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2010 Fiscal Year Annual Research Report

核内ネットワークを制御する天然変性タンパク質の機能発現

Planned Research

Project AreaTarget recognition and expression mechanism of intrinsically disordered protein
Project/Area Number 21113005
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

石野 良純  九州大学, 大学院・農学研究院, 教授 (30346837)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 清水 光弘  明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)
奥脇 暢  筑波大学, 人間総合科学研究科, 准教授 (50322699)
Keywords天然変性タンパク質 / 分子間相互作用 / DNA複製 / 転写因子 / スヒトンシャペロン / DNAトランスアクション / クロマチン / ヌクレオソーム
Research Abstract

DNA複製フォーク停止の修復に大変重要なタンパク質因子Hef/FancMのN-末側ヘリカーゼ用ドメインとC-末側ヌクレアーゼ用ドメインの間に存在する領域が本当に天然変性状態であることを、NMR,CD,高速AFM観察の手法を用いて調べた。さらに、この部分にPCNAが結合すること、そして、実際に結合する部位を同定した。同時にこの領域と相互作用するタンパク質因子を酵母two-Hybrid法で網羅的にスクリーニングをし、候補タンパク質を選定した。これらのタンパク質間の相互作用を確認中である。
出芽酵母の減数分裂開始を制御するクロマチン関連転写因子Ume6とRmelの機能解析を進めた。Ume6は転写活性化と抑制の両方の機能を持つが、それぞれの機能発現にはN末側とC末側の異なる天然変性領域が関与していることを見出した。Rmelによる転写抑制には分子中央の天然変性領域が重要であると考えられた。一方、クロマチンとのネットワーク解明に向けて、天然変性タンパク質ヒストンから構成されるヌクレオソームの構造多様性の要因についても解析を進めた。
核小体ヒストンシャペロンNucleophosmin/B23タンパク質に関して研究を進めている。B23は天然変性状態にある酸性アミノ酸領域を介してヒストンシャペロンとして機能する。また、B23のN末端領域を介した多量体形成は、ヒストンシャペロン活性に非常に重要である。本年度はB23とそのファミリータンパク質NPM3の多量体形成がその機能発現には重要であることを明らかにした。
以上のように三つの実験系で天然変性領域が直接関与する相互作用の機能解析が進んできたので、構造解析グループと協力し合いながら、天然変性領域の相互作用様式の共通性と多様性について調べて行こうとしている。

  • Research Products

    (35 results)

All 2011 2010

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (27 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Reverse-Chaperoning Activity of an AAA+ Protein2011

    • Author(s)
      Liu, C., et al
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 100 Pages: 1344-1352

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Architecture of the DNA polymerase B-proliferating cell nuclear antigen (PCNA)-DNA ternary complex2011

    • Author(s)
      Mayanagi, K., et al
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

      Volume: 108 Pages: 1845-1849

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNA複製をコントロールするクランプ複合体2011

    • Author(s)
      清成信一, 石野良純
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 49 Pages: 9-11

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic analysis of DNA repair in the hyperthermophilic archaeon, Thermococcus kodakaraensis2010

    • Author(s)
      Fujikane, R., et al
    • Journal Title

      Genes & Genetic Systems

      Volume: 85 Pages: 243-257

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNAクランプ/複製DNAポリメラーゼ複合体におけるDNA合成・修正スイッチング機構2010

    • Author(s)
      西田洋一, 他
    • Journal Title

      日本結晶学会誌

      Volume: 52 Pages: 201-207

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 5-bromodeoxyuridine induces transcription of repressed genes with disruption of nucleosome positioning2010

    • Author(s)
      Miki, K., et al
    • Journal Title

      FEBS Journal

      Volume: 277 Pages: 4539-4548

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Regulation of nucleolar chromatin by B23/Nucleophosmin jointly depends upon its RNA binding activity and transcription factor UBF2010

    • Author(s)
      Hisaoka, M., et al
    • Journal Title

      Molecular and Cellular Biology

      Volume: 30 Pages: 4952-4964

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural and functional analyses of a DNA repair protein Hef containing a ID region between the helicase and endonuclease domains2011

    • Author(s)
      Yoshizumi Ishino
    • Organizer
      The 1st International Symposium on Intrinsically disordered proteins
    • Place of Presentation
      Hamagin Hall "VIA MARE", Yokohama(招待講演)
    • Year and Date
      20110127-20110128
  • [Presentation] 超好熱性アーキアの複製フォーク進行と停止修復に関わる超分子複合体の構造と機能2010

    • Author(s)
      石野良純
    • Organizer
      ワークショップ「染色体複製とその制御における超高次複合体のダイナミクス」第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)(招待講演)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] 電子顕微鏡単粒子解析による複製関連複合体の反応制御機構の研究2010

    • Author(s)
      真柳浩太, 他
    • Organizer
      ワークショップ「染色体複製とその制御における超高次複合体のダイナミクス」第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] 超好熱性アーキアThermococcus kodakaraensisのDNA修復蛋白質Hefの機能解析~天然変性領域を中心に~2010

    • Author(s)
      石野園子, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] Homotetrameric GINS from the thermoacidophilic archaean, Thermoplasma acidophilum2010

    • Author(s)
      Hiromi Ogino, et al
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] 超好熱性アーキアThermococcus kodakaraensisの複製フォーク複合体解明に向けてのMCM,GINS複合体解析2010

    • Author(s)
      藤野誠司, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] DNA配列によるヌクレオソーム形成の促進と転写制御2010

    • Author(s)
      清水光弘, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] 出芽酵母の転写活性化・抑制因子Ume6における天然変性領域の機能解析2010

    • Author(s)
      諸橋伸行, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] 核小体形成の生化学的解析2010

    • Author(s)
      奥脇暢, 他
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(神戸市)
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] 超好熱性アーキアThermococcus kodakaraensis由来DNA修復蛋白質Hefに存在する天然変性領域の解析2010

    • Author(s)
      石野園子, 他
    • Organizer
      第11回極限環境生物学会年会
    • Place of Presentation
      京都大学(京都市)
    • Year and Date
      20101115-20101116
  • [Presentation] Pyrococcus furiosus由来Endonuclease Vによるヒポキサンチン除去修復機構2010

    • Author(s)
      江頭由里子, 他
    • Organizer
      第11回極限環境生物学会年会
    • Place of Presentation
      京都大学(京都市)
    • Year and Date
      20101115-20101116
  • [Presentation] 超好熱性アーキアThermococcus kodakaraensisのPCNA2の細胞内における役割2010

    • Author(s)
      久場由真仁, 他
    • Organizer
      第11回極限環境生物学会年会
    • Place of Presentation
      京都大学(京都市)
    • Year and Date
      20101115-20101116
  • [Presentation] 超好熱性アーキアThermococcus kodakaraensis由来MCMの構造と機能2010

    • Author(s)
      藤野誠司, 他
    • Organizer
      第11回極限環境生物学会年会
    • Place of Presentation
      京都大学(京都市)
    • Year and Date
      20101115-20101116
  • [Presentation] ヌクレオソーム形成促進配列と転写制御2010

    • Author(s)
      清水光弘
    • Organizer
      平成22年度遺伝研研究会細胞核超分子複合体の動態とその機能
    • Place of Presentation
      国立遺伝学研究所(三島市)(依頼講演)(招待講演)
    • Year and Date
      20101021-20101022
  • [Presentation] 蛋白質工学によるTaqDNAポリメラーゼの機能改変2010

    • Author(s)
      金尾弥生, 他
    • Organizer
      日本農芸化学会西日本支部大会
    • Place of Presentation
      崇城大学(熊本市)
    • Year and Date
      20100917-20100918
  • [Presentation] Pyrococcus furiosus由来endonuclease Vの機能解析2010

    • Author(s)
      江頭由里子, 他
    • Organizer
      日本農芸化学会西日本支部大会
    • Place of Presentation
      崇城大学(熊本市)
    • Year and Date
      20100917-20100918
  • [Presentation] アーキアのDNA修復関連蛋白質Hefの構造と機能について2010

    • Author(s)
      平田励, 他
    • Organizer
      日本農芸化学会西日本支部大会
    • Place of Presentation
      崇城大学(熊本市)
    • Year and Date
      20100917-20100918
  • [Presentation] DNA修復タンパク質Hef~その発見から現在まで~2010

    • Author(s)
      石野良純
    • Organizer
      日本Archaea研究会第23回講演会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(名古屋市)(特別講演)(招待講演)
    • Year and Date
      20100709-20100710
  • [Presentation] ホモログが一種類のみ存在するアーキアのDNA複製関連複合体GINSの解析~Thermoplasma acidophilum GINSを例として~2010

    • Author(s)
      尾木野弘実, 他
    • Organizer
      日本Archaea研究会第23回講演会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(名古屋市)
    • Year and Date
      20100709-20100710
  • [Presentation] 酵母ゲノムでのシスおよびトランス因子の変異によるヌクレオソームの機能解析2010

    • Author(s)
      清水光弘
    • Organizer
      第19回酵母合同シンポジウム-イノベーションを推進する酵母研究-
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)(招待講演)
    • Year and Date
      20100624-20100625
  • [Presentation] DNA複製フォーク進行停止の修復に関わる天然変性蛋白質2010

    • Author(s)
      石野良純
    • Organizer
      ワークショップ「天然変性タンパク質研究が目指すサイエンス」第10回日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(札幌市)(招待講演)
    • Year and Date
      20100616-20100618
  • [Presentation] Pyrococcus furiosus由来endonuclease Vの機能解析2010

    • Author(s)
      石野園子, 他
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • Year and Date
      20100616-20100618
  • [Presentation] クロマチン構造をシスに制御するDNA因子と転写制御2010

    • Author(s)
      諸橋伸行, 他
    • Organizer
      第54回日本薬学会関東支部会
    • Place of Presentation
      東京薬科大学(東京都)
    • Year and Date
      2010-10-02
  • [Presentation] Nucleolar chromatin regulation by B23/nucleophosmin depends upon its RNA binding activity and transcription factor UBF2010

    • Author(s)
      Miharu Hisaoka, et al
    • Organizer
      9^<th> EMBL conference : Transcription and chromatin
    • Place of Presentation
      ハイデルベルグ(ドイツ)
    • Year and Date
      2010-08-29
  • [Presentation] TAF-I, a novel somatic linker histone chaperone, is involved in chromatin dynamics2010

    • Author(s)
      Kohsuke Kato, et al
    • Organizer
      9^<th> EMBL conference : Transcription and chromatin
    • Place of Presentation
      ハイデルベルグ(ドイツ)
    • Year and Date
      2010-08-29
  • [Presentation] Function of Upstream Binding Factor in the Organization of Nucleolus2010

    • Author(s)
      Mitsuru Okuwaki
    • Organizer
      Wellcome Trust Scientific Conference, Sub-nuclear Structure and Fucntions
    • Place of Presentation
      ケンブリッジ(UK)
    • Year and Date
      2010-07-28
  • [Presentation] RNAによるヒストンシャペロンNucleolin(NCL)の機能制御2010

    • Author(s)
      早乙女愛, 他
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      静岡県修善寺(伊豆市)
    • Year and Date
      2010-05-28
  • [Book] Application of environmental DNA resources to create useful DNA polymerases with different properties. In Microbes in Environmental Management and Biotechnology2011

    • Author(s)
      Ishino S., Ishino Y.
    • Publisher
      Springer(印刷中)

URL: 

Published: 2013-06-26  

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