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2012 Fiscal Year Annual Research Report

Density-Functional Approach to Atomic and Electronic Structures and their Dynamics in Nano-Structures

Planned Research

Project AreaMaterials Design through Computics: Complex Correlation and Non-equilibrium Dynamics
Project/Area Number 22104005
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

押山 淳  東京大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (80143361)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 宮崎 剛  独立行政法人物質・材料研究機構, その他部局等, 研究員 (50354147)
土田 英二  独立行政法人産業技術総合研究所, その他部局等, 研究員 (50357521)
尾崎 泰助  北陸先端科学技術大学院大学, 学内共同利用施設等, 准教授 (70356723)
Project Period (FY) 2010-04-01 – 2015-03-31
Keywords密度汎関数理論 / 第一原理計算 / オーダーN / ナノ構造 / 電子状態 / コンピューティクス
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、量子論の第一原理に立脚した実空間アプローチとオーダーN法(N: 系のサイズ)を計算手法の軸にすえ、ナノスケール構造体の形状と電子機能の複合相関と非平衡ダイナミクスの解明、および新機能を有するナノ構造体の提唱を行うことを目的としており、24年度は以下の成果が得られた。① 京コンピュータに代表される、超並列アーキテクチャのコンピュータ上で高速化を進めてきたRSDFT(実空間密度汎関数理論)コードを多機能化した。すなわち、ウルトラソフト擬ポテンシャルの導入により広範な物質群をターゲットとすること、新たな櫻井-杉浦固有値解法の実装によりフェルミ準位付近の固有値を選択的に求めること、またCar-Parrinello分子動力学法との統合により、大規模ダイナミクス計算を行うこと、が可能となった。② 密度行列の最適化に基づくオーダーN手法であるCONQUESTを、マルチコア超並列コンピュータ上で高速化し、また、基底関数系である局在軌道の最適化手法およびオーダーN分子動力学法の実装を行った。③ 多機能オーダーN法コードであるOpenMXの超並列化を行った。修正再帰二分法と慣性モーメントテンソルに基づく新しい領域分割法を開発し、京コンピュータ131,072コア計算において、極めて高い並列効率を達成した。④ 有限要素法コードFEMTECKの多機能化と次々世代アーキテクチャ、とくにインテル系アクセラレータでのフィーザビリティを調査した。
以上の手法開発成果を活用し、① Siナノワイヤーの大規模電子状態計算と、それに基づくコンパクト・モデルにより、トランジスターの電流電圧特性の、ナノ断面形状、結晶方位依存性を明らかにしたこと、② Si基板上Geのエピタキシャル成長中のナノ構造(ハット・クラスター)の構造最適化を行い、構造制御の可能性を探索したこと、などの物質科学分野での成果があげられた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

(1) 実空間のCPMD法の開発は順調に進展しており、1,000原子系のCPMDが京1000コアで1タイムステップあたり、3秒で計算実行できるまでにチューンされた。
(2) CONQUESTの「京」上でのハイブリッド並列化は順調に進展し、10,000ノード超での高い実行性能を示している。
(3) 世界的に見ても多くのユーザーが利用しているOpen MXコードの、京コンピュータに代表される、マルチコア・超並列アーキテクチャ上での高効率化が進んだ。

Strategy for Future Research Activity

24年度までに、重要なコードについてのマルチコア・超並列コンピュータ上での高速化が進展した。今後は多機能化をはかるとともに、物質科学的に重要なターゲット、シリコン、ゲルマニウム系、シリコン・カーバイド系、酸化亜鉛系、炭素ナノ系、ソフト物質系等に対する先端的な電子状態計算を実行し、物質科学の発展に寄与する。また、A02研究項目の渡邉計画研究班との共同で、輸送係数計算コードの開発を計画している。

  • Research Products

    (33 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (17 results) (of which Peer Reviewed: 17 results) Presentation (14 results) (of which Invited: 14 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Sodium and magnesium ionic conduction in complex hydrides2013

    • Author(s)
      M.Matsuo, H.Oguchi, T.Sato, H.Takamura, E.Tsuchida, T.Ikeshoji, and S.Orimo
    • Journal Title

      Journal of Alloys and Compounds

      Volume: 580 Pages: S98-S101

    • DOI

      10.1016/j.jallcom.2013.01.058

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural Stability and Scanning Tunneling Microscopy Images of Strained Ge Films on Si(001)2013

    • Author(s)
      Y. Fujimoto
    • Journal Title

      Phys. Rev. B

      Volume: 87 Pages: 075323

    • DOI

      10.1103/PhysRevB.87.075323

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Relation between nanomorphology and energy bands of Si nanowires2013

    • Author(s)
      S. Kyogoku
    • Journal Title

      Phys. Rev. B

      Volume: 87 Pages: 165418

    • DOI

      10.1103/PhysRevB.87.165418

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A quantum chemistry study of Ds-Pa unnatural DNA base pair2013

    • Author(s)
      T. Otsuka
    • Journal Title

      Int. J. Quantum Chem.

      Volume: 113 Pages: 504-509

    • DOI

      10.1002/qua.24094

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cation dependence of the electronic states in molecular triangular lattice systems beta’-X[Pd(dmit)2]2: A first-principles study2013

    • Author(s)
      T. Tsumuraya
    • Journal Title

      J. Phys. Soc. Jpn.

      Volume: 82 Pages: 033709:1-4

    • DOI

      10.7566/JPSJ.82.033709

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural relaxation and binding energy calculations of FK506 binding protein complexes using the large-scale DFT code CONQUEST2013

    • Author(s)
      T. Otsuka
    • Journal Title

      IOP Journal of Physics: Conference Series

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] First-Principles Study of Multiterminal Quantum Interference Controlled Molecular Devices2013

    • Author(s)
      Y. Okuno
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. C

      Volume: 117 Pages: 100-109

    • DOI

      10.1021/jp309455n

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] First-Principles study of interface structure and energy of Fe/NbC2013

    • Author(s)
      H. Sawada
    • Journal Title

      Model. Sim. Mat. Sci. Eng.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Floating Electron States in Covalent Semiconductors2012

    • Author(s)
      Y. Matsushita
    • Journal Title

      Phys. Rev. Lett.

      Volume: 108 Pages: 246404

    • DOI

      10.1103/PhysRevLett.108.246404

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microscopic Mechanisms of Initial Oxidationof Si(100): Reaction Pathways and Free-Energy Barriers2012

    • Author(s)
      K. Koizumi
    • Journal Title

      Phys. Rev. B

      Volume: 85 Pages: 205314:1-4

    • DOI

      10.1103/PhysRevB.85.205314

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Quasiparticles and Fermi liquid behavior in an organic metal2012

    • Author(s)
      T. Kiss
    • Journal Title

      Nat. Commun.

      Volume: 3 Pages: 1089:1-5

    • DOI

      10.1038/ncomms2079

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Experimental Evidence for Epitaxial Silicene on Diboride Thin Films2012

    • Author(s)
      A. Fleurence
    • Journal Title

      Phys. Rev. Lett.

      Volume: 108 Pages: 245501

    • DOI

      10.1103/PhysRevLett.108.245501

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 第一原理に基づく物質計算の現状と展望2012

    • Author(s)
      押山淳
    • Journal Title

      日本シミュレーション学会誌

      Volume: 31 Pages: 11

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 実空間密度汎関数法コードRSDFTによる大規模第一原理計算2012

    • Author(s)
      岩田潤一
    • Journal Title

      計算工学

      Volume: 17 Pages: 22

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] シリコンナノワイヤのシミュレーションとπ-CAVEシステムによる可視化2012

    • Author(s)
      古家真之介
    • Journal Title

      可視化情報学会誌

      Volume: 32 Pages: 138-143

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 第一原理計算で探るコヒーレントフォノンの生成機構2012

    • Author(s)
      篠原康
    • Journal Title

      日本物理学会誌

      Volume: 67 Pages: 685-689

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] オーダーN法を用いた大規模第一原理計算:ナノ構造物質、巨大性対分子に対する第一原理計算2012

    • Author(s)
      有田通朗
    • Journal Title

      精密工学会超精密加工専門委員会会誌「超精密」

      Volume: 18 Pages: 50-55

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 第一原理計算による半導体材料設計2013

    • Author(s)
      岩田潤一
    • Organizer
      第60回応用物理学会春期学術講演会シンポジウム“半導体モデリング・シミュレーション技術の現状と将来展望”
    • Place of Presentation
      神奈川工科大学, 神奈川
    • Year and Date
      2013-03-27 – 2013-03-27
    • Invited
  • [Presentation] 複雑生体系に対する全原子第一原理計算2013

    • Author(s)
      宮崎剛
    • Organizer
      日本物理学会第68回年次大会、領域11, 9, 7, 12合同シンポジウム「水素結合と分散力に関する第一原理計算の現状と課題」
    • Place of Presentation
      広島大学東広島キャンパス, 広島
    • Year and Date
      2013-03-26 – 2013-03-29
    • Invited
  • [Presentation] Massively Parallelized Density Functional Calculations for Large-Scale Systems Including a Hundred Thousand Atoms2013

    • Author(s)
      T. Ozaki
    • Organizer
      2nd International Symposium on Hierarchy and Holism in Natural Sciences
    • Place of Presentation
      National Center of Sciences, Tokyo
    • Year and Date
      2013-02-19 – 2013-02-21
    • Invited
  • [Presentation] 複雑生体系に対する全原子第一原理計算2013

    • Author(s)
      宮崎剛
    • Organizer
      分子研研究会「生物物質科学の展望」
    • Place of Presentation
      分子科学研究所, 愛知
    • Year and Date
      2013-01-10 – 2013-01-11
    • Invited
  • [Presentation] Real-Space Density-Functional Approach to Electronic Properties of Nanostructures2012

    • Author(s)
      A. Oshiyama
    • Organizer
      Conference on Computaional Physics
    • Place of Presentation
      Nichii Gakkan, Hyogo
    • Year and Date
      2012-10-14 – 2012-10-18
    • Invited
  • [Presentation] Band Structure Calculations of Large-Scale Systems by Sakurai-Sugiura Method2012

    • Author(s)
      J.-I. Iwata
    • Organizer
      nternational Symposium on Computics: Quantum Simulation and Design (ISC-QSD)
    • Place of Presentation
      Osaka University Hall, Osaka
    • Year and Date
      2012-10-11 – 2012-10-13
    • Invited
  • [Presentation] Large-scale electronic structure calculations with real-space grid density functional theory code2012

    • Author(s)
      J.-I. Iwata
    • Organizer
      International conference on Simulation Technology
    • Place of Presentation
      Integrated Research Center of Kobe University, Hyogo
    • Year and Date
      2012-09-27 – 2012-09-28
    • Invited
  • [Presentation] First-principles electronic structure calculations for 100,000-atom systems with real-space density functional theory code2012

    • Author(s)
      J.-I. Iwata
    • Organizer
      International Union of Material Research Societies - International Conference on Electronic Materials (IUMRS-ICEM 2012)
    • Place of Presentation
      PACIFICO Yokohama, Kanagawa
    • Year and Date
      2012-09-23 – 2012-09-28
    • Invited
  • [Presentation] Massively parallelized O(N) Krylov subspace method for large-scale DFT calculations2012

    • Author(s)
      T. Ozaki
    • Organizer
      IUMRS-ICEM 2012
    • Place of Presentation
      PACIFICO Yokohama, Kanagawa
    • Year and Date
      2012-09-23 – 2012-09-28
    • Invited
  • [Presentation] Atomic and electronic structures of BEDT-TTF and M(dmit)2 systems at high pressures: A first-principles study of organic molecular solids2012

    • Author(s)
      T. Miyazaki
    • Organizer
      IUCrHP2012/QuBS2012 “Advances in Crystallography at High Pressures” International Symposium of the Quantum Beam Science Directorate
    • Place of Presentation
      HOTEL LAKE VIEW MITO, Ibaraki
    • Year and Date
      2012-09-23 – 2012-09-27
    • Invited
  • [Presentation] First-principles electronic structure calculations with K computer2012

    • Author(s)
      J.-I. Iwata
    • Organizer
      Theory and Applications of Computational Chemistry (TACC2012)
    • Place of Presentation
      Pavia, Italy
    • Year and Date
      2012-09-02 – 2012-09-07
    • Invited
  • [Presentation] Large-scale electronic structure calculations by OpenMX: Current status and future2012

    • Author(s)
      T. Ozaki
    • Organizer
      MASP2012
    • Place of Presentation
      The University of Tokyo Kashiwa Campus Kashiwa library seminar room, Chiba
    • Year and Date
      2012-07-26 – 2012-07-26
    • Invited
  • [Presentation] Materials Design through Computics: Nanostructures of Silicon and Carbon2012

    • Author(s)
      A. Oshiyama
    • Organizer
      10th Int. Meeting on High Peformance Computing for Computational Science (VECPAR2012)
    • Place of Presentation
      RIKEN Advanced Institute for Computational Science (AICS), Hyogo
    • Year and Date
      2012-07-17 – 2012-07-20
    • Invited
  • [Presentation] Real-space grid density functional theory calculations2012

    • Author(s)
      J. Iwata
    • Organizer
      Material Simulation in Petaflops era (MASP2012)
    • Place of Presentation
      The University of Tokyo Kashiwa Campus Kashiwa library media hall, Chiba
    • Year and Date
      2012-07-12 – 2012-07-12
    • Invited
  • [Book] 岩波講座【計算科学】計算と物質2012

    • Author(s)
      押山淳
    • Total Pages
      292
    • Publisher
      岩波書店
  • [Remarks] コンピューティクスによる物質デザイン:複合相関と非平衡ダイナミクス

    • URL

      http://computics-material.jp/

URL: 

Published: 2018-02-02  

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