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2010 Fiscal Year Annual Research Report

メリステム機能のエピジェネティックな統御系

Planned Research

Project AreaPlant regulatory systems that control developmental interactions between meristems and lateral organs
Project/Area Number 19060014
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

角谷 徹仁  国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 教授 (20332174)

KeywordsDNAメチル化 / small RNA / ヒストン修飾
Research Abstract

遺伝子のDNAメチル化を負に制御するjmjC遺伝子IBM1(increase in BONSAI methylation 1)の突然変異は様々な発生異常を誘発する(Saze et al 2008 Science)。ibm1突然変異のヒストン修飾に対する効果をゲノムワイドに調べた結果、多くの遺伝子でヒストンH3の9番目のリジンのメチル化が上昇していることがわかった(Inagaki et al 2010)。また、ibm1で誘発されるH3K9のメチル化はヒストンH3メチル化酵素であるKYPに依存した。他の突然変異と組合わせることにより得られた結果から、IBM1は転写に依存してヒストン脱メチル化を行うという説を提唱した(Inagaki et al 2010)。一方、ibm1とddm1(decrease in DNA methylation)の二重突然変異下では、それぞれの単独変異と比べて、強い発生異常が観察される(Saze et al 2008)。この異常の原因となっている標的遺伝子を同定するため、連鎖解析を開始した。この際ddm1の効果が世代を超えて継承されることを利用した。ddm1由来の染色体をibm1突然変異下に持つ系統のうち、二重変異体と類似した表現型を示す者が見いだされたので、現在これを解析している。また、ibm1の表現型を抑圧する変異体の候補が得られているので、その解析を始めている。

  • Research Products

    (17 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (11 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Epigenetic variation in the FWA gene within the genus Arabidopsis2011

    • Author(s)
      Fujimoto R, Sasaki T, Kudoh H, Taylor JM, Kakutani T, Dennis ES
    • Journal Title

      Plant J

      Volume: 66 Pages: 831-843

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Developmental changees in crossover frequency in Arabidopsis2011

    • Author(s)
      Toyama M, Matsuda K, Kakutani T, Terao-Morita M, Tasaka M
    • Journal Title

      Plant J

      Volume: 14 Pages: 81-87

  • [Journal Article] Deferentiation of epigenetic modifications between transposons and genes2011

    • Author(s)
      Saze H, Kakutani T
    • Journal Title

      Curr Opin Plant Biol

      Volume: 65 Pages: 589-599

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Control of genie DNA methylation in Arabidopsis2011

    • Author(s)
      Inagaki S, Kakutani T
    • Journal Title

      J Plant Research

      Volume: 123(総説) Pages: 299-302

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Autocatalytic differentiation of epigenetic modifications in Arabidopsis genome2010

    • Author(s)
      Inagaki S, Miura-Kamio A, Nakamura Y, Lu F, Cui X, Cao X, Kimura H, Saze H, Kakutani T
    • Journal Title

      EMBO J

      Volume: 29 Pages: 3496-3506

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in genes and transposons in Arabidopsis2011

    • Author(s)
      Kakutani T
    • Organizer
      CDB Symposium 2011 Epigenetic Landscape in Development and Disease
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2011-03-14
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in genes and transposons in Arabidopsis2011

    • Author(s)
      Kakutani T
    • Organizer
      Plant & Animal Genome XIX, EPIC : Plant Epigenome Project
    • Place of Presentation
      San Diego, USA
    • Year and Date
      2011-01-15
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるDNAメチル化の遺伝学2010

    • Author(s)
      角谷徹仁
    • Organizer
      大阪大学蛋白質研究所セミナー「ゲノム記憶の成立機序とその制御/
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in genes and transposons in Arabidopsis2010

    • Author(s)
      Kakutani T
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Asia meeting "From Plant Biology to Crop Biotechnology"
    • Place of Presentation
      Suzhou, China
    • Year and Date
      2010-10-28
  • [Presentation] Arabidopsis属におけるCOPIA93/COPIA20ファミリーの分布と挿入位置特異性2010

    • Author(s)
      河邊昭、塚原小百合、角谷徹仁
    • Organizer
      日本遺伝学会第82回大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2010-09-21
  • [Presentation] ArabidopsislyrataにおけるCOPIA93レトロトランスポゾンのセントロメア特異的分布の形成機構2010

    • Author(s)
      塚原小百合、小林啓恵、河邊昭、角谷徹仁
    • Organizer
      日本遺伝学会第82回大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2010-09-21
  • [Presentation] RNAi経路とクロマチン再構成による植物発生とDNAメチル化の制御2010

    • Author(s)
      佐々木卓、三浦明日香、小林啓恵、伊藤佑、角谷徹仁
    • Organizer
      日本遺伝学会第82回大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2010-09-21
  • [Presentation] シロイヌナズナの遺伝子領域におけるヘテロクロマチン修飾除去メカニズムの解析2010

    • Author(s)
      佐瀬英俊、高嶋和哉、北山淳子、小林啓恵、角谷徹仁
    • Organizer
      日本遺伝学会第82回大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2010-09-21
  • [Presentation] DNAメチル化とトランスポゾンとシロイヌナズナのエピ遺伝学2010

    • Author(s)
      角谷徹仁
    • Organizer
      日本遺伝学会第82回大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2010-09-20
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in genes and transposons in Arabidopsis2010

    • Author(s)
      Kakutani T
    • Organizer
      International Conference of Arabidopsis Research
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2010-06-08
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in genes and transposons in Arabidopsis2010

    • Author(s)
      Kakutani T
    • Organizer
      ASM Conference "Mobile DNA"
    • Place of Presentation
      モントリオール,カナダ
    • Year and Date
      2010-04-27
  • [Remarks] 研究室URL

    • URL

      http://www.nig.ac.jp/labs/AgrGen/home-j.html

URL: 

Published: 2013-06-26  

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