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2011 Fiscal Year Annual Research Report

核と細胞質間のRNA分配制御

Planned Research

Project AreaDiversity and asymmetry achieved by RNA program
Project/Area Number 20112007
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

大野 睦人  京都大学, ウイルス研究所, 教授 (80201979)

KeywordsRNA / 輸送 / 核 / 細胞質 / 識別
Research Abstract

1.私たちは、複数の共通点を持つ似たもの同士であるmRNAとU snRNAという短いRNAの間がどのように区別されているのかを調べた結果、RNAの長さが重要であることを発見していたが、そのメカニズムについては長い間謎であった。今回、細胞がRNAを長さに応じて分類するメカニズムについて次のようなことを明らかにした。RNAポリメラーゼII型による転写開始直後、染色体DNAから新生RNAの末端が現れ始めると、そこにキャップ構造という特殊な構造が付加され、キャップ構造結合因子CBCが結合する。この時点では、このRNAが将来mRNAになるのかU snRNAになるのか細胞にはわからない。転写がさらに進み、新生RNAの長さが200~300塩基長より長くなると、hnRNP CというRNA結合タンパク質の四量体が安定に結合できるようになり、そのような転写物はmRNA前駆体であると分類され、同時にU snRNA輸送因子であるPHAXのその転写物への結合が阻害される。逆に、RNAの長さが200~300塩基長より短いまま転写が終了した場合、hnRNP Cの四量体が安定に結合できず、そのような転写物はU snRNA前駆体であると分類され、PHAXをはじめU snRNA輸送因子群がRNA上に集合する。このように、hnRNP Cの四量体が「分子のものさし」となってRNAの長さを測り、RNAを長さに応じて仕分けすることが明らかになった。
2.mRNA前駆体の核外輸送塗防ぐ重要な機構が細胞には存在するが、哺乳類においてはその情報はほとんどなかった。HeLa細胞を用いて候補因子のノックダウンや過剰発現とMS2テザリングアッセイを組み合わせた解析を行った結果、スプライシングの初期因子であるU1 snRNP、U2AF、UAP56などが哺乳類のmRNA前駆体の核内保持に重要であることが明らかになった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

長年の謎であり、本研究提案の目玉であった「RNAの長さを測る機構」を明らかにすることができた。この成果を一流国際誌SCIENCE誌に発表した。この成果は京都新聞(平成24年3月30日25面)に掲載された。また、京都大学および京都大学ウイルス研究所ホームページなどで概要を公開した。

Strategy for Future Research Activity

本研究期間の最後の年度にあたり、「RNAの長さを測る機構」の背後にあるmRNAの核外輸送を制御する可能性のあるシグナル伝達系をRNA-seq法などで明らかにすることに挑む。また、「RNAの長さを測る機構」の研究から派生したいくつかのシードを発展させたい。

  • Research Products

    (25 results)

All 2012 2011

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (22 results)

  • [Journal Article] HnRNP C tetramer measures RNA length to classify RNA polymerase II transcripts for export2012

    • Author(s)
      McCloskey, A
    • Journal Title

      Science

      Volume: 335 Pages: 1643-46

    • DOI

      10.1126/science.1218469

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multiple factors in the early splicing complex are involved in the puclear retention of pre-mRNAs in mammalia cells2011

    • Author(s)
      Takemura, R
    • Journal Title

      Genes Cells

      Volume: 16(10) Pages: 1035-49

    • DOI

      DOI:10.1111/j.1365-2443.2011.01548

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Specific Y14 domains mediate its nucleo-cytoplasmic shuttling and association with spliced mRNA2011

    • Author(s)
      Kataoka, N
    • Journal Title

      Sci.Rep

      Volume: 1,92 Pages: 40,915

    • DOI

      DOI:10.1038/srep00092

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] HnRNP C tetramer measures RNA length to classify RNA polymerase II transcripts for export2012

    • Author(s)
      McCloskey, A
    • Organizer
      The 10th International Student
    • Place of Presentation
      芝蘭会館(京都市)
    • Year and Date
      20120305-20120308
  • [Presentation] 真核生物リボソームの品質管理2012

    • Author(s)
      北畠真
    • Organizer
      第1回リボソームミーアィング
    • Place of Presentation
      広島大学(広島市)
    • Year and Date
      2012-03-16
  • [Presentation] 機能不全rRNAの分解においてタンパク質分解経路の果たす役割2012

    • Author(s)
      藤井耕太郎
    • Organizer
      第1回リボソームミーアィング
    • Place of Presentation
      広島大学(広島市)
    • Year and Date
      2012-03-16
  • [Presentation] 機能不全リボソームの分解に関わるE3ユビキチンリガーゼ複合体の解析2012

    • Author(s)
      坂田知子
    • Organizer
      第1回リボソームミーアィング
    • Place of Presentation
      広島大学(広島市)
    • Year and Date
      2012-03-16
  • [Presentation] 真核生物におけるリボソームRNAの品質管理のメカニズム2011

    • Author(s)
      北畠真
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] A novel activity of HIV-1 Rev protein to remodel export RNPs in directing virus-specific RNA export2011

    • Author(s)
      Taniguchi, I
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] HnRNP Cの4量体はRNAの長さを測り、核外輸送へ向けてRNA polymerase II由来の転写産物を仕分けする2011

    • Author(s)
      マクロースキー亜紗子
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] Nonfunctional rRNA decay functionally requires proteasome activity2011

    • Author(s)
      Fujii, K
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] 機能不全リボソームを分解に関わるE3ユビキチンリガーゼ複合体の解析2011

    • Author(s)
      坂田知子
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] Characterization of a degradation intermediate of the nonfunctional ribおsome2011

    • Author(s)
      Sakai, T
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] hnRNP Cの四量体は核外輸送に際してRNAの長さを測る2011

    • Author(s)
      大野睦人
    • Organizer
      第10回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      クラッセホテル北広島(北広島市)
    • Year and Date
      20111026-20111028
  • [Presentation] マウス細胞内における28S rRNA上に生じた紫外線損傷の修復2011

    • Author(s)
      宮田淳美
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング2011
    • Place of Presentation
      あいち健康プラザ(大府市)
    • Year and Date
      20110830-20110901
  • [Presentation] U snRNAの核外輸送を促進する因子の同定2011

    • Author(s)
      和泉光人
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング2011
    • Place of Presentation
      あいち健康プラザ(大府市)
    • Year and Date
      20110830-20110901
  • [Presentation] Unraveling the Molecular Mechanism of Nonfunctional 25S rRNA Decay : Proteasome-Dependent Step-wise Degradation of Mutant rRNAs in S.cerevisiae2011

    • Author(s)
      Kitabatake, M
    • Organizer
      2011 RNA meeting
    • Place of Presentation
      Kyoto International Conference
    • Year and Date
      20110614-20110619
  • [Presentation] A novel activity of HIV-1 Rev protein to remodel export RNPs in directing virus-specific RNA export. Cerevisiae2011

    • Author(s)
      Taniguchi, I
    • Organizer
      2011 RNA meeting
    • Place of Presentation
      Kyoto International Conference
    • Year and Date
      20110614-20110619
  • [Presentation] In vivo reversal of a UV-induced lesion on mouse 28S rRNA2011

    • Author(s)
      Miyata, A
    • Organizer
      2011 RNA meeting
    • Place of Presentation
      Kyoto International Conference
    • Year and Date
      20110614-20110619
  • [Presentation] HnRNPC1/C2 tetramer measures RNA length to ensure the proper nuclear export of messenger RNAs2011

    • Author(s)
      McCloskey, A
    • Organizer
      2011 RNA meeting
    • Place of Presentation
      Kyoto International Conference
    • Year and Date
      20110614-20110619
  • [Presentation] p54nrb and PSF promote Nuclear Export of Spliceosomal U snRNA precursors2011

    • Author(s)
      Izumi, H
    • Organizer
      2011 RNA meeting
    • Place of Presentation
      Kyoto International Conference
    • Year and Date
      20110614-20110619
  • [Presentation] Identification of Scaffold Attachment Factor B1 (SAFB1) as a candidate factor that measures RNA length2011

    • Author(s)
      Nishio, H
    • Organizer
      2011 RNA meeting
    • Place of Presentation
      Kyoto International Conference
    • Year and Date
      20110614-20110619
  • [Presentation] Xrn1 and the exosome are involved in nonfunctional 25S rRNA decay2011

    • Author(s)
      Sakai, T
    • Organizer
      2011 RNA meeting
    • Place of Presentation
      Kyoto International Conference
    • Year and Date
      20110614-20110619
  • [Presentation] U snRNA核外輸送を促進する因子の解析2011

    • Author(s)
      和泉光人
    • Organizer
      平成23年度京都大学ウイルス研究所学術交流会
    • Place of Presentation
      京都教育文化センター(京都市)
    • Year and Date
      2011-12-19
  • [Presentation] RNAの核外輸送や品質管理におけるRNA識別2011

    • Author(s)
      大野睦人
    • Organizer
      2nd Forum in DOJIN
    • Place of Presentation
      熊本ホテルキャッスル(熊本市)
    • Year and Date
      2011-11-04

URL: 

Published: 2013-06-26  

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