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2013 Fiscal Year Annual Research Report

回路活動データの解析法と局所神経回路のモデリング

Planned Research

Project AreaMesoscopic neurocircuitry: towards understanding of the functional and structural basis of brain information processing
Project/Area Number 22115013
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

深井 朋樹  独立行政法人理化学研究所, 脳科学総合研究センター, チームリーダー (40218871)

Project Period (FY) 2010-06-23 – 2015-03-31
Keywords脳・神経 / 情報工学 / ハイパフォーマンスコンピューティング / アルゴリズム / モデル化
Research Abstract

メゾ回路モデル:大脳皮質神経回路はさまざまな非ランダムな特徴をもつことが知られている。興奮性シナプス強度の対数正規分布を取り入れた神経回路モデルに、密に結合したニューロン・クラスターを導入すると、実験的に知られている結合の統計性がよく再現できることを示した。またニューロモルフィック技術の発展を促すため、このような神経回路の発見とその情報処理の特徴を、工学者向けに紹介するレビューを執筆した。興奮性シナプスの可塑性と、抑制性シナプスの可塑性の協同によって、複数のシナプス経路から特定の経路を入力依存に選択する機構を理論的に提案し論文発表した。さらに大脳皮質局所神経回路が刺激依存にセル・アセンブリを自己組織化し、安定の保持するためには、対数型STDPとシナプスの短期可塑性が強調して働く必要があることを理論的に証明した(論文投稿中)。また、リカレント神経回路を用いて入力情報を確率的にサンプリングし、ベイズ推定を行うためのメカニズムを複数検討した。この結果については、もう少し理論的な理解を深める必要がある。
データ解析法:多細胞記録実験のスパイク分離手法の第一段階であるスパイク検出は今まであまり検討されてこなかった。そこでベイズ推定を用いて検出されたピーク信号がスパイクである確率を推定することで、信頼度を最適に調節しながら検出する手法を提案した。内部状態モデルによってスパイク発火の非定常性を加味した情報幾何学的手法を用い、運動野の多細胞記録データに見られる同期や相関構造を解析し、層依存の効果を見出した。光計測により得られた画像信号の時系列から、数百個の神経細胞の位置とCa2+活動を同時に正確に同定する手法を完成させた(論文を執筆中)。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

メソ回路モデルでは、大脳皮質局所回路の非ランダムな構造を説明できる配線の統計的モデルを見出すことに成功した。また層構造を取り入れたカラム神経回路モデルについても、共同研究が進んでいる。一方、ニューロン集団のデータ解析手法の開発については、リニアプローブ記録のデータからスパイク分離する方法の開発に成功したが、神経集団の発火活動の特徴を検出する手法には弱点が残っており、本質的解決をみるまでに至っていない。

Strategy for Future Research Activity

方法論の開発が遅れていること、また神経ビッグデータの扱いが大きな課題になっている現状に鑑み、データ解析手法の開発に注力する。そのため、仮説フリーな方法論の開発を一旦中止し、神経集団のスパイク時系列の検出に特化した方法の開発を、今までどおりのカーネルPCAと、それとは全く別の方法にもとづいて進める。またカルシウム・イメージングのデータから自動的にスパイク活動と神経集団の位置情報を推定する手法を完成させる。

  • Research Products

    (20 results)

All 2014 2013

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (14 results) (of which Invited: 3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Neural dynamics and information representation in microcircuits of motor cortex.2013

    • Author(s)
      Yasuhiro Tsubo, Yoshikazu Isomura, Tomoki Fukai
    • Journal Title

      Frontiers in Neural Circuits

      Volume: 7 Pages: 1-10

    • DOI

      10.3389/fncir.2013.00085

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The synchronous activity of lateral habenular neurons is essential for regulating hippocampal theta oscillation.2013

    • Author(s)
      Hidenori Aizawa, Shin Yanagihara, Megumi Kobayashi, Kazue Niisato, Takashi Takekawa, Rie Harukuni, Thomas J. McHugh, Tomoki Fukai, Yoshikazu Isomura, Hitoshi Okamoto
    • Journal Title

      J. Neurosci.

      Volume: 33 Pages: 8909-8921

    • DOI

      10.1523/JNEUROSCI.4369-12.2013

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reward-modulated motor information in identified striatum neurons.2013

    • Author(s)
      Yoshikazu Isomura, Takashi Takekawa, Rie Harukuni, Takashi Handa, Hidenori Aizawa, Masahiko Takada, and Tomoki Fukai
    • Journal Title

      J. Neurosci.

      Volume: 33 Pages: 10209-10220

    • DOI

      10.1523/JNEUROSCI.0381-13.2013

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A θ-γ Oscillation Code for Neuronal Coordination during Motor Behavior.2013

    • Author(s)
      Jun Igarashi, Yoshikazu Isomura, Kensuke Arai, Rie Harukuni, Tomoki Fukai
    • Journal Title

      J. Neurosci.

      Volume: 33 Pages: 18515-18530

    • DOI

      10.1523/JNEUROSCI.2126-13.2013

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spatial and feature-based attention in a layered cortical microcircuit model.2013

    • Author(s)
      Nobuhiko Wagatsuma, Tobias C. Potjans, Markus Diesmann, Ko Sakai, Tomoki Fukai
    • Journal Title

      PLOS One

      Volume: 8 Pages: 1-14

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0080788

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 神経回路モデルにおける事前分布の学習2014

    • Author(s)
      平谷直輝、深井朋樹
    • Organizer
      日本物理学会第69回年次大会
    • Place of Presentation
      東海大学湘南キャンパス
    • Year and Date
      20140327-20140330
  • [Presentation] Sequence, irregular firing, and oscillations in cortical circuits2014

    • Author(s)
      Tomoki Fukai
    • Organizer
      KITP Program: Neurophysics of Space, Time and Learning
    • Place of Presentation
      Santa Barbara, USA
    • Year and Date
      20140227-20140307
    • Invited
  • [Presentation] Interplay between short- and long-term plasticity in cell-assembly formation2014

    • Author(s)
      Naoki Hiratani, Tomoki Fukai
    • Organizer
      Computational and Systems Neuroscience Meeting (COSYNE) 2014
    • Place of Presentation
      Salt Lake City, USA
    • Year and Date
      20140227-20140302
  • [Presentation] Neural clustering inferred from weight-wiring statistics in local cortical networks2013

    • Author(s)
      Vladimir Klinshov, Jun-nosuke Teramae, Vladimir Isaakovich Nekorkin, Tomoki Fukai
    • Organizer
      Neuroscience 2013 (SfN's 43rd annual meeting)
    • Place of Presentation
      San Diego, USA
    • Year and Date
      20131109-20131113
  • [Presentation] The effect of short-term depression on cell assembly formation2013

    • Author(s)
      Naoki Hiratani, Tomoki Fukai
    • Organizer
      Neuroscience 2013 (SfN's 43rd annual meeting)
    • Place of Presentation
      San Diego, USA
    • Year and Date
      20131109-20131113
  • [Presentation] Neural ensemble dynamics in rat dorsomedial prefrontal cortex during probabilistic sensory-cued choice2013

    • Author(s)
      Takashi Handa, Takashi Takekawa, Rie Harukuni, Yoshikazu Isomura, Tomoki Fukai
    • Organizer
      Bernstein Conference 2013
    • Place of Presentation
      Tubingen, Germany
    • Year and Date
      20130925-20130927
  • [Presentation] Active noise genesis and memory processes in recurrent neural networks2013

    • Author(s)
      Tomoki Fukai
    • Organizer
      IAS Program on Statistical Physics and Computational Neuroscience
    • Place of Presentation
      Hong Kong, China
    • Year and Date
      20130717-20130719
    • Invited
  • [Presentation] Inhibitory STDP improves temporal processing in disynaptic circuits2013

    • Author(s)
      Florence Kleberg, Matthieu Gilson, Tomoki Fukai
    • Organizer
      22nd Annual Computational Neuroscience Meeting (CNS) 2013
    • Place of Presentation
      Paris, France
    • Year and Date
      20130713-20130718
  • [Presentation] 神経細胞集団の発火時系列解析2013

    • Author(s)
      深井朋樹
    • Organizer
      Neuro2013
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館
    • Year and Date
      20130620-20130623
    • Invited
  • [Presentation] Internal noise and stochastic memory states in cortical networks with long-tailed synaptic connections2013

    • Author(s)
      Jun-nosuke Teramae, Yasuhiro Tsubo, Naoki Hiratani, Tomoki Fukai
    • Organizer
      Neuro2013
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館
    • Year and Date
      20130620-20130623
  • [Presentation] Inhibitory Spike-Timing Dependent Plasticity supports efficient spike transmission2013

    • Author(s)
      Florence Kleberg, Matthieu Gilson, Tomoki Fukai
    • Organizer
      Neuro2013
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館
    • Year and Date
      20130620-20130623
  • [Presentation] Spike-based computations and cell assemblies as a basis of working memory2013

    • Author(s)
      Tomoki Fukai, Matthieu Gilson
    • Organizer
      Neuro2013
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館
    • Year and Date
      20130620-20130623
  • [Presentation] Neural ensemble dynamics in rat dorsomedial prefrontal cortex during a sensory-guided choice task2013

    • Author(s)
      Takashi Handa, Takashi Takekawa, Rie Harukuni, Yoshikazu Isomura, Tomoki Fukai
    • Organizer
      Neuro2013
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館
    • Year and Date
      20130620-20130623
  • [Presentation] EToS4: new version of accurate spike sorting system based on totally improved algorithms2013

    • Author(s)
      Takashi Takekawa, Yoshikazu Isomura, Tomoki Fukai
    • Organizer
      Neuro2013
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館
    • Year and Date
      20130620-20130623
  • [Book] “Cortical Networks with Lognormal Synaptic Connectivity and Their Implications in Neuronal Avalanches”, in Criticality in Neural Systems2014

    • Author(s)
      Tomoki Fukai, Vladimir Klinshov, Jun-nosuke Teramae
    • Total Pages
      403-416
    • Publisher
      WILEY-VCH Verlag GmbH & Co

URL: 

Published: 2015-05-28  

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