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2010 Fiscal Year Annual Research Report

非天然アミノ酸の部位特異的導入技術を用いたタンパク質の揺らぎ解析

Planned Research

Project AreaMolecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
Project/Area Number 20107005
Research InstitutionJapan Advanced Institute of Science and Technology

Principal Investigator

芳坂 貴弘  北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 教授 (30263619)

Keywordsタンパク質 / 非天然アミノ酸 / 揺らぎ / 4塩基コドン / 無細胞翻訳系 / マルトース結合タンパク質 / 蛍光共鳴エネルギー移動 / 一分子測定
Research Abstract

本研究では、4塩基コドンを用いた非天然アミノ酸のタンパク質への部位特異的導入技術を用いて、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)のドナーとアクセプターとなる2種類の非天然アミノ酸をタンパク質の特定部位へ導入することで、タンパク質の構造揺らぎをFRETを用いて計測することを試みている。また20種類の天然アミノ酸以外に、多種類の非天然アミノ酸のタンパク質への導入系を確立し、非天然アミノ酸置換により揺らぎを制御できるシステムを開発する。そのためにまず、タンパク質のN末端あるいはN末端領域に蛍光標識アミノ酸を効率的に導入する手法を確立して、その手法を用いて、N末端にFRETのドナーとなる蛍光標識アミノ酸を、内部の様々な部位に非蛍光性アクセプターとなる非天然アミノ酸を導入した、マルトース結合タンパク質を合成した。蛍光寿命測定とその解析により、N末端と内部部位の2点間距離およびその揺らぎが測定可能であることが示された。さらに、光安定性の高い2種類の蛍光標識アミノ酸を導入したタンパク質を合成して、二重蛍光標識タンパク質の構造変化に伴うFRET効率の変化を、フロー式1分子蛍光測定により測定できることも実証した。また、アミノ酸置換の揺らぎへの影響を系統的に評価する上で有用となる、1種類のアンバーコドン置換遺伝子から20種類のアミノ酸置換タンパク質を効率的に合成できる手法の開発、および、翻訳後修飾に伴うタンパク質の揺らぎ解析に有用となる、蛍光標識された翻訳後修飾タンパク質の合成法の開発も行なった。

  • Research Products

    (27 results)

All 2012 2011 2010 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (21 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Incorporation of Unnatural Non-α-Amino Acids into the N-Terminus of Proteins in a Cell-Free Translation System2012

    • Author(s)
      Takahiro Hohsaka
    • Journal Title

      Methods Mol. Biol.

      Volume: 794 Pages: 229-239

    • DOI

      10.1007/978-1-61779-331-8_14

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biosynthesis of proteins containing modified lysines and fluorescent labels using non-natural amino acid mutagenesis2011

    • Author(s)
      Yasunori Tokuda, Takayoshi Watanabe, Kazushi Horiike, Kaori Shiraga, Ryoji Abe, Norihito Muranaka, Takahiro Hohsaka
    • Journal Title

      J.Biosci.Bioeng.

      Volume: 111 Pages: 402-407

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2010.12.012

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Incorporation of fluorescent-labeled non-α-amino carboxylic acids into the N-terminus of proteins in response to amber initiation codon2010

    • Author(s)
      Masanori Miura, Norihito Muranaka, Ryoji Abe, Takahiro Hohsaka
    • Journal Title

      Bull.Chem.Soc.Jpn.

      Volume: 83 Pages: 546-553

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Incorporation of fluorescent non-natural amino acids into N-terminal tag of proteins in cell-free translation and its dependence on position and neighboring codons2010

    • Author(s)
      Ryoji Abe, Kaori Shiraga, Shogo Ebisu, Hiroaki Takagi, Takahiro Hohsaka
    • Journal Title

      J.Biosci.Bioeng.

      Volume: 110 Pages: 32-38

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 非天然アミノ酸のタンパク質への導入技術-バイオメディカル応用に向けて2010

    • Author(s)
      芳坂貴弘
    • Journal Title

      メディカルバイオ別冊

      Pages: 72-77

  • [Presentation] 拡張遺伝暗号を用いたタンパク質の網羅的アミノ酸置換法の開発2011

    • Author(s)
      渡邉貴嘉・峯浦稔也・芳坂貴弘
    • Organizer
      日本化学会春季年会
    • Place of Presentation
      神奈川大学(神奈川県)
    • Year and Date
      2011-03-27
  • [Presentation] 蛍光標識アミノ酸の導入とGFP融合発現による二重標識タンパク質の合成とFRET解析2011

    • Author(s)
      山口純・飯島一生・芳坂貴弘
    • Organizer
      日本化学会春季年会
    • Place of Presentation
      神奈川大学(神奈川県)
    • Year and Date
      2011-03-27
  • [Presentation] 開始コドンの拡張による非天然アミノ酸誘導体のタンパク質N末端への導入2011

    • Author(s)
      三浦将典・白神かおり・芳坂貴弘
    • Organizer
      日本化学会春季年会
    • Place of Presentation
      神奈川大学(神奈川県)
    • Year and Date
      2011-03-27
  • [Presentation] Site-specific incorporation of two fluorescent nonnatural amino acids into proteins for single-molecule FRET2010

    • Author(s)
      Yasunori Tokuda, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      PACIFICHEM2010
    • Place of Presentation
      Honolulu, USA
    • Year and Date
      2010-12-17
  • [Presentation] N-terminal specific fluorescence labeling of proteins through incorporation of fluorescent hydroxy acid2010

    • Author(s)
      Takayoshi Watanabe, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      PACIFICHEM2010
    • Place of Presentation
      Honolulu, USA
    • Year and Date
      2010-12-17
  • [Presentation] FRET analysis of protein structures by double-incorporation of fluorescent and non-fluorescent nonnatural amin acids2010

    • Author(s)
      Issei Iijima, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      PACIFICHEM2010
    • Place of Presentation
      Honolulu, USA
    • Year and Date
      2010-12-17
  • [Presentation] Site-specific incorporation of PEGylated nonnatural amino acids into proteins in a cell-free translation system2010

    • Author(s)
      Naoki Shozen, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      PACIFICHEM2010
    • Place of Presentation
      Honolulu, USA
    • Year and Date
      2010-12-17
  • [Presentation] Synthesis of double-labeled proteins with GFP and fluorescent nonnatural amino acids2010

    • Author(s)
      Atsushi Yamaguchi, Issei Iijima, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      PACIFICHEM2010
    • Place of Presentation
      Honolulu, USA
    • Year and Date
      2010-12-17
  • [Presentation] Fluorescence analysis of sialic acid-binding lectin by incorporation of flucrescent nonnatural amino acids2010

    • Author(s)
      Yasutaka Ito, Issei Iijima, Yasunori Tokuda, Rikio Yabe, Atsushi Kuno, Jun Hirabayashi, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      PACIFICHEM2010
    • Place of Presentation
      Honolulu, USA
    • Year and Date
      2010-12-17
  • [Presentation] アンバーサプレッサーtRNAを用いた網羅的アミノ酸置換法の開発2010

    • Author(s)
      峯浦稔也、渡邉貴嘉、芳坂貴弘
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会(BMB2010)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県)
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] 蛍光標識アミノ酸の導入とGFP融合発現によるタンパク質の二重標識法の開発2010

    • Author(s)
      山口純, 飯島一生, 芳坂貴弘
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会(BMB2010)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県)
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] 二種類の蛍光標識アミノ酸の導入によるFRETと蛍光消光を利用したタンパク質の基質結合の検出2010

    • Author(s)
      飯島一生、芳坂貴弘
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会(BMB2010)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県)
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] FRET analysis of protein structures by double-incorporation of nonnatural amino acids2010

    • Author(s)
      Issei Iijima, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      揺らぎが機能を決める生命分子の科学 第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      滋賀県立県民交流センターピアザ淡海(滋賀県)
    • Year and Date
      2010-11-30
  • [Presentation] Novel method for saturation mutagenesis of proteins using cell-free translation system2010

    • Author(s)
      Takayoshi Watanabe, Toshiya Mineura, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      揺らぎが機能を決める生命分子の科学 第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      滋賀県立県民交流センターピアザ淡海(滋賀県)
    • Year and Date
      2010-11-30
  • [Presentation] Precise FRET analysis of protein structures by double-incorporation of nonnatural amino acids labeled with donor and acceptor2010

    • Author(s)
      Issei Iijima, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学川内キャンパス(宮城県)
    • Year and Date
      2010-09-20
  • [Presentation] FRET analysis of structural changes in Staphylococcal nuclease2010

    • Author(s)
      Yusuke Kishi, Mariko Yamaguchi, Issei Iijima, Yoichi Yamazaki, Hironari Kamikubo, Takahiro Hohsaka, Mikio Kataoka
    • Organizer
      第48回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学川内キャンパス(宮城県)
    • Year and Date
      2010-09-20
  • [Presentation] タンパク質の網羅的アミノ酸置換のための新規手法の開発2010

    • Author(s)
      渡邉貴嘉、峯浦稔也、山口純、芳坂貴弘
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2010-06-18
  • [Presentation] 蛍光標識アミノ酸の導入とGFP融合発現を利用したタンパク質のFRET解析2010

    • Author(s)
      山口純、飯島一生、江草忠義、芳坂貴弘
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2010-06-17
  • [Presentation] 非天然アミノ酸導入技術を用いた二重蛍光標識タンパク質の合成と一分子FRETへの応用2010

    • Author(s)
      徳田安則、芳坂貴弘
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2010-06-17
  • [Presentation] 非天然アミノ酸の二重導入によるタンパク質構造の精密なFRET解析2010

    • Author(s)
      飯島一生、芳坂貴引
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2010-06-16
  • [Presentation] ピンポイント蛍光標識抗体断片の抗原結合による蛍光増強2010

    • Author(s)
      上田宏、阿部亮二、高木広明、伊原正喜、芳坂貴弘
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2010-06-16
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.jaist.ac.jp/ms/labs/hohsaka/

URL: 

Published: 2012-07-19  

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