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2010 Fiscal Year Annual Research Report

組換え酵素における天然変性領域の機能

Planned Research

Project AreaTarget recognition and expression mechanism of intrinsically disordered protein
Project/Area Number 21113004
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

柴田 武彦  独立行政法人理化学研究所, 遺伝制御科学特別研究ユニット, ユニットリーダー (70087550)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 草野 好司  京都工芸繊維大学, 学内共同利用施設等, 特任教授 (70336098)
香川 亘  早稲田大学, 理工学術院, 助教 (70415123)
Keywords天然変性タンパク質 / 相同DNA組換え / 遺伝的組換え / 組換えメディエーター / RAD52 / Rad51 / 相同対合 / RecA
Research Abstract

相同組換えは互いに共通の塩基配列を糊代に2つのDNAをつなぎ換える生物に普遍的な遺伝現象である。天然変性領域の存在が予測された組換え酵素RAD51と組換えメディエーターRAD52との相互作用について重点的に取り上げた。比較対象として、同等の機能をもつ真正細菌のRecOとRecAを取り上げた。また、天然変性領域とRecA-foldをもつRecQ-familyのDNAヘリカーゼについて検討を始めた。理研は生化学的手法と分子遺伝学的手法、早大は構造生物的手法、京都工繊大はモデル生物のハエと出芽酵母で遺伝学的手法を用いて天然変性領域でのタンパク質間相互作用の分子機能と生体での組換え機能とを結び付けて理解する目的で研究を行った。RPAがない時にも、ScRad52がRad51と2:1の量比でRad51が行うATP依存的ssDNAとdsDNAの相同(DNA)対合(ヘテロ二重鎖組換え中間体形成反応)を強く促進することを我々は、これまでに明らかにしている。昨年度に続いて本年度もScRad52について全体の折り畳みに影響なくdsDNA結合欠損になったアミノ酸置換変異蛋白質を用いてこの促進機能を解析した結果、Rad52がdsDNAを捕捉してRad51へ受け渡すことで相同対合反応を高効率で行うことを明らかにした。一方、Rad52は、RPAが結合した単鎖DNAへのRad51の結合を、Rad51との相互作用によって補助する組換えメディエーター機能をもつことが知られている。Rad51との相互作用に重要といわれているRad52のC末端天然変性領域内のフラグメント精製系を確立した。精製したRad52のC末端フラグメントを用いて解析したところ、このフラグメントが巨大な多量体を形成するRad51を単量体に解体し、また、Rad51と1:1の複合体を形成する事を明らかにした。

  • Research Products

    (17 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (12 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] A mechanism for single-stranded DNA-binding protein (SSB) displacement from single-stranded DNA upon SSB-RecO interaction2011

    • Author(s)
      Inoue, J.
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry

      Volume: 286 Pages: 6720-6732

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Enlightenment of yeast mitochondrial homoplasmy : diversified roles of gene conversion2011

    • Author(s)
      Ling, F.
    • Journal Title

      Genes

      Volume: 2 Pages: 169-190

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mismatch-induced lethality due to a defect in Escherichia coli RecQ helicase in exonuclease-deficient background : Dependence on MutS and UvrD functions2010

    • Author(s)
      Yamana, Y., Sonezaki, S., Ogawa, H. I.and Kusano, K.
    • Journal Title

      Plasmid

      Volume: 63 Pages: 119-127

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A DNA-binding surface of SPO11-1, an Arabidopsis SPO11 orthologue required for normal meiosis2010

    • Author(s)
      Shingu, Y.
    • Journal Title

      The FEBS Journal

      Volume: 277 Pages: 2360-2374

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Displacement mechanism for SSB from single-stranded DNA by a recombination mediator : SSB-RecO interaction at the atomic resolution2011

    • Author(s)
      Inoue, J.
    • Organizer
      International Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      Awaji Japan
    • Year and Date
      20110123-20110126
  • [Presentation] Roles of the N-terminal and C-terminal domains of the Rad52 protein in homologous recombinational repair2011

    • Author(s)
      Kagawa, W.
    • Organizer
      International Symposium on the Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      Awaji Japan
    • Year and Date
      20110123-20110126
  • [Presentation] Roles of intrinsically unstructured proteins in homologous genetic recombination2011

    • Author(s)
      Shibata, T.
    • Organizer
      1st International Symposium on Intrinsically Disordered Proteins
    • Place of Presentation
      Yokohama, Japan
    • Year and Date
      2011-01-28
  • [Presentation] Mitochondrial DNA homoplasmy as gene homogenization of repeated sequences by rolling circle replication2010

    • Author(s)
      Shibata, T.
    • Organizer
      7th Conference of Asian Society for Mitochondrial Research, Medicine (ASMRM)
    • Place of Presentation
      Fukuoka, Japan
    • Year and Date
      20101216-20101218
  • [Presentation] 出芽酵母Rad52の第二DNA結合部位も相同組換えに必要である2010

    • Author(s)
      新井直人
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] A mechanism for SSB displacement from single-stranded DNA upon SSB-protein interaction2010

    • Author(s)
      Inoue, J.
    • Organizer
      7th 3R (Replication, Recombination, Repair) Symposium (3R) Symposium
    • Place of Presentation
      Toyama, Japan
    • Year and Date
      20101026-20101030
  • [Presentation] Bases of break-induced replication in mitochondrial genome dynamics2010

    • Author(s)
      Shibata, T.
    • Organizer
      57th NIBB Conference : The Dynamic Genome
    • Place of Presentation
      Okazaki, Japan
    • Year and Date
      20101014-16
  • [Presentation] イネの相同組換え開始酵素SPO11ホモログの解析2010

    • Author(s)
      新宮良宣
    • Organizer
      第28回日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      20100902-20100903
  • [Presentation] 酵母とヒトDNA修復タンパク質Rad52の機能ドメイン解析2010

    • Author(s)
      香川亘
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] A mechanism of DNA homology search, based on the structure of DNA bound to proteins that promote homologous recombination2010

    • Author(s)
      Masuda, T.
    • Organizer
      The 12th IUBMB (OzBio)
    • Place of Presentation
      Melbourne, Australia
    • Year and Date
      2010-09-27
  • [Presentation] The universal DNA structure in homologous recombination2010

    • Author(s)
      Mikawa, T.
    • Organizer
      The 24th Annual Symposium of the Protein Society
    • Place of Presentation
      San Diego USA
    • Year and Date
      2010-08-03
  • [Presentation] 相同組換え開始制御に働く天然変性タンパク質の機能2010

    • Author(s)
      柴田武彦
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2010-06-18
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.riken.jp/r-world/research/lab/wako/shibata/index.html

URL: 

Published: 2013-06-26  

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