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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Catalytic control of chemoselectivity by the functional group targeted catalyst

Planned Research

Project AreaDigitalization-driven Transformative Organic Synthesis (Digi-TOS)
Project/Area Number 21H05208
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

大嶋 孝志  九州大学, 薬学研究院, 教授 (10313123)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 森本 浩之  九州大学, 薬学研究院, 講師 (20593867)
Project Period (FY) 2021-09-10 – 2026-03-31
Keywords化学選択性 / 触媒制御 / ベイズ最適化 / 官能基評価キット / デジタル創薬
Outline of Annual Research Achievements

本計画研究では、革新反応開発に機械学習を徹底活用(実験科学と情報科学の異分野融合)することで、化学選択性の触媒制御法開発の超加速を実現し、その基礎となる官能基標的触媒を網羅的に創出することを目的として研究を行なっている。具体的には、主に以下の検討で研究成果を上げた。
・カルボン酸のα-重水素化反応の開発において、機械学習的手法も組み込みながら反応条件最適化を行い、三つの汎用される試薬の組み合わせることで、カルボン酸を選択的に活性化し、重アセトニトリルと反応させることで、カルボン酸のα位選択的に重水素化できることを見出した。医薬品を含む様々な基質に適応することができ、最近特に注目されている重水素化医薬品を合成することに成功した。また、重水素の導入により、医薬品の代謝安定性が向上することを実験的に証明した。さらに、本手法は、通常はエノール化が困難なカルボン酸を選択的にエノール化することが可能であるため、カルボン酸とエステルの大きな酸性度の差を逆転して、エステル存在下でカルボン酸を選択的に重水素化することに成功した。
・総括班で準備した官能基評価キットを活用し、Suzuki-Miyauraクロスカップリング反応、触媒的不斉Pro-Aldol反応、カルボン酸とアミンの縮合反応、Sc触媒によるN-無保護ケチミン形成反応に対し、26種類の官能基の影響を網羅的に検討し、官能基共存性のデジタル化を行うための情報収集を行うことができた。また、検討の過程で、新反応開発のきっかけとなる現象を複数見出すことに成功し、新たな化学選択的な反応開発の端緒となった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度は、昨年度の検討結果をもとに、(1)から(5)の項目に関して、以下の検討を行った。(1)化学選択的電解酸化反応において連続型変数のベイズ最適化を中心に検討し、反応条件最適化の効率化を図る。また、離散型変数、特に溶媒効果に関して様々な機械学習の手法を検討し、その手法を確立する。(2)総括班で準備した官能基評価キットを活用し、化学選択性の網羅的情報収集を行う。反応の種類を拡張するとともに、見出した正の添加効果に関して精査し、新たな触媒系の開発につなげる。(3)計算科学と情報科学を融合させ、先に開発した不斉触媒反応の主制御因子の顕在化を行う。(4)現在進めているデジタル創薬に関する共同研究を推進する。特に、機械学習によって提案された創薬リードの合成と生物活性評価を推進する。(5)エステル交換反応、分子内環化反応、電解フロー反応などのフロー反応での最適化を行う。
(1)および(2)に関しては、【研究実績の概要】に記載した通り、実績を上げることができた。(1)のうち、溶媒効果に関する機械学習の手法の検討でも、すでにいくつか実績を上げている。これらの結果を踏まえ、領域全体での溶媒効果の機械学習のプロジェクトを立ち上げた(総括班での事業に昇格)。(3)に関しては、A03班の矢田らとの共同研究体制を構築し、機械学習に必要な特徴量の抽出を終えることができた。(4)に関しては、A03班の宮尾らとの国際共同研究を実施しており、生物系、合成系、情報系の共同研究チームを構築し、深層学習によって提案された化合物の合成と生物活性の確認を行なっている。(5)に関しては、エステル交換反応、分子内エン環化反応に対して機械学習を用いた最適化を実施しており、論文投稿の準備中である。

Strategy for Future Research Activity

R5年度も引き続き、以下の5項目の検討を行う。
(1)化学選択的電解酸化反応において連続型変数のベイズ最適化を中心に検討し、反応条件最適化の効率化を図る。また、離散型変数、特に溶媒効果に関して様々な機械学習の手法を検討し、その手法を確立する。(2)総括班で準備した官能基評価キットを活用し、化学選択性の網羅的情報収集を行う。反応の種類を拡張するとともに、見出した正の添加効果に関して精査し、新たな触媒系の開発につなげる。(3)計算科学と情報科学を融合させ、先に開発した不斉触媒反応の主制御因子の顕在化を行う。(4)現在進めているデジタル創薬に関する共同研究を推進する。特に、機械学習によって提案された創薬リードの合成と生物活性評価を推進する。(5)エステル交換反応、分子内環化反応、電解フロー反応などのフロー反応での最適化を行なう。
(1)に関しては、これまで難しかった離散型変数の機械学習を用いた最適化手法の検討、特に溶媒効果の検討を行う。既に、溶媒のクラスタリングによる代表溶媒の選定、代表溶媒の検討から溶媒最適化手法(270種以上の溶媒の中から最適溶媒を少ない実験数で見出す手法)を、A02班の間瀬らと共に構築しており、基幹反応に対する検討を進めていく。これは総括班事業として他の班員にも協力を仰ぎながら実施する。(2)総括班事業としての官能基評価キットを用いた情報収集の一部を分担し、実施していく。(3)に関しては、計算科学によって収集した特徴量を用いながら、触媒的不斉反応の収率および不斉収率の最適化を新たな機械学習手法を構築しながら行う。(4)深層学習によって提案された化合物の合成を進めながら、合成-アッセイ-評価のループを回し、新たなデータを組み込みながら深層学習の精度向上に努める。(5)電解フロー反応にフォーカスし、新たなアミノ酸合成法の開発を進める。

  • Research Products

    (57 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (49 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 18 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Eindhoven University of Technology(オランダ)

    • Country Name
      NETHERLANDS
    • Counterpart Institution
      Eindhoven University of Technology
  • [Journal Article] O- and N-Selective Electrophilic Activation of Allylic Alcohols and Amines in Pd-Catalyzed Direct Alkylation2023

    • Author(s)
      Lin Lu、Kataoka Shunsuke、Hirayama Kiichi、Shibuya Ryozo、Watanabe Kenji、Morimoto Hiroyuki、Ohshima Takashi
    • Journal Title

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 71 Pages: 101~106

    • DOI

      10.1248/cpb.c22-00745

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Organocatalytic Direct Enantioselective Hydrophosphonylation of <i>N</i>-Unsubstituted Ketimines for the Synthesis of α-Aminophosphonates2023

    • Author(s)
      Yamada Koki、Kondo Yuta、Kitamura Akihiko、Kadota Tetsuya、Morimoto Hiroyuki、Ohshima Takashi
    • Journal Title

      ACS Catalysis

      Volume: 13 Pages: 3158~3163

    • DOI

      10.1021/acscatal.2c05953

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] One-Pot Catalytic Synthesis of α-Tetrasubstituted Amino Acid Derivatives via In Situ Generation of <i>N</i>-Unsubstituted Ketimines2022

    • Author(s)
      Kondo Yuta、Hirazawa Yoshinobu、Kadota Tetsuya、Yamada Koki、Morisaki Kazuhiro、Morimoto Hiroyuki、Ohshima Takashi
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 24 Pages: 6594~6598

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.2c02587

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ternary catalytic α-deuteration of carboxylic acids2022

    • Author(s)
      Tanaka T.、Koga Y.、Honda Y.、Tsuruta A.、Matsunaga N.、Koyanagi S.、Ohdo S.、Yazaki R.、Ohshima T.
    • Journal Title

      Nature Synthesis

      Volume: 1 Pages: 824~830

    • DOI

      10.1038/s44160-022-00139-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A TRPC3/6 Channel Inhibitor Promotes Arteriogenesis after Hind-Limb Ischemia2022

    • Author(s)
      Shimauchi Tsukasa、Numaga-Tomita Takuro、Kato Yuri、Morimoto Hiroyuki、Sakata Kosuke、Matsukane Ryosuke、Nishimura Akiyuki、Nishiyama Kazuhiro、Shibuta Atsushi、Horiuchi Yutoku、Kurose Hitoshi、Kim Sang Geon、Urano Yasuteru、Ohshima Takashi、Nishida Motohiro
    • Journal Title

      Cells

      Volume: 11 Pages: 2041~2041

    • DOI

      10.3390/cells11132041

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cancer Spheroid Proliferation Is Suppressed by a Novel Low-toxicity Compound, Pyra-Metho-Carnil, in a Context-independent Manner2022

    • Author(s)
      YOSHIDA KAZUMASA、NISHI KENSUKE、ISHIKURA SHUHEI、NAKABAYASHI KAZUHIKO、YAZAKI RYO、OHSHIMA TAKASHI、SUENAGA MASAHIKO、SHIRASAWA SENJI、TSUNODA TOSHIYUKI
    • Journal Title

      Anticancer Research

      Volume: 42 Pages: 3993~4001

    • DOI

      10.21873/anticanres.15895

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Controlling Chemoselectivity by Functional Group Targeted Catalyst (FGT-cat)2023

    • Author(s)
      Takashi OHSHIMA
    • Organizer
      The 26th SANKEN International Symposium GREEN Transformation for a Sustainable Society
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 官能基標的触媒による化学選択性の制御2023

    • Author(s)
      大嶋孝志
    • Organizer
      岡山大学学術研究院自然科学研究科 学術講演会
    • Invited
  • [Presentation] Catalytic Chemoselective α-Deuteration of Carboxylic Acids2023

    • Author(s)
      Takashi OHSHIMA
    • Organizer
      J-PARC Workshop 2022 Deuterium Science Entering a New Phase
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] α-Amino acid and peptide synthesis using catalytic cross-dehydrogenative coupling2023

    • Author(s)
      Taro Tsuji、Kayoko Hashiguchi、Mana Yoshida、Tetsu Ikeda、Yunosuke Koga、Yusaku Honda、Tsukushi Tanaka、Suyong Re、Kenji Mizuguchi、Daisuke Takahashi、Ryo Yazaki、Takashi Ohshima
    • Organizer
      日本化学会 第103春季年会(2023)
  • [Presentation] 薬学研究におけるデジタル有機合成2023

    • Author(s)
      大嶋孝志
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
    • Invited
  • [Presentation] 窒素上無保護ケチミンの新規触媒的直接合成法の開発とワンポット合成への応用2023

    • Author(s)
      近藤 優太、平澤 禎将、門田 哲弥、山田 昂輝、森崎 一宏、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
  • [Presentation] 触媒的直接炭素-炭素結合切断による、アシル化された含窒素芳香族複素環から異なる窒素含有複素環化合物への変換反応の開発2023

    • Author(s)
      パン ボウ、辛 海龍、崔 智修、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
  • [Presentation] プロリンを触媒としたグリシンSchiff塩基のアルドール縮合反応の開発2023

    • Author(s)
      澤村 淳、家入 大観、矢崎 亮、大嶋 孝志
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
  • [Presentation] アンモニウム塩で加速されるアミド切断反応に対する官能基共存性の評価及びアミド切断反応を促進する新規添加剤の開発2023

    • Author(s)
      崔 智修、齋藤 菜月、縄稚 杏奈、近藤 優太、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
  • [Presentation] 窒素上無保護ケチミンの直接的触媒的不斉ヒドロホスホニル化反応の開発2023

    • Author(s)
      山田 昂輝、近藤 優太、北村 昌彦、門田 哲弥、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
  • [Presentation] 有機合成のデジタル化を志向した、官能基評価キットによる反応の網羅的データ集積手法の開発2023

    • Author(s)
      縄稚 杏奈、齋藤 菜月、近藤 優太、崔 智修、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      日本薬学会第143年会
  • [Presentation] デジタル有機合成とフロー反応2022

    • Author(s)
      大嶋 孝志
    • Organizer
      近畿化学協会 フロー・マイクロ合成研究会 第94回研究会
    • Invited
  • [Presentation] α-アミノ酸Schiff 塩基と炭化水素の触媒的脱水素型クロスカップリング反応の開発2022

    • Author(s)
      辻汰朗、橋口佳代子、吉田真奈、池田哲、古賀祐之介、本多優作、田中津久志、Suyong Re、水口賢司、高橋大輔、矢崎亮、大嶋孝志
    • Organizer
      第20回次世代を担う有機化学シンポジウム
  • [Presentation] α-アミノ酸Schiff 塩基と炭化水素の触媒的脱水素型クロスカップリング反応2022

    • Author(s)
      辻汰朗、橋口佳代子、吉田真奈、池田哲、古賀祐之介、本多優作、田中津久志、Suyong Re、水口賢司、高橋大輔、矢崎亮、大嶋孝志
    • Organizer
      第32回万有福岡シンポジウム
  • [Presentation] アンモニウム塩とアリルアルコールからの穏和かつ簡便な触媒的第一級アリルアミン合成法の開発2022

    • Author(s)
      片岡 駿介、澁谷 亮三、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      第11回JACI/GSCシンポジウム
  • [Presentation] 官能基標的触媒による化学選択性の触媒制御:保護基フリーの合成プロセスを目指して2022

    • Author(s)
      大嶋 孝志
    • Organizer
      第55回天然物化学談話会
    • Invited
  • [Presentation] 化学選択性の触媒制御への挑戦そして「デジタル有機合成」へ2022

    • Author(s)
      大嶋 孝志
    • Organizer
      第54回有機金属若手の会夏の学校
    • Invited
  • [Presentation] α-アミノ酸Schiff塩基と炭化水素の触媒的脱水素型クロスカップリング反応の開発2022

    • Author(s)
      辻汰朗、橋口佳代子、吉田真奈、池田哲、古賀祐之介、本多優作、田中津久志、李秀栄、水口賢司、高橋大輔、矢崎亮、大嶋孝志
    • Organizer
      第54回有機金属若手の会夏の学校
  • [Presentation] アンモニウム塩とアリルアルコールからの穏和かつ簡便な触媒的第一級アリルアミン合成法の開発2022

    • Author(s)
      片岡 駿介、澁谷 亮三、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      第54回有機金属若手の会夏の学校
  • [Presentation] プロリンを触媒としたグリシンSchiff塩基のアルドール縮合反応の開発2022

    • Author(s)
      澤村 淳、家入 大観、矢崎 亮、大嶋孝志
    • Organizer
      有機合成化学協会第120回シンポジウム
  • [Presentation] ワンポット反応による窒素上無保護非天然アミノ酸誘導体の新規触媒的合成法の開発2022

    • Author(s)
      近藤 優太、門田 哲弥、平澤 禎将、山田 昂輝、森崎 一宏、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      日本プロセス化学会2022サマーシンポジウム
  • [Presentation] カルボン酸の触媒的α-重水素化反応の開発2022

    • Author(s)
      古賀 祐之介、田中 津久志、本多 優作、鶴田 朗人、松永 直哉、小柳悟、大戸 茂弘、矢崎 亮、大嶋 孝志
    • Organizer
      第59回化学関連支部合同九州大会
  • [Presentation] 窒素上無保護ケチミンに対する触媒的不斉ヒドロホスホニル化反応の開発2022

    • Author(s)
      山田 昂輝、近藤 優太、北村 昌彦、門田 哲弥、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      第59回化学関連支部合同九州大会
  • [Presentation] 銅触媒を用いたα-アミノ酸誘導体のβ位官能基化の開発2022

    • Author(s)
      工藤 愛透翔、田渕 友梨、谷之口 誠也、矢崎 亮、大嶋 孝志
    • Organizer
      第59回化学関連支部合同九州大会
  • [Presentation] フロー反応と「デジタル有機合成」2022

    • Author(s)
      大嶋 孝志
    • Organizer
      第 1 回 FlowST サマー・ワークショップ
    • Invited
  • [Presentation] カルボン酸およびその等価体の化学選択的エノラート形成反応2022

    • Author(s)
      大嶋 孝志
    • Organizer
      第89回触媒化学融合研究センター講演会
    • Invited
  • [Presentation] α-四置換型非天然α-アミノ酸の新規触媒的合成法の開発と「デジタル有機合成」2022

    • Author(s)
      大嶋 孝志
    • Organizer
      有機合成夏期セミナー「明日の有機合成化学」
    • Invited
  • [Presentation] Catalytic α-Oxidation of Carboxylic Acids via Radical Process2022

    • Author(s)
      Ryo Yazaki、Tsukushi Tanaka、Takashi Ohshima
    • Organizer
      第68回有機金属化学討論会
  • [Presentation] アンモニウム塩とアリルアルコールからの穏和かつ簡便な触媒的第一級アリルアミン合成法の開発2022

    • Author(s)
      片岡 駿介、澁谷 亮三、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      第68回有機金属化学討論会
  • [Presentation] 窒素上無保護ケチミンに対する触媒的不斉ヒドロホスホニル化反応の開発2022

    • Author(s)
      山田 昂輝、近藤 優太、北村 昌彦、門田 哲弥、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      第51回複素環化学討論会
  • [Presentation] デジタル有機合成の拓く未来2022

    • Author(s)
      大嶋 孝志
    • Organizer
      日本化学会関東支部 2022 年度講演会 化学分野におけるDXの現状ならびに今後の展望
    • Invited
  • [Presentation] 窒素上無保護ケチミンの新規触媒的直接合成法の開発と含窒素化合物のワンポット合成への応用2022

    • Author(s)
      近藤 優太、門田 哲弥、平澤 禎将、山田 昂輝、森崎 一宏、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      第38回有機合成化学セミナー
  • [Presentation] プロリンを触媒としたグリシンSchiff塩基のアルドール縮合反応の開発2022

    • Author(s)
      澤村 淳、家入 大観、矢崎 亮、大嶋 孝志
    • Organizer
      日本化学会秋季事業 第12回CSJ化学フェスタ2022
  • [Presentation] AI支援による反応制御の深化2022

    • Author(s)
      大嶋 孝志
    • Organizer
      日本化学会秋季事業 第12回CSJ化学フェスタ2022
    • Invited
  • [Presentation] 化学選択性の触媒制御とデジタル有機合成2022

    • Author(s)
      大嶋孝志
    • Organizer
      東京大学大学院講演会
    • Invited
  • [Presentation] 有機合成のデジタル化を志向した、官能基評価キットによる反応の網羅的データ集積手法の開発2022

    • Author(s)
      齋藤 菜月、縄稚 杏奈、近藤 優太、崔 智修、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      第121回有機合成シンポジウム
  • [Presentation] 有機合成のデジタル化を志向した、官能基評価キットによる反応の網羅的データ集積手法の開発2022

    • Author(s)
      齋藤 菜月、縄稚 杏奈、近藤 優太、崔 智修、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      第39回日本薬学会九州山口支部大会
  • [Presentation] 窒素上無保護ケチミンに対する直接的触媒的不斉ヒドロホスホニル化反応の開発2022

    • Author(s)
      山田 昂輝、近藤 優太、北村 昌彦、門田 哲弥、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      第39回日本薬学会九州山口支部大会
  • [Presentation] Chemoselective Catalytic a-Oxidation and a-Deuteration of Carboxylic Acids2022

    • Author(s)
      Takashi OHSHIMA
    • Organizer
      The 15th International Symposium on Organic Reactions (ISOR15)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 触媒的脱水素型クロスカップリング反応によるα-アミノ酸およびペプチド合成2022

    • Author(s)
      矢崎 亮、辻 汰朗、橋口 佳代子、吉田 真奈、池田 哲、古賀 祐之介、本多 優作、田中 津久志、李 秀栄、水口 賢司、高橋 大輔、大嶋 孝志
    • Organizer
      第48回反応と合成の進歩シンポジウム
  • [Presentation] Transformation of Unactivated 2-Acylimidazoles and Related Azaarenes to Other Heterocycles via C-C Bond Cleavage2022

    • Author(s)
      Bo Pang、Hai-Long Xin、Jeesoo Choi、Hiroyuki Morimoto、Takashi Ohshima
    • Organizer
      第48回反応と合成の進歩シンポジウム
  • [Presentation] アンモニウム塩とアリルアルコールからの穏和な触媒的第一級アリルアミン合成法の開発2022

    • Author(s)
      片岡 駿介、澁谷 亮三、森本 浩之、大嶋 孝志
    • Organizer
      第48回反応と合成の進歩シンポジウム
  • [Presentation] 有機触媒を用いる窒素上無保護ケチミンの新規直接合成法の開発とアミノ酸誘導体のワンポット合成への応用2022

    • Author(s)
      近藤 優太、門田 哲弥、平澤 禎将、山田 昂輝、森崎 一宏、森本 浩之、大嶋孝志
    • Organizer
      第15回有機触媒シンポジウム
  • [Presentation] Chemoselective Catalytic a-Oxidation and a-Deuteration of Carboxylic Acids2022

    • Author(s)
      T. Tanaka、Y. Koga、Y. Honda、R. Yazaki、T. Ohshima
    • Organizer
      Tateshina Conference on Organic Chemistry
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 有機合成におけるケモインフォマティクス2022

    • Author(s)
      大嶋孝志
    • Organizer
      第45回ケモインフォマティクス討論会
    • Invited
  • [Presentation] Development of Direct Catalytic Synthesis of N-Unprotected Ketimines2022

    • Author(s)
      Yuta Kondo、Tetsuya Kadota、Yoshinobu Hirazawa、Kazuhiro Morisaki、Hiroyuki Morimoto、Takashi Ohshima
    • Organizer
      11th Singapore International Chemistry Conference (SICC-11)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Controlling and Digitization of Chemoselectivity by Functional Group Targeted Catalyst and by Functional Group Evaluation Kit2022

    • Author(s)
      Takashi Ohshima
    • Organizer
      11th Singapore International Chemistry Conference (SICC-11)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 「デジタル有機合成」の基盤となる特色あるデータベース構築の取り組み2022

    • Author(s)
      大嶋孝志
    • Organizer
      「第105回産研テクノサロン」 講演会
    • Invited
  • [Presentation] フロー反応の活用によるデジタル有機合成の推進2022

    • Author(s)
      大嶋孝志
    • Organizer
      2022 年度「有機合成化学講習会」 講演会
    • Invited
  • [Remarks] 九州大学大学院薬学研究院環境調和創薬化学分野

    • URL

      https://green.phar.kyushu-u.ac.jp/

URL: 

Published: 2023-12-25  

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