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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Chronoproteinology: Protein Properties that Define the Day Length Explored in Unicellular Green Algae

Planned Research

Project AreaChrono-proteinology: principle and design for protein timers
Project/Area Number 21H05131
Research InstitutionKitasato University

Principal Investigator

松尾 拓哉  北里大学, 理学部, 教授 (00452201)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 村中 智明  名古屋大学, 生命農学研究科, 助教 (50761938)
Project Period (FY) 2021-08-23 – 2024-03-31
Keywords概日時計 / カサノリ / 除核
Outline of Annual Research Achievements

細胞内の情報処理は、転写ネットワークの枠組みで理解されることが多い。生物の1日を規定する概日時計も同様であり、真核生物では転写フィードバックループがリズム発振を担うと教科書に記載されている。しかし、転写阻害下でも概日リズムが観られるという矛盾が多くの生物群で報告されており、広く保存された転写に依存しない振動体の存在が議論されている。本研究では、核を取り除いても長期間に渡って安定な概日リズムを示す緑藻、カサノリを用い、除核細胞における概日リズムを生理レベルから分子レベルに至るあらゆる側面で解析する。タンパク質の修飾や複合体形成には特に着目する。
今年度は、初年度に確立したハイスループット測定系を用いて、除核細胞の生理学的な解析を行った。除核のための細胞の切断位置や切断時刻の影響や、転写阻害剤、翻訳阻害剤、キナーゼ阻害剤などの影響を詳細に解析した。その結果、細胞質の翻訳阻害剤や、キナーゼ阻害剤が除核細胞の概日リズムに影響を与えることを明らかにした。また、キナーゼ阻害剤ライブラリーのスクリーニングにより、カサノリのリズムに影響を与える阻害剤を複数同定した。さらに、トランスクリプトーム解析を進めた。デノボアッセンブリーを行い、カサノリの転写産物の配列を決定した。それをレファレンス配列としてプロテオーム解析の予備的実験を行い、十分に利用可能な質のレファレンス配列データが得られていることを確認した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の計画通り進んでいる。また、予想していなかった結果も得られており、当初の計画以上に研究が発展する可能性もある。

Strategy for Future Research Activity

これまで得られている生理学的な知見とトランスクリプトーム解析の結果を用いて、プロテオーム解析を進める。様々な条件下(阻害剤や除核)でタンパク質レベルでの概日振動を網羅的に解析する。

Remarks

https://www.kitasato-u.ac.jp/sci/research/faculty/?c=laboratory_topics&lab_pk=1694482655

  • Research Products

    (19 results)

All 2023

All Presentation (19 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 8 results)

  • [Presentation] 巨大単細胞生物カサノリで転写に依存しない概日時計システムを探る2023

    • Author(s)
      松尾拓哉
    • Organizer
      第23回 日本蛋白質科学会年会 ワークショップ
    • Invited
  • [Presentation] Molecular mechanisms underlying light-induced resetting of the circadian clock in the green alga Chlamydomonas2023

    • Author(s)
      松尾拓哉
    • Organizer
      The 33rd International Conference on Arabidopsis Research
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 緑藻から探る非転写概日振動体2023

    • Author(s)
      松尾拓哉
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会 シンポジウム 「時間タンパク質学」
    • Invited
  • [Presentation] 緑藻を用いた概日時計振動機構の研究2023

    • Author(s)
      松尾拓哉
    • Organizer
      第17回クラミドモナス研究会
  • [Presentation] 緑の藻から探る 体内時計コアメカニズム2023

    • Author(s)
      松尾拓哉
    • Organizer
      第8回理学部セミナー(北里大学)
    • Invited
  • [Presentation] 除核カサノリが24時間をカウントする分子機構2023

    • Author(s)
      松尾拓哉
    • Organizer
      学術変革領域B「時間タンパク質学」領域会議2023
    • Invited
  • [Presentation] 脊椎動物の骨格筋ミオシン重鎖遺伝子クラスターの発現と運動器官の進化2023

    • Author(s)
      加藤優斗,宮坂拓実,金子大輝,福井彰雅,松尾拓哉,伊藤道彦,田村啓
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] シマリスの冬眠に伴う低温誘導 RNA 結合タンパク質 Rbm3 遺伝子の発現増加機構の解析2023

    • Author(s)
      坂部寧々、米山美羽、田村啓、伊藤道彦、松尾拓哉、塚本大輔
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 植物の概日時計とリン酸リレー系の機能的関係について2023

    • Author(s)
      青木摂之、松尾拓哉、山篠貴史、杉田護、崔鶴宇、地宗克洋、羅嘉傑、菅沼裕紀奈、田内和久ラザルス
    • Organizer
      日本植物学会第87回大会
  • [Presentation] 哺乳類の性決定遺伝子Sryの分子進化: 真獣哺乳類祖先?現存種2023

    • Author(s)
      奥山 ほのか、稲積 しおり、荻田 悠作、井口 竣友、回渕 修治、林 舜、須田 皓介、田村 啓、塚本 大輔、松尾 拓哉、伊藤 道彦
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 転写因子DMRT1の転写活性化領域における分子進化2023

    • Author(s)
      石川直樹、藤谷和子、岡野則仁、林舜、須田皓介、奥山ほのか、坂部寧々、稲積しおり、塚本大輔、田村啓、松尾拓哉、伊藤道彦
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 異種交配におけるサブゲノム非対称的トランスポゾン発現の脱抑制:piRNAおよび片親ゲノム排除との連関性の検討2023

    • Author(s)
      須田皓介、三浦郁夫、田村啓、塚本大輔、奥山ほのか、松尾拓哉、伊藤道彦
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Circadian-period variation underlies the local adaptation of photoperiodism2023

    • Author(s)
      Tomoaki Muranaka, Shogo Ito, Hiroshi Kudoh, Tokitaka Oyama
    • Organizer
      Taiwan-Japan Plant Biology 2023
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Circadian-period variation underlies the local adaptation of photoperiodism2023

    • Author(s)
      Tomoaki Muranaka, Ito Sogo, Hiroshi Kudoh, Tokitaka Oyama
    • Organizer
      The 33rd International Conference on Arabidopsis Research
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 湛水時期の異なる水田における アオウキクサの開花フェノロジー2023

    • Author(s)
      村中智明
    • Organizer
      第71回 日本生態学会大会
  • [Presentation] 鹿児島のアオウキクサは3タイプの開花フェノロジーを示す2023

    • Author(s)
      村中智明
    • Organizer
      第55回種生物学シンポジウム
  • [Presentation] 低価格タイムラプスカメラとYOLOX によるイネ開花時刻の推定2023

    • Author(s)
      村中智明,横山寛,松浦萌華,田浦悟,一谷勝之,神田英司
    • Organizer
      日本植物学会第87回大会
  • [Presentation] 巨大単細胞藻類カサノリのプロテオーム解析に向けたトランスクリプトームデータの整備2023

    • Author(s)
      村中智明, 今井康平, 松尾拓哉
    • Organizer
      第23回蛋白質科学会年会
    • Invited
  • [Presentation] Circadian rhythms in a cell: cell-autonomous and non-cell-autonomous2023

    • Author(s)
      Tomoaki Muranaka, Tokitaka Oyama
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
    • Invited

URL: 

Published: 2024-12-25  

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