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2022 Fiscal Year Annual Research Report

全能性消失時のエピゲノム制御機構の解明

Planned Research

Project AreaProgram of totipotency: From decoding to designing
Project/Area Number 19H05754
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

井上 梓  国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, チームリーダー (60814910)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山口 新平  東邦大学, 理学部, 講師 (80740795)
Project Period (FY) 2019-06-28 – 2024-03-31
Keywordsヒストン修飾 / 生殖系列細胞 / 受精卵
Outline of Annual Research Achievements

受精卵は、胚体組織と胚体外組織の両方に分化可能な潜在能力である全能性を有する。この全能性は、内部細胞塊(ICM)と栄養膜細胞(TE)への最初の分化が生じる胚盤胞期までに消失する。全能性の維持と消失には、エピゲノムの可塑性の維持と不可逆的な変化がそれぞれ重要と考えられるが、その分子実体は不明である。

本研究では、受精卵の父母アレルが有する機能の違いに着目して、全能性の理解に向けた研究を進めている。受精卵のエピゲノムの大きな特徴に、父母アレル間のヒストン修飾のゲノムワイドな非対称性がある。この父母アレル間非対称性は着床前発生過程で大きく失われるが、例外もあることがわかってきた。例えば、ポリコーム抑制複合体2 (PRC2)により付与されるH3K27me3修飾は、母性アレル特異的な局在を維持しながら発生し、DNAメチル化非依存的なゲノム刷り込みを制御する。そしてこの刷り込みの破綻は胚発生・胎盤形成の異常を引き起こす。このことから、配偶子形成過程におけるヒストン修飾の確立機構や受精後の動態の解明は、全能性の理解に重要であると考えられる。

本年度、井上は、卵形成過程におけるH3K27me3の確立機構、受精直後に起こる発生関連遺伝子群からのH3K27me3の消失機構とその意義、および全能性が消失する時期(2細胞期胚から胚盤胞期胚)におけるポリコーム制御機構に関する研究を進めた。山口は、全能性に類似した性質を示す2細胞期胚様胚性幹細胞(2CLC)において、リボソームRNAプロセシング関連遺伝子の異常とp53の活性化がESCから2CLCへの移行を促進することを見出した。また、2細胞期胚の核の特徴であるクロモセンター形成に関する研究を発表した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

(井上) 卵形成過程におけるH3K27me3の確立に関与する新たな因子を同定した。また、受精直後に発生関連遺伝子群からH3K27me3が急速に消失する機構と意義を解明しつつある。さらに、全能性が消失する時期(2細胞期胚から胚盤胞期胚)にかけて、ポリコームが段階的に条件的ヘテロクロマチンを新規形成させる様子を捉えた。 (山口) 2CLCというin vitroモデルを利用し、p53を通じた全能性細胞の移行制御機構を発見し、報告した。さらにストレス応答が異なる多能性の移行に機能している証拠が得られており、その背後にある分子機構にアプローチする準備が整った。

Strategy for Future Research Activity

【井上 計画-1】H3K27me3依存的刷り込みの確立に、H2Aモノユビキチン化修飾(H2Aub1)を必要とする遺伝子群とそうでない遺伝子群があることを見出している。このH2Aub1依存性の違いを生み出す機構を解明しつつあるので、さらに研究を進める。【井上 計画-2】受精直後の1細胞期胚において発生関連遺伝子群におけるH3K27me3消失の機構と意義に関して研究を進める。【井上 計画-3】全能性が消失する時期に新規形成される条件的ヘテロクロマチンの形成機構とその意義を解明する。
【山口 計画-1】胚性幹細胞(ES細胞)中に存在する2細胞期胚様細胞(2CLC)への移行をモデルに、全能性の獲得、消失機構の解明に取り組む。これまでにp53が2CLCへの移行に重要な機能を果たしていることを報告したが、今年度はp53の上流、下流で働く機構として細胞周期と複製ストレスに着目して研究を展開する。【山口 計画-2】 全能性消失期における父母アレルの働きの違いを明らかにする。これまでにキメラ胚を用いて特定の細胞系譜を単為発生胚由来細胞に置き換える系を確立した。今年度はこの系を用いて、内部細胞塊やその他の組織における父母アレル特有の機能や制御機構を明らかにする。また、分子的特徴や分化能を解明するために、単一核RNAシークエンシング解析を実施する。【山口 計画-3】DNA脱メチル化関連酵素であるTet1とPRC1の主要サブユニットであるRing1Bに機能的な相互作用があることを示唆する結果を得ている。そこで今年度はTet1欠損マウスおよびES細胞を用いて、この相互作用の機構と意義を詳細に解析する。

  • Research Products

    (20 results)

All 2023 2022

All Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 2 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 9 results)

  • [Journal Article] Conservation and divergence of canonical and non-canonical imprinting in murids2023

    • Author(s)
      Richard Albert Julien、Kobayashi Toshihiro、Inoue Azusa、Monteagudo-Snchez Ana、Kumamoto Soichiro、Takashima Tomoya、Miura Asuka、Oikawa Mami、Miura Fumihito、Takada Shuji、Hirabayashi Masumi、Korthauer Keegan、Kurimoto Kazuki、Greenberg Maxim V. C.、Lorincz Matthew、Kobayashi Hisato
    • Journal Title

      Genome Biology

      Volume: 24 Pages: -

    • DOI

      10.1186/s13059-023-02869-1

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Noncanonical imprinting: intergenerational epigenetic inheritance mediated by Polycomb complexes2023

    • Author(s)
      Inoue Azusa
    • Journal Title

      Current Opinion in Genetics and Development

      Volume: 78 Pages: 102015~102015

    • DOI

      10.1016/j.gde.2022.102015

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] DNMT1 can induce primary germ layer differentiation through de novo DNA methylation2023

    • Author(s)
      Tada Masako、Ito Takamasa、Kubiura-Ichimaru Musashi、Miura Fumihito、Yamaguchi Shinpei、Tajima Shoji、Surani M. Azim、Ito Takashi
    • Journal Title

      Research Square

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.21203/rs.3.rs-2788282/v1

  • [Journal Article] Integrative analysis of scRNA-seq and scATAC-seq revealed transit-amplifying thymic epithelial cells expressing autoimmune regulator2022

    • Author(s)
      Miyao、Miyauchi、Kelly、Terooatea、Ishikawa、Oh、Hirai、Horie、Takakura、Ohki、Hayama、Maruyama、Seki、Ishii、Yabukami Haruka、Yoshida Masaki、Inoue Azusa、Sakaue-Sawano Asako、Miyawaki Atsushi、Muratani Masafumi、Minoda Aki、Akiyama Nobuko、Akiyama Taishin
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 11 Pages: -

    • DOI

      10.7554/eLife.73998

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Low-Input CUT&RUN for Mouse Oocytes and Preimplantation Embryos2022

    • Author(s)
      Hayashi Ryoya、Inoue Azusa
    • Journal Title

      Method Mol Biol

      Volume: - Pages: 83~92

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2724-2_6

  • [Journal Article] Noncanonical imprinting sustains embryonic development and restrains placental overgrowth2022

    • Author(s)
      Matoba Shogo、Kozuka Chisayo、Miura Kento、Inoue Kimiko、Kumon Mami、Hayashi Ryoya、Ohhata Tatsuya、Ogura Atsuo、Inoue Azusa
    • Journal Title

      Genes & Development

      Volume: p Pages: -

    • DOI

      10.1101/gad.349390.122

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Transcriptomic signatures in trophectoderm and inner cell mass of human blastocysts classified according to developmental potential, maternal age and morphology2022

    • Author(s)
      Kai Yoshiteru、Mei Hailiang、Kawano Hiroomi、Nakajima Naotsuna、Takai Aya、Kumon Mami、Inoue Azusa、Yamashita Naoki
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Pages: e0278663

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0278663

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A region-dependent allele-biased expression of Dopa decarboxylase in mouse brain2022

    • Author(s)
      Sheng Kit-Yeng、Nakano Toru、Yamaguchi Shinpei
    • Journal Title

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      Volume: 10 Pages: -

    • DOI

      10.3389/fcell.2022.1078927

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Genomic imprinting mediated by maternal histone modifications.2022

    • Author(s)
      Azusa Inoue
    • Organizer
      The 2nd Subhash Mukhopadhyay Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Genomic imprinting mediated by maternal Polycomb repressive complexes.2022

    • Author(s)
      Azusa Inoue
    • Organizer
      The international symposium of Totipotency and Germ Cell Development
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Genomic imprinting by maternal Polycomb repressive complexes.2022

    • Author(s)
      Azusa Inoue
    • Organizer
      The 20th International Symposium on Developmental Biotechnology at the Korean Society of Animal Reproduction and Biotechnology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Genomic imprinting by Polycomb repressive complexes2022

    • Author(s)
      Azusa Inoue
    • Organizer
      University of California at Davis, Microbiology and Molecular Genetics
    • Invited
  • [Presentation] Mechanism and functions of non-canonical imprinting2022

    • Author(s)
      Azusa Inoue
    • Organizer
      EMBO Workshop 2022, Molecular Mechanisms of Developmental and Regenerative Biology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 母性ポリコーム複合体によるゲノム刷り込み2022

    • Author(s)
      井上梓
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会
  • [Presentation] マウス卵におけるH3K27me3確立機構2022

    • Author(s)
      井上梓
    • Organizer
      第95回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] ヒストン修飾の母性伝承による発生制御機構2022

    • Author(s)
      井上梓
    • Organizer
      第74回日本細胞生物学会大会
    • Invited
  • [Presentation] ヒストン修飾の母性伝承による発生制御機構2022

    • Author(s)
      井上梓
    • Organizer
      第15回日本エピジェネティクス研究会年会
    • Invited
  • [Presentation] Functions of maternal Polycomb-mediated imprinting2022

    • Author(s)
      井上梓
    • Organizer
      第55回日本発生生物学会年会
    • Invited
  • [Presentation] マウス脳におけるインプリンティングの可視化と機能解明2022

    • Author(s)
      山口 新平
    • Organizer
      第45回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] インプリンティングの機能解析のためのキメラ胚実験系の構築2022

    • Author(s)
      東 真里奈、山口新平
    • Organizer
      全能性プログラム 新学術領域・学術変革 A 合同若手の会 2022

URL: 

Published: 2024-12-25  

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