小分子ＲＮＡ作用マシナリーの調節機構

2013 Fiscal Year Annual Research Report

• Project Area: Functional machinery for non-coding RNAs
• Project/Area Number: 21115004
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 程 久美子 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 准教授 (50213327)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 小田 健昭 東京大学, 分子細胞生物学研究所, 研究員 (00608523) ; 山下 暁朗 横浜市立大学, 医学部, 講師 (20405020)
• Project Period (FY): 2009-04-01 – 2015-03-31
• Keywords: 核酸 / 発現制御 / ゲノム / 非コードRNA / 小分子RNA

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、小分子RNAによる塩基対合様式が遺伝子発現制御機構に与える影響とRNA結合タンパク質による調節作用を明らかにすることを目的とした。主な研究実績は次のとおりである。
(1) miRNAサイレンシング効率の定量的解析：miRNAは塩基配列特異的に遺伝子発現を抑制する。我々はmiRNAによるサイレンシングの効率を、塩基対合の熱力学的性質をNearest-neighbor法を用いて数値化し、数式を用いて定量化することに成功した。このような塩基対合の熱力学的性質は温度によって大きな影響を受けるが、それぞれの生物種において保存されているmiRNAの種類は、体温あるいは生育温度と強い相関関係があることを明らかにし、miRNAが進化の過程において温度による選択を受けている可能性を示した。
(2) TNRC6AによるArgonaute-miRNAの核―細胞質間輸送機構の解明：miRNAによる遺伝子抑制は主として細胞質で起こる現象であると考えられてきた。しかしながら、我々はRNAサイレンシングにおける翻訳抑制機構に重要な役割をもつTNRC6Aが核移行シグナルと核外移行シグナルの両方をもち、小分子RNAとAgoタンパク質の核―細胞質間輸送タンパク質として機能することを明らかにした。
(3) RNA結合タンパク質TRBPとPACTの機能解析：2本鎖RNA結合タンパク質であるTRBPおよびPACTは、両者とも３つの2本鎖RNA結合ドメインをもつ、良く似た構造のタンパク質であるが、その機能がどのように区別されているかは不明であった。我々は、TRBPまたはPACTとsiRNAおよびDNA-RNAキメラ型siRNAとの親和性は詳細に解析し、両者のsiRNAへの親和性は大きく異なることを明らかにし、siRNAはTRBPと強く相互作用していることを示した。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Fc gamma receptor IIb participates in maternal IgG trafficking of human placental endothelial cells. (2015)
  • Author(s): Ishikawa T, Takizawa T, Iwaki J, Mishima T, Ui-Tei K, Takeshita T, Matsubara S, Takizawa T.
  • Journal Title: nt. J. Mol. Med. Volume: 35 Pages: 1273-1789
  • DOI: 10.3892/ijmm.2015.2141.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Renal Tubule Angiotensin II Type 1 Receptor-Associated Protein Promotes Natriuresis and Inhibits Salt-Sensitive Blood Pressure Elevation. (2015)
  • Author(s): Wakui H, Uneda K, Tamura K, Ohsawa M, Azushima K, Kobayashi R, Ohki K, Dejima T, Kanaoka T, Tsurumi-Ikeya Y, Matsuda M, Haruhara K, Nishiyama A, Yabana M, Fujikawa T, Yamashita A, Umemura S.
  • Journal Title: J Am Heart Assoc. Volume: 19;4(3) Pages: e001594.
  • DOI: 10.1161/JAHA.114.001594.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Mutations in the glutaminyl-tRNA synthetase gene cause early-onset epileptic encephalopathy. (2015)
  • Author(s): Kodera H, Osaka H, Iai M, Aida N, Yamashita A, Tsurusaki Y, Nakashima M, Miyake N, Saitsu H, Matsumoto N.
  • Journal Title: J Hum Genet. Volume: 60(2) Pages: 97-101.
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.103.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] CRISPRdirect: software for designing CRISPR/Cas guide RNA with reduced off-target sites. (2014)
  • Author(s): Naito Y, Hino K, Bono H, UI-Tei K.
  • Journal Title: Bioinformatics Volume: Vol.31 Pages: 1-4
  • DOI: 10.1093/bioinformatics/btu743.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] A-to-I editing in the miRNA seed region regulates target mRNA selection and silencing efficiency. (2014)
  • Author(s): Kume H, Hino K, Galipon J, Ui-Tei K.
  • Journal Title: Nucleic Acids Res. Volume: 42 Pages: 10050-10060
  • DOI: 10.1093/nar/gku662
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Interactions between the non-seed region of siRNA and RNA-binding RLC/RISC proteins, Ago and TRBP, in mammalian cells. (2014)
  • Author(s): Takahashi T, Zenno S, Ishibashi O, Takizawa T, Saigo K, Ui-Tei K.
  • Journal Title: Nucleic Acids Res. Volume: 42 Pages: 5256-5269.
  • DOI: 10.1093/nar/gku153
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Fluctuation of Rac1 activity is associated with the phenotypic and transcriptional heterogeneity of glioma cells. (2014)
  • Author(s): Yukinaga H, Shionyu C, Hirata E, Ui-Tei K, Nagashima T, Kondo S, Okada-Hatakeyama M, Naoki H, Matsuda M.
  • Journal Title: J. Cell Sci. Volume: 127 Pages: 1805-1815
  • DOI: 10.1242/jcs.139733
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] A hemizygous GYG2 mutation and Leigh syndrome: a possible link? (2014)
  • Author(s): Imagawa E, Osaka H, Yamashita A, Shiina M, Takahashi E, Sugie H, Nakashima M, Tsurusaki Y, Saitsu H, Ogata K, Matsumoto N, Miyake N.
  • Journal Title: Hum Genet. Volume: 133(2 Pages: 225-34.
  • DOI: 10.1007/s00439-013-1372-6.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] A novel phosphorylation-independent interaction between SMG6 and UPF1 is essential for human NMD. (2014)
  • Author(s): Nicholson P, Josi C, Kurosawa H, Yamashita A, Mühlemann O.
  • Journal Title: Nucleic Acids Res. Volume: 42(14) Pages: 9217-35.
  • DOI: 10.1093/nar/gku645.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Structures of SMG1-UPFs complexes: SMG1 contributes to regulate UPF2-dependent activation of UPF1 in NMD. (2014)
  • Author(s): Melero R, Uchiyama A, Castaño R, Kataoka N, Kurosawa H, Ohno S, Yamashita A, Llorca O.
  • Journal Title: Structure. Volume: 22(8) Pages: 1105-19.
  • DOI: 10.1016/j.str.2014.05.015.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Effects of the Angiotensin receptor blocker olmesartan on adipocyte hypertrophy and function in mice with metabolic disorders. (2014)
  • Author(s): Maeda A, Tamura K, Wakui H, Ohsawa M, Azushima K, Uneda K, Kanaoka T, Kobayashi R, Ohki K, Matsuda M, Tsurumi-Ikeya Y, Yamashita A, Tokita Y, Umemura S.
  • Journal Title: Biomed Res Int. Volume: 2014 Pages: 946492.
  • DOI: 10.1155/2014/946492.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Effects of Ang II receptor blocker irbesartan on adipose tissue function in mice with metabolic disorders. (2014)
  • Author(s): Maeda A, Tamura K, Wakui H, Ohsawa M, Azushima K, Uneda K, Kobayashi R, Tsurumi-Ikeya Y, Kanaoka T, Dejima T, Ohki K, Haku S, Yamashita A, Umemura S.
  • Journal Title: Int J Med Sci. Volume: 11(6) Pages: 646-51.
  • DOI: 10.7150/ijms.8577.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] aPKCλ maintains the integrity of the glomerular slit diaphragm through trafficking of nephrin to the cell surface. (2014)
  • Author(s): Satoh D, Hirose T, Harita Y, Daimon C, Harada T, Kurihara H, Yamashita A, Ohno S.
  • Journal Title: J Biochem. Volume: 156(2) Pages: 115-28.
  • DOI: 10.1093/jb/mvu022.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Deletion of the angiotensin II type 1 receptor-associated protein enhances renal sodium reabsorption and exacerbates angiotensin II-mediated hypertension. (2013)
  • Author(s): Ohsawa M, Tamura K, Wakui H, Maeda A, Dejima T, Kanaoka T, Azushima K, Uneda K, Tsurumi-Ikeya Y, Kobayashi R, Matsuda M, Uchida S, Toya Y, Kobori H, Nishiyama A, Yamashita A, Ishikawa Y, Umemura S.
  • Journal Title: Kidney Int. Volume: 86(3) Pages: 570-81.
  • DOI: 10.1038/ki.2014.95.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Fluctuation of global gene expression by endogenous miRNAs response to the introduction of an exogenous miRNA. (2013)
  • Author(s): Nagata Y, Shimizu E, Hibio N, Ui-Tei K.
  • Journal Title: Int. J. Mol. Sci. Volume: 14 Pages: 11171-11189
  • DOI: doi:10.3390/ijms140611171
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Optimal choice of functional and off-target effect-reduced siRNAs for RNAi therapeutics. (2013)
  • Author(s): Ui-Tei K.
  • Journal Title: Front. Genet. Volume: 4 Pages: 107
  • DOI: 10.3389/fgene.2013.00107
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Distinguishable In Vitro Binding Mode of Monomeric TRBP and Dimeric PACT with siRNA (2013)
  • Author(s): Takahashi T, Miyakawa T, Zenno S, Nishi K, Tanokura M, Ui-Tei
  • Journal Title: PLoS ONE Volume: 8 Pages: e63434
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0063434
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Human TNRC6A is an Argonaute-navigator protein for microRNA-mediated gene silencing in the nucleus. (2013)
  • Author(s): Nishi K, Nishi A, Nagasawa T, Ui-Tei K.
  • Journal Title: RNA Volume: 19 Pages: 17-35
  • DOI: 10.1261/rna.034769.112
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Designing functional siRNA with reduced off-target effects. (2013)
  • Author(s): Naito Y, Ui-Tei K.
  • Journal Title: Methods Mol. Biol. Volume: 942 Pages: 57-68
  • DOI: 10.1007/978-1-62703-119-6_3
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] IFPA meeting 2012 workshop report I: Comparative placentation and animal models, advanced techniques in placental histopathology, human pluripotent stem cells as a model for trophoblast differentiation (2013)
  • Author(s): Ackerman WE 4th, Carter AM, De Mestre AM, Golos TG, Jeschke U, Kusakabe K, Laurent LC, Parast MM, Roberts RM, Robinson JM, Rutherford J, Soma H, Takizawa T, Ui-Tei K, Las GE.
  • Journal Title: Placenta Volume: 34 Pages: S3-5
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Activation of angiotensin II type 1 receptor-associated protein exerts an inhibitory effect on vascular hypertrophy and oxidative stress in angiotensin II-mediated hypertension. (2013)
  • Author(s): Wakui H, Dejima T, Tamura K, Uneda K, Azuma K, Maeda A, Ohsawa M, Kanaoka T, Azushima K, Kobayashi R, Matsuda M, Yamashita A, Umemura S.
  • Journal Title: Cardiovasc Res. Volume: 100(3) Pages: 511-9.
  • DOI: 10.1093/cvr/cvt225.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Bofu-tsu-shosan, an oriental herbal medicine, exerts a combinatorial favorable metabolic modulation including antihypertensive effect on a mouse model of human metabolic disorders with visceral obesity. (2013)
  • Author(s): Azushima K, Tamura K, Wakui H, Maeda A, Ohsawa M, Uneda K, Kobayashi R, Kanaoka T, Dejima T, Fujikawa T, Yamashita A, Toya Y, Umemura S.
  • Journal Title: PLoS One. Volume: 8(10) Pages: e75560.
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0075560.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] An epigenetic switch is crucial for spermatogonia to exit the undifferentiated state toward a Kit-positive identity. (2013)
  • Author(s): Shirakawa T, Yaman-Deveci R, Tomizawa S, Kamizato Y, Nakajima K, Sone H, Sato Y, Sharif J, Yamashita A, Takada-Horisawa Y, Yoshida S, Ura K, Muto M, Koseki H, Suda T, Ohbo K.
  • Journal Title: Development. Volume: 140(17) Pages: 3565-76.
  • DOI: 10.1242/dev.094045.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] The novel PAR-1-binding protein MTCL1 has crucial roles in organizing microtubules in polarizing epithelial cells. (2013)
  • Author(s): Sato Y, Akitsu M, Amano Y, Yamashita K, Ide M, Shimada K, Yamashita A, Hirano H, Arakawa N, Maki T, Hayashi I, Ohno S, Suzuki A.
  • Journal Title: J Cell Sci. Volume: 126(Pt 20) Pages: 4671-83.
  • DOI: 10.1242/jcs.127845.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Angiotensin receptor-binding protein ATRAP/Agtrap inhibits metabolic dysfunction with visceral obesity. (2013)
  • Author(s): Maeda A, Tamura K, Wakui H, Dejima T, Ohsawa M, Azushima K, Kanaoka T, Uneda K, Matsuda M, Yamashita A, Miyazaki N, Yatsu K, Hirawa N, Toya Y, Umemura S.
  • Journal Title: J Am Heart Assoc. Volume: 2(4) Pages: e000312.
  • DOI: 10.1161/JAHA.113.000312.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Upstream stimulatory factors 1 and 2 mediate the transcription of angiotensin II binding and inhibitory protein. (2013)
  • Author(s): Matsuda M, Tamura K, Wakui H, Maeda A, Ohsawa M, Kanaoka T, Azushima K, Uneda K, Haku S, Tsurumi-Ikeya Y, Toya Y, Maeshima Y, Yamashita A, Umemura S.
  • Journal Title: J Biol Chem. Volume: 288(26) Pages: 19238-49.
  • DOI: 10.1074/jbc.M113.451054.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Enhanced angiotensin receptor-associated protein in renal tubule suppresses angiotensin-dependent hypertension. (2013)
  • Author(s): Wakui H, Tamura K, Masuda S, Tsurumi-Ikeya Y, Fujita M, Maeda A, Ohsawa M, Azushima K, Uneda K, Matsuda M, Kitamura K, Uchida S, Toya Y, Kobori H, Nagahama K, Yamashita A, Umemura S.
  • Journal Title: Hypertension. Volume: 61(6) Pages: 1203-10.
  • DOI: 10.1161/HYPERTENSIONAHA.111.00572.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Role of SMG-1-mediated Upf1 phosphorylation in mammalian nonsense-mediated mRNA decay. (2013)
  • Author(s): Yamashita A.
  • Journal Title: Genes Cells. Volume: 18(3) Pages: 161-75.
  • DOI: 10.1111/gtc.12033.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] The physiology and pathophysiology of a novel angiotensin receptor-binding protein ATRAP/Agtrap. (2013)
  • Author(s): Tamura K, Wakui H, Maeda A, Dejima T, Ohsawa M, Azushima K, Kanaoka T, Haku S, Uneda K, Masuda S, Azuma K, Shigenaga A, Koide Y, Tsurumi-Ikeya Y, Matsuda M, Toya Y, Tokita Y, Yamashita A, Umemura S.
  • Journal Title: Curr Pharm Des. Volume: 19(17) Pages: 3043-8.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] CRISPRdirect: web-based tool for designing CRISPR/Cas guide RNA with reduced off-target sites. (2015)
  • Author(s): Yuki Naito, Kimihiro Hino, Kumiko Ui-Tei, Hidemasa Bono
  • Organizer: Oxford Symposia CRISPR 2015 OXFORD: Technology and Application
  • Place of Presentation: St. Hilda’s College, Oxford, UK
  • Year and Date: 2015-03-23 – 2015-03-23
• [Presentation] Global identification of the interacting RNAs with dual functional RNA binding protein TRBP by next-generation sequencing (2015)
  • Author(s): Kumiko Ui-Tei, Fuminori Murakami, Tomoko Takahashi
  • Organizer: International Symposium on Genome Science 2015"Expanding Frontiers of Genome ScienceⅡ"
  • Place of Presentation: 一ツ橋ホール(東京都)
  • Year and Date: 2015-01-20 – 2015-01-20
• [Presentation] CRISPR/Cas9システムにおけるゲノム切断効率に対するガイドRNA標的認識領域塩基長の影響 (2014)
  • Author(s): 日野 公洋、程 久美子
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • Year and Date: 2014-11-26 – 2014-11-26
• [Presentation] Re-targeting and modulation of silencing efficiency by miRNAs with A-to-I editing in the seed region (2014)
  • Author(s): Hideaki Kume, Kimihiro Hino, Josephine Galipon, Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • Year and Date: 2014-11-26 – 2014-11-26
• [Presentation] Functional conversion of a key regulator of RNA silencing, TRBP, during apoptosis in mammalian cell. (2014)
  • Author(s): Tomoko Takahashi, Shuhei Zenno, Kenji Nishi, Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • Year and Date: 2014-11-26 – 2014-11-26
• [Presentation] 二本鎖RNA結合タンパク質TRBPと相互作用するRNAの網羅的解析 (2014)
  • Author(s): 村上 文則、高橋 朋子、程 久美子
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • Year and Date: 2014-11-26 – 2014-11-26
• [Presentation] TNRC6Aタンパク質の核内複合体構成因子の網羅的同定とその解析 (2014)
  • Author(s): 須澤 壮崇、西 賢二、秦 裕子、尾山 大明、程 久美子
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • Year and Date: 2014-11-26 – 2014-11-26
• [Presentation] 小分子RNAによる遺伝子抑制機構におけるRNA結合タンパク質の機能解析 (2014)
  • Author(s): 中野 悠子、高橋 朋子、程 久美子
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • Year and Date: 2014-11-26 – 2014-11-26
• [Presentation] Validation of A-to-I RNA editing sites identified by RIP-seq in human miRNAs (2014)
  • Author(s): Soh Ishiguro, Josephine Galipon, Rintaro Ishii, Yutaka Suzuki, Shinji Kondo, Mariko Okada-Hatakeyama, Masaru Tomita, Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜(神奈川県)
  • Year and Date: 2014-11-26 – 2014-11-26
• [Presentation] Control of RNA silencing by thermodynamics in the nucleotide base-pairing (2014)
  • Author(s): Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 第41回国際核酸化学シンポジウム(ISNAC2014)
  • Place of Presentation: 北九州国際会議場(福岡県)
  • Year and Date: 2014-11-07 – 2014-11-07
  • Invited
• [Presentation] Selection of chemical modifications for a target gene-specific RNA interference (2014)
  • Author(s): Takahashi T, Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: The International Symposium of Chemistry and Biology of RNA Interference (ISCBRi)
  • Place of Presentation: 北九州国際会議場(福岡県)
  • Year and Date: 2014-11-04 – 2014-11-04
  • Invited
• [Presentation] ヒトのADARアイソフォームによるA-to-I miRNA編集の検出とその発現解析 (2014)
  • Author(s): 石黒 宗、Galipon Josephine、石井 倫太郎、鈴木 穣、近藤 仲二、岡田 眞里子、富田 勝、程 久美子
  • Organizer: 第６回 生命情報科学若手の会
  • Place of Presentation: 理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター(CDB) (兵庫県)
  • Year and Date: 2014-10-29 – 2014-10-30
• [Presentation] Clarification of roles played by each region of siRNA in RNA silencing by systematic DNA modifications (2014)
  • Author(s): Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 新学術領域研究「天然物ケミカルバイオロジー：分子標的と活性制御」 第３回国際シンポジウム
  • Place of Presentation: 千里ライフサイエンスセンター・ライフホール(大阪府)
  • Year and Date: 2014-10-28 – 2014-10-28
• [Presentation] Distinct patterns of A-to-I editings on miRNAs due to different ADAR isoforms (2014)
  • Author(s): Josephine Galipon, Rintaro Ishii, Soh Ishiguro, Yutaka Suzuki, Shinji Kondo, Mariko Okada-Hatakeyama, Masaru Tomita, Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 新学術領域「ゲノム支援」2014年度 拡大班会議
  • Place of Presentation: 神戸ポートピアホテル(兵庫県)
  • Year and Date: 2014-08-20 – 2014-08-21
• [Presentation] Specificity of miRNA A-to-I editing by different human ADAR isoforms. (2014)
  • Author(s): Josephine Galipon, Rintaro Ishii, Soh Ishiguro1, Yutaka Suzuki, Shinji Kondo, Mariko Okada-Hatakeyama, Masaru Tomita, Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 第16回日本RNA学会年会
  • Place of Presentation: ウインクあいち(愛知県)
  • Year and Date: 2014-07-23 – 2014-07-23
• [Presentation] A-to-I editing of miRNAs by human ADAR isoforms. (2014)
  • Author(s): Josephine Galipon, Rintaro Ishii, Yutaka Suzuki, Shinji Kondo, Mariko Okada-Hatakeyama, Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 第4回理研ゲノム科学総合研究組織(GSC)七夕ミーティング
  • Place of Presentation: 理化学研究所 横浜事業所交流棟ホール(神奈川県)
  • Year and Date: 2014-07-11 – 2014-07-11
• [Presentation] CRISPR/Cas9 systemを用いたゲノムへの変異導入法 (2014)
  • Author(s): 日野 公洋、程 久美子
  • Organizer: 新学術領域研究「天然物ケミカルバイオロジー：分子標的と活性制御」第５回若手研究者ワークショップ
  • Place of Presentation: 名古屋大学 坂田・平田ホール(愛知県)
  • Year and Date: 2014-05-29 – 2014-05-29
• [Presentation] 化学修飾導入siRNAによる1遺伝子特異的ケムバイオケム型RNA干渉法の開発をめざして (2014)
  • Author(s): 程 久美子、西 賢二、高橋 朋子
  • Organizer: 新学術領域研究「天然物ケミカルバイオロジー：分子標的と活性制御」第6回公開シンポジウム
  • Place of Presentation: 名古屋大学 坂田・平田ホール(愛知県)
  • Year and Date: 2014-05-28 – 2014-05-28
• [Presentation] Subcellular localization of TNRC6A is determined by Argonaute protein. (2014)
  • Author(s): Kenji Nishi, Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 第14回東京大学生命科学シンポジウム(BIO-UT 2014)
  • Place of Presentation: 東京大学・伊藤国際学術研究センター(東京都)
  • Year and Date: 2014-04-26 – 2014-04-26
• [Presentation] The preferable guide RNA sequence for efficient human genome engineering using CRISPR/Cas9 system. (2014)
  • Author(s): Kimihiro Hino, Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 第14回東京大学生命科学シンポジウム(BIO-UT 2014)
  • Place of Presentation: 東京大学・伊藤国際学術研究センター(東京都)
  • Year and Date: 2014-04-26 – 2014-04-26
• [Presentation] 小分子RNA 作用マシナリーの調節機構ーゲノムワイドな遺伝子発現制御の分子メカニズム (2014)
  • Author(s): 程 久美子
  • Organizer: 新学術領域 非コードRNA作用マシナリー 第5回領域会議
  • Place of Presentation: グランド エクシブ 那須白河(栃木県)
  • Year and Date: 2014-01-09 – 2014-01-09
• [Presentation] Genome-wide identification of A-to-I editing on miRNAs. (2014)
  • Author(s): Josephine Galipon, Rintaro Ishii, Yutaka Suzuki, Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 新学術領域 非コードRNA作用マシナリー 第5回領域会議
  • Place of Presentation: グランド エクシブ 那須白河(栃木県)
  • Year and Date: 2014-01-09 – 2014-01-09
• [Presentation] A-to-I editing of human long non-coding RNAs (2013)
  • Author(s): Josephine Galipon, Rintaro Ishii, Yutaka Suzuki, Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-12-05 – 2013-12-05
• [Presentation] RNA安定性調節を介した遺伝子発現システムの制御 (2013)
  • Author(s): 今村 亮俊、越智 晴香、今町 直登、秋月 源、前川 翔、鈴木 穣、程 久美子、関水 和久、秋光 信佳
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-12-04 – 2013-12-04
• [Presentation] 核内機能性non-coding RNAの分解に関与するRNA結合蛋白質の同定 (2013)
  • Author(s): 越智 晴香、今村 亮俊、谷 英典、秋月 源、程 久美子、関水 和久、秋光 信佳
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-12-04 – 2013-12-04
• [Presentation] Overexpression of Argonaute proteins inhibits the nuclear transport of TNRC6A (2013)
  • Author(s): Kenji Nishi, Tatsuya Nagasawa, Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-12-03 – 2013-12-03
• [Presentation] CRISPR/Cas9 ヒトゲノム編集システムにおける最適標的部位の選択 (2013)
  • Author(s): 日野 公洋、程 久美子
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-12-03 – 2013-12-03
• [Presentation] Two cooperative regions sites on in the non-seed region of DNA/RNA chimeric siRNA are associated with TRBP binding for effective RNAi activity. (2013)
  • Author(s): Tomoko Takahashi, Shuhei Zenno and Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-12-03 – 2013-12-03
• [Presentation] RNAサイレンシングを制御する新規二本鎖RNA結合タンパク質の同定 (2013)
  • Author(s): 村上 文則、日野 公洋、程 久美子
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-12-03 – 2013-12-03
• [Presentation] 核内TNRC6Aの機能解明に向けた複合体構成因子の同定 (2013)
  • Author(s): 須澤 壮崇、西 賢二、鈴木 穣、程 久美子
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-12-03 – 2013-12-03
• [Presentation] マイクロRNAによる認識遺伝子抑制機構におけるA-to-I RNA編集の影響の解析 (2013)
  • Author(s): 久米 秀明、日野 公洋、Galipon Josephine、石井 倫太郎、程 久美子
  • Organizer: 第36回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド(兵庫県)
  • Year and Date: 2013-12-03 – 2013-12-03
• [Presentation] Efficient RNAi by DNA/RNA chimeric siRNA is associated with TRBP binding to the siRNA non-seed region. (2013)
  • Author(s): Tomoko Takahashi, Shuhei Zenno, Kenji Nishi and Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 第40回国際核酸化学シンポジウム
  • Place of Presentation: 神奈川大学(神奈川県)
  • Year and Date: 2013-11-13 – 2013-11-13
• [Presentation] Distinct in vitro siRNA-binding modes of human dsRNA-binding proteins, TRBP and PACT (2013)
  • Author(s): Tomoko Takahashi, Takuya Miyakawa, Shuhei Zenno, Kenji Nishi, Masaru Tanokura and Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 2013 RiboClub Annual Meeting
  • Place of Presentation: Hôtel Chéribourg,Quebec, Canada
  • Year and Date: 2013-09-23 – 2013-09-25
• [Presentation] Comprehensive analysis of A-to-I edited sites on non-coding RNA targets (2013)
  • Author(s): Josephine Galipon, Rintaro Ishii, Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 2013 RiboClub Annual Meeting
  • Place of Presentation: Hôtel Chéribourg,Quebec, Canada
  • Year and Date: 2013-09-23 – 2013-09-25
• [Presentation] Long non-coding RNA,NEAT1v2の量的制御に関与するPUM1の解析 (2013)
  • Author(s): 秋月 源、今村 亮俊、越智 晴香、谷 英典、関水 和久、程 久美子、秋光 信佳
  • Organizer: 第１２回次世代を担う若手ファーマ・バイオフォーラム2013
  • Place of Presentation: 東京大学本郷キャンパス 大学院薬学系研究科(東京都)
  • Year and Date: 2013-09-14 – 2013-09-15
• [Presentation] Comparative study of In Vitro siRNA-Binding Modes of human dsRNA-binding proteins, TRBP and PACT (2013)
  • Author(s): Tomoko Takahashi, Shuhei Zenno, Kenji Nishi and Kumiko Ui-Tei
  • Organizer: 第13回東京大学生命科学シンポジウム(BIO-UT 2013)
  • Place of Presentation: 東京大学 伊藤国際学術研究センター(東京都)
  • Year and Date: 2013-06-08 – 2013-06-08
• [Book] 実験医学増刊 今日から使える！データベース・ウェブツール (2014)
  • Author(s): 高橋朋子, 程久美子
  • Total Pages: 2
  • Publisher: 羊土社
• [Book] 実験医学増刊 今日から使える！データベース・ウェブツール (2014)
  • Author(s): 日野 公洋、内藤 雄樹、坊農 秀雅、程 久美子
  • Total Pages: 2
  • Publisher: 羊土社
• [Book] 実験医学 CRISPR/Casが生命科学を加速する (2014)
  • Author(s): 日野 公洋、内藤 雄樹、坊農 秀雅、程 久美子
  • Total Pages: 7
  • Publisher: 羊土社
• [Book] 遺伝子治療・診断の最先端技術と新しい医薬品・診断薬の開発 (2014)
  • Author(s): 程 久美子
  • Total Pages: 4
  • Publisher: 技術情報協会
• [Book] 実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ 原理からよくわかるリアルタイムPCR (2013)
  • Author(s): 西 賢二、日野 公洋、程 久美子
  • Total Pages: 7
  • Publisher: 羊土社
• [Remarks] 程研究室
  • URL: http://ui-tei.rnai.jp/
• [Remarks] 大野研究室（山下所属）
  • URL: http://www-user.yokohama-cu.ac.jp/~ohnos/Japanease/indexJ.html