Analysis of chromatin structure changes during cell differentiation.

2010 Fiscal Year Self-evaluation Report

• Project Area: The physicochemical field for genetic activities
• Project/Area Number: 20114007
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: SUEMORI Hirofumi Kyoto University, 再生医科学研究所, 准教授 (90261198)
• Project Period (FY): 2008 – 2012
• Keywords: 細胞分化 / クロマチン / 遺伝子発現 / ヒストン修飾 / ES細胞

Research Abstract

発生分化における遺伝子発現の時空間的変化がゲノムのDNA塩基配列情報だけではなく、クロマチン構造や染色体の高次構造の変化によっても制御されると考え、このような核内高次構造が作り出す「場」とその変化が、哺乳動物の発生分化においてどのような機能を有するのかを、まず遺伝子発現制御機構としての観点から解析をすすめている。
本研究課題では、高精度の分化誘導技術を応用し、クロマチン高次構造とその機能が細胞分化過程でどのように変化しているのかを明らかにすることを目的とする。このような核内高次構造が形成する「場」が遺伝情報の機能発現にどのように関与しているのかは、これまでの研究でもほとんど解明されておらず、本研究領域に新たなパラダイムを形成しうるものである

Research Products

• [Journal Article] Role of SOX2 in maintaining pluripotency of human embryonic stem cells. (2010)
  • Author(s): Adachi K, Suemori H, Yasuda SY, Nakatsuji N, Kawase E.
  • Journal Title: Genes Cells 15 Pages: 455-470
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] International Stem Cell Initiative Consortium, Comparison of defined culture systems for feeder cell free propagation of human embryonic stem cells. (2010)
  • Author(s): Akopian V, Andrews PW, Beil S, Benvenisty N, Brehm J, Christie M, Ford A, Fox V, Gokhale PJ, Healy L, Holm F, Hovatta O, Knowles BB, Ludwig TE, McKay RD, Miyazaki T, Nakatsuji N, Oh SK, Pera MF, Rossant J, Stacey GN, Suemori H.
  • Journal Title: In Vitro Cell Dev Biol Anim. 46 Pages: 247-258
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] In vitro hepatic maturation of human embryonic stem cells by using a mesenchymal cell line derived from murine fetal livers. (2010)
  • Author(s): Ishii T, Yasuchika K, Fukumitsu K, Kawamoto T, Kawamura-Saitoh M, Amagai Y, Ikai I, Uemoto S, Kawase E, Suemori H, Nakatsuji N.
  • Journal Title: Cell Tissue Res. 339 Pages: 505-512
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Gene targeting in human pluripotent stem cells with adeno-associated virus vectors. (2009)
  • Author(s): Mitsui K, Suzuki K, Aizawa E, Kawase E, Suemori H, Nakatsuji N, Mitani K.
  • Journal Title: Biochem.Biophys.Res.Commun. 388 Pages: 711-717
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Adipogenic differentiation of human induced pluripotent stem cells : comparison with that of human embryonic stem cells. (2009)
  • Author(s): Taura D, Noguchi M, Sone M, Hosoda K, Mori E, Okada Y, Takahashi K, Homma K, Oyamada N, Inuzuka M, Sonoyama T, E bihara K, Tamura N, Itoh H, Suemori H, Nakatsuji N, Okano H, Yamanaka S, Nakao K.
  • Journal Title: FEBS Lett. 583 Pages: 1029-1033
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] In vitro germ cell differentiation from cynomolgus monkey embryonic stem cells. (2009)
  • Author(s): Yamauchi K, Hasegawa K, Chuma S, Nakatsuji N, Suemori H.
  • Journal Title: PLoS ONE. 4 Pages: 5338
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] (2009)
  • Author(s): Fukumitsu K, Ishii T, Yasuchika K, Amagai Y, Saitoh M, Kawamoto T, Kawase E, Suemori H, Nakatsuji N, Ikai I, Uemoto S.
  • Journal Title: Tissue Eng Part A. 15 Pages: 3847-3856
  • Peer Reviewed
• [Presentation] ヒトES細胞からの原条形成過程におけるクロマチン修飾因子の発現解析 (2010)
  • Author(s): 末盛博文
  • Organizer: 第33回日本分子生物学会年会
  • Year and Date: 20100000
• [Presentation] ヒトES細胞から見た多能性幹細胞の特性 (2010)
  • Author(s): 末盛博文
  • Organizer: 第9回日本再生医療学会
  • Year and Date: 20100000
• [Presentation] Tissuespe cificpromoter hypomethylation as a newaspect of tissue-specific differentiallymethylated regions, T-DMR. (2009)
  • Author(s): Nagae G, Isagawa T, Shiraki N, Kaneda A, Suemori H, Kume S, Aburatani H.
  • Organizer: 第32回日本分子生物学会年会
  • Year and Date: 20090000
• [Presentation] 初めてのヒトES細胞 培養と分化誘導 (2009)
  • Author(s): 末盛博文
  • Organizer: 第8回核ダイナミクス研究会
  • Year and Date: 20090000
• [Book] 再生医療の最前線2010(再生医療に適したES細胞培養システム実験医学) (2010)
  • Author(s): 高田圭, 末盛博文
  • Total Pages: 204-208