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2021 Fiscal Year Annual Research Report

ゼニゴケ油体をモデルとしたオルガネラ周期の証明と中心因子の同定

Planned Research

Project AreaIntrinsic periodicity of cellular systems and its modulation as the driving force behind plant development
Project/Area Number 19H05675
Research InstitutionNational Institute for Basic Biology

Principal Investigator

上田 貴志  基礎生物学研究所, 細胞動態研究部門, 教授 (10311333)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 近藤 洋平  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(新分野創成センター、アストロバイオロジーセンター、生命創成探究, 生命創成探究センター, 助教 (00724444)
河内 孝之  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (40202056)
金澤 建彦  基礎生物学研究所, 細胞動態研究部門, 助教 (60802783)
Project Period (FY) 2019-06-28 – 2024-03-31
Keywordsゼニゴケ / 油体 / 油体周期 / 分泌経路 / 微小管
Outline of Annual Research Achievements

油体周期仮説では、細胞膜期と油体期が相互に転換することを想定している。その証明のために油体細胞一細胞におけるトランスクリプトームの変遷を調べることを目指しているが、核の単離条件の検討が難航している。現在他の植物でうまくいっている方法をゼニゴケに適用すべく、実験条件の検討を続けている。一方、油体形成のメカニズムの解明においては大きな進展があった。発生中の無性芽では、通常は一つの油体細胞あたり一つの巨大な油体が形成される。そこに微小管重合阻害剤を処理すると、油体が断片化することが見いだされた。アクチンの重合阻害剤は、このような影響は持たなかった。このことから、油体形成には微小管が深く関わることが示された。そこで蛍光タンパク質で標識した微小管により油体形成時の微小管のライブイメージングを行ったところ、形成中の油体から放射状に伸びた微小管構造が観察された。我々の研究から油体は細胞板と類似した性質を有していることが分かっている。そこでこの構造を油体フラグモプラスト(OB phragmoplast)と名付け、微小管の配向などの解析を進めている。続いて、油体形成のマスター制御因子であるERF13を条件的に発現する実験系を構築した。estradiol添加によりERF13の発現を誘導したところ、光合成細胞に分化した細胞を含むほぼ全ての細胞で油体が形成された。このことは、ERF13が細胞の分化状態を転換する能力を持つことを示唆している。さらに、ERF13を誘導すると、ほぼ全ての細胞でOB phragmoplastが形成されることも見いだした。現在はOB phragmoplastの構成タンパク質を明らかにするべく実験を進めている。
油体の形態が異常になる変異体の解析も進めた。油体形態が真球に近くなる変異体の原因遺伝子が被覆複合体であるCOPIの構成因子MpSEC28であることを突き止め、その細胞内局在などを詳細に明らかにした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

一細胞解析の条件検討で苦戦しているが、油体の形成機構の解析では目覚ましい進展があった。

Strategy for Future Research Activity

引き続きバイオイメージング解析を中心とした油体周期仮説の検証と油体形成機構の解明を進めるとともに、単一油体細胞核トランスクリプトーム解析に向けた条件検討、油体形態が異常になる変異体の解析を進める。

  • Research Products

    (15 results)

All 2022 2021

All Journal Article (15 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 1 results)

  • [Journal Article] Improved clearing method contributes to deep imaging of plant organs2022

    • Author(s)
      Sakamoto Yuki、Ishimoto Anna、Sakai Yuuki、Sato Moeko、Nishihama Ryuichi、Abe Konami、Sano Yoshitake、Furuichi Teiichi、Tsuji Hiroyuki、Kohchi Takayuki、Matsunaga Sachihiro
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 5 Pages: 12

    • DOI

      10.1038/s42003-021-02955-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Diminished Auxin Signaling Triggers Cellular Reprogramming by Inducing a Regeneration Factor in the Liverwort Marchantia polymorpha2022

    • Author(s)
      Ishida Sakiko、Suzuki Hidemasa、Iwaki Aya、Kawamura Shogo、Yamaoka Shohei、Kojima Mikiko、Takebayashi Yumiko、Yamaguchi Katsushi、Shigenobu Shuji、Sakakibara Hitoshi、Kohchi Takayuki、Nishihama Ryuichi
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 63 Pages: 384~400

    • DOI

      10.1093/pcp/pcac004

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Migration of prospindle before the first asymmetric division in germinating spore of Marchantia polymorpha2022

    • Author(s)
      Sakai Yuuki、Higaki Takumi、Ishizaki Kimitsune、Nishihama Ryuichi、Kohchi Takayuki、Hasezawa Seiichiro
    • Journal Title

      Plant Biotechnology

      Volume: 39 Pages: 5~12

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.21.1217b

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A glycogen synthase kinase 3-like kinase MpGSK regulates cell differentiation in Marchantia polymorpha2022

    • Author(s)
      Furuya Tomoyuki、Nishihama Ryuichi、Ishizaki Kimitsune、Kohchi Takayuki、Fukuda Hiroo、Kondo Yuki
    • Journal Title

      Plant Biotechnology

      Volume: 39 Pages: 65~72

    • DOI

      10.5511/plantbiotechnology.21.1219a

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] LIM Tracker: a software package for cell tracking and analysis with advanced interactivity2022

    • Author(s)
      Aragaki Hideya、Ogoh Katsunori、Kondo Yohei、Aoki Kazuhiro
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Pages: 2702

    • DOI

      10.1038/s41598-022-06269-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] コケ植物の性決定システムと生存戦略2022

    • Author(s)
      大和勝幸、河内孝之
    • Journal Title

      生物の科学 遺伝

      Volume: 76 Pages: 213-219

  • [Journal Article] コケ植物を活かす2022

    • Author(s)
      河内孝之
    • Journal Title

      アグリバイオ

      Volume: 7 Pages: 198-199

  • [Journal Article] 深層学習の植物画像解析への応用2022

    • Author(s)
      藤井春樹、田中隼人、池内桃子、南野尚紀、上田貴志、近藤洋平、堀田一弘
    • Journal Title

      アグリバイオ

      Volume: 6 Pages: 38-43

  • [Journal Article] Fungal-Type Terpene Synthases in Marchantia polymorpha Are Involved in Sesquiterpene Biosynthesis in Oil Body Cells2021

    • Author(s)
      Takizawa Ryosuke、Hatada Miki、Moriwaki Yuta、Abe Sachika、Yamashita Yuko、Arimitsu Ryoma、Yamato Katsuyuki T、Nishihama Ryuichi、Kohchi Takayuki、Koeduka Takao、Chen Feng、Matsui Kenji
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 62 Pages: 528~537

    • DOI

      10.1093/pcp/pcaa175

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Major components of the KARRIKIN INSENSITIVE2-dependent signaling pathway are conserved in the liverwort Marchantia polymorpha2021

    • Author(s)
      Mizuno Yohei、Komatsu Aino、Shimazaki Shota、Naramoto Satoshi、Inoue Keisuke、Xie Xiaonan、Ishizaki Kimitsune、Kohchi Takayuki、Kyozuka Junko
    • Journal Title

      The Plant Cell

      Volume: 33 Pages: 2395~2411

    • DOI

      10.1093/plcell/koab106

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Coordination between growth and stress responses by DELLA in the liverwort Marchantia polymorpha2021

    • Author(s)
      Hernandez-Garcia Jorge、Sun Rui、Serrano-Mislata Antonio、Inoue Keisuke、Vargas-Chavez Carlos、Esteve-Bruna David、Arbona Vicent、Yamaoka Shohei、Nishihama Ryuichi、Kohchi Takayuki、Blazquez Miguel A.
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 31 Pages: 3678~3686.e11

    • DOI

      10.1016/j.cub.2021.06.010

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] A plant-specific DYRK kinase DYRKP coordinates cell morphology in Marchantia polymorpha2021

    • Author(s)
      Furuya Tomoyuki、Shinkawa Haruka、Kajikawa Masataka、Nishihama Ryuichi、Kohchi Takayuki、Fukuzawa Hideya、Tsukaya Hirokazu
    • Journal Title

      Journal of Plant Research

      Volume: 134 Pages: 1265~1277

    • DOI

      10.1007/s10265-021-01345-w

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Deep evolutionary origin of gamete-directed zygote activation by KNOX/BELL transcription factors in green plants2021

    • Author(s)
      Hisanaga Tetsuya、Fujimoto Shota、Cui Yihui、Sato Katsutoshi、Sano Ryosuke、Yamaoka Shohei、Kohchi Takayuki、Berger Frederic、Nakajima Keiji
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 10 Pages: e57090

    • DOI

      10.7554/eLife.57090

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of the sex-determining factor in the liverwort Marchantia polymorpha reveals unique evolution of sex chromosomes in a haploid system2021

    • Author(s)
      Iwasaki Miyuki, ... and Kohchi Takayuki
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 31 Pages: 5522~5532.e7

    • DOI

      10.1016/j.cub.2021.10.023

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development and Molecular Genetics of Marchantia polymorpha2021

    • Author(s)
      Kohchi Takayuki、Yamato Katsuyuki T.、Ishizaki Kimitsune、Yamaoka Shohei、Nishihama Ryuichi
    • Journal Title

      Annual Review of Plant Biology

      Volume: 72 Pages: 677~702

    • DOI

      10.1146/annurev-arplant-082520-094256

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2023-12-25  

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