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2010 Fiscal Year Annual Research Report

小分子RNA作用マシナリーの調節機構

Planned Research

Project AreaFunctional machinery for non-coding RNAs
Project/Area Number 21115004
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

程 久美子  東京大学, 大学院・理学系研究科, 准教授 (50213327)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 西村 教子  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 特任助教 (30514567)
Keywords非コードRNA / 小分子RNA / miRNA / RNA結合タンパク質 / siRNA / RISC
Research Abstract

MicroRNA(miRNA)は、Argonaute(Ago)タンパク質に取り込まれ、miRNA-induced silencing complex(miRISC)と呼ばれるRNA-タンパク質複合体を形成する。miRISC中のmiRNAは、3'UTRに部分的に相補的な配列をもつmRNAを識別して対合し、他のmiRISC構成因子とともに翻訳抑制や分解を引き起こす。動物細胞における、このようなRNAサイレンシングには細胞質で起こると考えられており、miRNA、Agoに加えて、GW182ファミリータンパク質が必須であることが示されている。GW182ファミリータンパク質は、そのGWmotif(s)を介してAgoと直接相互作用し、P-bodyと呼ばれる細胞質内の点状の構造体に局在することから、miRNAによるサイレンシングは主として細胞質で起こると考えられている。我々は、ヒトGW182ファミリータンパク質に属するTNRC6Aは、核移行シグナル(NLS)と核外移行シグナル(NES)をもつ核-細胞質間輸送タンパク質であることを見いだした。TNRC6AのNES変異体は核のみで点状の局在を示した。さらに、TNRC6Aの核移行により核内でもRNAサイレンシングが誘導されることが示唆された。すなわち、TNRC6Aの核移行にはAgoタンパク質は必ずしも必要ではないが、GW motif(s)を介した相互作用によりAgoを核内へ輸送できることが明らかになった。このとき、核内のAgoにもmiRNAは取り込まれていた。さらに、内在性のGw182ファミリータンパク質をRNAiでノックダウンした条件下で、野生型TNRC6Aを発現させるとサイレンシング活性が回復したが、NES変異型TNRC6Aを核内で発現させても同様のサイレンシング活性の回復がみられた。これらの結果から、TNRC6AはAgo-miRNAを核内に運び、核内でもmiRNAによるサイレンシングを引き起こすと考えられた。

  • Research Products

    (23 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (11 results) Book (4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Lacdinac (Galnacβ1-4glcnac) Contributes to Self-Renewal of Mouse Embryonic Stem Cells by Regulating LIF/STAT3 Signaling2011

    • Author(s)
      Sasaki, N.
    • Journal Title

      Stem Cells

      Volume: 29 Pages: 641-650

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Robust and Photo-controllable DNA Capsules Using Azobenzenes2010

    • Author(s)
      Tanaka, F.
    • Journal Title

      Nano Lett.

      Volume: 10 Pages: 3560-3565

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Basic and clinical studies on functional RNA molecules for advanced medical technologies2010

    • Author(s)
      Takizawa, T.
    • Journal Title

      J.Nippon Med.Sch.

      Volume: 77 Pages: 71-79

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sunspot, a link between Wingless signaling and endoreplication in Drosophila2010

    • Author(s)
      Taniue, K.
    • Journal Title

      Development

      Volume: 137 Pages: 1755-1764

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Gene expression of Spag6 in chick central nervous system2010

    • Author(s)
      Hamada, T.
    • Journal Title

      Anat.Histol.Embryol.

      Volume: 39 Pages: 227-232

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reduced base-base interactions between the DNA seed and RNA target are the major determinants of a significant reduction in the off-target effect due to DNA-seed-containing siRNA2010

    • Author(s)
      Ui-Tei, K.
    • Journal Title

      Proceedings of the 2009 Micro-NanoMechatronics and Human Science (MHS2009)

      Pages: 298-304

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional shRNA expression system with reduced off-target effects2010

    • Author(s)
      Naito, Y.
    • Journal Title

      Proceedings of the 2009 Micro-NanoMechatronics and Human Science (MHS2009)

      Pages: 291-297

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Identification of Nuclear Export Signal and Nuclear Localization Signal in Human GW182 Family Proteins2010

    • Author(s)
      Nishi, K.
    • Organizer
      The 19th CDB Meeting "KNA Sciences in Cell and Developmental Biology
    • Place of Presentation
      RIKEN Center for Developmental Biology(神戸)
    • Year and Date
      20100510-20100512
  • [Presentation] siDirect 2.0 : an Updated Website to Select Functional, Target-specific siRNA with Reduced Seed-dependent Off-target Effect for Mammalian Functional Genomics2010

    • Author(s)
      Yuki, N.
    • Organizer
      The 19th CDB Meeting "RNA Sciences in Cell and Developmental Biology
    • Place of Presentation
      RIKEN Center for Developmental Biology(神戸)
    • Year and Date
      20100510-20100512
  • [Presentation] siRNA非シード部位と二本鎖RNA結合タンパク質TRBPの相互作用2010

    • Author(s)
      高橋朋子
    • Organizer
      BMB2010
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2010-12-11
  • [Presentation] miRNAサイレンシング活性を決める要因の検討2010

    • Author(s)
      日比生直樹
    • Organizer
      BMB2010
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2010-12-11
  • [Presentation] ヒトGW182タンパク質の核-細胞質間輸送機構の解析2010

    • Author(s)
      西賢二
    • Organizer
      BMB2010
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2010-12-09
  • [Presentation] 小分子RNA作用マシナリーの調節機構-内在性miRNAサイレンシングの外来性miRNAによる抑制とその定量化2010

    • Author(s)
      程久美子
    • Organizer
      新学術領域非コードRNA作用マシナリー第2回領域会議
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター
    • Year and Date
      2010-10-06
  • [Presentation] 2本鎖RNA結合タンパク質TRBPとsiRNA相互作用の解析2010

    • Author(s)
      高橋朋子
    • Organizer
      新学術領域非コードRNA作用マシナリー第2回領域会議
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター
    • Year and Date
      2010-10-06
  • [Presentation] 高いゲノム多様性をもつHIV-1を標的とする至適siRNAの設計2010

    • Author(s)
      内藤雄樹
    • Organizer
      第20回日本数理生物学会年会
    • Place of Presentation
      北海道大学学術交流会館
    • Year and Date
      2010-09-16
  • [Presentation] ヒトGW182タンパク質における核外移行シグナル及び核移行シグナルの同定2010

    • Author(s)
      西賢二
    • Organizer
      第10回東京大学生命科学シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2010-05-01
  • [Presentation] siRNAのseed配列によるオフターゲット効果を最少とし、標的mRNA特異的抑制効果を示すsiRNA設計ウェブサーバの構築2010

    • Author(s)
      内藤雄樹
    • Organizer
      第10回東京大学生命科学シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2010-05-01
  • [Presentation] Modified siRNA is a powerful tool for mammalian gene silencing with significantly reduced off-target effect2010

    • Author(s)
      Ui-Tei, K.
    • Organizer
      The 3rd Pan Pacific Symposium on Stem Cells Research 2010
    • Place of Presentation
      Evergreen Laurel Hotel(台中)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-04-17
  • [Book] Gene Silencing : Theory Techniques and Applications2010

    • Author(s)
      Narikawa, K.
    • Total Pages
      287-319
    • Publisher
      Genome-wide identification and analysis of miRNAs complementary to upstream of mRNA transcription start sites
  • [Book] RNA工学の基礎と応用(普及版)2010

    • Author(s)
      内藤雄樹
    • Total Pages
      104-113
    • Publisher
      効率的なsiRNAの設計
  • [Book] 改訂第5版新遺伝子工学ハンドブック2010

    • Author(s)
      内藤雄樹
    • Total Pages
      209-214
    • Publisher
      培養細胞での遺伝子ノックダウン法哺乳類細胞での標的遺伝子を特異的にノックダウンできるsiRNAの選択法
  • [Book] 改訂第5版新遺伝子工学ハンドブック2010

    • Author(s)
      西賢二
    • Total Pages
      215-220
    • Publisher
      培養細胞での遺伝子ノックダウン法siRNAおよびmiRNAによる遺伝子ノックダウン
  • [Remarks]

    • URL

      http://ui-tei.rnai.jp/

URL: 

Published: 2013-06-26  

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