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2022 Fiscal Year Annual Research Report

マクロオートファジーにおける膜動態と基質選択のメカニズム

Planned Research

Project AreaMultimode autophagy: Diverse pathways and selectivity
Project/Area Number 19H05708
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

中戸川 仁  東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 (90414010)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大隅 良典  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 栄誉教授 (30114416)
Project Period (FY) 2019-06-28 – 2024-03-31
Keywordsオートファジー / マクロオートファジー / ミクロオートファジー / タンパク質分解 / オルガネラ分解
Outline of Annual Research Achievements

(1) マクロオートファジーにおける膜動態の解明:シード小胞(Atg9小胞)とAtgタンパク質が構成する複数の複合体の間の相互作用の解析を進め、PI3K複合体IのPAS局在化機構を明らかにした。成果を論文にまとめ、投稿し、査読者のコメントに応じて改訂し、改訂版を投稿した。一方で、Atg2脂質輸送タンパク質複合体の小胞体への結合を制御するメカニズムに関して突破口となる発見が得られた。
(2) マクロオートファジーにおける新たな基質選択機構の解明:Atg24複合体が隔離膜の開口端に局在化し、開口部を拡張することで、リボソームやプロテアソームなどの大きな細胞質粒子の隔離膜内への取り込みに重要な役割を果たしていることを明らかにした。成果を論文にまとめ、投稿し、査読者のコメントに対応するための追加実験をほぼ完了した。
(3) マクロオートファジーとミクロオートファジーの連携:マクロヌクレオファジーに必須のATG39を破壊した出芽酵母は窒素飢餓下で早期に死に至る。この細胞死の原因はミクロヌクレオファジーの異常昂進が原因であることとその詳細を明らにし、成果を発表すべく、論文の執筆を開始した。
(4) オートファジーによるタンパク質分解の総合的理解:窒素源飢餓条件においてオートファジーによって選択的に分解される新規タンパク質を複数発見し、オートファジーのマシナリーがそれらを選択するメカニズムを明らかにした。これらの成果を発表すべく、論文の執筆を開始した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本研究は、次年度(2023年度)が最終年度となるが、上記の通り、複数の課題について、論文を発表あるいは執筆する段階に達している。一方で、セミインタクト細胞を用いたオートファゴソーム形成の試験管内再構成など、期待通りの進捗が得られなかった課題もあるため、「おおむね順調に進展している」という自己評価とした。

Strategy for Future Research Activity

上記の通り、本研究で得られた成果を基に、複数の論文を改訂、投稿、執筆する段階に至っている。これらの課題に注力し、最終年度中に可能な限り多くの成果を発表することを第一の目標とする。一方で、残された課題も含め、今後の発展に向けて引き続き研究を実施する。

  • Research Products

    (14 results)

All 2023 2022

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 3 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Atg8 family proteins, LIR/AIM motifs and other interaction modes2023

    • Author(s)
      Rogov Vladimir V.、Nezis Ioannis P.、Tsapras Panagiotis、Zhang Hong、Dagdas Yasin、Noda Nobuo N.、Nakatogawa Hitoshi、Wirth Martina、Mouilleron Stephane、McEwan David G.、Behrends Christian、Deretic Vojo、Elazar Zvulun、Tooze Sharon A.、Dikic Ivan、Lamark Trond、Johansen Terje
    • Journal Title

      Autophagy Reports

      Volume: 2 Pages: -

    • DOI

      10.1080/27694127.2023.2188523

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Atg39 links and deforms the outer and inner nuclear membranes in selective autophagy of the nucleus2022

    • Author(s)
      Mochida Keisuke、Otani Toshifumi、Katsumata Yuto、Kirisako Hiromi、Kakuta Chika、Kotani Tetsuya、Nakatogawa Hitoshi
    • Journal Title

      Journal of Cell Biology

      Volume: 221 Pages: -

    • DOI

      10.1083/jcb.202103178

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ER-phagy: selective autophagy of the endoplasmic reticulum.2022

    • Author(s)
      Mochida Keisuke、Nakatogawa Hitoshi*
    • Journal Title

      EMBO reports

      Volume: 23 Pages: -

    • DOI

      10.15252/embr.202255192

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Atg39 binding to the inner nuclear membrane triggers nuclear envelope deformation in piecemeal macronucleophagy2022

    • Author(s)
      Mochida Keisuke、Nakatogawa Hitoshi
    • Journal Title

      Autophagy

      Volume: 18 Pages: 3046~3047

    • DOI

      10.1080/15548627.2022.2069957

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A method for the isolation and characterization of autophagic bodies from yeast provides a key tool to investigate cargos of autophagy2022

    • Author(s)
      Kawamata Tomoko、Makino Shiho、Kagohashi Yoko、Sasaki Michiko、Ohsumi Yoshinori
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 298 Pages: 102641~102641

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102641

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Atg39のリン酸化を介したヌクレオファジーの制御機構の解明2022

    • Author(s)
      富所 暁
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第55回研究報告会
  • [Presentation] Analysis of the mechanism of nuclear pore complex autophagy in Saccharomyces cerevisiae2022

    • Author(s)
      何 家琪
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第55回研究報告会
  • [Presentation] オートファジーに必須のAtg1複合体とAtg2-Atg18複合体の相互作用の解析2022

    • Author(s)
      安田 悠莉
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第55回研究報告会
  • [Presentation] マクロヌクレオファジーによるミクロヌクレオファジーの制御とその破綻による細胞死2022

    • Author(s)
      中戸川 仁
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第55回研究報告会
  • [Presentation] Molecular mechanism and physiological role of macronucleophagy in budding yeast2022

    • Author(s)
      中戸川 仁
    • Organizer
      The 10th International Symposium on Autophagy
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Atg24-Atg20 complex is necessary for sequestration of large components into autophagosome2022

    • Author(s)
      小谷 哲也
    • Organizer
      The 10th International Symposium on Autophagy
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Mechanisms that target phosphatidylinositol 3-kinase complex I to the pre-autophagosomal structure2022

    • Author(s)
      人見 佳菜恵
    • Organizer
      The 10th International Symposium on Autophagy
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The involvement of micronucleophagy in cell death caused by defective macronucleophagy2022

    • Author(s)
      李 子洋
    • Organizer
      The 10th International Symposium on Autophagy
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] オートファジー・リソソーム研究の新展開2022

    • Author(s)
      中戸川 仁
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Invited

URL: 

Published: 2023-12-25  

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