• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2023 Fiscal Year Annual Research Report

過渡的タンパク質複合体の高速構造解析プラットフォームの構築

Planned Research

Project AreaMulti-scale platform for untangling physiological complexity
Project/Area Number 21H05112
Research InstitutionKansai Medical University

Principal Investigator

寿野 良二  関西医科大学, 医学部, 准教授 (60447521)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 加藤 貴之  大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (20423155)
藤田 大士  京都大学, 高等研究院, 准教授 (20713564)
Project Period (FY) 2021-08-23 – 2024-03-31
Keywordsクライオ電子顕微鏡単粒子解析 / 創薬 / GPCR / バイアスドリガンド / シグナル伝達 / 膜タンパク質
Outline of Annual Research Achievements

【概要】本研究領域では、多元的アウトプットとして現れる複雑な生理作用を、分子(寿野班)、細胞(井上班)、個体(櫻井班)、制御(斉藤班)といった次元に分解して検証し、分子、細胞、個体各スケールにおける「素過程」の重ね合わせの形にて記述・可視化を実現する。寿野班は分子フェーズを担当し、GPCR A,
Bを介したシグナル伝達機構の全貌をX線結晶構造解析およびクライオ電子顕微鏡の単粒子解析(Cryoelectron microscopy single particle analysis : Cryo-EM SPA)によって原子分解能レベルで明らかにする。
【目的】バイアス型リガンド結合型GPCR A, BのX線結晶構造解析によるシグナル選択性の解明、GPCR A, Bとシグナル伝達因子複合体の構造解析によるシグナル伝達機構全貌の解明、ケージ技術とCryo-EM SPAを融合した迅速構造決定プラットフォームの開発を目指す。
【研究成果】 本年度は、X線結晶構造解析のためのコンストラクト作製、発現、精製と、Cryo-EM SPAのためのGPCR A, BとGタンパク質の複合体形成条件を検討し、それぞれGタンパク質選択的作動薬、バランスド作動薬存在下で安定な複合体を得ることができた。複合体について200kVの電子顕微鏡でスクリーニングし、GPCR Aの選択的リガンド、非選択的リガンド結合状態で300kVのクライオ電子顕微鏡単粒子解析(Cryo-EM SPA)によりそれぞれ3.24, 3.0A分解能での構造決定に成功した。GPCR Bについても選択的リガンド4種、非選択的リガンド結合状態では300kVのCryo-EM SPAによりそれぞれ3.12, 3.20, 3.26, 2.90, 2.76A分解能で構造決定した。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (8 results)

All 2024 2023

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 4 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Interaction modes of human orexin 2 receptor with selective and nonselective antagonists studied by NMR spectroscopy2024

    • Author(s)
      Imamura Kayo、Akagi Ken-Ichi、Miyanoiri Yohei、Tsujimoto Hirokazu、Hirokawa Takatsugu、Ashida Hideo、Murakami Kaori、Inoue Asuka、Suno Ryoji、Ikegami Takahisa、Sekiyama Naotaka、Iwata So、Kobayashi Takuya、Tochio Hidehito
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 32 Pages: 352~361.e5

    • DOI

      10.1016/j.str.2023.12.008

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Exploring Diverse Signaling Mechanisms of G Protein-Coupled Receptors through Structural Biology2024

    • Author(s)
      Suno Ryoji
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 00 Pages: 1-9

    • DOI

      10.1093/jb/mvae018

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] バイアスドリガンドによるヒトκオピオイド受容体シグナル伝達の構造的洞察2023

    • Author(s)
      寿野 良二
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会
    • Invited
  • [Presentation] Structural and dynamic insights into the biased signaling mechanism of the kappa opioid receptor2023

    • Author(s)
      寿野 良二
    • Organizer
      生理学研究会2023
    • Invited
  • [Presentation] Structural insights into human kappa opioid receptor signaling by biased ligand2023

    • Author(s)
      寿野 良二
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会(名古屋)
    • Invited
  • [Presentation] G蛋白質共役受容体の多様な機能発現機構の構造生物学的解明2023

    • Author(s)
      寿野 良二
    • Organizer
      東京理科大学 研究推進機構 総合研究院 2023年度 生物環境イノベーション研究部門・公開シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Structural insights into the human Prostaglandin E receptor EP3-Gi signaling complex.2023

    • Author(s)
      Ryoji Suno
    • Organizer
      GPCR workshop
    • Int'l Joint Research
  • [Book] クライオ電子顕微鏡ハンドブック2023

    • Author(s)
      寿野 良二、清水(小林)拓也
    • Total Pages
      460
    • Publisher
      NTS

URL: 

Published: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi