2021 Fiscal Year Annual Research Report
Plant epigenome regulation under fluctuating environment
| Project Area | Multi-layered regulatory system of plant resilience under fluctuating environment |
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| Project/Area Number |
20H05913
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| Research Institution | Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University |
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Principal Investigator |
佐瀬 英俊 沖縄科学技術大学院大学, 植物エピジェネティクスユニット, 准教授 (70510006)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
稲垣 宗一 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (00597883)
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| Project Period (FY) |
2020-11-19 – 2025-03-31
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| Keywords | エピゲノム制御 / 環境応答 / 病原体応答 / 植物ゲノム |
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| Outline of Annual Research Achievements |
佐瀬は、シロイヌナズナにおいて遺伝子転写産物が環境ストレスによってどのように多様化するのかについて解析を行っている。また、エピゲノムが変化した変異体などの解析により、植物のエピゲノム制御によってトランスクリプトーム多様化がどのように引き起こされているかを明らかにしようとしている。現在までにシロイヌナズナにおいてさまざまなエピゲノム変異体のトランスクリプトーム解析を進めている。 稲垣は、ヒストンH3K4モノメチル化酵素による免疫レセプターNLR遺伝子群の制御機構の解析を行い、NLR遺伝子群の制御において転写の伸長が鍵となることを示唆する結果が得られた。また、少数の植物細胞からのエピゲノム解析の確立を進め、１個体の植物からヒストン修飾のChIP-seqをすることが可能になった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
シロイヌナズナにおいて、エピゲノム修飾の変化により多くのmRNAの転写開始点やスプライシングパターンが変化することが検出された。また、少数の植物細胞からのエピゲノム解析の確立を進め、１個体の植物からヒストン修飾のChIP-seqをすることが可能になった。
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| Strategy for Future Research Activity |
エピゲノム変化がどのように転写開始点変化やスプライシングなどのRNAの転写後プロセッシングに影響するのかさらなる解析を進める。また、トランスクリプトームが環境ストレス条件下でどのような転写制御を受けるのか、表現型への影響を含めた解析を行う。
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