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2012 Fiscal Year Annual Research Report

Generation of meta-rule through dynamical systems with multiple timescales: towards a theory of learning and evolution

Planned Research

Project AreaThe study on the neural dynamics for understanding communication in terms of complex hetero systems
Project/Area Number 21120004
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

金子 邦彦  東京大学, 総合文化研究科, 教授 (30177513)

Project Period (FY) 2009-04-01 – 2014-03-31
Keywords力学系 / カオス的遍歴 / 可塑性 / 学習 / 進化
Outline of Annual Research Achievements

力学系を拡張することで生命システムの自律的発展の理論を開拓している。主要な結果は以下のとおりである。

1.入出力関係の学習、記憶と自発活動:昨年までに、力学系のフローの変化(分岐)として記憶をとらえる描像を提出した。今年度は、簡単なシナプス変化則で、この入力依存の記憶が形成されることを示し、その条件を明らかにした。その結果、入力に応じて、要請された出力へ分岐する力学系が形成される。ここで過去の記憶になるに従い、入力による想起が完全でなくなり、あるところまでくると想起ができなくなる。その結果、記憶容量が定まることを明らかにした。更に、入力がない時には記憶間を遍歴するカオス的自発神経活動が生じ、これは最近の記憶により近づいていることも示した。
2.多数の速い変数と1つの遅い変数が結合した力学系において、速い変数の集団的カオスによる、確率的状態遷移が生じることを明らかにした。速い変数を平均化して求まる解が多数のブランチを持ち、断熱極限では1つのブランチに落ちるが、有限の速度差ではカオスによりブランチ解を遷移するのである。このように遅い変数によるコントロールと速い変数によるスイッチを両立させた固有のダイナミクスを見出し、その解析法を提案した。
3.このほか、環境が変動する際に、ノイズにより外界への適応性と進化的な安定性が両立させられること、大自由度力学系による外界への適応過程を明らかにするなどを行って生物学的可塑性の数理的基盤を明らかにするべく研究を進めた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

いくつかの点では予想外の展開が有り、計画以上の進展を示したものもあり全体としては順調に進んでいる。

1.入出力関係の学習、記憶と自発活動:簡単なシナプス変化則による記憶形成が予想以上にうまく機能していることがわかり、これは大きなステップになった。いくつかの拡張も行って予想以上の発展を示している。ただし、この成果の出版、広報活動は更なるスピードで進めることが必要である。
2.進化に関する研究は、着実な成果を挙げ、可塑性をゆらぎによってあらわす基盤をあたえ、また環境変動に対してゆらぎで対処する進化過程も見出した。この方向の結果は長文のレビューをEvolutionary Systems Biologyの1章としてまとめ、一定の評価が得られつつある。ただし、この数理的研究を脳科学へ結びつける点はまだ構想段階にとどまっており、やや遅れ気味である。
3.結合力学系と細胞分化、大自由度遺伝子発現系による適応過程については、Science,PLoSCompBiolなどにこれまでの結果をまとめてアピールをすることができた。特に細胞分化の理論への関心は発生生物学者にも広がりつつある。
4.多数の速い変数と1つの遅い変数が結合した力学系については予想外の興味深い結果が得られた。今後、脳科学との関連づけが待たれる。

Strategy for Future Research Activity

1.これまでに提案した学習則が繰り返し学習に関して効率的かを調べる。ついで、相関のある出力パタンを多数学習した際にカテゴリー化が形成されるかを明らかにする。その際につくられる自発的神経活動の性質を明らかにする。更には、これらの学習則の一般化を図る。一連の研究をまとめて、memory as bifurcation (ないし力学系flowの性質の変化としての学習、記憶)という描像の確立に務める。そのために、広報、出版活動にも力を入れる。更に実験で検証するための提案を行う。
2.多自由度の速い変数と遅い変数が相互作用する力学系研究を進めて、その両者の干渉により、遅い変数による制御が順にスイッチしていくことを明らかにし、また、その脳科学への意義を議論する。
3.環境の変化に応じて、系が可塑性を回復し、その後安定した機能を持つよう進化する仕組みを、ゆらぎ、応答の両面から定量的に解析する。それにより、各成分の間で、遺伝変異由来とノイズ由来のゆらぎの間に比例関係が成り立つこと、また成分の濃度は環境による変動を打ち消すよう遺伝子進化が生じることを明らかにし、それを熱力学のルシャトリエ原理を参考にしつつ、定式化する。つまり、環境への応答と遺伝子の進化へのルシャトリエ原理の確率とそれによる、可塑性の理論の構築である。
4.上記3の研究れと1の学習の研究を組み合わせて、学習に際してのノイズによる揺らぎと学習可塑性の関係の定式化を目指す。更には、以上のシステムを相互作用させることで可塑性を互いに増強して、互いのシステムのイメージが内部に形成されるかを調べる。
最終年度であるので、生命システムの可塑性と安定性の数理的定式化をまとめ、論文発表を含めて発信を積極的に行う。これにより新規ルールの形成過程、記憶の書き換えの理論を構築してコミュニケーションの数理的基盤を形成する。

  • Research Products

    (37 results)

All 2013 2012

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (30 results) (of which Invited: 9 results)

  • [Journal Article] Embedding Responses in Spontaneous Neural Activity Shaped through Sequential Learning2013

    • Author(s)
      T. Kurikawa and K. Kaneko
    • Journal Title

      PLoS Computational Biology

      Volume: 9 Pages: e1002943

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1002943

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Replica symmetry breaking in an adiabatic spin-glass model of adaptive evolution2012

    • Author(s)
      A. Sakata, K. Hukushima and K. Kaneko
    • Journal Title

      Europhys. Lett.

      Volume: 99 Pages: 68004

    • DOI

      10.1209/0295-5075/99/68004

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Associative Memory Model with the Spontaneous neural Activity2012

    • Author(s)
      T. Kurikawa and K. Kaneko
    • Journal Title

      Europhys. Lett.

      Volume: 98 Pages: 48002

    • DOI

      10.1209/0295-5075/98/48002

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Dynamical-Systems View of Stem Cell Biology2012

    • Author(s)
      C. Furusawa and K. Kaneko
    • Journal Title

      Science

      Volume: 338 Pages: 215-217

    • DOI

      10.1126/science.1224311

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evolution of Robustness and Plasticity under Environmental Fluctuation: Formulation in terms of Phenotypic Variances2012

    • Author(s)
      Kunihiko Kaneko
    • Journal Title

      J. Stat. Phys.

      Volume: 148 Pages: 686-704

    • DOI

      10.1007/s10955-012-0563-1

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Learning to Memorize Input-Output Mapping as Bifurcation in Neural Dynamics; Relevance of Multiple Timescales for Synapse Changes2012

    • Author(s)
      Tomoki Kurikawa
    • Journal Title

      Neural Computing and Applications

      Volume: 21 Pages: 725-734

    • DOI

      10.1007/s00521-011-0650-2

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phenotypic Plasticity and Robustness: Evolutionary Stability Theory, Gene Expression Dynamics Model, and Laboratory Experiments2012

    • Author(s)
      Kunihiko Kaneko
    • Journal Title

      Evolutionary Systems Biology (Springer, ed. Orkun S. Soyer)

      Volume: * Pages: 249-278

    • DOI

      10.1007/978-1-4614-3567-9_12

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 遺伝型-表現型マッピングの統計力学モデルの解析2013

    • Author(s)
      斉藤稔
    • Organizer
      第68回日本物理学会年会
    • Place of Presentation
      広島大学(広島)
    • Year and Date
      2013-03-28
  • [Presentation] 触媒反応ネットワークの進化とマクロ現象論の可能性2013

    • Author(s)
      金子邦彦
    • Organizer
      第68回日本物理学会年会
    • Place of Presentation
      広島大学(広島)
    • Year and Date
      2013-03-27
  • [Presentation] 酵素の取り合いを介した細胞記憶の形成2013

    • Author(s)
      畠山哲央
    • Organizer
      第68回日本物理学会年会
    • Place of Presentation
      広島大学(広島)
    • Year and Date
      2013-03-27
  • [Presentation] 遺伝子ネットワークによる非周期パターン形成の仕組み及びその進化III2013

    • Author(s)
      香曽我部隆裕
    • Organizer
      第68回日本物理学会年会
    • Place of Presentation
      広島大学(広島)
    • Year and Date
      2013-03-27
  • [Presentation] 生きていることの状態論――生命システムの可塑性と安定性2013

    • Author(s)
      金子邦彦
    • Organizer
      自然科学研究機構プロジェクト 合同シンポジウム「脳神経情報の階層的研究」「機能生命科学における揺らぎと決定」
    • Place of Presentation
      自然科学研究機構・生理学研究所(愛知)
    • Year and Date
      2013-03-05
    • Invited
  • [Presentation] Phenotypic #64258;uctuation accelerates evolution2013

    • Author(s)
      Nen Saito
    • Organizer
      the First Annual Winter q-bio Meeting
    • Place of Presentation
      Hilton Hawaiian Village in Waikiki(ハワイ)
    • Year and Date
      2013-02-20
  • [Presentation] Cooperative adaptive responses in gene regulatory networks with many degrees of freedom2013

    • Author(s)
      Masayo Inoue
    • Organizer
      the First Annual Winter q-bio Meeting
    • Place of Presentation
      Hilton Hawaiian Village in Waikiki(ハワイ)
    • Year and Date
      2013-02-20
  • [Presentation] Homeostasis and Memory by Autonomous Regulation of Time-scales by Enzyme-limited Competition2013

    • Author(s)
      Kunihiko Kaneko
    • Organizer
      Bioinspired - Methods and Applications
    • Place of Presentation
      東京大学生産技術研究所(東京)
    • Year and Date
      2013-02-05
    • Invited
  • [Presentation] Biological Homeostasis by Autonomous Regulation of Enzyme Concentration2012

    • Author(s)
      金子邦彦
    • Organizer
      2nd Discussion Symposium on Artificial Life and Biomimetic Functional Materials
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌)
    • Year and Date
      2012-12-11
    • Invited
  • [Presentation] "Plasticity and Robustness in Development and Evolution: Perspective from2012

    • Author(s)
      金子邦彦
    • Organizer
      理化学研究所 生命システム研究センター 開所記念国際シンポジウム“Towards Whole-Cell Modeling”
    • Place of Presentation
      QBiC(神戸)
    • Year and Date
      2012-11-07
    • Invited
  • [Presentation] AEIOU neuron model and columnar dynamics resulting from slow adaptation currents.2012

    • Author(s)
      David Colliaux
    • Organizer
      The NeuroComp/KEOpS’12 workshop
    • Place of Presentation
      Functional Genomics Center(フランス)
    • Year and Date
      2012-10-11
  • [Presentation] 表現型ゆらぎによる進化の促進2012

    • Author(s)
      斉藤稔
    • Organizer
      研究会「理論と実験」2012
    • Place of Presentation
      広島大学(広島)
    • Year and Date
      2012-10-06
  • [Presentation] 遺伝子ネットワークで制御されるパターンの進化2012

    • Author(s)
      香曽我部隆裕
    • Organizer
      研究会「理論と実験」2012
    • Place of Presentation
      広島大学(広島)
    • Year and Date
      2012-10-06
  • [Presentation] ニューラルネットワークの入力による分岐構造と学習による変化2012

    • Author(s)
      栗川知己
    • Organizer
      RIMS研究集会“力学系の作る集団ダイナミクス”
    • Place of Presentation
      京都大学(京都)
    • Year and Date
      2012-09-28
  • [Presentation] Spontaneous and Evoked Neural Activities Shaped through A Sequential Learning Process2012

    • Author(s)
      栗川知己
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知)
    • Year and Date
      2012-09-23
  • [Presentation] 自律的酵素量制御による時間スケール調整;ホメオスタシスと記憶2012

    • Author(s)
      金子邦彦
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(愛知)
    • Year and Date
      2012-09-22
    • Invited
  • [Presentation] 遺伝子制御ネットワークによる非周期空間パターン形成の仕組み及びその進化 II2012

    • Author(s)
      香曽我部隆裕
    • Organizer
      日本物理学会 2012年秋季大会
    • Place of Presentation
      横浜国立大学(神奈川)
    • Year and Date
      2012-09-21
  • [Presentation] 学習過程にそった自発・誘起活動の総空間構造の変化2012

    • Author(s)
      栗川知己
    • Organizer
      日本物理学会 2012年秋季大会
    • Place of Presentation
      横浜国立大学(神奈川)
    • Year and Date
      2012-09-21
  • [Presentation] 進化の情報理論による解析2012

    • Author(s)
      斉藤稔
    • Organizer
      日本物理学会 2012年秋季大会
    • Place of Presentation
      横浜国立大学(神奈川)
    • Year and Date
      2012-09-19
  • [Presentation] 大自由度遺伝子発現制御モデルにおける適応応答の制御的進化2012

    • Author(s)
      井上雅世
    • Organizer
      日本物理学会 2012年秋季大会
    • Place of Presentation
      横浜国立大学(神奈川)
    • Year and Date
      2012-09-19
  • [Presentation] 多峰適応度地形上でのボールドウィン効果2012

    • Author(s)
      斉藤稔
    • Organizer
      日本数理生物学会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山)
    • Year and Date
      2012-09-12
  • [Presentation] Relationship Between Spontaneous Activity And Its Response to An External Input Shaped Through Learning2012

    • Author(s)
      栗川知己
    • Organizer
      日本神経回路学会
    • Place of Presentation
      名古屋工業大学(愛知)
    • Year and Date
      2012-09-12
  • [Presentation] 大自由度遺伝子発現制御モデルにおける適応応答の制御的進化2012

    • Author(s)
      井上雅世
    • Organizer
      広島大学大学院理学研究科 第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      広島大学(広島)
    • Year and Date
      2012-09-06
  • [Presentation] Spontaneous and Evoked Neural Activities Shaped through A Sequential Learning Process2012

    • Author(s)
      Tomoki Kurikawa
    • Organizer
      Dynamic Brain Forum
    • Place of Presentation
      El Parador(セビリア)
    • Year and Date
      2012-09-05
  • [Presentation] Biological Homeostasis: Adaptation by Catalytic Reaction Networks and Temperature Compensation in Biological Rhythm2012

    • Author(s)
      Kunihiko Kaneko
    • Organizer
      summer school "DNA dynamics and life strategies"
    • Place of Presentation
      Krogerup Hoejskole(デンマーク)
    • Year and Date
      2012-08-15
    • Invited
  • [Presentation] Characterization of stem cells and cancer cells on the basis of gene expression dynamics and robustness2012

    • Author(s)
      Kunihiko Kaneko
    • Organizer
      summer school "DNA dynamics and life strategies"
    • Place of Presentation
      Krogerup Hoejskole(デンマーク)
    • Year and Date
      2012-08-15
    • Invited
  • [Presentation] Biological Homeostasis: Adaptation by Catalytic Reaction Networks and Temperature Compensation in Biological Rhythm2012

    • Author(s)
      Kunihiko Kaneko
    • Organizer
      Dynamics Days Asia Pacific
    • Place of Presentation
      Academia Sinica(台湾)
    • Year and Date
      2012-08-07
    • Invited
  • [Presentation] 学習による自発活動とその刺激に対する応答の形成2012

    • Author(s)
      栗川知己
    • Organizer
      包括脳夏のワークショップ
    • Place of Presentation
      仙台国際センター(仙台)
    • Year and Date
      2012-07-26
  • [Presentation] Phenotypic fluctuations, developmental plasticity, and environmental variation2012

    • Author(s)
      Kunihiko Kaneko
    • Organizer
      Euro Evo Devo
    • Place of Presentation
      University of Lisbon(ポルトガル)
    • Year and Date
      2012-07-12
    • Invited
  • [Presentation] Direction of Alpha Travelling Wave Associated with Detection of Near-Threshold Stimuli2012

    • Author(s)
      Daisuke SHimaoka
    • Organizer
      Association for Scientific Study of Consciousness
    • Place of Presentation
      サセックス大学(英国)
    • Year and Date
      2012-07-04

URL: 

Published: 2018-02-02  

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