2022 Fiscal Year Annual Research Report
Elucidation of the mechanism of kinetically controlled reaction fields in cells
| Project Area | Kinetics-Driven Supramolecular Chemistry |
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| Project/Area Number |
21H05095
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| Research Institution | Tohoku University |
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Principal Investigator |
奥村 正樹 東北大学, 学際科学フロンティア研究所, 准教授 (50635810)
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| Project Period (FY) |
2021-08-23 – 2024-03-31
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| Keywords | 反応遅延制御 / 酸化的フォールディング / LLPS |
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| Outline of Annual Research Achievements |
小胞体内化学的触媒反応場の形成メカニズムを明らかにするため、分子生物学的手法により構成成分やトリガーとなる因子を抽出する。2021年度から小胞体内化学的触媒反応場の形成因子を見出しており、2021年度から引き続き2022年度は、小胞体内化学的触媒反応場の形成および消失メカニズムを明らかにするため、A01班齋尾と協力し、NMR測定による立体構造・ダイナミクス解析を行った。その結果、小胞体内化学的触媒反応場の形成因子のアミノ酸アサイメントを終えただけでなく、構造変化を捉えることに成功した。さらに、化学的触媒反応場に不可欠な領域の特定に至った。
さらに、前年度から引き続き、小胞体内化学的触媒反応場の可視化を目指し、屈折率を活かしたホロトモグラフィー顕微鏡を設置した(ParkらNat. Photonics 2018)。その結果、幾種かのシャペロン、酵素、基質、低分子化合物の濃縮の可視化に成功し、濃縮における選択性を示すことが出来た。さらに前年度の課題であった細胞内検証において、U2OS細胞を用いて、免疫沈降法を用いて検証した結果、細胞内fociを確認することが出来た。
最終年度では、動的な反応遅延制御環境における酵素反応遅延のメカニズムを明らかにするための酵素反応の素過程を追跡する。また、C01班村岡と協力し、反応遅延制御の反応場の化学制御が可能になると考えられる、幾種かの酸化還元化合物を開発し論文として発表した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
A01班齋尾と協力し、反応遅延制御に関わる反応場に関し、解析を終えており、現在論文投稿準備中である。さらに、また、C01班村岡と協力し、幾報か論文として発表・投稿中であることを鑑みると、当初の計画以上に本研究計画が進んでいることを裏付ける。
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| Strategy for Future Research Activity |
2022年度までに特定した幾種かのシャペロン、酵素、基質、低分子化合物の濃縮における選択性から、反応遅延を実現する生理学的意義が存在すると考えられる。そのため、次年度では反応場における酵素反応遅延について検証する必要がある。
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Research Products
(15 results)
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[Journal Article] Cysteine-based protein folding modulators for trapping intermediates and misfolded forms2022
Author(s)
Nishino, H., Kitamura, M., Okada, S., Miyake, R., Okumura, M., and Muraoka, T.*
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Journal Title
RSC Advances
Volume: 12
Pages: 26658-26664
Peer Reviewed
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