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2012 Fiscal Year Annual Research Report

メリステム機能のエピジェネティックな統御系

Planned Research

Project AreaPlant regulatory systems that control developmental interactions between meristems and lateral organs
Project/Area Number 19060014
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

角谷 徹仁  国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 教授 (20332174)

Project Period (FY) 2007-07-25 – 2013-03-31
KeywordsDNAメチル / small RNA / ヒストン修飾
Research Abstract

(1)BONSAI遺伝子のメチル化が上昇する突然変異体を選抜することにより新奇のピストン脱メチル化酵素遺伝子IBM1(increase in BONSAI methylation 1)を同定し、前年度までに、ibm1による発生異常を抑圧する変異体を単離している。この変異体ではゲノムDNAメチル化のパターンはibm1単独変異体とほとんど変わらず、さらにヒストンH3K9メチル化(H3Kgme)をゲノムワイドに調べたところ、やはりibm1単独変異体とほとんど変わらないことがわかった。現在、他のピストン修飾についてもゲノムワイドに調べている。(2)ibm1による発生異常やH3K9me上昇は次世代には継承されない。また、興味深いことに、ibmによる発生異常は、変異がホモになった当代よりも次世代で顕著に観察される。全ゲノムでのバイサルファイト解析を行った結果、DNAメチル化の上昇が、当代と比べて後代で大きく上昇していることがわかった(未発表)。発生の特定の段階でヒストン脱メチル化がおこると推察される。また、ibmlとddm1との二重変異体でも発生異常が強くなるが、この場合もibm1単独変異と比べてDNAメチル化が上昇していることがわかった。(3)ddm1変異体下におけるBONSAI遺伝子のメチル化上昇にはRNAi因子が不要であることを前年度までに示している(Saze&Kakutani 2007 EMBO J;Sasaki et al 2012 Plant J)。今年度は、自殖を繰り返したddm1を材料に全ゲノムバイサルファイト解析を行い、自殖にともなうメチル化の低下や上昇について知ることができた。

  • Research Products

    (12 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (9 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] What triggers DNA methylation in gene and TEs : contribution of body methylation?2013

    • Author(s)
      Inagaki S, Kakutani T
    • Journal Title

      Cold Spring Harbor Symp Quant Biol

      Volume: (Epub ahead of prit)

  • [Journal Article] Centromere-targeted de novo integrations of as LTR retrotransposon of Arabidopsis lyrata.2012

    • Author(s)
      Tsukahara S, et al.
    • Journal Title

      Genes & Development

      Volume: 26 Pages: 705-713

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] DNAメチル化の遺伝学2012

    • Author(s)
      角谷徹仁
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡県)
    • Year and Date
      2012-12-13
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in genes and transposos2012

    • Author(s)
      Kakutani T,
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Asia Conferences : Plant Epigenetics, Stress and Evolution
    • Place of Presentation
      Suzhou Dushu Lake Conference Center (China)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-11-02
  • [Presentation] rDNA-targeted intergration of a non-autonomous LTR retrotransposon2012

    • Author(s)
      程朝陽
    • Organizer
      Cold Spring Harbor Asia Conferences : Plant Epigenetics, Stress and Evolution
    • Place of Presentation
      Suzhou Dushu Lake Conference Center (China)
    • Year and Date
      2012-11-01
  • [Presentation] Terminal inverted repeat(TIR)を持たないシロイヌナズナMutator様因子の転移様式2012

    • Author(s)
      付焜
    • Organizer
      日本遺伝学会第84回大会
    • Place of Presentation
      九州大学医学部百年講堂(福岡県)
    • Year and Date
      2012-09-26
  • [Presentation] DNAメチル化に作用するシロイヌナズナ変異体の一塩基解像度メチローム解析2012

    • Author(s)
      伊藤佑
    • Organizer
      日本遺伝学会第84回大会
    • Place of Presentation
      九州大学医学部百年講堂(福岡県)
    • Year and Date
      2012-09-25
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in genes and trasposons in Arabidopsis2012

    • Author(s)
      角谷徹仁
    • Organizer
      日本遺伝学会第84回大会
    • Place of Presentation
      九州大学医学部百年講堂(福岡県)
    • Year and Date
      2012-09-24
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in genes and transposos2012

    • Author(s)
      Kakutani T.
    • Organizer
      The 23rd International Conference on Arabidopsis Research
    • Place of Presentation
      Hofburg Imperial Palace (Austria)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-07-04
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in genes and transoposons in Arabidopsis2012

    • Author(s)
      Kakutani T.
    • Organizer
      The 77^<th> Cold Spring Harbor Symposium in Quantitative Biology of Plants
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor Laboratory (U.S.A.)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-06-02
  • [Presentation] Genetics of DNA methylation in genes and transposons in Arabidopsis2012

    • Author(s)
      角谷徹仁
    • Organizer
      2012 International Symposium on Epigenetic Regulation in Higher Plant
    • Place of Presentation
      Institute of Genetics and Developmental Biolgy (中国・北京)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-04-20
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.nig.ac.jp/labs/AgrGen/home-j.html

URL: 

Published: 2014-07-16  

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