ＮＭＲを利用したタンパク質および複合糖質の揺らぎの検出とその機能連関の探査

2012 Fiscal Year Annual Research Report

• Project Area: Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
• Project/Area Number: 20107004
• Research Institution: National Institutes of Natural Sciences Okazaki Research Facilities
• Principal Investigator: 加藤 晃一 大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設), 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 教授 (20211849)
• Project Period (FY): 2008-04-01 – 2013-03-31
• Keywords: NMR / 揺らぎ / 糖鎖 / タンパク質 / 複合糖質

Outline of Annual Research Achievements

（１）糖鎖の揺らぎの解析：　酵母発現系を用いて調製した高マンノース型糖鎖M9およびM8Bの13C標識体を調製し、核オーバーハウザー効果等を利用して立体構造情報を収集した。特に、M9に関しては昨年度実施したスピンラベル化に加えてランタニドタグによる修飾を実現し、コンフォメーション揺らぎを探査する実験的手法を確立した。さらに、ギランバレー症候群に関与するガングリオシド間の相互作用を超高磁場NMRを利用して解析することも可能となった。
（２）アミロイド形成機構の解明：　本研究を通じて開発してきた方法論を駆使して、神経変性疾患にかかわるタンパク質のアミロイド形成過程をNMRを利用して探査した。各種ガングリオシドを組み込んだ小型バイセルを用いて天然変性タンパク質αシヌクレインとの相互作用をNMRで解析し、本タンパク質とガングリオシドクラスターの特異的相互作用の初期過程を捉えることに成功した。また、分子シャペロンGroELがアミロイドβの繊維形成を抑制することを見出し、GroELとαシヌクレインおよびアミロイドβの相互作用の詳細をNMRを用いて明らかにした。
（３）マルチドメイン・マルチサブユニットタンパク質の構造揺らぎの探査：　選択的重水素標識を利用した中性子小角散乱計測を通じてプロテアソーム活性化因子PA28のサブユニット配置を決定し、ヘテロヘプタマー中における柔軟なループ構造の機能的役割を明らかにした。また、古細菌由来のタンパク質PbaBがプロテアソーム活性化因子と分子シャペロンとしての機能をあわせもつことを初めて示した。本タンパク質はホモテトラマー構造を形成し、Ｃ末端部の柔構造を用いてこれら2つの機能を発揮していることを明らかにした。

Research Progress Status

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Ganglioside-embedding small bicelles for probing membrane-landing processes of intrinsically disordered proteins (2013)
  • Author(s): Takumi Yamaguchi, Tsuyoshi Uno, Yoshinori Uekusa, Maho Yagi-Utsumi, and Koichi Kato
  • Journal Title: Chem. Commun. Volume: 49 Pages: 1235-1237
  • DOI: 10.1039/c2cc38016a.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Application of metabolic 13C labeling in conjunction with high-field nuclear magnetic resonance spectroscopy for comparative conformational analysis of high mannose-type oligosaccharides (2013)
  • Author(s): Yukiko Kamiya, Kotaro Yanagi, Toshihiko Kitajima, Takumi Yamaguchi, Yasunori Chiba, and Koichi Kato
  • Journal Title: Biomolecules Volume: 3 Pages: 108-123
  • DOI: 10.3390/biom3010108
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Stable isotope-assisted NMR characterization of interaction between lipid A and sarcotoxin IA, a cecropin-type antibacterial peptide (2013)
  • Author(s): Maho Yagi-Utsumi, Yoshiki Yamaguchi, Pornthip Boonsri, Takeshi Iguchie, Kazuo Okemoto, Shunji Natori, and Koichi Kato
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res. Commun. Volume: 431 Pages: 136-140
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2013.01.009.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Spatial arrangement and functional role of α subunits of proteasome activator PA28 in hetero-oligomeric form (2013)
  • Author(s): Masaki Sugiyama, Hiroki Sahashi, Eiji Kurimoto, Shin-ichi Takata, Hirokazu Yagi, Keita Kanai, Eri Sakata, Yasufumi Minami, Keiji Tanaka, and Koichi Kato
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res. Commun. Volume: 432 Pages: 141-145
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2013.01.071.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Solution structure of the Q41N variant of ubiquitin as a model for the alternatively folded state N2 of ubiquitin (2013)
  • Author(s): Soichiro Kitazawa, Tomoshi Kameda, Maho Yagi-Utsumi, Kenji Sugase, Nicola J.Baxter, Koichi Kato, Michael P. Williamson, and Ryo Kitahara
  • Journal Title: Biochemistry Volume: 52 Pages: 1874-1885
  • DOI: 10.1021/bi301420m.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] An archaeal homolog of proteasome assembly factor functions as a proteasome activator (2013)
  • Author(s): Kentaro Kumoi, Tadashi Satoh, Kazuyoshi Murata, Takeshi Hiromoto, Tsunehiro Mizushima, Yukiko Kamiya, Masanori Noda, Susumu Uchiyama, Hirokazu Yagi, and Koichi Kato
  • Journal Title: PLoS ONE Volume: 8 Pages: e60294
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0060294.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The use of spin desalting columns in DMSO-quenched H/D-exchange NMR experiments (2013)
  • Author(s): Mahesh S. Chandak, Takashi Nakamura, Toshio Takenaka, Tapan K.Chaudhuri, Maho Yagi-Utsumi, Jin Chen, Koichi Kato, and Kunihiro Kuwajima
  • Journal Title: Protein Sci. Volume: 22 Pages: 486-491
  • DOI: 10.1002/pro.2221.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Terminal spin labeling of a high-mannose-type oligosaccharide for quantitative NMR analysis of its dynamic conformation (2013)
  • Author(s): Takumi Yamaguchi, Yukiko Kamiya, Yeun-Mun Choo, Sayoko Yamamoto,and Koichi Kato
  • Journal Title: Chem. Lett. Volume: 42 Pages: 544-546
  • DOI: 10.1246/cl.2013.544
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] NMR approaches for characterizing interactions between the bacterial chaperonin GroEL and unstructured proteins (2013)
  • Author(s): Noritaka Nishida, Maho Yagi-Utsumi, Fumihiro Motojima, Masasuke Yoshida, Ichio Shimada, and Koichi Kato
  • Journal Title: J. Biosci. Bioeng. Volume: - Pages: in press
  • DOI: 10.1016/j.jbiosc.2013.02.012.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Structural and functional mosaic nature of MHC class I molecules in their peptide-free form (2013)
  • Author(s): Eiji Kurimoto, Kimiko Kuroki, Yoshiki Yamaguchi, Maho Yagi-Utsumi, Takahiro Igaki, Takeshi Iguchi, Katsumi Maenaka, and Koichi Kato
  • Journal Title: Mol. Immunol. Volume: - Pages: in press
  • DOI: 10.1016/j.molimm.2013.03.014.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Synthesis of a bridging ligand with a non-denaturated protein pendant: Toward protein encapsulation in a coordination cage (2012)
  • Author(s): Daishi Fujita, Kosuke Suzuki, Sota Sato, Maho Yagi-Utsumi, Eiji Kurimoto, Yoshiki Yamaguchi, Koichi Kato, and Makoto Fujita
  • Journal Title: Chem. Lett. Volume: 41 Pages: 313-315
  • DOI: 10.1246/cl.2012.313
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Application of Paramagnetic NMR-Validated Molecular Dynamics Simulation to the Analysis of a Conformational Ensemble of a Branched Oligosaccharide (2012)
  • Author(s): Ying Zhang, Sayoko Yamamoto, Takumi Yamaguchi, and Koichi Kato
  • Journal Title: Molecules Volume: 17 Pages: 6658-6671
  • DOI: 10.3390/molecules17066658.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] NMR and mutational identification of the collagen-binding site of the chaperone Hsp47 (2012)
  • Author(s): Maho Yagi-Utsumi, S.Yoshikawa, Y.Yamaguchi, Y.Nishi, E.Kurimoto, Y.Ishida, T.Homma, J.Hoseki, Y.Nishikawa, T.Koide, K.Nagata, and K.Kato
  • Journal Title: PLoS ONE Volume: 7 Pages: e45930
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0045930.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Protein encapsulation within synthetic molecular hosts (2012)
  • Author(s): Daishi Fujita, K. Suzuki, S. Sato, M.Yagi-Utsumi, Y.Yamaguchi, N. Mizuno, T.Kumasaka, M.Takata, M.Noda, S. Uchiyama, K.Kato, and M.Fujita
  • Journal Title: Nature Commun. Volume: 3 Pages: 1093
  • DOI: 10.1038/ncomms2093.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Molecular and structural basis for N-glycan-dependent determination of glycoprotein fates in cells (2012)
  • Author(s): Yukiko Kamiya, Tadashi Satoh, and Koichi Kato
  • Journal Title: Biochim. Biophys. Acta - General Subjects Volume: 1820 Pages: 1327-1337
  • DOI: 10.1016/j.bbagen.2011.12.017
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Molecular and structural basis for N-glycan-depepndent determination of glycoprotein fates in cells (2013)
  • Author(s): Koichi Kato
  • Organizer: Glycobiology, Gordon Research Conference
  • Place of Presentation: Ventura （アメリカ）
  • Year and Date: 2013-03-04
  • Invited
• [Presentation] Conformational dynamics and interactions of oligosaccharides in physiological and pathological contexts (2013)
  • Author(s): Koichi Kato
  • Organizer: Fifth Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences: Experiments and Simulations
  • Place of Presentation: Gohan （韓国）
  • Year and Date: 2013-02-25
  • Invited
• [Presentation] NMR approaches for characterizing molecular recognition process of intrinsically disordered proteins (2013)
  • Author(s): Maho Yagi-Utsumi, Takumi Yamaguchi, Yoshinori Uekusa, Koichi Kato
  • Organizer: Fifth Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences: Experiments and Simulations
  • Place of Presentation: Gohan （韓国）
  • Year and Date: 2013-02-25
  • Invited
• [Presentation] Paramagnetic NMR approaches for characterization of conformational dynamics and interactions of oligosaccharides (2013)
  • Author(s): Ying Zhang，山口拓実，山本さよこ，植草義徳，矢木真穂，加藤晃一
  • Organizer: 日本生物物理学会中部支部講演会
  • Place of Presentation: 名古屋大学野依記念学術交流館（愛知）
  • Year and Date: 2013-02-19
• [Presentation] プロテアソームを構成するサブユニットとその集合因子Ump1pの相互作用解析 (2013)
  • Author(s): 大川慶祐，矢木宏和，植草義徳，矢木真穂，水島恒裕，佐藤匡史，佐伯 泰，田中啓二，加藤晃一
  • Organizer: 日本生物物理学会中部支部講演会
  • Place of Presentation: 名古屋大学野依記念学術交流館（愛知）
  • Year and Date: 2013-02-19
• [Presentation] NMR approaches to the molecular basis of oligosaccharide functions (2013)
  • Author(s): Takumi Yamaguchi, Koichi Kato
  • Organizer: 2013 Asian Core Winter School
  • Place of Presentation: Busan （韓国）
  • Year and Date: 2013-01-28
  • Invited
• [Presentation] NMR Spectroscopic Characterization of the Pathogenic Interaction of Amyloid β Peptide with GM1 Clusters (2013)
  • Author(s): Maho Yagi-Utsumi, Koichi Kato
  • Organizer: Pure and Applied Chemistry International Conference 2013 (PACCON 2013)
  • Place of Presentation: Chon Buri（タイ）
  • Year and Date: 2013-01-24
• [Presentation] Paramagnetic Lanthanide-tagging for NMR Conformational Characterization of Glycolipids (2013)
  • Author(s): Takumi Yamaguchi, Ying Zhang, Koichi Kato
  • Organizer: Pure and Applied Chemistry International Conference 2013 (PACCON 2013)
  • Place of Presentation: Chon Buri（タイ）
  • Year and Date: 2013-01-24
• [Presentation] Structural Views of Carbohydrate-Protein Interaction Systems as Potential Therapeutic Targets (2013)
  • Author(s): Koichi Kato
  • Organizer: Pure and Applied Chemistry International Conference 2013 (PACCON 2013)
  • Place of Presentation: Chon Buri（タイ）
  • Year and Date: 2013-01-24
  • Invited
• [Presentation] Structural Views of Carbohydrate-Protein Interaction Systems as Potential Therapeutic Targets (2013)
  • Author(s): Koichi Kato
  • Organizer: Kasetsart University Special Seminar
  • Place of Presentation: Bangkok （タイ）
  • Year and Date: 2013-01-22
  • Invited
• [Presentation] Comparative conformational analysis of high-mannose-type oligosaccharides using high-field NMR spectroscopy combined with 13C-labeling technique (2013)
  • Author(s): Kotaro Yanagi Yukiko Kamiya, Toshihiko Kitajima, Takumi Yamaguchi, Yasunori Chiba, Koichi Kato
  • Organizer: Sokendai Asian Winter School "Frontiers in Photo-Molecular Science"
  • Place of Presentation: 岡崎コンファレンスセンター（愛知）
  • Year and Date: 2013-01-15
• [Presentation] 複合糖質の立体構造・ダイナミクス・相互作用 (2012)
  • Author(s): 加藤晃一
  • Organizer: 第85回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 福岡国際会議場・マリンメッセ福岡（福岡）
  • Year and Date: 2012-12-14
  • Invited
• [Presentation] 糖タンパク質の運命を決定する細胞内レクチンの糖鎖認識メカニズムの構造基盤 (2012)
  • Author(s): 佐藤匡史
  • Organizer: 第134回薬学談話会
  • Place of Presentation: 名古屋市立大学（愛知）
  • Year and Date: 2012-12-12
  • Invited
• [Presentation] Redox-dependent conformational dynamics of protein disulfide isomerase coupled with exposure of its substrate binding region (2012)
  • Author(s): Kouya Inagaki, Yoshinori Uekusa, Yukiko Kamiya, Tadashi Satoh, Koichi Kato
  • Organizer: The 6th International Symposium, Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
  • Place of Presentation: 京都テルサ（京都）
  • Year and Date: 2012-12-06
• [Presentation] Conformations, dynamics, and interactions of sugar chains as studied by NMR spectroscopy (2012)
  • Author(s): Yoshinori Uekusa, Ying Zhang, Kotaro Yanagi, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato
  • Organizer: The 6th International Symposium, Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
  • Place of Presentation: 京都テルサ（京都）
  • Year and Date: 2012-12-06
• [Presentation] Hydrogen-deuterium (H/D) exchange studies on free GroES and the GroEL-SR1-ADP chaperonin complex (2012)
  • Author(s): Mahesh S. Chandak, Takashi Nakamura, Koki Makabe, Toshio Takenaka, Jin Chen, Koichi Kato, Kunihiro Kuwajima
  • Organizer: The 6th International Symposium, Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
  • Place of Presentation: 京都テルサ（京都）
  • Year and Date: 2012-12-06
• [Presentation] Characterization of conformational dynamics of branched oligosaccharides by using paramagnetic NMR techniques (2012)
  • Author(s): Ying Zhang, Takumi Yamaguchi, Sayoko Yamamoto, Koichi Kato
  • Organizer: 9th SOKENDAI Student Seminar (Life Science Retreat 2012)
  • Place of Presentation: ヤマハリゾートつま恋（静岡）
  • Year and Date: 2012-12-06
• [Presentation] NMR characterization of conformational fluctuations of oligosaccharides and glycoconjugates (2012)
  • Author(s): Koichi Kato
  • Organizer: The 6th International Symposium, Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
  • Place of Presentation: 京都テルサ（京都）
  • Year and Date: 2012-12-05
  • Invited
• [Presentation] Multiple binding models in molecular recognition process of GroEL as studied by NMR spectroscopy (2012)
  • Author(s): Tomoko Kunihara, Maho Yagi-Utsumi, Takashi Nakamura, Kunihiro Kuwajima, Koichi Kato
  • Organizer: The 6th International Symposium, Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
  • Place of Presentation: 京都テルサ（京都）
  • Year and Date: 2012-12-05
• [Presentation] Solution structure of the alternatively folded state of ubiquitin (2012)
  • Author(s): Soichiro Kitazawa, Tomoshi Kameda, Maho Yagi, Kenji Sugase, Nicky Baxter, Koici Kato, Williamson Michael P., Ryo Kitahara
  • Organizer: The 6th International Symposium, Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
  • Place of Presentation: 京都テルサ（京都）
  • Year and Date: 2012-12-05
• [Presentation] 複合糖質の構造生物学： 創薬標的としての糖鎖 (2012)
  • Author(s): 加藤晃一
  • Organizer: 第40回構造活性相関シンポジウム
  • Place of Presentation: 岡崎市図書館交流プラザ・りぶら（愛知）
  • Year and Date: 2012-11-30
  • Invited
• [Presentation] Conformational dynamics and interactions of glycoconjugates of therapeutic interest (2012)
  • Author(s): 加藤晃一
  • Organizer: 公益財団法人 水谷糖質科学振興財団 創立20周年記念国際シンポジウム Glycoscience：diversity and integration 生命多様性の統合的理解に向けた糖質科学
  • Place of Presentation: 東京カンファレンスセンター（東京）
  • Year and Date: 2012-11-29
  • Invited
• [Presentation] NMR spectroscopic approaches to the conformational dynamics of oligosaccharides by paramagnetic tagging (2012)
  • Author(s): Takumi Yamaguchi, Ying Zhang, Koichi Kato
  • Organizer: The First International Symposium on Biofunctional Chemistry (ISBC2012)
  • Place of Presentation: 東工大蔵前会館（東京）
  • Year and Date: 2012-11-28
• [Presentation] GM-1ガングリオシドがクラスター化したナノ表面の自己組織化 (2012)
  • Author(s): 佐藤宗太，吉正 泰，藤田大士，矢木真穂，加藤晃一，藤田 誠
  • Organizer: 第51回NMR討論会
  • Place of Presentation: ウインク愛知（愛知）
  • Year and Date: 2012-11-10
• [Presentation] 常磁性効果を応用した糖鎖の動的立体構造解析 (2012)
  • Author(s): 山口拓実，Zhang Ying，山本さよこ，亀田倫史，加藤晃一
  • Organizer: 第51回NMR討論会
  • Place of Presentation: ウインク愛知（愛知）
  • Year and Date: 2012-11-10
• [Presentation] Induction of Residual Dipolarc oupling by Aggregates of Magnetically Aligning Self-Assembled Complexes (2012)
  • Author(s): Ryosuke Takeuchi, Sota Sato, Maho Yagi, Yoshiki Yamaguchi, Koichi Kato, Makoto Fujita
  • Organizer: 第51回NMR討論会
  • Place of Presentation: ウインク愛知（愛知）
  • Year and Date: 2012-11-08
• [Presentation] ユビキチンの高エネルギー状態N2 の立体構造解明 (2012)
  • Author(s): 北沢創一郎，亀田倫史，矢木真穂，菅瀬謙治，Nicky Baxter，加藤晃一，Williamson Michael P，北原 亮
  • Organizer: 第51回NMR討論会
  • Place of Presentation: ウインク愛知（愛知）
  • Year and Date: 2012-11-08
• [Presentation] 酸化還元状態に依存してプロテインジスルフィドイソメラーゼの基質結合部位ドメインの空間配置が変化する仕組み (2012)
  • Author(s): Kouya Inagaki, Yoshinori Uekusa, Yukiko Kamiya, Tadashi Satoh, Koichi Kato
  • Organizer: 第50回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋大学（愛知）
  • Year and Date: 2012-09-22
• [Presentation] HD-exchange motion of free heptameric GroES studied by the use of TROSY and DMSO quenching followed by 2D NMR (2012)
  • Author(s): Mahesh S. Chandak, Takashi Nakamura, Koki Makabe, Toshio Takenaka, Jin Chen, Koichi Kato, Kunihiro Kuwajima
  • Organizer: 第50回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋大学（愛知）
  • Year and Date: 2012-09-22
• [Presentation] Solution structure of the alternatively folded state of ubiquitin (2012)
  • Author(s): Soichiro Kitazawa, Tomoshi Kameda, Maho Yagi, Kenji Sugase, Nicky Baxter, Koichi Kato, Michael P. Williamson, Ryo Kitahara
  • Organizer: 第50回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋大学（愛知）
  • Year and Date: 2012-09-22
• [Presentation] 超高磁場NMR法を用いた高マンノース型糖鎖の構造解析高磁場NMR法を用いた高マンノース型糖鎖の構造解析 (2012)
  • Author(s): 柳浩太郎，神谷由紀子，千葉靖典，喜多島敏彦，地神芳文，加藤晃一
  • Organizer: 第31回日本糖質学会年会
  • Place of Presentation: 鹿児島市民文化ホール（鹿児島）
  • Year and Date: 2012-09-18
• [Presentation] NMR法を用いたガングリオ複合体における特異的な糖質間相互作用の解析 (2012)
  • Author(s): 植草義徳, 加藤晃一
  • Organizer: 第31回日本糖質学会年会
  • Place of Presentation: 鹿児島市民文化ホール（鹿児島）
  • Year and Date: 2012-09-18
• [Presentation] 常磁性NMR法による糖鎖の動的立体構造解析 (2012)
  • Author(s): 山口拓実，Zhang Ying，山本さよこ，亀田倫史，Erdelyi Mate，Griesinger Christian，加藤晃一
  • Organizer: 第31回日本糖質学会年会
  • Place of Presentation: 鹿児島市民文化ホール（鹿児島）
  • Year and Date: 2012-09-18
• [Presentation] NMR法を用いたザルコトキシンIAとリピドAとの相互作用解析 (2012)
  • Author(s): 矢木真穂，Pornthip Boonsri，山口芳樹，加藤晃一
  • Organizer: 第31回日本糖質学会年会
  • Place of Presentation: 鹿児島市民文化ホール（鹿児島）
  • Year and Date: 2012-09-18
• [Presentation] ATP非依存性シャペロンの構造ダイナミクスと機能発現メカニズム (2012)
  • Author(s): 加藤晃一
  • Organizer: 新学術領域「揺らぎと生体機能」「水和とATP」合同公開シンポジウム 「ゆらぎと水－生命のエネルギーと分子機構を探る」
  • Place of Presentation: 大阪ガーデンパレス（大阪）
  • Year and Date: 2012-09-14
  • Invited
• [Presentation] 分子動力学計算と常磁性NMR法による糖鎖の立体構造揺らぎの評価 (2012)
  • Author(s): 山口拓実，Zhang Ying，山本さよこ，亀田倫史，加藤晃一
  • Organizer: 新学術領域「揺らぎと生体機能」「水和とATP」合同公開シンポジウム 「ゆらぎと水－生命のエネルギーと分子機構を探る」
  • Place of Presentation: 大阪ガーデンパレス（大阪）
  • Year and Date: 2012-09-14
• [Presentation] 蛋白質の高エネルギー構造の合理的設計と立体構造解析：ユビキチン (2012)
  • Author(s): 北原亮，北沢創一郎，亀田倫史，矢木-内海真穂，菅瀬謙治，Nicky Baxtar，Michael .P.Williamson，加藤晃一
  • Organizer: 新学術領域「揺らぎと生体機能」「水和とATP」合同公開シンポジウム 「ゆらぎと水－生命のエネルギーと分子機構を探る」
  • Place of Presentation: 大阪ガーデンパレス（大阪）
  • Year and Date: 2012-09-14
• [Presentation] NMRを利用したガングリオシド糖鎖間相互作用の観測 (2012)
  • Author(s): 植草義徳，加藤晃一
  • Organizer: 糖鎖科学中部拠点 第10回「若手の力」フォーラム
  • Place of Presentation: 静岡県立大学（静岡）
  • Year and Date: 2012-09-06
• [Presentation] NOE-derived solution structure of the high-energy open conformer N2 of ubiquitin (2012)
  • Author(s): Soichiro Kitazawa Tomoshi Kameda, Maho Yagi-Utsumi, Kenji Sugase, Koichi Kato, Ryo Kitahara
  • Organizer: XXVth ICMRBS
  • Place of Presentation: Lyon （フランス）
  • Year and Date: 2012-08-19
• [Presentation] Conformational fluctuation of ubiquitin probed by perturbation with pressure and mutation (2012)
  • Author(s): Ryo Kitahara, Soichiro Kitazawa, Maho Yagi-Utsumi, Nicky Baxter, Mike Williamson, Koichi Kato
  • Organizer: XXVth ICMRBS
  • Place of Presentation: Lyon （フランス）
  • Year and Date: 2012-08-19
• [Presentation] Structural views of carbohydrate-protein interaction systems as potential therapeutic targets (2012)
  • Author(s): Koichi Kato
  • Organizer: 26 International Carbohydrate Symposium
  • Place of Presentation: Madrid （スペイン）
  • Year and Date: 2012-07-26
  • Invited
• [Presentation] NMR analysis of specific carbohydrate-carbohydrate interaction between gangliosides (2012)
  • Author(s): Yoshinori Uekusa, Sandro Sonnino, and Koichi Kato
  • Organizer: 26 International Carbohydrate Symposium
  • Place of Presentation: Madrid （スペイン）
  • Year and Date: 2012-07-25
• [Presentation] Oligosaccharide conformational dynamics analyses by using PCS in conjunction with MD simulation (2012)
  • Author(s): Ying Zhang, Takumi Yamaguchi, Sayoko Yamamoto, and Koichi Kato
  • Organizer: 26 International Carbohydrate Symposium
  • Place of Presentation: Madrid （スペイン）
  • Year and Date: 2012-07-23
• [Presentation] NMRを用いた糖鎖の動的立体構造解析 (2012)
  • Author(s): 山口拓実
  • Organizer: 分子研若手の会
  • Place of Presentation: 分子科学研究所（愛知）
  • Year and Date: 2012-07-06
  • Invited
• [Presentation] タンパク質の機能拡張子としての糖鎖を観る (2012)
  • Author(s): 加藤晃一，矢木宏和，神谷由紀子，佐藤匡史
  • Organizer: 第12回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場（愛知）
  • Year and Date: 2012-06-20
  • Invited
• [Presentation] 新規プロテアソーム活性化因子 PbaB の構造と機能 (2012)
  • Author(s): 雲井健太郎，佐藤匡史，矢木宏和，廣本武史，水島恒裕，内山 進，野田勝紀，村田和義，神谷由紀子，加藤晃一
  • Organizer: 第12回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場（愛知）
  • Year and Date: 2012-06-20
• [Presentation] 直鎖状ポリユビキチン鎖形成を担うE3リガーゼ複合体における非典型的な UBA-UBL 相互作用 (2012)
  • Author(s): 矢木宏和，石本和大，廣本武史，藤田宏明，水島恒裕，植草義徳，矢木真穂，栗本英治，野田勝紀，内山 進，徳永文稔，岩井一宏，加藤晃一
  • Organizer: 第12回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場（愛知）
  • Year and Date: 2012-06-20
• [Presentation] 常磁性NMR分光法と分子動力学計算を組み合わせた糖鎖の動的立体構造解析 (2012)
  • Author(s): 山口拓実，Zhang Ying，山本さよこ，加藤晃一
  • Organizer: 第39回生体分子科学討論会
  • Place of Presentation: 東北大学片平さくらホール（宮城）
  • Year and Date: 2012-06-09
• [Presentation] 古細菌タンパク質PbaBによるATP非依存的プロテアソーム活性化機構の構造基盤 (2012)
  • Author(s): 雲井健太郎，佐藤匡史，廣本武史，水島恒裕，神谷由紀子，野田勝紀，内山 進，村田和義，矢木宏和，加藤晃一
  • Organizer: 第76回日本生化学会 中部支部例会・シンポジウム
  • Place of Presentation: 岡崎コンファレンスセンター（愛知）
  • Year and Date: 2012-05-26
• [Presentation] 非典型的なUBA-UBL相互作用が介在する直鎖状ポリユビキチン鎖を生成するE3リガーゼ複合体 (2012)
  • Author(s): 矢木宏和，石本和大，廣本武史，藤田宏明，水島恒裕，植草義徳，矢木真穂，栗本英治，野田勝紀，内山 進，徳永文稔，岩井一宏，加藤晃一
  • Organizer: 第76回日本生化学会 中部支部例会・シンポジウム
  • Place of Presentation: 岡崎コンファレンスセンター（愛知）
  • Year and Date: 2012-05-26
• [Book] バイオ／抗体医薬品の開発・製造プロセス (2012)
  • Author(s): 加藤晃一
  • Total Pages: 11
  • Publisher: 情報機構
• [Book] 新機能抗体開発ハンドブック (2012)
  • Author(s): 加藤晃一
  • Total Pages: 5
  • Publisher: エヌ・ティー・エス
• [Book] 次世代に向けた抗体医薬開発の技術と展望 (2012)
  • Author(s): 加藤晃一
  • Total Pages: 15
  • Publisher: シーエムシー出版