• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2021 Fiscal Year Annual Research Report

データ駆動手法による素反応条件およびアウトプット予測と実証

Planned Research

Project AreaDigitalization-driven Transformative Organic Synthesis (Digi-TOS)
Project/Area Number 21H05223
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

松原 誠二郎  京都大学, 工学研究科, 教授 (90190496)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 倉橋 拓也  京都大学, 工学研究科, 准教授 (50432365)
Project Period (FY) 2021-09-10 – 2026-03-31
Keywords自動合成 / 機械学習 / 反応予測
Outline of Annual Research Achievements

自動合成システムの構築に焦点を当てた。本システムは,1) 自動合成経路解析,2) 自動反応条件設定,3)自動合成装置の三要素が連動することにより実現する。自動合成経路解析は,Synthiaの利用を決定した。実際,デジタル有機合成の先進国である英国での製薬会社GSK(グラクソスミスクライン)においても,逆合成経路解析システムとしてSynthiaを利用するとした。2)の自動反応条件設定は,中でもMITのJensen, Coley両教授が開発したReaction Conditions Recommender (RCR: ACS Cent. Sci. 2018, 4, 1465)が評価が高かったが,2022年3月にSynthiaの開発者のB. A. Grzybowskiが,このシステムの的中率が,40%切るという論文を発表した(J. Am. Chem. Soc. 10.1021/jacs.1c12005)。本論文は,決してRCRが不適切ということではなく,3)の自動合成装置の開発と実際の合成反応を行うことの重要性を示したものと言える。本研究では,RCRの利用を続けた。3)の自動合成装置の開発においては,Cronin(グラスゴー大)が示した“Chemputor”を試作し,CroninがGithubにおいて公開している制御プログラムをプログラミングの知識を持たない実験者が使用できるように,ビジュアルプログラミングに書き換え,実験手順の入力が極めて容易にした。本体は,Cronin-Chemputorの性能を十分再現できるものとなったが,現時点では,エステル化・アセタール化・アミド化において0.3molの実験が可能であることを示せた。また,反応のアウトプット予測の一環として,反応速度グラフの予測を行い,機械学習により回帰式を求めることができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

自動合成のシステムを形成することはできたが,実用性となると,手作業の方が早いのではないかという率直な感想を持ってしまう。機械学習によるアウトプット予測も,反応を実施する「実データ」に代わるものか,正直疑問を持つ。これは,デジタル有機合成技術一般に言えるものである。

Strategy for Future Research Activity

今後の研究の方向性は以下の2点である。
1)現在成果を得ている反応速度グラフの予測を発展させる。具体的には多官能基化基質の位置選択性を予測すること。また,自分たちの反応データではなく,既存の文献データで試みることである。これは22年度にかなりの程度で実現してきている,
2)実験手順のプログラミングの簡素化が必要である。具体的には,論文のSIは,現段階でオープンアクセスであり,重要なデータソースとして非常に興味深い。この文章をから自動合成のプログラムの生成を行うことを目的とする。

  • Research Products

    (7 results)

All 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Int'l Joint Research] Queensland University(オーストラリア)

    • Country Name
      AUSTRALIA
    • Counterpart Institution
      Queensland University
  • [Journal Article] Unmasking Inherent Chirality within the Cubane Skeleton2021

    • Author(s)
      N. Yoshino, Y. Kato, Y. Shimada, C. M. Williams, S. Matsubara
    • Journal Title

      Israel Journal of Chemistry

      Volume: 61 Pages: 380-386

    • DOI

      10.1002/ijch.202100013

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] PREPARATION OF 2-ARYL-3-SILYL- AND 2-ARYL-3-GERMYL-1,3-BUTADIENES VIA ARYLNICKELATION AND ZINCIOMETHYLATION2021

    • Author(s)
      N. Yoshino, B. Sharewa, Z. Ikeda, S. Matsubara
    • Journal Title

      Heterocycles

      Volume: 103 Pages: 769-777

    • DOI

      10.3987/COM-20-S(K)36

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Catalytic asymmetric cycloetherification via intramolecular oxy-Michael addition of enols2021

    • Author(s)
      R. Murata, K. Asano, S. Matsubara
    • Journal Title

      Tetrahedron

      Volume: 97 Pages: 132381

    • DOI

      10.1016/j.tet.2021.132381

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 有機合成のデジタル化2021

    • Author(s)
      松原誠二郎
    • Organizer
      第82回応用物理学会秋季学術講演会
    • Invited
  • [Presentation] 有機合成のデジタル化2021

    • Author(s)
      松原誠二郎
    • Organizer
      2021年度化学工学会第87回年会
    • Invited
  • [Presentation] 有機合成のデジタル化2021

    • Author(s)
      松原誠二郎
    • Organizer
      2022年日本化学会第102春季年会基調講演
    • Invited

URL: 

Published: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi