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2010 Fiscal Year Annual Research Report

シミュレーションによる生命情報の場の再現

Planned Research

Project AreaThe physicochemical field for genetic activities
Project/Area Number 20114008
Research InstitutionNational Institute of Genetics

Principal Investigator

木村 暁  国立遺伝学研究所, 新分野創造センター, 准教授 (10365447)

Keywords遺伝情報場 / コンピュータシミュレーション / 細胞核 / 線虫 / 染色体
Research Abstract

線虫C. elegansの初期胚をモデルとして、細胞核内で遺伝情報を取り巻く環境について空間的視点から定量化し、遺伝情報場の理論を提唱することを目的とする。本研究では遺伝子収納の場である核の大きさに着目する。当該年度での成果は以下の通りである。
(1)線虫C.elegansの初期胚発生過程における細胞分裂期の染色体の凝縮について解析を行っている。前年度までに、核の大きさと染色体の凝縮とに相関があることを見いだしていた。本年度は核空間が染色体のおりたたみに及ぼす影響についてコンピュータシミュレーションにより見積っている。シミュレーションした染色体の挙動は、核の大きさ依存にいくつかの変化をみせた。この変化と染色体の凝縮度の関連について、シミュレーションおよび実験両面から見当している。
(2)線虫C.elegansの初期胚発生過程における染色体の動態を可視化、定量化した。これにより染色体の核内での「動きやすさ」も発生過程で異なることが示唆された。現在は、さまざまな条件で染色体の動態を比較するとともに、染色体動態をコンピュータシミュレーションと比較して、発生途上の「核場」の違いと染色体の動態とを理論的に結びつけたい。

  • Research Products

    (11 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Intracellular organelles mediate cytoplasmic pulling force for centrosome centration in the Caenorhabditis elegans early embryo.2011

    • Author(s)
      Kimura K., Kimura A.
    • Journal Title

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA

      Volume: 108 Pages: 137-142

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細胞サイズの定量生物学2010

    • Author(s)
      木村暁
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 82 Pages: 302-305

  • [Journal Article] The oscillation of Notch activation but not its boundary is required for somite border formation and rostral-caudal patterning within a somite.2010

    • Author(s)
      Oginuma M., et al.
    • Journal Title

      Development

      Volume: 137 Pages: 1515-1522

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Modeling microtubule-mediated forces and centrosome positioning in Caenorhabditis elegans embryos.2010

    • Author(s)
      Kimura A., Onami S.
    • Journal Title

      Methods in Cell Biology

      Volume: 97 Pages: 437-453

  • [Presentation] Size-dependency/independency in the spatial organization of the cell : nuclear positioning and chromosome dynamics in C.elegans embryos.2011

    • Author(s)
      Kimura, A.
    • Organizer
      International Symposium Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場,淡路
    • Year and Date
      2011-01-24
  • [Presentation] 線虫C.elegans初期胚における染色体動態の測定とモデルの構築2010

    • Author(s)
      木村暁
    • Organizer
      第83回日本生化学会大会第33回日本分子生物学会年会合同大会(BMB2010)
    • Place of Presentation
      神戸国際展示場(神戸市)
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] 線虫C.elegans初期胚における紡錘体伸長と細胞質分裂のモデル構築2010

    • Author(s)
      木村暁
    • Organizer
      日本動物学会第81回大会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場キャンパス,東京
    • Year and Date
      2010-09-24
  • [Presentation] Quantitative modeling of mitotic spindle in C.elegans embryos.2010

    • Author(s)
      Kimura, A.
    • Organizer
      43rd Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists
    • Place of Presentation
      京都国際会議場、京都
    • Year and Date
      2010-06-22
  • [Presentation] Quantitative Measurement and Modeling reveal Cell Size dependent Mechanisms to Elongate Mitotic Spindles in the C.elegans embryo.2010

    • Author(s)
      Kimura, A.
    • Organizer
      2nd Joint Meeting of the French and Japanease Societies for Developmental Biology
    • Place of Presentation
      パスツール研究所、パリ
    • Year and Date
      2010-05-26
  • [Book] Cell Cycle in Development"(Kubiak JZ Ed.)2011

    • Author(s)
      Hara Y., Kimura, A.
    • Total Pages
      500
    • Publisher
      Springe-Verlag
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.nig.ac.jp/section/kimura/kimura-j.html

URL: 

Published: 2012-07-19  

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