emerging power of epigenomics in life science
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2009-12-10
  • [Remarks] 研究成果と関連した

    • URL

      http://www.nig.ac.jp/labs/AgrGen/home-j.html

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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