2021 Fiscal Year Annual Research Report
非ドメイン型バイオポリマーに関する分子修飾機構の解明
| Project Area | Biology of Non-domain Biopolymer |
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| Project/Area Number |
21H05280
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
尾山 大明 東京大学, 医科学研究所, 准教授 (30422398)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
鈴木 健夫 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 講師 (90533125)
秦 裕子 東京大学, 医科学研究所, 技術専門員 (80401256)
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| Project Period (FY) |
2021-09-10 – 2026-03-31
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| Keywords | 質量分析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
近年、全長にわたって天然変性領域から成り、一次配列への機能依存性が低い超天然変性タンパク質や、非翻訳領域と考えられていたRNA配列がコードする新規ORF由来のタンパク質など、従来のタンパク質の概念の枠組みを超えた遺伝子産物の存在が次々と明らかになってきている。タンパク質の一部又は全体が特定の立体構造を持たない天然変性タンパク質の存在は以前から知られていたが、立体構造の検証が困難なことから長年、他の分子との相互作用に関する綿密な議論が進まない状況が続いていた。しかしながら、NMR等を用いた詳細な解析により、転写制御を担う主要分子群であるCREBやp53の天然変性領域が重要な機能的役割を果たすことが報告され、細胞内でのタンパク質-タンパク質相互作用、あるいはタンパク質-RNA相互作用における、特定の構造を取りにくい「非ドメイン型」配列を介した分子間相互作用研究の重要性が急速に高まっている。
非ドメイン型タンパク質・RNAと相互作用する因子群は、弱い分子間相互作用、あるいは結合・解離が速い動的相互作用によって機能している場合、従来の免疫沈降法をベースとした質量分析法（AP-MS法）では相互作用分子群を包括的に検出することが困難であると考えられる。本年度は、従来行われているAP-MS法に加え、近位依存性ビオチン標識法（BioID法）をはじめとする近接分子群のラベル化に基づく質量分析同定技術を領域内の各研究課題に幅広く提供し、非ドメイン型タンパク質・RNAに関する相互作用データを高深度・高精度に取得する解析パイプラインを構築した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究課題においては、従来行われているAP-MS法に加え、近位依存性ビオチン標識法（BioID法）をはじめとする近接分子群のラベル化に基づく質量分析同定技術を初年度から領域内の各研究課題に積極的に提供し、当該技術開発に関する情報を領域内で共有・蓄積するプラットフォームを構築した。
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| Strategy for Future Research Activity |
当研究領域で見出されたHeroタンパク質やクマムシ特異的タンパク質などの非ドメイン型タンパク質、あるいはarcRNAに代表される非ドメイン型RNAに関して、超高感度質量分析技術を駆使することにより包括的に分子修飾を同定すると共に、被修飾部位ごとの機能的役割について精密な動態分析を行い、非ドメイン型バイオポリマー特有の分子制御に資する分子修飾機構を、修飾部位レベルの解像度で精密に議論することが可能な解析プラットフォームを確立する。
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Research Products
(3 results)
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[Journal Article] Role of the Orphan Transporter SLC35E1 in the Nuclear Egress of Herpes Simplex Virus 12022
Author(s)
Maeda F, Kato A, Takeshima K, Shibazaki M, Sato R, Shibata T, Miyake K, Kozuka-Hata H, Oyama M, Shimizu E, Imoto S, Miyano S, Adachi S, Natsume T, Takeuchi K, Maruzuru Y, Koyanagi N, Arii J, Kawaguchi Y
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Journal Title
J Virol
Volume: 印刷中
Pages: -
Peer Reviewed / Open Access
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