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2008 Fiscal Year Annual Research Report

ケミカルバイオロジーによる細胞内物流システムの理解と制御

Planned Research

Project AreaIntracellular logistics: interdisciplinary approaches to pathophysiology of membrane traffic
Project/Area Number 20113008
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

清水 史郎  The Institute of Physical and Chemical Research, 長田抗生物質研究室, 専任研究員 (30312268)

Keywords化合物アレイ / 公的化合物バンク施設 / 赤色蛍光タンパク質 / ヘパラナーゼ / NPDepo / 細胞内ロジスティクス / ケミカルバイオロジー
Research Abstract

1.化合物アレイを用いた細胞内ロジスティクス制御分子の阻害剤探索 今年度は様々な標的クンパク質を解析する目的で、多くのヒト遺伝子に関して赤色蛍光タンパク質(RFP)との融合遺伝子の発現ベクターを作製した。さらに、各計画研究班員に直接関連するオートファジー関連タンパク質群、メラニン輸送関連分子群、細胞接着関連タンパク質群、細胞表面分子群、さらには、がん転移促進タンパク質群などについてRFP融合タンパク質発現ベクターをいくつか作製した。作製が完了したものに関しては、培養細胞に発現させた後、理化学研究所内の公的化合物バンク施設(NPDepo)に収蔵されているアレイ化された化合物との結合を評価した。いくつかのタンパク質についてはヒット化合物があったため、類縁化合物も含めて細胞内での影響を調べた。
2.ケミカルバイオロジー的手法によるがん細胞の転移・浸潤機構の解析 本年度はまず、ヘパラナーゼ誘導性の細胞遊走能の亢進機構を解析する目的で、ヘパラナーゼ結合タンパク質の同定を試みた。ここで同定されたタンパク質群は、がん細胞の転移を促進する可能性が考えられる。これらのタンパク質群の中で既存の阻害剤が存在しないものは、次年度以降に化合物アレイで評価するタンパク質群の候補とした
さらに、活性化型ヘパラナーゼを精製する目的で、様々なタグを導入したヘパラナーゼ発現用のベクターを作製し、培養ヒトがん細胞に遺伝子導入後、発現確認および活性化について評価を行った。

  • Research Products

    (11 results)

All 2009 2008

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] On-chip fragment-based approach for discovery of high-affinity bivalent inhibitors.2009

    • Author(s)
      Miyazaki, I., et al.
    • Journal Title

      ChemBioChem 10(印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure-affinity relationship study of bleomycins and Shble protein using a chemical array.2009

    • Author(s)
      Miyazaki, I., et al.
    • Journal Title

      ChemBioChem 10(印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RECK negatively regulates matrix metalloproteinase-9 transcription.2009

    • Author(s)
      Takagi, S., et al.
    • Journal Title

      Cancer Research 69

      Pages: 1502-1508

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A cell-based screening to detect inhibitors of BRAF signaling pathway.2009

    • Author(s)
      Asami Y., et al.
    • Journal Title

      Journal of Antibiotics 62(印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Polo-like kinase 1 phosphorylates and regulates Bcl-xL during pironetin-induced apoptosis.2009

    • Author(s)
      Tamura Y, et al.
    • Journal Title

      Oncogene 28

      Pages: 107-116

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Requirement of the conserved, hydrophobic C-terminus region for the activation of heparanase.2008

    • Author(s)
      Lai, N. S., et al.
    • Journal Title

      Experimental Cell Research 314

      Pages: 2834-2845

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Robust and systematic drug screening method using chemical arrays and the protein library: identification of novel inhibitors of carbonic anhydrase II.2008

    • Author(s)
      Miyazaki, I.., et al.
    • Journal Title

      Bioscience,Biotechnology,and Biochemistry 72

      Pages: 2739-2749

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 分子細胞学的解析2008

    • Author(s)
      清水 史郎 他
    • Journal Title

      日本臨牀 増刊号1 がん薬物療法学 67

      Pages: 143-147

  • [Presentation] Establishment of novel antitumor drugs screening method by using chemical array2009

    • Author(s)
      Simizu, S., et al.
    • Organizer
      AACR-ACS Joint Conference on Chemistry in Cancer Research
    • Place of Presentation
      米国 : Westin New Orleans Canal Place
    • Year and Date
      20090208-11
  • [Presentation] On-chip fragment-based approach for new tool of antitumor drug design2009

    • Author(s)
      Miyazaki, I., et al.
    • Organizer
      AACR-ACS Joint Conference on Chemistry in Cancer Research
    • Place of Presentation
      米国 : Westin New Orleans Canal Place
    • Year and Date
      20090208-11
  • [Presentation] Activation and function of heparanase: roles of post-translational modifications2008

    • Author(s)
      Simizu, S., et al.
    • Organizer
      International Symposium on Systems Glycobiology
    • Place of Presentation
      東京 : 東京カンファレンスセンター
    • Year and Date
      2008-12-05

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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